Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H2B083

Protein Details
Accession H2B083    Localization Confidence High Confidence Score 21.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-23MVSKQNKKKSKVKFNNDQKDESNHydrophilic
221-242DNVRWNRSIYRKSKRYNYHIETHydrophilic
492-518NTTFFFNKLKTRKRKRDKGKDVRESFTHydrophilic
825-850KSESAGPEEKRKKKRNASVEKNGNSTHydrophilic
892-913VINQTNKKVRTHRDDNKVLKIVHydrophilic
1014-1033ASPGKVTKSKNTTRRCATCGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
500-511LKTRKRKRDKGK
833-839EKRKKKR
Subcellular Location(s) nucl 24.5, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR040240  TAF1  
IPR022591  TAF1_HAT_dom  
IPR041670  Znf-CCHC_6  
Gene Ontology GO:0005669  C:transcription factor TFIID complex  
GO:0004402  F:histone acetyltransferase activity  
GO:0001091  F:RNA polymerase II general transcription initiation factor binding  
GO:0017025  F:TBP-class protein binding  
GO:0006366  P:transcription by RNA polymerase II  
KEGG kaf:KAFR_0I02540  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF12157  DUF3591  
PF15288  zf-CCHC_6  
Amino Acid Sequences MVSKQNKKKSKVKFNNDQKDESNKDLTKEDDAYDAIFGGEFGSLEIGSYIRNDSNDDGATQHLPDAVDFEDEDELADEEELSQADDDNKGTAVNKSHASILPNDNMNLSLNDMDPNGNMMNEAVAFGNGVQDGNEFMLSHDGSPILPNNLNEFESGNNALFMGIDDTNGNAVFVEQQTSYDMFSMANNNQPQISKQDEKIRSANREKALLKYYFPDFKKGDNVRWNRSIYRKSKRYNYHIETDFIPLKPLIPSKLKLQVQQDQKKIFRTMDHITTIQALQKKKKKHSIITATLDELYPLIDEKSNEKTNLNENNKISEDLLVATDDWDEEKIINGEKSIERNTDTLLSTKVDDINSDAWNWNEDNLVDAKLSEAKHAELDMNDEKLLLLIQREPVHKDVQPISVNLPFDHMFSGPQLSEKLLLSKFNISNDEIYSTLKRTHQPKVRSTISNLNIEHSQPAINLQSPFYKVVLPRNQLRFYHRPKFGSNIRPNTTFFFNKLKTRKRKRDKGKDVRESFTSTADLTIGDTAPIYLMEYSEQDPLALSKFGMANKLINYYRKYNEQDTLRPKLPVGETHVLGVQDKSPFWNFGFVEPGHIVPTLYNNMVRAPVFKHGVSGTDFLLVRSTGNGTNNKFYLRNINHLFTVGQTFPVEEIPGPNSRKVTSMRTTRLKMIVYRILNRTPNRAISIEPITRHFPDQDYGQNRQKIKEFMKYQREGPDKGLWKLKEGEVLLDNENTKKLLLPEQVAEVESMSHGLQFWEDNENYNFDEKLLKLEENLLPWNVTKNFVNATQMRAMIQIHGAGDPTGCGEGFSFLKTSMKGGFVKSESAGPEEKRKKKRNASVEKNGNSTGHTYNVVQQQKAYEEEISKTWYTHTKSLSVTNPFEEIDDPNVINQTNKKVRTHRDDNKVLKIVRKRRDENGIIQRQTIIIKDPRVIKGYIRGKERMKEAKLDVNKLLEDDNLNLENVEDIEMQKKLLQNELASLEKSQQRRAARQMITANKKKMQEQQNPDGSASPGKVTKSKNTTRRCATCGQIGHIRTNKSCPMYNAANNAANEDNSTNATNSPAAVTTPIVHNSSEVQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.9
2 0.93
3 0.89
4 0.84
5 0.78
6 0.76
7 0.71
8 0.66
9 0.64
10 0.55
11 0.52
12 0.5
13 0.47
14 0.43
15 0.4
16 0.35
17 0.28
18 0.26
19 0.24
20 0.21
21 0.18
22 0.13
23 0.1
24 0.09
25 0.07
26 0.06
27 0.05
28 0.05
29 0.06
30 0.06
31 0.06
32 0.06
33 0.06
34 0.06
35 0.08
36 0.11
37 0.12
38 0.13
39 0.15
40 0.17
41 0.21
42 0.22
43 0.21
44 0.19
45 0.2
46 0.21
47 0.18
48 0.17
49 0.15
50 0.14
51 0.13
52 0.14
53 0.12
54 0.12
55 0.12
56 0.13
57 0.11
58 0.11
59 0.11
60 0.1
61 0.09
62 0.08
63 0.09
64 0.07
65 0.07
66 0.08
67 0.07
68 0.07
69 0.07
70 0.07
71 0.09
72 0.1
73 0.11
74 0.11
75 0.11
76 0.11
77 0.12
78 0.15
79 0.18
80 0.21
81 0.23
82 0.23
83 0.27
84 0.29
85 0.3
86 0.32
87 0.33
88 0.34
89 0.34
90 0.34
91 0.3
92 0.28
93 0.28
94 0.22
95 0.19
96 0.15
97 0.13
98 0.14
99 0.14
100 0.14
101 0.12
102 0.14
103 0.12
104 0.11
105 0.1
106 0.09
107 0.09
108 0.08
109 0.09
110 0.07
111 0.06
112 0.06
113 0.06
114 0.07
115 0.07
116 0.07
117 0.06
118 0.06
119 0.07
120 0.08
121 0.08
122 0.07
123 0.07
124 0.12
125 0.12
126 0.12
127 0.12
128 0.11
129 0.11
130 0.13
131 0.15
132 0.15
133 0.17
134 0.18
135 0.22
136 0.24
137 0.24
138 0.22
139 0.21
140 0.18
141 0.19
142 0.2
143 0.15
144 0.13
145 0.12
146 0.12
147 0.11
148 0.1
149 0.1
150 0.08
151 0.08
152 0.08
153 0.09
154 0.1
155 0.1
156 0.09
157 0.06
158 0.06
159 0.08
160 0.08
161 0.1
162 0.09
163 0.1
164 0.12
165 0.13
166 0.13
167 0.11
168 0.11
169 0.1
170 0.11
171 0.15
172 0.15
173 0.21
174 0.22
175 0.22
176 0.23
177 0.24
178 0.24
179 0.24
180 0.3
181 0.28
182 0.32
183 0.42
184 0.44
185 0.49
186 0.55
187 0.57
188 0.59
189 0.62
190 0.65
191 0.57
192 0.61
193 0.57
194 0.54
195 0.54
196 0.47
197 0.4
198 0.36
199 0.38
200 0.39
201 0.39
202 0.41
203 0.36
204 0.37
205 0.46
206 0.46
207 0.49
208 0.51
209 0.57
210 0.57
211 0.62
212 0.62
213 0.58
214 0.63
215 0.64
216 0.64
217 0.68
218 0.7
219 0.71
220 0.77
221 0.8
222 0.81
223 0.82
224 0.77
225 0.76
226 0.69
227 0.63
228 0.55
229 0.51
230 0.46
231 0.35
232 0.31
233 0.22
234 0.2
235 0.21
236 0.22
237 0.21
238 0.23
239 0.25
240 0.28
241 0.38
242 0.39
243 0.42
244 0.46
245 0.49
246 0.55
247 0.61
248 0.63
249 0.61
250 0.61
251 0.61
252 0.58
253 0.52
254 0.44
255 0.41
256 0.39
257 0.37
258 0.37
259 0.32
260 0.29
261 0.29
262 0.27
263 0.25
264 0.25
265 0.25
266 0.31
267 0.38
268 0.46
269 0.53
270 0.62
271 0.67
272 0.7
273 0.76
274 0.77
275 0.79
276 0.77
277 0.69
278 0.61
279 0.53
280 0.44
281 0.33
282 0.23
283 0.14
284 0.08
285 0.07
286 0.06
287 0.07
288 0.08
289 0.11
290 0.19
291 0.22
292 0.23
293 0.24
294 0.25
295 0.31
296 0.41
297 0.44
298 0.43
299 0.4
300 0.43
301 0.44
302 0.42
303 0.34
304 0.25
305 0.2
306 0.14
307 0.14
308 0.1
309 0.09
310 0.08
311 0.07
312 0.06
313 0.06
314 0.06
315 0.06
316 0.05
317 0.07
318 0.07
319 0.09
320 0.09
321 0.09
322 0.12
323 0.13
324 0.17
325 0.18
326 0.19
327 0.19
328 0.19
329 0.2
330 0.2
331 0.19
332 0.17
333 0.16
334 0.16
335 0.15
336 0.15
337 0.16
338 0.13
339 0.13
340 0.14
341 0.15
342 0.15
343 0.15
344 0.15
345 0.13
346 0.14
347 0.14
348 0.12
349 0.1
350 0.09
351 0.1
352 0.1
353 0.1
354 0.08
355 0.08
356 0.08
357 0.12
358 0.12
359 0.12
360 0.12
361 0.11
362 0.12
363 0.13
364 0.13
365 0.09
366 0.15
367 0.15
368 0.15
369 0.14
370 0.14
371 0.13
372 0.12
373 0.12
374 0.07
375 0.06
376 0.06
377 0.1
378 0.14
379 0.16
380 0.19
381 0.21
382 0.23
383 0.24
384 0.27
385 0.25
386 0.27
387 0.27
388 0.26
389 0.26
390 0.26
391 0.25
392 0.21
393 0.21
394 0.16
395 0.15
396 0.15
397 0.12
398 0.1
399 0.1
400 0.11
401 0.08
402 0.09
403 0.09
404 0.08
405 0.1
406 0.1
407 0.13
408 0.12
409 0.13
410 0.14
411 0.19
412 0.2
413 0.2
414 0.22
415 0.2
416 0.2
417 0.2
418 0.2
419 0.14
420 0.15
421 0.14
422 0.13
423 0.15
424 0.17
425 0.22
426 0.25
427 0.33
428 0.39
429 0.45
430 0.5
431 0.55
432 0.57
433 0.54
434 0.54
435 0.54
436 0.5
437 0.49
438 0.44
439 0.38
440 0.33
441 0.31
442 0.28
443 0.19
444 0.15
445 0.09
446 0.1
447 0.09
448 0.11
449 0.11
450 0.11
451 0.13
452 0.14
453 0.15
454 0.14
455 0.15
456 0.14
457 0.23
458 0.29
459 0.3
460 0.36
461 0.4
462 0.44
463 0.43
464 0.49
465 0.5
466 0.51
467 0.56
468 0.54
469 0.51
470 0.48
471 0.53
472 0.53
473 0.55
474 0.55
475 0.54
476 0.53
477 0.52
478 0.52
479 0.48
480 0.45
481 0.36
482 0.3
483 0.29
484 0.29
485 0.34
486 0.41
487 0.49
488 0.55
489 0.65
490 0.73
491 0.77
492 0.85
493 0.88
494 0.91
495 0.93
496 0.93
497 0.93
498 0.93
499 0.86
500 0.78
501 0.69
502 0.62
503 0.51
504 0.41
505 0.31
506 0.2
507 0.16
508 0.13
509 0.11
510 0.07
511 0.07
512 0.05
513 0.04
514 0.04
515 0.04
516 0.04
517 0.04
518 0.04
519 0.03
520 0.03
521 0.04
522 0.05
523 0.07
524 0.07
525 0.07
526 0.07
527 0.07
528 0.07
529 0.08
530 0.07
531 0.05
532 0.06
533 0.08
534 0.08
535 0.1
536 0.1
537 0.1
538 0.11
539 0.15
540 0.16
541 0.18
542 0.2
543 0.23
544 0.24
545 0.29
546 0.32
547 0.3
548 0.35
549 0.34
550 0.39
551 0.41
552 0.45
553 0.4
554 0.37
555 0.34
556 0.32
557 0.29
558 0.24
559 0.25
560 0.23
561 0.21
562 0.22
563 0.23
564 0.19
565 0.19
566 0.17
567 0.11
568 0.09
569 0.09
570 0.11
571 0.1
572 0.12
573 0.12
574 0.16
575 0.15
576 0.15
577 0.19
578 0.16
579 0.18
580 0.17
581 0.17
582 0.13
583 0.13
584 0.12
585 0.08
586 0.1
587 0.09
588 0.09
589 0.09
590 0.09
591 0.09
592 0.11
593 0.11
594 0.1
595 0.1
596 0.13
597 0.15
598 0.15
599 0.16
600 0.14
601 0.16
602 0.17
603 0.16
604 0.13
605 0.13
606 0.14
607 0.12
608 0.13
609 0.11
610 0.09
611 0.08
612 0.1
613 0.09
614 0.13
615 0.18
616 0.19
617 0.21
618 0.22
619 0.23
620 0.22
621 0.21
622 0.27
623 0.25
624 0.31
625 0.32
626 0.33
627 0.31
628 0.31
629 0.3
630 0.21
631 0.22
632 0.14
633 0.11
634 0.1
635 0.1
636 0.09
637 0.09
638 0.09
639 0.06
640 0.07
641 0.09
642 0.15
643 0.16
644 0.18
645 0.19
646 0.19
647 0.22
648 0.24
649 0.28
650 0.29
651 0.35
652 0.41
653 0.46
654 0.48
655 0.48
656 0.49
657 0.44
658 0.39
659 0.37
660 0.37
661 0.33
662 0.36
663 0.36
664 0.37
665 0.42
666 0.41
667 0.41
668 0.37
669 0.36
670 0.34
671 0.31
672 0.27
673 0.25
674 0.3
675 0.27
676 0.25
677 0.25
678 0.26
679 0.27
680 0.27
681 0.24
682 0.19
683 0.18
684 0.2
685 0.25
686 0.27
687 0.32
688 0.37
689 0.42
690 0.42
691 0.43
692 0.44
693 0.43
694 0.42
695 0.45
696 0.46
697 0.5
698 0.58
699 0.58
700 0.57
701 0.6
702 0.6
703 0.53
704 0.49
705 0.48
706 0.42
707 0.43
708 0.47
709 0.38
710 0.37
711 0.38
712 0.34
713 0.31
714 0.27
715 0.26
716 0.21
717 0.23
718 0.21
719 0.2
720 0.2
721 0.16
722 0.16
723 0.14
724 0.12
725 0.11
726 0.11
727 0.16
728 0.18
729 0.19
730 0.19
731 0.21
732 0.22
733 0.21
734 0.19
735 0.13
736 0.1
737 0.08
738 0.08
739 0.06
740 0.05
741 0.05
742 0.05
743 0.06
744 0.06
745 0.07
746 0.12
747 0.12
748 0.15
749 0.16
750 0.18
751 0.18
752 0.19
753 0.18
754 0.13
755 0.16
756 0.13
757 0.16
758 0.16
759 0.15
760 0.14
761 0.19
762 0.2
763 0.19
764 0.21
765 0.18
766 0.16
767 0.16
768 0.21
769 0.18
770 0.19
771 0.17
772 0.17
773 0.19
774 0.19
775 0.25
776 0.21
777 0.23
778 0.23
779 0.23
780 0.22
781 0.21
782 0.2
783 0.15
784 0.14
785 0.12
786 0.1
787 0.1
788 0.1
789 0.08
790 0.08
791 0.07
792 0.07
793 0.06
794 0.05
795 0.05
796 0.05
797 0.08
798 0.08
799 0.09
800 0.09
801 0.09
802 0.12
803 0.12
804 0.13
805 0.13
806 0.16
807 0.17
808 0.18
809 0.22
810 0.21
811 0.23
812 0.22
813 0.23
814 0.2
815 0.21
816 0.24
817 0.21
818 0.31
819 0.39
820 0.48
821 0.56
822 0.64
823 0.72
824 0.78
825 0.86
826 0.86
827 0.88
828 0.88
829 0.89
830 0.89
831 0.82
832 0.76
833 0.68
834 0.57
835 0.47
836 0.41
837 0.31
838 0.23
839 0.21
840 0.18
841 0.23
842 0.3
843 0.33
844 0.29
845 0.28
846 0.29
847 0.29
848 0.3
849 0.26
850 0.21
851 0.19
852 0.21
853 0.22
854 0.24
855 0.22
856 0.2
857 0.21
858 0.25
859 0.28
860 0.31
861 0.32
862 0.32
863 0.34
864 0.4
865 0.44
866 0.43
867 0.4
868 0.36
869 0.36
870 0.31
871 0.3
872 0.25
873 0.21
874 0.18
875 0.18
876 0.16
877 0.16
878 0.17
879 0.16
880 0.18
881 0.19
882 0.26
883 0.31
884 0.36
885 0.42
886 0.48
887 0.57
888 0.65
889 0.72
890 0.72
891 0.74
892 0.8
893 0.8
894 0.8
895 0.78
896 0.71
897 0.68
898 0.68
899 0.68
900 0.67
901 0.7
902 0.67
903 0.66
904 0.74
905 0.71
906 0.71
907 0.73
908 0.73
909 0.64
910 0.6
911 0.53
912 0.45
913 0.41
914 0.32
915 0.27
916 0.23
917 0.24
918 0.28
919 0.33
920 0.36
921 0.38
922 0.38
923 0.34
924 0.39
925 0.45
926 0.46
927 0.46
928 0.49
929 0.52
930 0.56
931 0.63
932 0.62
933 0.56
934 0.57
935 0.55
936 0.58
937 0.59
938 0.58
939 0.52
940 0.46
941 0.43
942 0.37
943 0.34
944 0.26
945 0.22
946 0.19
947 0.2
948 0.17
949 0.17
950 0.16
951 0.15
952 0.13
953 0.12
954 0.13
955 0.09
956 0.09
957 0.12
958 0.13
959 0.13
960 0.16
961 0.19
962 0.18
963 0.23
964 0.25
965 0.23
966 0.27
967 0.3
968 0.29
969 0.27
970 0.26
971 0.27
972 0.3
973 0.32
974 0.34
975 0.37
976 0.42
977 0.48
978 0.56
979 0.6
980 0.56
981 0.6
982 0.63
983 0.67
984 0.7
985 0.72
986 0.7
987 0.66
988 0.67
989 0.66
990 0.67
991 0.67
992 0.67
993 0.68
994 0.71
995 0.73
996 0.72
997 0.67
998 0.59
999 0.5
1000 0.44
1001 0.36
1002 0.29
1003 0.24
1004 0.25
1005 0.3
1006 0.33
1007 0.41
1008 0.47
1009 0.55
1010 0.62
1011 0.68
1012 0.75
1013 0.78
1014 0.8
1015 0.76
1016 0.72
1017 0.67
1018 0.66
1019 0.6
1020 0.57
1021 0.54
1022 0.5
1023 0.53
1024 0.53
1025 0.54
1026 0.48
1027 0.51
1028 0.51
1029 0.48
1030 0.5
1031 0.44
1032 0.46
1033 0.49
1034 0.51
1035 0.51
1036 0.5
1037 0.51
1038 0.47
1039 0.47
1040 0.41
1041 0.33
1042 0.3
1043 0.25
1044 0.21
1045 0.18
1046 0.19
1047 0.17
1048 0.16
1049 0.18
1050 0.16
1051 0.16
1052 0.16
1053 0.14
1054 0.13
1055 0.13
1056 0.14
1057 0.14
1058 0.18
1059 0.21
1060 0.21
1061 0.2