Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H2AWJ8

Protein Details
Accession H2AWJ8    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
250-275TESEANSQTKKRKKKFIVKEAGETRLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
259-282KKRKKKFIVKEAGETRLQKKKMKK
Subcellular Location(s) nucl 24.5, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045146  SF3A1  
IPR000061  Surp  
IPR035967  SWAP/Surp_sf  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0045292  P:mRNA cis splicing, via spliceosome  
KEGG kaf:KAFR_0F01510  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01805  Surp  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50128  SURP  
Amino Acid Sequences MESLDEELKKNIEKTVGFIKANGREFEAKLLNDPRDRFSFIRPENEHYEHYISLLEGTSTSDVLKNIPKQPGLFVFSEYDKVGNIPAEDIEIIKKTAEFVVVQSGEDKSYDVLMDQILLRCESREDDTFKFLNKEHKLHSTFIDFVNQYKQIQRSEKIEKLDSWQGILTRSFERAKYNEYIKQMTKKNAKLGKFYKVRFTAIDWSKFHKITEQPCEKTNILDFSELSRLKITDNKPIINAFFSKASDNVTESEANSQTKKRKKKFIVKEAGETRLQKKKMKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.27
2 0.34
3 0.38
4 0.36
5 0.37
6 0.41
7 0.44
8 0.48
9 0.45
10 0.4
11 0.37
12 0.37
13 0.41
14 0.39
15 0.31
16 0.33
17 0.38
18 0.4
19 0.42
20 0.43
21 0.42
22 0.41
23 0.45
24 0.41
25 0.4
26 0.45
27 0.43
28 0.51
29 0.49
30 0.51
31 0.54
32 0.55
33 0.51
34 0.45
35 0.44
36 0.34
37 0.31
38 0.26
39 0.18
40 0.15
41 0.14
42 0.09
43 0.06
44 0.08
45 0.08
46 0.08
47 0.08
48 0.09
49 0.09
50 0.12
51 0.18
52 0.22
53 0.27
54 0.31
55 0.32
56 0.31
57 0.34
58 0.36
59 0.34
60 0.29
61 0.25
62 0.23
63 0.22
64 0.23
65 0.2
66 0.16
67 0.12
68 0.12
69 0.11
70 0.1
71 0.09
72 0.08
73 0.07
74 0.08
75 0.08
76 0.08
77 0.08
78 0.08
79 0.08
80 0.08
81 0.08
82 0.08
83 0.08
84 0.09
85 0.08
86 0.07
87 0.13
88 0.13
89 0.13
90 0.13
91 0.13
92 0.12
93 0.12
94 0.12
95 0.06
96 0.07
97 0.06
98 0.05
99 0.05
100 0.05
101 0.06
102 0.06
103 0.07
104 0.07
105 0.08
106 0.08
107 0.08
108 0.08
109 0.09
110 0.12
111 0.14
112 0.17
113 0.18
114 0.22
115 0.22
116 0.23
117 0.23
118 0.22
119 0.28
120 0.27
121 0.29
122 0.28
123 0.35
124 0.36
125 0.36
126 0.36
127 0.29
128 0.26
129 0.24
130 0.25
131 0.17
132 0.16
133 0.17
134 0.17
135 0.15
136 0.17
137 0.2
138 0.21
139 0.25
140 0.26
141 0.29
142 0.35
143 0.38
144 0.38
145 0.37
146 0.33
147 0.33
148 0.36
149 0.3
150 0.24
151 0.21
152 0.19
153 0.19
154 0.19
155 0.16
156 0.12
157 0.16
158 0.16
159 0.17
160 0.2
161 0.2
162 0.24
163 0.26
164 0.29
165 0.3
166 0.32
167 0.36
168 0.36
169 0.42
170 0.43
171 0.47
172 0.51
173 0.5
174 0.55
175 0.57
176 0.56
177 0.57
178 0.56
179 0.58
180 0.57
181 0.55
182 0.55
183 0.51
184 0.51
185 0.43
186 0.42
187 0.42
188 0.4
189 0.46
190 0.39
191 0.42
192 0.45
193 0.44
194 0.41
195 0.37
196 0.38
197 0.38
198 0.47
199 0.5
200 0.48
201 0.49
202 0.55
203 0.48
204 0.45
205 0.41
206 0.34
207 0.27
208 0.26
209 0.24
210 0.21
211 0.29
212 0.27
213 0.25
214 0.22
215 0.21
216 0.21
217 0.28
218 0.28
219 0.3
220 0.35
221 0.35
222 0.36
223 0.38
224 0.37
225 0.33
226 0.32
227 0.24
228 0.22
229 0.21
230 0.21
231 0.2
232 0.21
233 0.2
234 0.2
235 0.19
236 0.19
237 0.19
238 0.18
239 0.23
240 0.23
241 0.24
242 0.26
243 0.31
244 0.38
245 0.46
246 0.57
247 0.61
248 0.68
249 0.76
250 0.84
251 0.89
252 0.9
253 0.92
254 0.87
255 0.88
256 0.83
257 0.77
258 0.72
259 0.66
260 0.62
261 0.6
262 0.6