Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1E4RNV0

Protein Details
Accession A0A1E4RNV0    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
5-29SPAASKSKSPVKAPKNKPEVKRATTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
16-21KAPKNK
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 13.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045144  TAF4  
IPR007900  TAF4_C  
Gene Ontology GO:0005669  C:transcription factor TFIID complex  
GO:0006352  P:DNA-templated transcription initiation  
Pfam View protein in Pfam  
PF05236  TAF4  
CDD cd08045  TAF4  
Amino Acid Sequences MGSASPAASKSKSPVKAPKNKPEVKRATTVPNRFDEQNNDAQSRSSTPVAQQEPQQAVLLARSKTKDDKQKTSREDGGKSKVSADDASKLNDAIAAAGVDIQKEEELLAQQHAHRASNITAANQFSQRQRQYNPHLNAFLHPYHLAVFMNRVANQNGILQNFVQDGELLELMSVACQQWLSKIVSKTVILSRHRRRGIPSFNSKNKKLSLSLLTAIQRSDLSKELRNLAAKQKEMEEKRVSKRIILGLEKSADANGDASAKAGAEETLHRAANATAAMMAMNPGRKKYSWMTSSTGGGDDAAGGDKDGKNKQSSIISVRGDNGLRYREIRSGNSVTMKDLLGVIEEERMGTEKAVIKGYAKLKD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.53
2 0.6
3 0.69
4 0.77
5 0.81
6 0.83
7 0.86
8 0.85
9 0.85
10 0.84
11 0.79
12 0.76
13 0.7
14 0.7
15 0.71
16 0.72
17 0.67
18 0.62
19 0.6
20 0.56
21 0.56
22 0.52
23 0.48
24 0.48
25 0.47
26 0.43
27 0.4
28 0.38
29 0.35
30 0.33
31 0.31
32 0.24
33 0.21
34 0.23
35 0.31
36 0.34
37 0.35
38 0.36
39 0.39
40 0.39
41 0.39
42 0.36
43 0.28
44 0.25
45 0.27
46 0.27
47 0.21
48 0.23
49 0.23
50 0.27
51 0.33
52 0.41
53 0.47
54 0.5
55 0.6
56 0.64
57 0.73
58 0.75
59 0.75
60 0.76
61 0.71
62 0.69
63 0.65
64 0.64
65 0.58
66 0.53
67 0.47
68 0.4
69 0.36
70 0.32
71 0.28
72 0.26
73 0.23
74 0.25
75 0.23
76 0.22
77 0.19
78 0.18
79 0.15
80 0.1
81 0.09
82 0.06
83 0.05
84 0.07
85 0.07
86 0.06
87 0.06
88 0.06
89 0.06
90 0.06
91 0.06
92 0.05
93 0.06
94 0.07
95 0.09
96 0.1
97 0.11
98 0.15
99 0.16
100 0.16
101 0.15
102 0.17
103 0.16
104 0.2
105 0.2
106 0.17
107 0.18
108 0.19
109 0.2
110 0.2
111 0.22
112 0.2
113 0.28
114 0.31
115 0.33
116 0.36
117 0.43
118 0.49
119 0.57
120 0.57
121 0.52
122 0.51
123 0.47
124 0.45
125 0.41
126 0.32
127 0.24
128 0.2
129 0.16
130 0.14
131 0.14
132 0.13
133 0.09
134 0.1
135 0.11
136 0.13
137 0.14
138 0.15
139 0.14
140 0.14
141 0.15
142 0.17
143 0.16
144 0.15
145 0.14
146 0.12
147 0.12
148 0.12
149 0.11
150 0.08
151 0.06
152 0.06
153 0.06
154 0.06
155 0.05
156 0.04
157 0.04
158 0.04
159 0.04
160 0.04
161 0.03
162 0.03
163 0.03
164 0.03
165 0.04
166 0.08
167 0.1
168 0.14
169 0.15
170 0.16
171 0.18
172 0.18
173 0.19
174 0.2
175 0.25
176 0.25
177 0.34
178 0.4
179 0.48
180 0.5
181 0.5
182 0.51
183 0.53
184 0.58
185 0.56
186 0.59
187 0.59
188 0.66
189 0.71
190 0.68
191 0.63
192 0.57
193 0.51
194 0.42
195 0.37
196 0.32
197 0.29
198 0.28
199 0.27
200 0.26
201 0.24
202 0.22
203 0.18
204 0.15
205 0.12
206 0.13
207 0.14
208 0.15
209 0.18
210 0.21
211 0.23
212 0.25
213 0.27
214 0.28
215 0.33
216 0.35
217 0.32
218 0.31
219 0.32
220 0.38
221 0.37
222 0.42
223 0.41
224 0.44
225 0.49
226 0.55
227 0.52
228 0.45
229 0.46
230 0.44
231 0.42
232 0.38
233 0.34
234 0.29
235 0.3
236 0.28
237 0.25
238 0.2
239 0.14
240 0.11
241 0.1
242 0.07
243 0.07
244 0.07
245 0.07
246 0.07
247 0.07
248 0.06
249 0.06
250 0.06
251 0.06
252 0.07
253 0.11
254 0.14
255 0.14
256 0.14
257 0.14
258 0.14
259 0.15
260 0.14
261 0.1
262 0.06
263 0.06
264 0.07
265 0.06
266 0.07
267 0.07
268 0.11
269 0.12
270 0.14
271 0.17
272 0.17
273 0.23
274 0.28
275 0.35
276 0.35
277 0.39
278 0.41
279 0.41
280 0.43
281 0.39
282 0.33
283 0.24
284 0.19
285 0.15
286 0.1
287 0.09
288 0.08
289 0.06
290 0.06
291 0.09
292 0.11
293 0.16
294 0.21
295 0.25
296 0.27
297 0.28
298 0.32
299 0.33
300 0.36
301 0.36
302 0.39
303 0.37
304 0.35
305 0.36
306 0.36
307 0.32
308 0.31
309 0.29
310 0.25
311 0.26
312 0.27
313 0.28
314 0.3
315 0.34
316 0.34
317 0.37
318 0.38
319 0.4
320 0.44
321 0.41
322 0.38
323 0.36
324 0.32
325 0.26
326 0.22
327 0.17
328 0.13
329 0.13
330 0.11
331 0.11
332 0.11
333 0.1
334 0.1
335 0.12
336 0.11
337 0.11
338 0.15
339 0.19
340 0.22
341 0.25
342 0.25
343 0.25
344 0.32