Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1E4RPF0

Protein Details
Accession A0A1E4RPF0    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
424-454EDEKKSEEPTKNQPKKKQNNKKDEEPEKEDEAcidic
NLS Segment(s)
PositionSequence
42-51LKKQEKAAKR
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 13.333, mito_nucl 9.166, cyto 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000649  IF-2B-related  
IPR042529  IF_2B-like_C  
IPR037171  NagB/RpiA_transferase-like  
Gene Ontology GO:0003743  F:translation initiation factor activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF01008  IF-2B  
Amino Acid Sequences MSDAPVAPIKAPEKAVAVAANVDSAPADSPSGKLSNKELKELKKQEKAAKRAAQKAANGITPEQQVQLAEQKMEKKKQQLATNTNLKKQLHQTLIKDDNVKKIPSLFSHLETREQRNAASPSISHIVHPAILSLTLKYSTYKVVGSIARLRNMLEAFKVVIRDYKTPENTTLTRHLTGHLSHQIEYLKSARPLSISMGNAIRWLKQEISHISIDTKELKAKDILVEKIDDFIKEKIDLSDRVIIENASQHILEGSTILTYGHSDVLEELFKYCVLEQGKSFNLIIVDSRPLFEGKKLLNSLVNTNIKATPITQDYLKVNYVLLNSLSSTILADTDCVFLGAHAMLSNGHLYSRVGTGLIAMMCHTRNIPVLTCCESVKFSDKVQLDSVTTNELADPEDLVEQIHSKKPPQKKSFALEQFIKQCEDEKKSEEPTKNQPKKKQNNKKDEEPEKEDENAPLKDWKSKENISLLNIMYDLTPPQYIKKVVTELGALPPSSVPVILREYKNT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.26
3 0.22
4 0.2
5 0.18
6 0.17
7 0.16
8 0.12
9 0.12
10 0.1
11 0.09
12 0.09
13 0.08
14 0.1
15 0.09
16 0.1
17 0.14
18 0.19
19 0.2
20 0.21
21 0.29
22 0.37
23 0.38
24 0.46
25 0.5
26 0.52
27 0.62
28 0.69
29 0.71
30 0.7
31 0.76
32 0.77
33 0.8
34 0.79
35 0.79
36 0.77
37 0.76
38 0.76
39 0.76
40 0.72
41 0.65
42 0.65
43 0.58
44 0.53
45 0.47
46 0.39
47 0.36
48 0.32
49 0.31
50 0.24
51 0.21
52 0.18
53 0.18
54 0.24
55 0.21
56 0.2
57 0.23
58 0.31
59 0.38
60 0.46
61 0.49
62 0.5
63 0.57
64 0.63
65 0.67
66 0.69
67 0.68
68 0.69
69 0.74
70 0.7
71 0.67
72 0.67
73 0.6
74 0.55
75 0.56
76 0.55
77 0.53
78 0.55
79 0.53
80 0.55
81 0.6
82 0.58
83 0.58
84 0.52
85 0.52
86 0.5
87 0.47
88 0.39
89 0.37
90 0.37
91 0.32
92 0.36
93 0.3
94 0.29
95 0.36
96 0.36
97 0.41
98 0.43
99 0.46
100 0.45
101 0.43
102 0.4
103 0.39
104 0.41
105 0.34
106 0.3
107 0.24
108 0.22
109 0.26
110 0.25
111 0.19
112 0.18
113 0.17
114 0.17
115 0.17
116 0.13
117 0.09
118 0.1
119 0.1
120 0.09
121 0.09
122 0.09
123 0.09
124 0.1
125 0.11
126 0.12
127 0.13
128 0.13
129 0.12
130 0.16
131 0.17
132 0.19
133 0.27
134 0.28
135 0.29
136 0.29
137 0.29
138 0.27
139 0.27
140 0.24
141 0.16
142 0.14
143 0.13
144 0.14
145 0.14
146 0.11
147 0.14
148 0.16
149 0.19
150 0.22
151 0.29
152 0.31
153 0.33
154 0.35
155 0.36
156 0.35
157 0.36
158 0.38
159 0.34
160 0.32
161 0.3
162 0.29
163 0.26
164 0.26
165 0.27
166 0.27
167 0.25
168 0.23
169 0.25
170 0.25
171 0.22
172 0.24
173 0.21
174 0.17
175 0.18
176 0.18
177 0.16
178 0.16
179 0.16
180 0.17
181 0.2
182 0.17
183 0.17
184 0.18
185 0.17
186 0.19
187 0.19
188 0.17
189 0.14
190 0.15
191 0.14
192 0.15
193 0.19
194 0.19
195 0.23
196 0.22
197 0.21
198 0.2
199 0.19
200 0.19
201 0.17
202 0.15
203 0.14
204 0.14
205 0.15
206 0.15
207 0.16
208 0.18
209 0.19
210 0.19
211 0.17
212 0.18
213 0.17
214 0.18
215 0.18
216 0.14
217 0.12
218 0.12
219 0.12
220 0.11
221 0.12
222 0.11
223 0.13
224 0.14
225 0.14
226 0.19
227 0.18
228 0.18
229 0.18
230 0.16
231 0.14
232 0.15
233 0.13
234 0.08
235 0.07
236 0.07
237 0.07
238 0.07
239 0.06
240 0.05
241 0.04
242 0.03
243 0.03
244 0.04
245 0.03
246 0.04
247 0.05
248 0.05
249 0.05
250 0.05
251 0.05
252 0.06
253 0.06
254 0.06
255 0.06
256 0.06
257 0.06
258 0.06
259 0.06
260 0.1
261 0.11
262 0.12
263 0.12
264 0.15
265 0.16
266 0.17
267 0.17
268 0.13
269 0.12
270 0.11
271 0.11
272 0.09
273 0.1
274 0.09
275 0.09
276 0.09
277 0.1
278 0.1
279 0.11
280 0.14
281 0.13
282 0.18
283 0.18
284 0.19
285 0.21
286 0.21
287 0.22
288 0.25
289 0.27
290 0.22
291 0.23
292 0.23
293 0.2
294 0.2
295 0.18
296 0.13
297 0.13
298 0.14
299 0.13
300 0.15
301 0.16
302 0.19
303 0.19
304 0.16
305 0.14
306 0.14
307 0.14
308 0.12
309 0.11
310 0.09
311 0.09
312 0.09
313 0.09
314 0.07
315 0.07
316 0.06
317 0.06
318 0.06
319 0.06
320 0.06
321 0.07
322 0.06
323 0.07
324 0.06
325 0.06
326 0.07
327 0.06
328 0.05
329 0.05
330 0.05
331 0.05
332 0.06
333 0.07
334 0.06
335 0.06
336 0.06
337 0.06
338 0.07
339 0.08
340 0.08
341 0.07
342 0.07
343 0.07
344 0.08
345 0.08
346 0.07
347 0.07
348 0.08
349 0.08
350 0.09
351 0.09
352 0.08
353 0.11
354 0.13
355 0.15
356 0.15
357 0.19
358 0.23
359 0.24
360 0.23
361 0.22
362 0.21
363 0.21
364 0.25
365 0.23
366 0.19
367 0.26
368 0.27
369 0.28
370 0.29
371 0.28
372 0.24
373 0.23
374 0.23
375 0.18
376 0.17
377 0.15
378 0.12
379 0.11
380 0.11
381 0.1
382 0.09
383 0.07
384 0.08
385 0.08
386 0.08
387 0.08
388 0.09
389 0.12
390 0.17
391 0.18
392 0.24
393 0.32
394 0.41
395 0.52
396 0.57
397 0.62
398 0.65
399 0.69
400 0.74
401 0.73
402 0.71
403 0.64
404 0.63
405 0.61
406 0.56
407 0.51
408 0.41
409 0.39
410 0.4
411 0.41
412 0.38
413 0.36
414 0.39
415 0.45
416 0.54
417 0.54
418 0.53
419 0.58
420 0.66
421 0.72
422 0.75
423 0.78
424 0.8
425 0.85
426 0.91
427 0.91
428 0.9
429 0.92
430 0.91
431 0.91
432 0.91
433 0.9
434 0.87
435 0.83
436 0.78
437 0.7
438 0.65
439 0.56
440 0.5
441 0.46
442 0.38
443 0.33
444 0.34
445 0.32
446 0.36
447 0.36
448 0.38
449 0.39
450 0.43
451 0.46
452 0.48
453 0.5
454 0.46
455 0.49
456 0.44
457 0.37
458 0.33
459 0.27
460 0.2
461 0.17
462 0.15
463 0.11
464 0.13
465 0.13
466 0.17
467 0.22
468 0.24
469 0.26
470 0.31
471 0.33
472 0.32
473 0.33
474 0.32
475 0.28
476 0.32
477 0.32
478 0.27
479 0.23
480 0.22
481 0.21
482 0.19
483 0.17
484 0.11
485 0.12
486 0.19
487 0.25