Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1E4RNA3

Protein Details
Accession A0A1E4RNA3    Localization Confidence High Confidence Score 23.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
98-126QSNELEQRINRLKRKPKNEESEIKKRKKAHydrophilic
210-234EKLNSAKKLKKDMREKKRQNDISFNHydrophilic
296-324NDYSKPKKPVKMKKLLKKLKLKLKDRNKTBasic
640-663GVGPGKAKTEKKLRKQHDLNSSNTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
108-125RLKRKPKNEESEIKKRKK
216-226KKLKKDMREKK
300-322KPKKPVKMKKLLKKLKLKLKDRN
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045347  HIND  
IPR005011  SNU66/SART1  
Gene Ontology GO:0046540  C:U4/U6 x U5 tri-snRNP complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF19252  HIND  
PF03343  SART-1  
Amino Acid Sequences MPESIELSIAETNKLRAKIGLPLIAVEKSAATENLESSSSKSMQNNRDKSDGVRKTELSIEETNKLRLSLGLRPIPVDSNSGSGGVASGESRENNSSQSNELEQRINRLKRKPKNEESEIKKRKKAVTSLLWEDADSSEDTSSWLNKLGKDTKIQSQTQRKQTPEAATDPDMAIGHSSRELASIKDGEILTLKDTDILDTEDLKDLLENEKLNSAKKLKKDMREKKRQNDISFNGRTSYEENEGEAEEEEEETAITGSTIFLPSKEEPEERDSKPQGHTMKLLGLFDEDEDMHLGNDYSKPKKPVKMKKLLKKLKLKLKDRNKTAEEVEYAPLQRVELEGMNEKETFEEEDELQLILALKRRQKQQSRSRLTPEQIAQEVKQNKQWEMMNEIEERSNLSSSGMVFDYTTDFLNTLTPNEEPKVNSSDEIRVKEEPSSLVKEEPSSLVKEKPSSLVKEEPSSLVKEEPSILVKAESGDSIKEEPNSTKQEPTSSAREQTQFSLGLAGTLKFLQSKNIINKPTSEQQEHNKKQREAVKEAELLKLQLSIEERIVTQELQADKKFINLPKEERTIKIQEEVENRLRAKGVLPQIETNKRGRYNKPADRLSGYNPQVKLDYRDEEGHELNTKEAFKFLSHKFHGVGPGKAKTEKKLRKQHDLNSSNTTERIIE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.27
2 0.25
3 0.25
4 0.26
5 0.31
6 0.35
7 0.36
8 0.3
9 0.31
10 0.33
11 0.3
12 0.29
13 0.21
14 0.15
15 0.12
16 0.14
17 0.12
18 0.12
19 0.13
20 0.14
21 0.16
22 0.17
23 0.16
24 0.17
25 0.22
26 0.21
27 0.25
28 0.3
29 0.37
30 0.46
31 0.56
32 0.61
33 0.61
34 0.63
35 0.6
36 0.6
37 0.62
38 0.59
39 0.56
40 0.54
41 0.5
42 0.48
43 0.52
44 0.48
45 0.43
46 0.41
47 0.38
48 0.38
49 0.39
50 0.39
51 0.35
52 0.33
53 0.27
54 0.25
55 0.25
56 0.26
57 0.32
58 0.34
59 0.34
60 0.35
61 0.36
62 0.36
63 0.33
64 0.28
65 0.21
66 0.19
67 0.19
68 0.18
69 0.16
70 0.13
71 0.12
72 0.09
73 0.09
74 0.06
75 0.07
76 0.09
77 0.09
78 0.12
79 0.15
80 0.15
81 0.17
82 0.2
83 0.2
84 0.21
85 0.23
86 0.25
87 0.27
88 0.29
89 0.32
90 0.3
91 0.37
92 0.45
93 0.5
94 0.53
95 0.59
96 0.66
97 0.7
98 0.8
99 0.82
100 0.83
101 0.84
102 0.86
103 0.87
104 0.85
105 0.87
106 0.86
107 0.84
108 0.79
109 0.76
110 0.74
111 0.71
112 0.69
113 0.67
114 0.66
115 0.66
116 0.67
117 0.64
118 0.57
119 0.49
120 0.43
121 0.34
122 0.26
123 0.19
124 0.14
125 0.09
126 0.09
127 0.1
128 0.11
129 0.11
130 0.1
131 0.16
132 0.17
133 0.18
134 0.26
135 0.31
136 0.33
137 0.38
138 0.41
139 0.43
140 0.48
141 0.51
142 0.53
143 0.59
144 0.64
145 0.69
146 0.72
147 0.66
148 0.64
149 0.66
150 0.62
151 0.55
152 0.5
153 0.44
154 0.39
155 0.38
156 0.32
157 0.28
158 0.21
159 0.17
160 0.15
161 0.1
162 0.09
163 0.08
164 0.09
165 0.07
166 0.1
167 0.1
168 0.1
169 0.13
170 0.13
171 0.13
172 0.16
173 0.16
174 0.14
175 0.15
176 0.15
177 0.13
178 0.13
179 0.12
180 0.11
181 0.11
182 0.11
183 0.1
184 0.11
185 0.11
186 0.11
187 0.12
188 0.11
189 0.11
190 0.11
191 0.1
192 0.1
193 0.11
194 0.13
195 0.12
196 0.12
197 0.16
198 0.18
199 0.19
200 0.23
201 0.28
202 0.3
203 0.34
204 0.44
205 0.46
206 0.55
207 0.65
208 0.7
209 0.75
210 0.81
211 0.86
212 0.84
213 0.88
214 0.87
215 0.81
216 0.79
217 0.73
218 0.71
219 0.64
220 0.55
221 0.46
222 0.38
223 0.35
224 0.27
225 0.26
226 0.2
227 0.17
228 0.17
229 0.16
230 0.16
231 0.15
232 0.14
233 0.11
234 0.07
235 0.07
236 0.06
237 0.05
238 0.05
239 0.04
240 0.04
241 0.03
242 0.03
243 0.03
244 0.03
245 0.04
246 0.05
247 0.05
248 0.05
249 0.1
250 0.1
251 0.13
252 0.16
253 0.16
254 0.17
255 0.23
256 0.29
257 0.27
258 0.34
259 0.33
260 0.34
261 0.35
262 0.39
263 0.36
264 0.31
265 0.31
266 0.25
267 0.26
268 0.24
269 0.23
270 0.16
271 0.14
272 0.12
273 0.11
274 0.11
275 0.07
276 0.06
277 0.06
278 0.06
279 0.05
280 0.05
281 0.05
282 0.05
283 0.09
284 0.12
285 0.16
286 0.19
287 0.24
288 0.28
289 0.35
290 0.45
291 0.52
292 0.58
293 0.66
294 0.72
295 0.76
296 0.83
297 0.85
298 0.84
299 0.83
300 0.81
301 0.79
302 0.8
303 0.79
304 0.78
305 0.8
306 0.8
307 0.75
308 0.75
309 0.67
310 0.6
311 0.53
312 0.46
313 0.37
314 0.3
315 0.26
316 0.19
317 0.18
318 0.15
319 0.13
320 0.1
321 0.08
322 0.07
323 0.07
324 0.06
325 0.07
326 0.1
327 0.11
328 0.12
329 0.12
330 0.12
331 0.11
332 0.11
333 0.11
334 0.08
335 0.09
336 0.07
337 0.08
338 0.08
339 0.08
340 0.07
341 0.07
342 0.06
343 0.06
344 0.1
345 0.13
346 0.17
347 0.21
348 0.29
349 0.37
350 0.45
351 0.55
352 0.61
353 0.69
354 0.73
355 0.73
356 0.73
357 0.7
358 0.63
359 0.58
360 0.5
361 0.42
362 0.36
363 0.33
364 0.27
365 0.28
366 0.3
367 0.26
368 0.29
369 0.28
370 0.26
371 0.28
372 0.3
373 0.24
374 0.25
375 0.25
376 0.23
377 0.22
378 0.22
379 0.18
380 0.17
381 0.16
382 0.13
383 0.11
384 0.09
385 0.08
386 0.08
387 0.08
388 0.1
389 0.08
390 0.07
391 0.07
392 0.07
393 0.08
394 0.08
395 0.09
396 0.07
397 0.07
398 0.07
399 0.09
400 0.09
401 0.08
402 0.09
403 0.09
404 0.11
405 0.12
406 0.14
407 0.13
408 0.15
409 0.18
410 0.17
411 0.18
412 0.18
413 0.24
414 0.27
415 0.29
416 0.28
417 0.26
418 0.27
419 0.27
420 0.26
421 0.21
422 0.2
423 0.21
424 0.2
425 0.2
426 0.19
427 0.19
428 0.19
429 0.19
430 0.17
431 0.17
432 0.18
433 0.19
434 0.21
435 0.22
436 0.22
437 0.25
438 0.28
439 0.28
440 0.3
441 0.33
442 0.33
443 0.34
444 0.34
445 0.3
446 0.28
447 0.27
448 0.23
449 0.19
450 0.17
451 0.15
452 0.15
453 0.14
454 0.14
455 0.13
456 0.12
457 0.11
458 0.11
459 0.11
460 0.11
461 0.1
462 0.09
463 0.08
464 0.1
465 0.12
466 0.13
467 0.14
468 0.15
469 0.17
470 0.23
471 0.3
472 0.3
473 0.31
474 0.31
475 0.33
476 0.36
477 0.38
478 0.39
479 0.35
480 0.37
481 0.37
482 0.39
483 0.37
484 0.34
485 0.33
486 0.26
487 0.22
488 0.21
489 0.16
490 0.15
491 0.14
492 0.12
493 0.1
494 0.1
495 0.1
496 0.11
497 0.11
498 0.13
499 0.16
500 0.23
501 0.31
502 0.38
503 0.41
504 0.39
505 0.42
506 0.44
507 0.49
508 0.47
509 0.44
510 0.41
511 0.48
512 0.59
513 0.64
514 0.68
515 0.69
516 0.64
517 0.67
518 0.7
519 0.67
520 0.61
521 0.58
522 0.54
523 0.51
524 0.51
525 0.47
526 0.4
527 0.34
528 0.28
529 0.25
530 0.18
531 0.15
532 0.16
533 0.15
534 0.15
535 0.15
536 0.15
537 0.16
538 0.17
539 0.15
540 0.13
541 0.16
542 0.18
543 0.22
544 0.22
545 0.22
546 0.21
547 0.25
548 0.31
549 0.3
550 0.35
551 0.36
552 0.41
553 0.46
554 0.54
555 0.53
556 0.49
557 0.51
558 0.5
559 0.46
560 0.46
561 0.42
562 0.41
563 0.43
564 0.47
565 0.47
566 0.47
567 0.46
568 0.41
569 0.38
570 0.33
571 0.3
572 0.3
573 0.32
574 0.32
575 0.34
576 0.39
577 0.46
578 0.53
579 0.55
580 0.53
581 0.53
582 0.55
583 0.59
584 0.59
585 0.62
586 0.65
587 0.71
588 0.75
589 0.72
590 0.69
591 0.68
592 0.65
593 0.6
594 0.59
595 0.54
596 0.51
597 0.47
598 0.44
599 0.42
600 0.41
601 0.41
602 0.37
603 0.36
604 0.33
605 0.37
606 0.38
607 0.39
608 0.39
609 0.36
610 0.35
611 0.32
612 0.29
613 0.29
614 0.28
615 0.23
616 0.23
617 0.21
618 0.19
619 0.26
620 0.3
621 0.36
622 0.38
623 0.41
624 0.4
625 0.42
626 0.5
627 0.47
628 0.48
629 0.44
630 0.47
631 0.48
632 0.53
633 0.54
634 0.52
635 0.59
636 0.63
637 0.67
638 0.72
639 0.76
640 0.8
641 0.85
642 0.86
643 0.86
644 0.81
645 0.76
646 0.73
647 0.69
648 0.61
649 0.52