Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1E4RT04

Protein Details
Accession A0A1E4RT04    Localization Confidence High Confidence Score 20.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
135-159PDDLKWVKRGKNKRQMVKRKQILSVHydrophilic
296-317LDGKKHKKNISKQKPINPARLSHydrophilic
465-485EAMELWKRLKREKRAQTTDLEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
142-152KRGKNKRQMVK
299-309KKHKKNISKQK
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 14.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003604  Matrin/U1-like-C_Znf_C2H2  
IPR031590  PRP9_N  
IPR031774  SF3A3_dom  
IPR024598  SF3a60/Prp9_C  
IPR022755  Znf_C2H2_jaz  
IPR036236  Znf_C2H2_sf  
IPR013087  Znf_C2H2_type  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF16958  PRP9_N  
PF16837  SF3A3  
PF11931  SF3a60_Prp9_C  
PF12171  zf-C2H2_jaz  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00028  ZINC_FINGER_C2H2_1  
Amino Acid Sequences MSRFIEPQRFLLEEIDAIEQAVATRLRRYPHLLPNSDTSSQSQRPSKETLLQKHELRFFFDKYKKQCSLFLENYENRKDIFSNELKSLNDPSRDFQQFDNLLKFVNSRHEVGDTDEIEPAEDTIRLYSMYSSALPDDLKWVKRGKNKRQMVKRKQILSVAASHINIDSLFNPKEEYGKFIDLSELFPLYQSLQSQETQSANQITYLEYLSLFLKFPYDNVDNHSSIYNDYLNKLLAYLSNFYARAYPYENISELLNRISDSFDPSANDGKPNENGEVYCNACDKVFTKDSVYKGHLDGKKHKKNISKQKPINPARLSEHKISQLALKLSPITEATISNHERKAALTEREKMLEDLSTKENDLEYTTADESSDDEANNSGSDFDSDDEDTKSLPLGIDGRPVPHWLYKLQGLNRTYDCEICGNATYKGPVLFNKHFSTPKHQHGLKCLGVDETCLPIFKNITKISEAMELWKRLKREKRAQTTDLENAVEVEDDEGNVMSEKDYLELKRQGLL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.21
2 0.2
3 0.15
4 0.14
5 0.12
6 0.1
7 0.09
8 0.12
9 0.13
10 0.12
11 0.17
12 0.21
13 0.24
14 0.28
15 0.36
16 0.41
17 0.48
18 0.57
19 0.57
20 0.57
21 0.61
22 0.62
23 0.57
24 0.5
25 0.44
26 0.43
27 0.43
28 0.47
29 0.47
30 0.44
31 0.46
32 0.5
33 0.51
34 0.51
35 0.56
36 0.58
37 0.59
38 0.63
39 0.64
40 0.65
41 0.68
42 0.6
43 0.58
44 0.53
45 0.49
46 0.52
47 0.55
48 0.56
49 0.56
50 0.64
51 0.63
52 0.61
53 0.63
54 0.6
55 0.62
56 0.59
57 0.58
58 0.58
59 0.58
60 0.62
61 0.59
62 0.53
63 0.44
64 0.4
65 0.34
66 0.27
67 0.3
68 0.3
69 0.3
70 0.32
71 0.35
72 0.33
73 0.35
74 0.38
75 0.35
76 0.35
77 0.33
78 0.33
79 0.38
80 0.4
81 0.39
82 0.34
83 0.38
84 0.37
85 0.39
86 0.39
87 0.31
88 0.28
89 0.27
90 0.27
91 0.2
92 0.25
93 0.24
94 0.22
95 0.23
96 0.24
97 0.24
98 0.28
99 0.32
100 0.24
101 0.22
102 0.22
103 0.21
104 0.2
105 0.19
106 0.15
107 0.1
108 0.09
109 0.08
110 0.07
111 0.07
112 0.07
113 0.08
114 0.08
115 0.08
116 0.09
117 0.09
118 0.09
119 0.09
120 0.1
121 0.1
122 0.1
123 0.15
124 0.19
125 0.2
126 0.23
127 0.28
128 0.34
129 0.43
130 0.54
131 0.58
132 0.64
133 0.71
134 0.77
135 0.83
136 0.88
137 0.89
138 0.9
139 0.87
140 0.81
141 0.76
142 0.7
143 0.62
144 0.53
145 0.46
146 0.38
147 0.32
148 0.27
149 0.24
150 0.2
151 0.17
152 0.14
153 0.11
154 0.09
155 0.11
156 0.12
157 0.11
158 0.13
159 0.12
160 0.17
161 0.16
162 0.19
163 0.18
164 0.2
165 0.2
166 0.19
167 0.21
168 0.17
169 0.18
170 0.16
171 0.12
172 0.1
173 0.1
174 0.1
175 0.09
176 0.09
177 0.09
178 0.1
179 0.11
180 0.12
181 0.13
182 0.15
183 0.15
184 0.15
185 0.16
186 0.16
187 0.14
188 0.14
189 0.13
190 0.11
191 0.11
192 0.11
193 0.09
194 0.07
195 0.08
196 0.08
197 0.08
198 0.08
199 0.06
200 0.08
201 0.07
202 0.07
203 0.12
204 0.14
205 0.14
206 0.18
207 0.23
208 0.22
209 0.23
210 0.23
211 0.18
212 0.16
213 0.17
214 0.15
215 0.11
216 0.11
217 0.11
218 0.11
219 0.1
220 0.1
221 0.09
222 0.07
223 0.09
224 0.1
225 0.1
226 0.11
227 0.12
228 0.11
229 0.13
230 0.12
231 0.12
232 0.13
233 0.13
234 0.13
235 0.14
236 0.14
237 0.13
238 0.13
239 0.12
240 0.09
241 0.09
242 0.08
243 0.07
244 0.07
245 0.07
246 0.07
247 0.1
248 0.11
249 0.11
250 0.11
251 0.13
252 0.16
253 0.15
254 0.17
255 0.14
256 0.15
257 0.17
258 0.18
259 0.17
260 0.14
261 0.14
262 0.14
263 0.16
264 0.15
265 0.13
266 0.12
267 0.12
268 0.11
269 0.12
270 0.11
271 0.14
272 0.15
273 0.15
274 0.18
275 0.22
276 0.24
277 0.28
278 0.29
279 0.25
280 0.25
281 0.32
282 0.32
283 0.32
284 0.4
285 0.47
286 0.54
287 0.57
288 0.61
289 0.62
290 0.69
291 0.75
292 0.76
293 0.76
294 0.75
295 0.79
296 0.84
297 0.81
298 0.81
299 0.71
300 0.63
301 0.58
302 0.58
303 0.53
304 0.46
305 0.43
306 0.37
307 0.36
308 0.32
309 0.29
310 0.26
311 0.23
312 0.2
313 0.17
314 0.15
315 0.14
316 0.15
317 0.13
318 0.1
319 0.09
320 0.09
321 0.11
322 0.17
323 0.2
324 0.22
325 0.23
326 0.23
327 0.22
328 0.21
329 0.25
330 0.24
331 0.28
332 0.29
333 0.34
334 0.35
335 0.36
336 0.37
337 0.32
338 0.26
339 0.22
340 0.19
341 0.17
342 0.18
343 0.17
344 0.16
345 0.16
346 0.16
347 0.14
348 0.14
349 0.11
350 0.09
351 0.11
352 0.12
353 0.11
354 0.11
355 0.11
356 0.1
357 0.13
358 0.13
359 0.1
360 0.1
361 0.1
362 0.11
363 0.11
364 0.09
365 0.07
366 0.06
367 0.07
368 0.07
369 0.07
370 0.09
371 0.1
372 0.12
373 0.12
374 0.12
375 0.12
376 0.11
377 0.11
378 0.09
379 0.08
380 0.08
381 0.1
382 0.1
383 0.16
384 0.16
385 0.18
386 0.18
387 0.21
388 0.21
389 0.22
390 0.23
391 0.19
392 0.22
393 0.26
394 0.32
395 0.34
396 0.39
397 0.37
398 0.4
399 0.41
400 0.42
401 0.37
402 0.31
403 0.29
404 0.23
405 0.22
406 0.19
407 0.21
408 0.18
409 0.18
410 0.18
411 0.18
412 0.18
413 0.19
414 0.19
415 0.2
416 0.26
417 0.3
418 0.34
419 0.36
420 0.4
421 0.44
422 0.45
423 0.52
424 0.52
425 0.56
426 0.6
427 0.61
428 0.6
429 0.63
430 0.67
431 0.6
432 0.53
433 0.45
434 0.38
435 0.33
436 0.32
437 0.26
438 0.22
439 0.19
440 0.17
441 0.17
442 0.17
443 0.2
444 0.2
445 0.26
446 0.25
447 0.28
448 0.3
449 0.3
450 0.3
451 0.33
452 0.3
453 0.29
454 0.33
455 0.35
456 0.37
457 0.41
458 0.42
459 0.46
460 0.55
461 0.59
462 0.63
463 0.69
464 0.76
465 0.81
466 0.81
467 0.79
468 0.76
469 0.72
470 0.65
471 0.54
472 0.43
473 0.35
474 0.31
475 0.24
476 0.17
477 0.13
478 0.09
479 0.08
480 0.09
481 0.08
482 0.08
483 0.09
484 0.09
485 0.07
486 0.08
487 0.09
488 0.1
489 0.14
490 0.16
491 0.23
492 0.29