Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1E4RLH4

Protein Details
Accession A0A1E4RLH4    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
82-109RAAVQSVRRNRKRATKSKRNIRDDTYKEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
89-101RRNRKRATKSKRN
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 13, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036389  RNase_III_sf  
IPR007147  TF_Vhr  
Gene Ontology GO:0004525  F:ribonuclease III activity  
GO:0006396  P:RNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF04001  Vhr1  
Amino Acid Sequences MTKSEKDKSHGVTHTIRERLNFLDERLWKRFSARRLELIDTLELSTRKASEQELEISNVAETLRIEFGFGPDSFSDFDRLVRAAVQSVRRNRKRATKSKRNIRDDTYKEQNKRIKRDLESNTLSPEDPLTVDPVSVAATAPYALNDSLSSKNQNHDNTVEHLSKYKFMSEICKLNSDSQDEKSDYSKTKHFTVQDKSREAINAIIQPRLTKLTPSQPSPSYDLRPKTSAPTLPPLGNLNIRNSPQININNNNNNKAPFENETQFIPSSNIFDPSANLALLNYFERSKTCSEAGHAKNVSNLEHLGKSAIGCCSAFIFEKSFLTATHSSVEYLRSKLNDTHYISNFYKSLDPHSSVVFGLNDETAVTTLYTLIGGCIKDFGFETIMYTLCEAFYQRLTQDYPLISKHSIPFKSYNYLYNKPPLNDNKNNITQDDHLPDSLTSLAEVASELQDQLKHQHNFGTITPVASQSSQQSPLPPDSVSSSTRSSFLKGGARKAVFLKFLSQQLEFSYPTSNSAPPKLLELLENAKSAFKLTNSNDSRILGLKNLKTGQILSSDSDLEKIFKTNDNHIELEIFTQSFKAIPIYEITSAIIPSRKYNDDSPKIILPPPINNASPPIPPPNPTTIKTPLDSIVRPEGGLRFLSNQEDLPPSRPPPPPPAALLPKFQPLL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.62
2 0.6
3 0.56
4 0.49
5 0.48
6 0.44
7 0.45
8 0.39
9 0.33
10 0.36
11 0.42
12 0.47
13 0.49
14 0.49
15 0.42
16 0.47
17 0.51
18 0.5
19 0.53
20 0.52
21 0.55
22 0.57
23 0.61
24 0.57
25 0.54
26 0.48
27 0.38
28 0.33
29 0.29
30 0.24
31 0.21
32 0.2
33 0.18
34 0.17
35 0.18
36 0.19
37 0.19
38 0.22
39 0.26
40 0.27
41 0.28
42 0.27
43 0.26
44 0.24
45 0.2
46 0.16
47 0.12
48 0.1
49 0.1
50 0.11
51 0.11
52 0.12
53 0.12
54 0.13
55 0.16
56 0.16
57 0.17
58 0.15
59 0.18
60 0.18
61 0.18
62 0.2
63 0.16
64 0.17
65 0.16
66 0.16
67 0.15
68 0.15
69 0.15
70 0.17
71 0.22
72 0.29
73 0.35
74 0.44
75 0.55
76 0.61
77 0.66
78 0.69
79 0.74
80 0.77
81 0.8
82 0.81
83 0.81
84 0.85
85 0.89
86 0.93
87 0.91
88 0.87
89 0.84
90 0.83
91 0.78
92 0.76
93 0.76
94 0.74
95 0.7
96 0.72
97 0.72
98 0.7
99 0.73
100 0.73
101 0.7
102 0.67
103 0.72
104 0.7
105 0.72
106 0.69
107 0.61
108 0.56
109 0.49
110 0.43
111 0.34
112 0.27
113 0.19
114 0.14
115 0.13
116 0.13
117 0.11
118 0.11
119 0.1
120 0.1
121 0.1
122 0.09
123 0.08
124 0.05
125 0.05
126 0.06
127 0.06
128 0.06
129 0.07
130 0.07
131 0.07
132 0.08
133 0.11
134 0.14
135 0.17
136 0.21
137 0.22
138 0.26
139 0.33
140 0.34
141 0.35
142 0.34
143 0.34
144 0.33
145 0.37
146 0.35
147 0.28
148 0.31
149 0.29
150 0.3
151 0.28
152 0.25
153 0.21
154 0.21
155 0.27
156 0.27
157 0.33
158 0.31
159 0.34
160 0.34
161 0.37
162 0.39
163 0.38
164 0.36
165 0.32
166 0.35
167 0.32
168 0.32
169 0.29
170 0.31
171 0.3
172 0.31
173 0.33
174 0.31
175 0.33
176 0.37
177 0.41
178 0.43
179 0.49
180 0.55
181 0.57
182 0.57
183 0.54
184 0.5
185 0.46
186 0.39
187 0.32
188 0.26
189 0.24
190 0.22
191 0.22
192 0.2
193 0.2
194 0.21
195 0.21
196 0.18
197 0.15
198 0.18
199 0.26
200 0.3
201 0.33
202 0.37
203 0.36
204 0.39
205 0.42
206 0.42
207 0.38
208 0.4
209 0.41
210 0.4
211 0.4
212 0.38
213 0.37
214 0.38
215 0.36
216 0.32
217 0.34
218 0.33
219 0.31
220 0.31
221 0.29
222 0.26
223 0.28
224 0.26
225 0.23
226 0.25
227 0.25
228 0.27
229 0.25
230 0.24
231 0.26
232 0.3
233 0.32
234 0.34
235 0.4
236 0.46
237 0.47
238 0.49
239 0.44
240 0.39
241 0.35
242 0.3
243 0.26
244 0.21
245 0.24
246 0.23
247 0.23
248 0.22
249 0.23
250 0.22
251 0.2
252 0.18
253 0.13
254 0.14
255 0.13
256 0.15
257 0.13
258 0.13
259 0.13
260 0.14
261 0.14
262 0.11
263 0.1
264 0.08
265 0.07
266 0.08
267 0.08
268 0.07
269 0.07
270 0.07
271 0.08
272 0.11
273 0.12
274 0.14
275 0.14
276 0.14
277 0.16
278 0.25
279 0.26
280 0.31
281 0.3
282 0.27
283 0.29
284 0.29
285 0.27
286 0.19
287 0.18
288 0.13
289 0.12
290 0.12
291 0.1
292 0.09
293 0.09
294 0.09
295 0.08
296 0.07
297 0.07
298 0.07
299 0.07
300 0.08
301 0.08
302 0.07
303 0.09
304 0.09
305 0.09
306 0.1
307 0.09
308 0.09
309 0.14
310 0.14
311 0.13
312 0.14
313 0.14
314 0.14
315 0.14
316 0.17
317 0.13
318 0.13
319 0.14
320 0.13
321 0.15
322 0.17
323 0.21
324 0.25
325 0.26
326 0.31
327 0.31
328 0.36
329 0.35
330 0.34
331 0.3
332 0.24
333 0.23
334 0.18
335 0.21
336 0.18
337 0.2
338 0.19
339 0.19
340 0.19
341 0.16
342 0.17
343 0.12
344 0.09
345 0.08
346 0.07
347 0.06
348 0.05
349 0.05
350 0.04
351 0.04
352 0.04
353 0.03
354 0.04
355 0.04
356 0.04
357 0.04
358 0.04
359 0.05
360 0.05
361 0.05
362 0.06
363 0.06
364 0.07
365 0.07
366 0.08
367 0.07
368 0.07
369 0.08
370 0.08
371 0.09
372 0.08
373 0.08
374 0.07
375 0.06
376 0.06
377 0.06
378 0.06
379 0.07
380 0.08
381 0.08
382 0.1
383 0.11
384 0.12
385 0.14
386 0.14
387 0.15
388 0.15
389 0.18
390 0.16
391 0.17
392 0.2
393 0.25
394 0.25
395 0.26
396 0.3
397 0.3
398 0.34
399 0.34
400 0.37
401 0.36
402 0.39
403 0.39
404 0.41
405 0.42
406 0.37
407 0.43
408 0.45
409 0.47
410 0.5
411 0.52
412 0.52
413 0.55
414 0.55
415 0.49
416 0.42
417 0.36
418 0.33
419 0.32
420 0.26
421 0.19
422 0.19
423 0.18
424 0.17
425 0.15
426 0.11
427 0.07
428 0.06
429 0.06
430 0.05
431 0.05
432 0.05
433 0.05
434 0.05
435 0.05
436 0.06
437 0.07
438 0.08
439 0.13
440 0.21
441 0.21
442 0.22
443 0.25
444 0.26
445 0.28
446 0.28
447 0.3
448 0.21
449 0.21
450 0.21
451 0.19
452 0.18
453 0.16
454 0.17
455 0.13
456 0.16
457 0.18
458 0.18
459 0.2
460 0.22
461 0.24
462 0.24
463 0.21
464 0.19
465 0.2
466 0.23
467 0.21
468 0.21
469 0.22
470 0.21
471 0.23
472 0.23
473 0.22
474 0.2
475 0.22
476 0.27
477 0.27
478 0.31
479 0.37
480 0.36
481 0.36
482 0.38
483 0.37
484 0.32
485 0.3
486 0.29
487 0.24
488 0.28
489 0.29
490 0.26
491 0.24
492 0.23
493 0.26
494 0.22
495 0.2
496 0.19
497 0.16
498 0.19
499 0.21
500 0.22
501 0.22
502 0.24
503 0.26
504 0.22
505 0.25
506 0.24
507 0.22
508 0.2
509 0.21
510 0.23
511 0.24
512 0.24
513 0.21
514 0.2
515 0.19
516 0.2
517 0.17
518 0.14
519 0.19
520 0.21
521 0.32
522 0.35
523 0.38
524 0.38
525 0.37
526 0.37
527 0.32
528 0.3
529 0.25
530 0.28
531 0.27
532 0.3
533 0.31
534 0.31
535 0.29
536 0.29
537 0.25
538 0.23
539 0.23
540 0.18
541 0.19
542 0.19
543 0.18
544 0.19
545 0.18
546 0.15
547 0.15
548 0.15
549 0.16
550 0.21
551 0.25
552 0.31
553 0.38
554 0.41
555 0.41
556 0.39
557 0.38
558 0.31
559 0.29
560 0.23
561 0.16
562 0.11
563 0.11
564 0.1
565 0.1
566 0.1
567 0.1
568 0.09
569 0.1
570 0.13
571 0.16
572 0.16
573 0.17
574 0.17
575 0.16
576 0.15
577 0.17
578 0.18
579 0.15
580 0.19
581 0.24
582 0.27
583 0.3
584 0.38
585 0.46
586 0.5
587 0.52
588 0.53
589 0.52
590 0.51
591 0.5
592 0.47
593 0.4
594 0.38
595 0.4
596 0.41
597 0.37
598 0.35
599 0.37
600 0.34
601 0.34
602 0.32
603 0.35
604 0.32
605 0.34
606 0.38
607 0.43
608 0.45
609 0.44
610 0.47
611 0.47
612 0.49
613 0.47
614 0.45
615 0.41
616 0.41
617 0.4
618 0.39
619 0.38
620 0.34
621 0.33
622 0.32
623 0.3
624 0.27
625 0.27
626 0.23
627 0.2
628 0.22
629 0.25
630 0.24
631 0.23
632 0.23
633 0.28
634 0.28
635 0.28
636 0.32
637 0.31
638 0.38
639 0.43
640 0.45
641 0.48
642 0.52
643 0.52
644 0.51
645 0.58
646 0.6
647 0.58
648 0.58
649 0.52