FuNGI

A0A1E4RH87

Protein Details

Accession

A0A1E4RH87

Localization Confidence

High

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
93-113	NNNFTKPVRMHRKDPRNIQFQ	Hydrophilic
168-193	PDGGARKPKKNVFKRKTKQINLMAEE	Hydrophilic
497-525	NPNVKKRQIETNKSPKKKAKLERDSTPSQ	Hydrophilic
584-603	LVRLRNRVNAHKDNKQRIIT	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
172-185	ARKPKKNVFKRKTK
405-407	GKK
507-516	TNKSPKKKAK

Subcellular Location(s)

nucl 26

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter
Pfam	View protein in Pfam PF05793 TFIIF_alpha

Amino Acid Sequences

MSQLPVKKEPTVKSEPIDVFSPSSSFNGDATGRPSPSAASNGNTPNSNGSRPPVVKKEAKWQDIPLKCCTKAELDDIRYHILRFQTKQDVDINNNFTKPVRMHRKDPRNIQFQLTREEIDRRKRDQEARKLETDRAQEDEADSQAADEVDAASDAAKRNQADMSQVAPDGGARKPKKNVFKRKTKQINLMAEEKRKLRYEEYYPWVLEDYSGKNVFVGNYEAGSSDTQHVLFVFDKDGFKMVPAEKVYKFTPRNKYATLTLEEAEAKMEKNATTPRWLMKHMHDNSSSEGATPDMRFRHASTNGNAAVGGSSSRGRRMRTVTGGETNDRDSDHDDIDFDEEFADDEEAPIMDGDEEENKLSEKKIKREMMKAAHFDGQSDADMEDDDDLNDLFETEKSRKVDKEGKKLRKVLNKTEGGVYDSDDNEETNPPYVSQSDLESGNDSEDDETKVKEEPNDSLSNEVQNVRAFTARNVGDGFVVIKAPKDFLNGFPKGEWNPNVKKRQIETNKSPKKKAKLERDSTPSQTTSPQVKKEKQSVSPSPTPAATNLANVDLNSGGPNNEYVTVKEVLDIVSNNPLTTKELLVRLRNRVNAHKDNKQRIITIVKQTLKLVDGKLVLKDENR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.58
2	0.53
3	0.49
4	0.46
5	0.39
6	0.33
7	0.29
8	0.27
9	0.2
10	0.19
11	0.18
12	0.17
13	0.15
14	0.17
15	0.18
16	0.19
17	0.22
18	0.26
19	0.25
20	0.24
21	0.24
22	0.22
23	0.23
24	0.27
25	0.25
26	0.22
27	0.28
28	0.33
29	0.35
30	0.35
31	0.33
32	0.35
33	0.36
34	0.36
35	0.32
36	0.31
37	0.37
38	0.4
39	0.46
40	0.46
41	0.5
42	0.54
43	0.56
44	0.63
45	0.64
46	0.65
47	0.61
48	0.62
49	0.64
50	0.64
51	0.64
52	0.61
53	0.58
54	0.54
55	0.51
56	0.46
57	0.41
58	0.38
59	0.42
60	0.43
61	0.4
62	0.44
63	0.45
64	0.47
65	0.42
66	0.39
67	0.34
68	0.32
69	0.34
70	0.32
71	0.37
72	0.42
73	0.42
74	0.45
75	0.49
76	0.47
77	0.47
78	0.51
79	0.51
80	0.44
81	0.43
82	0.41
83	0.34
84	0.34
85	0.31
86	0.34
87	0.39
88	0.42
89	0.51
90	0.61
91	0.72
92	0.76
93	0.83
94	0.82
95	0.79
96	0.76
97	0.73
98	0.68
99	0.6
100	0.57
101	0.49
102	0.41
103	0.35
104	0.41
105	0.41
106	0.46
107	0.5
108	0.5
109	0.54
110	0.6
111	0.67
112	0.69
113	0.73
114	0.73
115	0.72
116	0.74
117	0.71
118	0.67
119	0.63
120	0.58
121	0.49
122	0.43
123	0.38
124	0.31
125	0.29
126	0.27
127	0.21
128	0.16
129	0.14
130	0.1
131	0.1
132	0.09
133	0.07
134	0.06
135	0.05
136	0.05
137	0.05
138	0.05
139	0.04
140	0.07
141	0.08
142	0.1
143	0.13
144	0.14
145	0.15
146	0.17
147	0.17
148	0.18
149	0.19
150	0.19
151	0.16
152	0.16
153	0.14
154	0.13
155	0.13
156	0.12
157	0.13
158	0.2
159	0.22
160	0.28
161	0.35
162	0.43
163	0.53
164	0.61
165	0.71
166	0.71
167	0.79
168	0.83
169	0.86
170	0.9
171	0.86
172	0.85
173	0.83
174	0.81
175	0.74
176	0.73
177	0.68
178	0.62
179	0.58
180	0.51
181	0.46
182	0.4
183	0.39
184	0.34
185	0.34
186	0.36
187	0.4
188	0.43
189	0.43
190	0.4
191	0.38
192	0.36
193	0.29
194	0.23
195	0.18
196	0.15
197	0.17
198	0.17
199	0.16
200	0.16
201	0.17
202	0.16
203	0.14
204	0.14
205	0.09
206	0.09
207	0.09
208	0.09
209	0.1
210	0.1
211	0.1
212	0.09
213	0.1
214	0.09
215	0.09
216	0.09
217	0.1
218	0.1
219	0.1
220	0.09
221	0.11
222	0.11
223	0.11
224	0.12
225	0.1
226	0.1
227	0.13
228	0.12
229	0.15
230	0.17
231	0.21
232	0.21
233	0.24
234	0.25
235	0.3
236	0.34
237	0.38
238	0.46
239	0.48
240	0.51
241	0.5
242	0.52
243	0.47
244	0.45
245	0.4
246	0.32
247	0.26
248	0.23
249	0.21
250	0.18
251	0.15
252	0.11
253	0.09
254	0.07
255	0.08
256	0.07
257	0.1
258	0.14
259	0.14
260	0.17
261	0.19
262	0.22
263	0.24
264	0.26
265	0.26
266	0.28
267	0.37
268	0.35
269	0.38
270	0.36
271	0.35
272	0.35
273	0.34
274	0.29
275	0.19
276	0.16
277	0.12
278	0.12
279	0.11
280	0.12
281	0.1
282	0.12
283	0.13
284	0.14
285	0.2
286	0.23
287	0.26
288	0.24
289	0.29
290	0.28
291	0.27
292	0.25
293	0.18
294	0.14
295	0.1
296	0.09
297	0.05
298	0.06
299	0.07
300	0.12
301	0.15
302	0.16
303	0.2
304	0.24
305	0.27
306	0.3
307	0.33
308	0.3
309	0.33
310	0.33
311	0.31
312	0.27
313	0.24
314	0.2
315	0.17
316	0.15
317	0.12
318	0.12
319	0.12
320	0.11
321	0.1
322	0.09
323	0.11
324	0.1
325	0.08
326	0.06
327	0.06
328	0.06
329	0.06
330	0.06
331	0.04
332	0.04
333	0.04
334	0.04
335	0.04
336	0.04
337	0.04
338	0.03
339	0.03
340	0.04
341	0.05
342	0.05
343	0.05
344	0.06
345	0.06
346	0.07
347	0.08
348	0.15
349	0.19
350	0.25
351	0.34
352	0.41
353	0.45
354	0.5
355	0.57
356	0.58
357	0.58
358	0.55
359	0.48
360	0.46
361	0.42
362	0.36
363	0.3
364	0.22
365	0.16
366	0.15
367	0.12
368	0.07
369	0.07
370	0.07
371	0.06
372	0.05
373	0.05
374	0.05
375	0.05
376	0.05
377	0.05
378	0.05
379	0.04
380	0.05
381	0.09
382	0.1
383	0.16
384	0.18
385	0.21
386	0.22
387	0.28
388	0.37
389	0.42
390	0.52
391	0.58
392	0.65
393	0.7
394	0.77
395	0.77
396	0.77
397	0.75
398	0.74
399	0.73
400	0.66
401	0.6
402	0.55
403	0.49
404	0.41
405	0.34
406	0.26
407	0.19
408	0.15
409	0.15
410	0.12
411	0.11
412	0.11
413	0.12
414	0.12
415	0.11
416	0.11
417	0.1
418	0.12
419	0.12
420	0.12
421	0.11
422	0.12
423	0.13
424	0.13
425	0.14
426	0.14
427	0.14
428	0.13
429	0.12
430	0.11
431	0.09
432	0.1
433	0.12
434	0.11
435	0.11
436	0.12
437	0.14
438	0.15
439	0.17
440	0.18
441	0.18
442	0.22
443	0.25
444	0.24
445	0.26
446	0.25
447	0.24
448	0.24
449	0.22
450	0.19
451	0.17
452	0.18
453	0.16
454	0.17
455	0.16
456	0.15
457	0.22
458	0.2
459	0.2
460	0.19
461	0.18
462	0.16
463	0.16
464	0.16
465	0.09
466	0.1
467	0.08
468	0.09
469	0.1
470	0.11
471	0.11
472	0.14
473	0.15
474	0.2
475	0.28
476	0.28
477	0.29
478	0.29
479	0.32
480	0.31
481	0.36
482	0.35
483	0.35
484	0.43
485	0.51
486	0.58
487	0.58
488	0.62
489	0.59
490	0.65
491	0.67
492	0.67
493	0.69
494	0.72
495	0.79
496	0.79
497	0.85
498	0.82
499	0.81
500	0.82
501	0.81
502	0.82
503	0.82
504	0.83
505	0.83
506	0.82
507	0.78
508	0.73
509	0.68
510	0.58
511	0.48
512	0.44
513	0.4
514	0.43
515	0.43
516	0.47
517	0.51
518	0.58
519	0.64
520	0.7
521	0.72
522	0.71
523	0.73
524	0.73
525	0.72
526	0.72
527	0.67
528	0.6
529	0.54
530	0.47
531	0.39
532	0.35
533	0.27
534	0.22
535	0.21
536	0.21
537	0.2
538	0.18
539	0.18
540	0.14
541	0.13
542	0.12
543	0.11
544	0.09
545	0.09
546	0.1
547	0.1
548	0.13
549	0.14
550	0.14
551	0.18
552	0.19
553	0.18
554	0.18
555	0.17
556	0.15
557	0.16
558	0.16
559	0.14
560	0.19
561	0.2
562	0.19
563	0.19
564	0.19
565	0.2
566	0.21
567	0.22
568	0.19
569	0.27
570	0.33
571	0.41
572	0.46
573	0.52
574	0.56
575	0.6
576	0.61
577	0.64
578	0.67
579	0.69
580	0.7
581	0.71
582	0.75
583	0.79
584	0.82
585	0.76
586	0.68
587	0.63
588	0.64
589	0.62
590	0.62
591	0.61
592	0.57
593	0.55
594	0.54
595	0.51
596	0.45
597	0.41
598	0.33
599	0.29
600	0.29
601	0.29
602	0.31
603	0.32

A0A1E4RH87

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer