Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H2AVK1

Protein Details
Accession H2AVK1    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-28MSFSLNIKSKGKNKKKRSKPAGSTVDIFHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
8-20KSKGKNKKKRSKP
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 12.5, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045166  Spp2-like  
IPR026822  Spp2/MOS2_G-patch  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
KEGG kaf:KAFR_0E02480  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF12656  G-patch_2  
Amino Acid Sequences MSFSLNIKSKGKNKKKRSKPAGSTVDIFNEGVDGLQDEELASSKKRKIRITEISKFTEENENAKKDAELVISMDNTDEPTKMVTSVEEYETVPVELFGEAMLRGMGWDGKYEKEEEKAKSINEKKQIHPEGLGIGAKGSNASLAADIESFMPVVKVKKQNSDDK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.81
2 0.89
3 0.92
4 0.94
5 0.94
6 0.92
7 0.91
8 0.89
9 0.82
10 0.74
11 0.64
12 0.56
13 0.46
14 0.37
15 0.26
16 0.18
17 0.13
18 0.1
19 0.08
20 0.06
21 0.05
22 0.05
23 0.05
24 0.05
25 0.05
26 0.07
27 0.08
28 0.09
29 0.13
30 0.18
31 0.22
32 0.29
33 0.34
34 0.4
35 0.48
36 0.57
37 0.63
38 0.66
39 0.68
40 0.65
41 0.61
42 0.54
43 0.46
44 0.43
45 0.35
46 0.32
47 0.31
48 0.29
49 0.28
50 0.29
51 0.27
52 0.19
53 0.2
54 0.14
55 0.09
56 0.09
57 0.09
58 0.09
59 0.09
60 0.08
61 0.06
62 0.07
63 0.07
64 0.06
65 0.05
66 0.06
67 0.06
68 0.07
69 0.07
70 0.05
71 0.07
72 0.09
73 0.09
74 0.09
75 0.09
76 0.1
77 0.1
78 0.1
79 0.07
80 0.06
81 0.06
82 0.05
83 0.04
84 0.04
85 0.04
86 0.04
87 0.04
88 0.04
89 0.03
90 0.03
91 0.04
92 0.05
93 0.05
94 0.07
95 0.08
96 0.1
97 0.11
98 0.14
99 0.14
100 0.19
101 0.24
102 0.24
103 0.29
104 0.3
105 0.31
106 0.39
107 0.44
108 0.46
109 0.5
110 0.53
111 0.52
112 0.6
113 0.62
114 0.53
115 0.48
116 0.41
117 0.33
118 0.31
119 0.27
120 0.16
121 0.13
122 0.12
123 0.1
124 0.09
125 0.08
126 0.06
127 0.05
128 0.06
129 0.06
130 0.06
131 0.07
132 0.07
133 0.07
134 0.08
135 0.08
136 0.07
137 0.06
138 0.07
139 0.09
140 0.12
141 0.2
142 0.28
143 0.32
144 0.42