Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H2AVZ1

Protein Details
Accession H2AVZ1    Localization Confidence High Confidence Score 20.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
25-57KGSFGSKKRYRFTKQELKARKQQRKSNGPWSAWHydrophilic
344-368IYSYSLRPKYKKHPNKVFKGQKSAGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
32-33KR
35-35R
38-45KQELKARK
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto 5.5, cyto_mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR020472  G-protein_beta_WD-40_rep  
IPR032847  PRPF17  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0071013  C:catalytic step 2 spliceosome  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
KEGG kaf:KAFR_0E03900  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00400  WD40  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50082  WD_REPEATS_2  
PS50294  WD_REPEATS_REGION  
CDD cd00200  WD40  
Amino Acid Sequences MVLIEGYSSGSGSSDESIVEEVHAKGSFGSKKRYRFTKQELKARKQQRKSNGPWSAWSSDEDNGSGDKEDSEAESTTVLEEIIGDDNEEEIGNDYMDETSNFYGEDGDLSRLLEVPSDLDIDLKKKPLSFKCYLPKRIKYKFSGHSSGTTCMKFIPNTGHLFLSGGNDNIVKIWDFYHDRKSLRDYRGHTKAIKSMSFNDDAHNFITSSFDQTVKLWDTETGQVKKRLKFKSTPNCVEFRPANNHEFIVGLADSKIAHYDTRESSKHGLVQTYDHHLGSILSLRFFPDGSKFISSSEDKTVRIWENQINIPIKQISDTTQYSMPFIGIHPEHKYFCTQSLDNTIYSYSLRPKYKKHPNKVFKGQKSAGYSIGLSFSPDGRYLLSGDSRSKIVLWDWNTNKSLKDINIPGKKPITQVAWHPQETSKVLCSGPVGAIYMLD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.09
2 0.09
3 0.1
4 0.11
5 0.1
6 0.11
7 0.12
8 0.11
9 0.14
10 0.14
11 0.13
12 0.13
13 0.2
14 0.27
15 0.29
16 0.39
17 0.44
18 0.52
19 0.61
20 0.7
21 0.71
22 0.73
23 0.79
24 0.79
25 0.82
26 0.84
27 0.86
28 0.84
29 0.86
30 0.87
31 0.87
32 0.85
33 0.85
34 0.85
35 0.85
36 0.85
37 0.86
38 0.84
39 0.76
40 0.72
41 0.69
42 0.61
43 0.52
44 0.46
45 0.38
46 0.31
47 0.3
48 0.25
49 0.19
50 0.17
51 0.17
52 0.16
53 0.13
54 0.11
55 0.1
56 0.1
57 0.11
58 0.12
59 0.12
60 0.11
61 0.11
62 0.11
63 0.11
64 0.1
65 0.08
66 0.06
67 0.05
68 0.06
69 0.08
70 0.07
71 0.07
72 0.07
73 0.07
74 0.08
75 0.08
76 0.07
77 0.07
78 0.07
79 0.07
80 0.07
81 0.07
82 0.07
83 0.08
84 0.08
85 0.08
86 0.08
87 0.09
88 0.09
89 0.08
90 0.08
91 0.08
92 0.09
93 0.08
94 0.09
95 0.1
96 0.1
97 0.1
98 0.1
99 0.1
100 0.09
101 0.08
102 0.07
103 0.08
104 0.09
105 0.08
106 0.09
107 0.1
108 0.12
109 0.14
110 0.16
111 0.17
112 0.18
113 0.26
114 0.32
115 0.39
116 0.41
117 0.47
118 0.54
119 0.62
120 0.7
121 0.71
122 0.73
123 0.74
124 0.79
125 0.78
126 0.74
127 0.73
128 0.72
129 0.7
130 0.67
131 0.59
132 0.56
133 0.52
134 0.49
135 0.44
136 0.36
137 0.29
138 0.24
139 0.25
140 0.19
141 0.18
142 0.2
143 0.2
144 0.23
145 0.24
146 0.23
147 0.2
148 0.21
149 0.2
150 0.17
151 0.13
152 0.1
153 0.09
154 0.09
155 0.09
156 0.09
157 0.08
158 0.06
159 0.06
160 0.06
161 0.1
162 0.14
163 0.17
164 0.24
165 0.28
166 0.29
167 0.3
168 0.37
169 0.41
170 0.42
171 0.46
172 0.43
173 0.47
174 0.54
175 0.56
176 0.51
177 0.45
178 0.44
179 0.42
180 0.39
181 0.32
182 0.29
183 0.29
184 0.3
185 0.28
186 0.25
187 0.22
188 0.21
189 0.2
190 0.17
191 0.13
192 0.09
193 0.12
194 0.1
195 0.12
196 0.12
197 0.12
198 0.11
199 0.12
200 0.15
201 0.13
202 0.13
203 0.11
204 0.1
205 0.12
206 0.16
207 0.22
208 0.22
209 0.24
210 0.31
211 0.36
212 0.4
213 0.47
214 0.48
215 0.46
216 0.49
217 0.56
218 0.6
219 0.65
220 0.67
221 0.62
222 0.59
223 0.55
224 0.53
225 0.45
226 0.38
227 0.37
228 0.34
229 0.32
230 0.31
231 0.3
232 0.25
233 0.23
234 0.19
235 0.12
236 0.08
237 0.07
238 0.06
239 0.06
240 0.06
241 0.06
242 0.07
243 0.05
244 0.06
245 0.06
246 0.1
247 0.13
248 0.19
249 0.19
250 0.22
251 0.24
252 0.25
253 0.28
254 0.26
255 0.25
256 0.2
257 0.22
258 0.21
259 0.25
260 0.24
261 0.2
262 0.19
263 0.17
264 0.17
265 0.15
266 0.18
267 0.12
268 0.11
269 0.11
270 0.12
271 0.12
272 0.12
273 0.13
274 0.1
275 0.12
276 0.14
277 0.16
278 0.16
279 0.16
280 0.21
281 0.21
282 0.21
283 0.26
284 0.26
285 0.24
286 0.25
287 0.3
288 0.28
289 0.29
290 0.3
291 0.26
292 0.28
293 0.3
294 0.35
295 0.32
296 0.29
297 0.3
298 0.27
299 0.23
300 0.2
301 0.18
302 0.15
303 0.18
304 0.19
305 0.2
306 0.22
307 0.22
308 0.22
309 0.21
310 0.18
311 0.13
312 0.12
313 0.15
314 0.14
315 0.16
316 0.2
317 0.23
318 0.24
319 0.24
320 0.28
321 0.24
322 0.27
323 0.3
324 0.26
325 0.26
326 0.32
327 0.33
328 0.29
329 0.28
330 0.24
331 0.19
332 0.2
333 0.2
334 0.2
335 0.26
336 0.33
337 0.37
338 0.44
339 0.54
340 0.64
341 0.72
342 0.76
343 0.79
344 0.82
345 0.88
346 0.92
347 0.92
348 0.88
349 0.87
350 0.8
351 0.75
352 0.71
353 0.63
354 0.54
355 0.45
356 0.38
357 0.29
358 0.27
359 0.2
360 0.15
361 0.14
362 0.13
363 0.13
364 0.14
365 0.14
366 0.13
367 0.14
368 0.14
369 0.16
370 0.19
371 0.2
372 0.22
373 0.24
374 0.23
375 0.23
376 0.22
377 0.2
378 0.19
379 0.24
380 0.26
381 0.34
382 0.37
383 0.43
384 0.45
385 0.45
386 0.43
387 0.39
388 0.4
389 0.32
390 0.36
391 0.38
392 0.46
393 0.54
394 0.55
395 0.58
396 0.57
397 0.57
398 0.51
399 0.49
400 0.45
401 0.39
402 0.46
403 0.5
404 0.52
405 0.51
406 0.51
407 0.47
408 0.48
409 0.47
410 0.42
411 0.35
412 0.3
413 0.29
414 0.27
415 0.27
416 0.23
417 0.21
418 0.19
419 0.17