Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1E4RPU5

Protein Details
Accession A0A1E4RPU5    Localization Confidence High Confidence Score 21.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
77-97EKTEKSAAKRISKKENPQSIIHydrophilic
143-162QLTTQQAKKSKKKNLDSLKDHydrophilic
379-401SPAERALRLKKQQKQLRKYEDEVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
80-90EKSAAKRISKK
270-275KAKKIK
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039128  TRIP4-like  
IPR009349  Znf_C2HC5  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF06221  zf-C2HC5  
Amino Acid Sequences MSYTKLKSYAVPAVAEILPLDNDSCQEMISYTLTLPNNEIQSHFLNLLGESEATFNFIATFMELKSQGDEQASKKSEKTEKSAAKRISKKENPQSIIPSNPKVKTPAWQSPEESKPPKQLKGRLDHNKSATTSELIDLKPSNQLTTQQAKKSKKKNLDSLKDIEWALNELEVSAQEYDLDSSNYIKRSCNCMATRHPLFEVAPNCLNCGKIICSKEGLQPCSFCGKDLLSFKDKEEIIKILKAEKENLDVKQDNIRNKSIQEQEGPSKEKAKKIKISVKPGENLWQAQDRALKKADEEKKKLQELIEKREKEQKEIEEQEIELKQYEKTKNVDPELLKAQERLETLLNFQATGAERTKIIDRASDYEMPSSNNQISWLSPAERALRLKKQQKQLRKYEDEVKSRSGRGKKVVEMVIKDGKVNMVERTINTADDPENDKEMESLKNEIKESKLQSEANLSRNVWDYKNDNKWEKPVY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.3
2 0.27
3 0.21
4 0.15
5 0.12
6 0.12
7 0.12
8 0.08
9 0.09
10 0.11
11 0.11
12 0.1
13 0.1
14 0.09
15 0.11
16 0.12
17 0.12
18 0.11
19 0.17
20 0.18
21 0.18
22 0.21
23 0.23
24 0.24
25 0.24
26 0.25
27 0.22
28 0.24
29 0.25
30 0.23
31 0.2
32 0.17
33 0.17
34 0.17
35 0.14
36 0.11
37 0.09
38 0.11
39 0.09
40 0.11
41 0.11
42 0.09
43 0.08
44 0.09
45 0.09
46 0.08
47 0.1
48 0.08
49 0.11
50 0.12
51 0.12
52 0.14
53 0.15
54 0.16
55 0.18
56 0.21
57 0.2
58 0.29
59 0.32
60 0.32
61 0.33
62 0.39
63 0.44
64 0.45
65 0.49
66 0.5
67 0.56
68 0.62
69 0.7
70 0.7
71 0.72
72 0.76
73 0.76
74 0.77
75 0.76
76 0.79
77 0.8
78 0.82
79 0.76
80 0.72
81 0.72
82 0.65
83 0.64
84 0.59
85 0.55
86 0.53
87 0.5
88 0.48
89 0.45
90 0.42
91 0.41
92 0.44
93 0.47
94 0.44
95 0.47
96 0.49
97 0.52
98 0.57
99 0.58
100 0.55
101 0.5
102 0.55
103 0.57
104 0.61
105 0.6
106 0.62
107 0.62
108 0.65
109 0.72
110 0.73
111 0.74
112 0.73
113 0.7
114 0.66
115 0.58
116 0.51
117 0.42
118 0.33
119 0.26
120 0.21
121 0.21
122 0.16
123 0.18
124 0.16
125 0.16
126 0.19
127 0.19
128 0.18
129 0.16
130 0.19
131 0.23
132 0.32
133 0.36
134 0.38
135 0.47
136 0.55
137 0.63
138 0.69
139 0.72
140 0.73
141 0.75
142 0.79
143 0.81
144 0.8
145 0.77
146 0.72
147 0.65
148 0.58
149 0.5
150 0.4
151 0.29
152 0.22
153 0.16
154 0.12
155 0.09
156 0.06
157 0.06
158 0.06
159 0.07
160 0.05
161 0.05
162 0.05
163 0.05
164 0.06
165 0.07
166 0.07
167 0.06
168 0.08
169 0.11
170 0.14
171 0.15
172 0.17
173 0.18
174 0.25
175 0.27
176 0.33
177 0.32
178 0.35
179 0.4
180 0.46
181 0.45
182 0.4
183 0.37
184 0.31
185 0.3
186 0.3
187 0.25
188 0.2
189 0.22
190 0.21
191 0.22
192 0.21
193 0.2
194 0.15
195 0.15
196 0.14
197 0.15
198 0.17
199 0.17
200 0.18
201 0.2
202 0.26
203 0.29
204 0.3
205 0.25
206 0.24
207 0.25
208 0.28
209 0.26
210 0.21
211 0.17
212 0.15
213 0.18
214 0.21
215 0.24
216 0.22
217 0.23
218 0.23
219 0.27
220 0.26
221 0.22
222 0.21
223 0.19
224 0.17
225 0.18
226 0.18
227 0.16
228 0.18
229 0.18
230 0.19
231 0.17
232 0.21
233 0.22
234 0.22
235 0.24
236 0.22
237 0.22
238 0.28
239 0.3
240 0.31
241 0.32
242 0.33
243 0.29
244 0.3
245 0.35
246 0.32
247 0.31
248 0.28
249 0.28
250 0.31
251 0.34
252 0.37
253 0.31
254 0.35
255 0.35
256 0.39
257 0.43
258 0.46
259 0.47
260 0.53
261 0.62
262 0.61
263 0.68
264 0.69
265 0.66
266 0.6
267 0.54
268 0.52
269 0.44
270 0.37
271 0.3
272 0.27
273 0.23
274 0.23
275 0.28
276 0.23
277 0.24
278 0.26
279 0.24
280 0.2
281 0.3
282 0.37
283 0.4
284 0.46
285 0.51
286 0.55
287 0.58
288 0.58
289 0.51
290 0.51
291 0.48
292 0.52
293 0.53
294 0.48
295 0.48
296 0.55
297 0.53
298 0.49
299 0.48
300 0.42
301 0.41
302 0.43
303 0.43
304 0.36
305 0.35
306 0.35
307 0.3
308 0.26
309 0.18
310 0.15
311 0.15
312 0.21
313 0.24
314 0.24
315 0.26
316 0.32
317 0.38
318 0.4
319 0.44
320 0.38
321 0.39
322 0.41
323 0.4
324 0.34
325 0.29
326 0.27
327 0.24
328 0.24
329 0.22
330 0.19
331 0.16
332 0.17
333 0.2
334 0.19
335 0.16
336 0.15
337 0.16
338 0.15
339 0.18
340 0.18
341 0.15
342 0.15
343 0.17
344 0.2
345 0.2
346 0.19
347 0.19
348 0.2
349 0.24
350 0.29
351 0.31
352 0.29
353 0.28
354 0.29
355 0.28
356 0.27
357 0.27
358 0.23
359 0.19
360 0.19
361 0.17
362 0.17
363 0.17
364 0.19
365 0.16
366 0.17
367 0.19
368 0.22
369 0.25
370 0.3
371 0.33
372 0.39
373 0.47
374 0.56
375 0.61
376 0.68
377 0.73
378 0.79
379 0.82
380 0.83
381 0.84
382 0.82
383 0.79
384 0.79
385 0.79
386 0.76
387 0.7
388 0.66
389 0.6
390 0.57
391 0.6
392 0.57
393 0.54
394 0.55
395 0.57
396 0.54
397 0.58
398 0.6
399 0.57
400 0.53
401 0.52
402 0.51
403 0.45
404 0.41
405 0.34
406 0.3
407 0.27
408 0.26
409 0.22
410 0.19
411 0.21
412 0.21
413 0.28
414 0.27
415 0.25
416 0.24
417 0.24
418 0.21
419 0.23
420 0.28
421 0.24
422 0.25
423 0.25
424 0.24
425 0.23
426 0.24
427 0.23
428 0.2
429 0.24
430 0.26
431 0.3
432 0.31
433 0.33
434 0.35
435 0.39
436 0.42
437 0.42
438 0.44
439 0.4
440 0.41
441 0.48
442 0.49
443 0.47
444 0.47
445 0.41
446 0.38
447 0.43
448 0.44
449 0.36
450 0.36
451 0.37
452 0.41
453 0.5
454 0.56
455 0.58
456 0.59