Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H2ARP0

Protein Details
Accession H2ARP0    Localization Confidence Medium Confidence Score 12
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
295-314PTNPPYKKALELKRKGKLTRHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
308-309RK
Subcellular Location(s) mito 12, nucl 10, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR028590  RNA_methyltr_E_TRM7  
IPR002877  RNA_MeTrfase_FtsJ_dom  
IPR015507  rRNA-MeTfrase_E  
IPR029063  SAM-dependent_MTases_sf  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0106339  F:tRNA (cytidine 32-2'-O)-methyltransferase activity  
GO:0002181  P:cytoplasmic translation  
GO:0002128  P:tRNA nucleoside ribose methylation  
KEGG kaf:KAFR_0C00450  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01728  FtsJ  
CDD cd02440  AdoMet_MTases  
Amino Acid Sequences MGKSSKDKRDLYYRKAKEQGYRARSAFKLLQLNDEFHFLDDETNLKRVVDLCAAPGSWSQVLSRKMFTESKGNLDGKKIVAVDLQPMSPIENVTTLQADITHPETLSKILHLFGNEKADFVCSDGAPDVTGLHDLDEYVQQQLIMSALQLTTCILKKNGTFVAKIFRGRDIDMLYSQLGYLFEKVICAKPKSSRGTSLEAFIVCLGYNPPSNWEPKLDLNKSVEEFFSGCSLGRLKISDDNKLSNWKIEERDIAEFMSCGGLDSVDSDATYHFDEDDTSNVKKPALVSLDPIQSPTNPPYKKALELKRKGKLTRAV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.73
2 0.76
3 0.75
4 0.72
5 0.73
6 0.75
7 0.71
8 0.72
9 0.65
10 0.64
11 0.59
12 0.57
13 0.51
14 0.47
15 0.48
16 0.41
17 0.48
18 0.43
19 0.45
20 0.4
21 0.39
22 0.32
23 0.24
24 0.25
25 0.16
26 0.15
27 0.13
28 0.16
29 0.15
30 0.16
31 0.16
32 0.14
33 0.15
34 0.15
35 0.18
36 0.19
37 0.17
38 0.17
39 0.18
40 0.19
41 0.18
42 0.18
43 0.18
44 0.14
45 0.15
46 0.14
47 0.19
48 0.24
49 0.25
50 0.26
51 0.24
52 0.28
53 0.3
54 0.31
55 0.33
56 0.31
57 0.34
58 0.39
59 0.4
60 0.36
61 0.37
62 0.37
63 0.28
64 0.29
65 0.24
66 0.17
67 0.17
68 0.16
69 0.17
70 0.16
71 0.15
72 0.13
73 0.13
74 0.14
75 0.12
76 0.12
77 0.08
78 0.08
79 0.09
80 0.09
81 0.1
82 0.08
83 0.08
84 0.08
85 0.08
86 0.09
87 0.11
88 0.11
89 0.1
90 0.1
91 0.11
92 0.12
93 0.12
94 0.11
95 0.09
96 0.09
97 0.1
98 0.11
99 0.12
100 0.13
101 0.19
102 0.18
103 0.18
104 0.17
105 0.17
106 0.15
107 0.15
108 0.14
109 0.07
110 0.08
111 0.08
112 0.08
113 0.07
114 0.07
115 0.06
116 0.05
117 0.06
118 0.05
119 0.05
120 0.05
121 0.05
122 0.05
123 0.07
124 0.07
125 0.06
126 0.07
127 0.06
128 0.06
129 0.06
130 0.06
131 0.04
132 0.04
133 0.03
134 0.03
135 0.03
136 0.04
137 0.04
138 0.05
139 0.06
140 0.08
141 0.08
142 0.1
143 0.1
144 0.14
145 0.18
146 0.18
147 0.17
148 0.17
149 0.23
150 0.24
151 0.26
152 0.23
153 0.21
154 0.21
155 0.21
156 0.23
157 0.18
158 0.17
159 0.15
160 0.15
161 0.12
162 0.11
163 0.1
164 0.09
165 0.08
166 0.07
167 0.07
168 0.06
169 0.06
170 0.07
171 0.09
172 0.12
173 0.16
174 0.18
175 0.2
176 0.25
177 0.33
178 0.38
179 0.39
180 0.42
181 0.41
182 0.45
183 0.43
184 0.39
185 0.33
186 0.27
187 0.25
188 0.18
189 0.14
190 0.08
191 0.08
192 0.07
193 0.07
194 0.09
195 0.08
196 0.12
197 0.14
198 0.17
199 0.17
200 0.19
201 0.21
202 0.26
203 0.35
204 0.33
205 0.36
206 0.36
207 0.38
208 0.37
209 0.35
210 0.28
211 0.2
212 0.19
213 0.15
214 0.13
215 0.11
216 0.09
217 0.1
218 0.11
219 0.11
220 0.12
221 0.12
222 0.13
223 0.2
224 0.23
225 0.28
226 0.3
227 0.32
228 0.33
229 0.39
230 0.38
231 0.34
232 0.35
233 0.33
234 0.33
235 0.32
236 0.35
237 0.31
238 0.33
239 0.29
240 0.27
241 0.23
242 0.19
243 0.17
244 0.13
245 0.1
246 0.07
247 0.07
248 0.06
249 0.06
250 0.07
251 0.08
252 0.07
253 0.07
254 0.07
255 0.07
256 0.09
257 0.1
258 0.09
259 0.08
260 0.08
261 0.1
262 0.11
263 0.15
264 0.17
265 0.18
266 0.21
267 0.22
268 0.22
269 0.22
270 0.22
271 0.25
272 0.27
273 0.26
274 0.27
275 0.33
276 0.38
277 0.36
278 0.37
279 0.32
280 0.27
281 0.31
282 0.32
283 0.35
284 0.31
285 0.34
286 0.4
287 0.42
288 0.49
289 0.55
290 0.6
291 0.61
292 0.7
293 0.77
294 0.78
295 0.83
296 0.78