Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H2AMT4

Protein Details
Accession H2AMT4    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
73-92RFISMKRSYKKNKSNICENCHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 24, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR021715  Slu7_dom  
IPR039974  Splicing_factor_SLU7  
IPR001878  Znf_CCHC  
IPR036875  Znf_CCHC_sf  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0030628  F:pre-mRNA 3'-splice site binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
KEGG kaf:KAFR_0A02480  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF11708  Slu7  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50158  ZF_CCHC  
Amino Acid Sequences MNNKRSYNDRNKHTNSNENEHIPRYIKTKPWYYNDSKSEDYLIHHRQKHGKDNNSIDIDHNDEPKIGLGIEDRFISMKRSYKKNKSNICENCGSEGHSRRDCLEKPRKLQSRIEGENIEVKVRDDDNLDWDAKNDRWFGYAGKEYDETLQSWREKRDRNMILDNQDKESTWDIDEEVELFKLGLQRDSAGKLREERNGKAGASVTSVRLREDKAAYLKDIHSDEINYDPKSRLYKSQELGTVDEKSKMFRRKLVGEGLELEKLHKFSRDYAKSVGIRDEREDKKKIEHVLIANPTKYEQLMKQQKSIEQEKANKNKVDISTLQAQKLHGTKQSEEDKKQIMDLYE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.79
2 0.75
3 0.74
4 0.71
5 0.67
6 0.65
7 0.57
8 0.55
9 0.48
10 0.43
11 0.39
12 0.39
13 0.4
14 0.43
15 0.5
16 0.53
17 0.58
18 0.64
19 0.68
20 0.71
21 0.7
22 0.69
23 0.62
24 0.55
25 0.5
26 0.42
27 0.39
28 0.37
29 0.41
30 0.43
31 0.45
32 0.5
33 0.56
34 0.62
35 0.69
36 0.7
37 0.69
38 0.69
39 0.72
40 0.73
41 0.68
42 0.62
43 0.53
44 0.46
45 0.42
46 0.36
47 0.32
48 0.24
49 0.21
50 0.21
51 0.19
52 0.17
53 0.11
54 0.09
55 0.1
56 0.11
57 0.12
58 0.12
59 0.12
60 0.12
61 0.12
62 0.15
63 0.17
64 0.23
65 0.29
66 0.39
67 0.48
68 0.58
69 0.68
70 0.74
71 0.79
72 0.79
73 0.83
74 0.8
75 0.76
76 0.71
77 0.62
78 0.56
79 0.47
80 0.44
81 0.4
82 0.4
83 0.4
84 0.37
85 0.36
86 0.34
87 0.4
88 0.4
89 0.44
90 0.48
91 0.49
92 0.53
93 0.62
94 0.69
95 0.67
96 0.7
97 0.67
98 0.66
99 0.61
100 0.59
101 0.5
102 0.42
103 0.43
104 0.37
105 0.3
106 0.2
107 0.18
108 0.16
109 0.16
110 0.15
111 0.12
112 0.12
113 0.15
114 0.17
115 0.17
116 0.15
117 0.15
118 0.17
119 0.17
120 0.19
121 0.16
122 0.14
123 0.14
124 0.15
125 0.15
126 0.17
127 0.2
128 0.18
129 0.19
130 0.19
131 0.18
132 0.19
133 0.19
134 0.15
135 0.13
136 0.17
137 0.18
138 0.2
139 0.25
140 0.29
141 0.33
142 0.36
143 0.45
144 0.45
145 0.46
146 0.5
147 0.49
148 0.49
149 0.49
150 0.47
151 0.39
152 0.34
153 0.3
154 0.25
155 0.23
156 0.18
157 0.12
158 0.12
159 0.1
160 0.09
161 0.09
162 0.08
163 0.06
164 0.05
165 0.05
166 0.04
167 0.05
168 0.08
169 0.08
170 0.08
171 0.08
172 0.09
173 0.1
174 0.13
175 0.15
176 0.14
177 0.15
178 0.19
179 0.22
180 0.27
181 0.3
182 0.28
183 0.3
184 0.3
185 0.29
186 0.26
187 0.24
188 0.18
189 0.17
190 0.16
191 0.14
192 0.16
193 0.16
194 0.16
195 0.17
196 0.17
197 0.18
198 0.19
199 0.21
200 0.22
201 0.23
202 0.23
203 0.24
204 0.23
205 0.23
206 0.23
207 0.2
208 0.16
209 0.15
210 0.15
211 0.18
212 0.21
213 0.18
214 0.19
215 0.19
216 0.22
217 0.26
218 0.27
219 0.29
220 0.33
221 0.4
222 0.4
223 0.44
224 0.45
225 0.43
226 0.44
227 0.39
228 0.35
229 0.28
230 0.3
231 0.25
232 0.24
233 0.3
234 0.35
235 0.35
236 0.37
237 0.42
238 0.43
239 0.47
240 0.51
241 0.45
242 0.39
243 0.4
244 0.36
245 0.32
246 0.28
247 0.24
248 0.19
249 0.19
250 0.18
251 0.18
252 0.17
253 0.22
254 0.33
255 0.37
256 0.39
257 0.4
258 0.47
259 0.46
260 0.47
261 0.47
262 0.4
263 0.37
264 0.38
265 0.44
266 0.44
267 0.48
268 0.51
269 0.45
270 0.48
271 0.52
272 0.53
273 0.48
274 0.46
275 0.43
276 0.47
277 0.53
278 0.5
279 0.45
280 0.41
281 0.37
282 0.32
283 0.3
284 0.25
285 0.2
286 0.27
287 0.37
288 0.4
289 0.44
290 0.47
291 0.5
292 0.54
293 0.57
294 0.54
295 0.53
296 0.59
297 0.64
298 0.7
299 0.74
300 0.69
301 0.64
302 0.63
303 0.56
304 0.53
305 0.45
306 0.4
307 0.42
308 0.44
309 0.45
310 0.4
311 0.39
312 0.38
313 0.4
314 0.39
315 0.35
316 0.36
317 0.36
318 0.42
319 0.52
320 0.55
321 0.55
322 0.57
323 0.57
324 0.53
325 0.53