Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1E4TDF4

Protein Details
Accession A0A1E4TDF4    Localization Confidence Low Confidence Score 8.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
2-23ASAMDKSTRKSVQKHNKQGSTSHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 12.833, cyto_mito 6.665, mito 6.5, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045117  ATXN2-like  
IPR009604  LsmAD_domain  
IPR025852  SM_dom_ATX  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF06741  LsmAD  
PF14438  SM-ATX  
Amino Acid Sequences MASAMDKSTRKSVQKHNKQGSTSSVPKSLSSPAVKSSSSPSNGSSTRDTFKPAMHARILQLLGRTYGKFVTATTRTGESYHGILTAAETEAALGVTLALATKLDASPDDMSIPNLIIQPEDLAFISISKPDLRSHEASASIRTDTDISRTEASLEAKFKELQPWKPDSDTPMISLEDSSPSSATKWDQFAANEKLFGVKSTYNEDFYTTKIDRTGADYKEREERAAQLAKEIESSADGGDRHIREERLGITEGEDIDEEDLYSGVKRDADPSLQTAQASSQAAKQDLPQDPAIITSKNAVPAKKDNTRIPNQDQFLKFATAERENLMQRQRAAQANHRVRNFSADIDELKQFSKSFKVPGPVPPDMVSIIQKNKAASNDNTASYQFKTGDITQKPTVPSPLHERANTRQRHSPSKSNAKPADMRPSAMVTPGMTPPVTMNSPSNQSKQSPAPLTPRAQFFGIDVTPPKCDYDFDTAFNPFLSSEEKLTNADIEPSFKVAPSWLLDSSEKTWDEMLASSQPQPNTTPMFVSNASPVMIPSAMTSPMMPGANAQAGMYYAGAPMMAPQMFNSYMMPPMQQGYYYGMPAAPQMYMVQPMTPQMQAQARHGYMGAPQMMPGQMPMNMNMNLNVNMQPGDPGMGYPAQPGMFMPPQNYNHPYANNR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.74
2 0.82
3 0.84
4 0.84
5 0.8
6 0.75
7 0.73
8 0.7
9 0.67
10 0.6
11 0.55
12 0.49
13 0.47
14 0.45
15 0.42
16 0.4
17 0.37
18 0.35
19 0.35
20 0.38
21 0.37
22 0.36
23 0.37
24 0.38
25 0.37
26 0.37
27 0.34
28 0.37
29 0.39
30 0.41
31 0.41
32 0.37
33 0.38
34 0.38
35 0.41
36 0.36
37 0.36
38 0.42
39 0.41
40 0.43
41 0.42
42 0.43
43 0.4
44 0.44
45 0.43
46 0.35
47 0.32
48 0.27
49 0.27
50 0.27
51 0.25
52 0.2
53 0.2
54 0.19
55 0.17
56 0.16
57 0.22
58 0.21
59 0.23
60 0.24
61 0.25
62 0.25
63 0.25
64 0.27
65 0.2
66 0.19
67 0.18
68 0.16
69 0.13
70 0.12
71 0.12
72 0.12
73 0.1
74 0.08
75 0.07
76 0.07
77 0.06
78 0.06
79 0.06
80 0.04
81 0.03
82 0.03
83 0.03
84 0.03
85 0.03
86 0.03
87 0.04
88 0.05
89 0.06
90 0.07
91 0.07
92 0.11
93 0.12
94 0.13
95 0.15
96 0.14
97 0.15
98 0.15
99 0.15
100 0.13
101 0.13
102 0.13
103 0.11
104 0.1
105 0.11
106 0.1
107 0.11
108 0.09
109 0.08
110 0.08
111 0.09
112 0.09
113 0.09
114 0.1
115 0.11
116 0.12
117 0.14
118 0.19
119 0.25
120 0.27
121 0.29
122 0.31
123 0.34
124 0.33
125 0.34
126 0.31
127 0.25
128 0.22
129 0.2
130 0.19
131 0.15
132 0.17
133 0.17
134 0.18
135 0.18
136 0.18
137 0.19
138 0.2
139 0.22
140 0.23
141 0.22
142 0.2
143 0.21
144 0.23
145 0.22
146 0.29
147 0.33
148 0.35
149 0.4
150 0.44
151 0.44
152 0.46
153 0.47
154 0.42
155 0.42
156 0.36
157 0.31
158 0.28
159 0.25
160 0.22
161 0.21
162 0.17
163 0.14
164 0.13
165 0.12
166 0.1
167 0.1
168 0.1
169 0.12
170 0.13
171 0.15
172 0.16
173 0.17
174 0.19
175 0.2
176 0.26
177 0.31
178 0.29
179 0.26
180 0.23
181 0.25
182 0.22
183 0.22
184 0.18
185 0.14
186 0.15
187 0.21
188 0.22
189 0.22
190 0.22
191 0.24
192 0.22
193 0.21
194 0.26
195 0.2
196 0.19
197 0.18
198 0.19
199 0.17
200 0.22
201 0.28
202 0.24
203 0.31
204 0.31
205 0.32
206 0.39
207 0.39
208 0.34
209 0.29
210 0.28
211 0.28
212 0.32
213 0.29
214 0.25
215 0.25
216 0.24
217 0.23
218 0.21
219 0.14
220 0.1
221 0.1
222 0.07
223 0.08
224 0.08
225 0.08
226 0.13
227 0.13
228 0.15
229 0.17
230 0.18
231 0.16
232 0.18
233 0.19
234 0.17
235 0.18
236 0.15
237 0.14
238 0.15
239 0.14
240 0.13
241 0.11
242 0.08
243 0.07
244 0.07
245 0.06
246 0.04
247 0.04
248 0.04
249 0.04
250 0.05
251 0.05
252 0.06
253 0.06
254 0.08
255 0.1
256 0.12
257 0.13
258 0.15
259 0.17
260 0.16
261 0.16
262 0.14
263 0.13
264 0.14
265 0.14
266 0.12
267 0.12
268 0.14
269 0.14
270 0.14
271 0.16
272 0.19
273 0.21
274 0.23
275 0.21
276 0.2
277 0.19
278 0.2
279 0.2
280 0.13
281 0.11
282 0.1
283 0.11
284 0.16
285 0.18
286 0.17
287 0.19
288 0.25
289 0.31
290 0.35
291 0.39
292 0.39
293 0.44
294 0.5
295 0.53
296 0.53
297 0.52
298 0.48
299 0.5
300 0.45
301 0.4
302 0.35
303 0.3
304 0.24
305 0.2
306 0.22
307 0.17
308 0.17
309 0.15
310 0.17
311 0.16
312 0.2
313 0.21
314 0.19
315 0.18
316 0.2
317 0.23
318 0.24
319 0.26
320 0.29
321 0.37
322 0.43
323 0.48
324 0.46
325 0.44
326 0.4
327 0.42
328 0.36
329 0.26
330 0.19
331 0.15
332 0.15
333 0.16
334 0.16
335 0.12
336 0.12
337 0.12
338 0.11
339 0.11
340 0.13
341 0.12
342 0.15
343 0.17
344 0.21
345 0.22
346 0.28
347 0.34
348 0.31
349 0.31
350 0.29
351 0.27
352 0.23
353 0.23
354 0.18
355 0.14
356 0.16
357 0.17
358 0.18
359 0.17
360 0.19
361 0.2
362 0.23
363 0.21
364 0.26
365 0.25
366 0.25
367 0.25
368 0.24
369 0.23
370 0.2
371 0.21
372 0.14
373 0.12
374 0.14
375 0.15
376 0.23
377 0.23
378 0.27
379 0.27
380 0.29
381 0.3
382 0.29
383 0.31
384 0.23
385 0.24
386 0.27
387 0.33
388 0.33
389 0.34
390 0.37
391 0.41
392 0.49
393 0.51
394 0.47
395 0.47
396 0.48
397 0.56
398 0.57
399 0.58
400 0.58
401 0.65
402 0.66
403 0.68
404 0.66
405 0.61
406 0.6
407 0.55
408 0.56
409 0.46
410 0.42
411 0.33
412 0.34
413 0.29
414 0.25
415 0.22
416 0.12
417 0.13
418 0.13
419 0.13
420 0.1
421 0.1
422 0.09
423 0.12
424 0.12
425 0.12
426 0.13
427 0.14
428 0.2
429 0.23
430 0.26
431 0.26
432 0.26
433 0.29
434 0.31
435 0.35
436 0.32
437 0.33
438 0.37
439 0.39
440 0.42
441 0.41
442 0.41
443 0.36
444 0.33
445 0.29
446 0.23
447 0.22
448 0.18
449 0.16
450 0.17
451 0.16
452 0.17
453 0.18
454 0.18
455 0.14
456 0.15
457 0.17
458 0.23
459 0.24
460 0.24
461 0.26
462 0.26
463 0.26
464 0.25
465 0.21
466 0.12
467 0.12
468 0.13
469 0.11
470 0.13
471 0.14
472 0.15
473 0.15
474 0.16
475 0.16
476 0.13
477 0.16
478 0.14
479 0.15
480 0.15
481 0.17
482 0.16
483 0.15
484 0.15
485 0.12
486 0.14
487 0.13
488 0.16
489 0.14
490 0.17
491 0.18
492 0.21
493 0.22
494 0.25
495 0.24
496 0.21
497 0.21
498 0.18
499 0.18
500 0.16
501 0.16
502 0.13
503 0.14
504 0.18
505 0.21
506 0.21
507 0.22
508 0.23
509 0.24
510 0.25
511 0.24
512 0.22
513 0.2
514 0.23
515 0.23
516 0.22
517 0.2
518 0.17
519 0.17
520 0.15
521 0.14
522 0.12
523 0.11
524 0.1
525 0.09
526 0.1
527 0.1
528 0.1
529 0.1
530 0.09
531 0.13
532 0.13
533 0.11
534 0.1
535 0.12
536 0.13
537 0.13
538 0.12
539 0.09
540 0.09
541 0.1
542 0.09
543 0.07
544 0.06
545 0.05
546 0.05
547 0.05
548 0.06
549 0.09
550 0.09
551 0.09
552 0.09
553 0.13
554 0.14
555 0.15
556 0.15
557 0.13
558 0.15
559 0.16
560 0.16
561 0.13
562 0.14
563 0.14
564 0.13
565 0.13
566 0.17
567 0.18
568 0.17
569 0.17
570 0.15
571 0.15
572 0.16
573 0.15
574 0.09
575 0.08
576 0.09
577 0.1
578 0.13
579 0.14
580 0.13
581 0.13
582 0.15
583 0.17
584 0.17
585 0.16
586 0.18
587 0.23
588 0.24
589 0.29
590 0.34
591 0.32
592 0.32
593 0.32
594 0.27
595 0.24
596 0.28
597 0.26
598 0.18
599 0.18
600 0.19
601 0.19
602 0.19
603 0.17
604 0.14
605 0.15
606 0.16
607 0.17
608 0.2
609 0.21
610 0.22
611 0.22
612 0.24
613 0.22
614 0.23
615 0.22
616 0.19
617 0.18
618 0.17
619 0.17
620 0.14
621 0.14
622 0.12
623 0.11
624 0.12
625 0.14
626 0.14
627 0.14
628 0.16
629 0.14
630 0.14
631 0.15
632 0.19
633 0.22
634 0.23
635 0.25
636 0.3
637 0.34
638 0.42
639 0.45
640 0.43
641 0.44