Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H2AUP1

Protein Details
Accession H2AUP1    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
642-668DFSKDLPISKRRKPKKRSHDSLTITDDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
650-658SKRRKPKKR
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 13.333, cyto 5, cyto_mito 3.333
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR046351  UTP4  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0030686  C:90S preribosome  
GO:0000462  P:maturation of SSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
KEGG kaf:KAFR_0D04430  -  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50082  WD_REPEATS_2  
Amino Acid Sequences MMADARDENASMLVHRSRFVDYTPSNITSVAFSHRSTTKNVTPSDLRLAIGRSNGNIEIWNPRNDYIQERVLFGGVNRSIEGLVWCNVSGEPLRLFSIGGSTVITEWDLASGLPLKNYDCNAGVIWSIAINESQDKLAVGCDNGTVVIVDISGGKGFMEHDLILVRQEARILSLCWNHDDFVIGGCSDGRVRVWSAKPKDLNRGRLLNTMKVDKSKRESTLVWSVLYLPASNQIVSGDSTGSVKFWDFQFSTLVQSFKTHEADVLCLSTDVTNSMIFSAGVDRKIFQYSHMSSSNKKNSKSWISTSNRLLHGNDVRALCSYQSKGAEFLISAGLEKTFVVSSLSSFADGSYRKIPFVAPFTKNVLVNKEQRLVVMWNENIIKIWKIGTDTNDERNYSLVCKLTLKDEQNISCCAMSPDGQVLVVGRTNTTKLFHLQPTGQKLKVTKLENDLLLKTGSKLIKFVDNSKIILCSIDDEILRMDLEADDDERFDEIELLEAPSTKSSIKVPYLNNVNNLEVSGTYAVYSRYCGTVDLIDLATNKVNSMVRLTNFITSVQINESRSTVLVVTAENKIYELNINKSTNSLQDENVDESLLSAWSKNNTENLPKQLQYSKDKCVGIFIDGQDMNKVWFWGATWIASLDFSKDLPISKRRKPKKRSHDSLTITDDSNFMNYNDEEDDIDMEFTENASILLDKANNNGGTSNKARDIGDSQAFFFTDKYKPILFTDSISENELVIVERPALMVTSQEKSYALPKLVF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.21
3 0.23
4 0.24
5 0.25
6 0.26
7 0.31
8 0.27
9 0.32
10 0.36
11 0.37
12 0.34
13 0.33
14 0.31
15 0.23
16 0.24
17 0.24
18 0.21
19 0.19
20 0.24
21 0.29
22 0.3
23 0.34
24 0.4
25 0.41
26 0.45
27 0.46
28 0.48
29 0.47
30 0.49
31 0.51
32 0.45
33 0.38
34 0.33
35 0.34
36 0.31
37 0.31
38 0.28
39 0.22
40 0.24
41 0.24
42 0.22
43 0.21
44 0.2
45 0.25
46 0.28
47 0.32
48 0.3
49 0.31
50 0.35
51 0.36
52 0.39
53 0.35
54 0.39
55 0.35
56 0.34
57 0.34
58 0.29
59 0.28
60 0.23
61 0.26
62 0.19
63 0.19
64 0.18
65 0.18
66 0.18
67 0.18
68 0.19
69 0.14
70 0.14
71 0.14
72 0.13
73 0.14
74 0.13
75 0.15
76 0.15
77 0.15
78 0.15
79 0.15
80 0.16
81 0.16
82 0.16
83 0.13
84 0.14
85 0.12
86 0.11
87 0.1
88 0.09
89 0.09
90 0.09
91 0.09
92 0.07
93 0.06
94 0.06
95 0.06
96 0.05
97 0.07
98 0.11
99 0.11
100 0.12
101 0.14
102 0.15
103 0.18
104 0.2
105 0.21
106 0.18
107 0.19
108 0.18
109 0.18
110 0.16
111 0.13
112 0.12
113 0.09
114 0.08
115 0.07
116 0.07
117 0.07
118 0.09
119 0.09
120 0.09
121 0.09
122 0.09
123 0.09
124 0.1
125 0.11
126 0.09
127 0.09
128 0.09
129 0.09
130 0.08
131 0.08
132 0.06
133 0.06
134 0.05
135 0.04
136 0.04
137 0.05
138 0.05
139 0.05
140 0.05
141 0.04
142 0.05
143 0.05
144 0.06
145 0.08
146 0.07
147 0.08
148 0.09
149 0.1
150 0.1
151 0.11
152 0.1
153 0.09
154 0.1
155 0.09
156 0.1
157 0.12
158 0.13
159 0.16
160 0.19
161 0.21
162 0.23
163 0.24
164 0.22
165 0.21
166 0.21
167 0.16
168 0.14
169 0.13
170 0.1
171 0.09
172 0.08
173 0.09
174 0.08
175 0.08
176 0.07
177 0.08
178 0.1
179 0.17
180 0.23
181 0.32
182 0.36
183 0.44
184 0.51
185 0.53
186 0.61
187 0.62
188 0.65
189 0.61
190 0.62
191 0.57
192 0.57
193 0.57
194 0.51
195 0.47
196 0.45
197 0.4
198 0.41
199 0.42
200 0.4
201 0.44
202 0.45
203 0.44
204 0.43
205 0.42
206 0.42
207 0.47
208 0.43
209 0.36
210 0.3
211 0.28
212 0.25
213 0.24
214 0.18
215 0.09
216 0.12
217 0.13
218 0.12
219 0.11
220 0.1
221 0.11
222 0.11
223 0.11
224 0.07
225 0.07
226 0.08
227 0.08
228 0.08
229 0.07
230 0.07
231 0.08
232 0.09
233 0.14
234 0.13
235 0.14
236 0.16
237 0.16
238 0.2
239 0.2
240 0.2
241 0.15
242 0.16
243 0.17
244 0.19
245 0.2
246 0.16
247 0.16
248 0.16
249 0.17
250 0.17
251 0.15
252 0.11
253 0.09
254 0.1
255 0.08
256 0.07
257 0.06
258 0.07
259 0.06
260 0.06
261 0.06
262 0.06
263 0.06
264 0.06
265 0.1
266 0.1
267 0.12
268 0.12
269 0.12
270 0.13
271 0.16
272 0.16
273 0.13
274 0.2
275 0.2
276 0.25
277 0.29
278 0.3
279 0.32
280 0.41
281 0.49
282 0.47
283 0.46
284 0.44
285 0.47
286 0.53
287 0.54
288 0.48
289 0.48
290 0.48
291 0.53
292 0.55
293 0.54
294 0.48
295 0.45
296 0.42
297 0.37
298 0.34
299 0.3
300 0.29
301 0.23
302 0.21
303 0.2
304 0.2
305 0.15
306 0.14
307 0.14
308 0.13
309 0.14
310 0.14
311 0.14
312 0.14
313 0.14
314 0.11
315 0.11
316 0.08
317 0.07
318 0.07
319 0.06
320 0.06
321 0.05
322 0.05
323 0.05
324 0.04
325 0.05
326 0.05
327 0.05
328 0.06
329 0.08
330 0.08
331 0.08
332 0.08
333 0.07
334 0.1
335 0.1
336 0.13
337 0.15
338 0.15
339 0.15
340 0.16
341 0.16
342 0.15
343 0.21
344 0.25
345 0.22
346 0.24
347 0.27
348 0.29
349 0.3
350 0.29
351 0.27
352 0.25
353 0.29
354 0.29
355 0.29
356 0.26
357 0.25
358 0.25
359 0.22
360 0.19
361 0.18
362 0.15
363 0.14
364 0.14
365 0.14
366 0.13
367 0.12
368 0.11
369 0.08
370 0.08
371 0.07
372 0.08
373 0.1
374 0.11
375 0.17
376 0.19
377 0.24
378 0.26
379 0.26
380 0.24
381 0.23
382 0.22
383 0.17
384 0.16
385 0.11
386 0.1
387 0.11
388 0.12
389 0.15
390 0.2
391 0.2
392 0.22
393 0.25
394 0.26
395 0.26
396 0.27
397 0.25
398 0.19
399 0.17
400 0.14
401 0.12
402 0.11
403 0.09
404 0.09
405 0.08
406 0.08
407 0.07
408 0.07
409 0.07
410 0.07
411 0.07
412 0.06
413 0.07
414 0.08
415 0.09
416 0.1
417 0.1
418 0.12
419 0.16
420 0.17
421 0.19
422 0.21
423 0.25
424 0.32
425 0.34
426 0.33
427 0.3
428 0.3
429 0.33
430 0.36
431 0.35
432 0.3
433 0.31
434 0.33
435 0.33
436 0.34
437 0.29
438 0.23
439 0.2
440 0.17
441 0.13
442 0.16
443 0.15
444 0.14
445 0.14
446 0.14
447 0.2
448 0.21
449 0.24
450 0.26
451 0.27
452 0.27
453 0.27
454 0.26
455 0.2
456 0.19
457 0.15
458 0.1
459 0.09
460 0.1
461 0.09
462 0.09
463 0.09
464 0.09
465 0.09
466 0.07
467 0.07
468 0.05
469 0.06
470 0.06
471 0.06
472 0.06
473 0.06
474 0.07
475 0.06
476 0.06
477 0.06
478 0.06
479 0.05
480 0.06
481 0.06
482 0.07
483 0.07
484 0.07
485 0.07
486 0.07
487 0.08
488 0.07
489 0.08
490 0.1
491 0.15
492 0.18
493 0.24
494 0.25
495 0.31
496 0.39
497 0.39
498 0.41
499 0.39
500 0.35
501 0.29
502 0.28
503 0.22
504 0.14
505 0.13
506 0.09
507 0.07
508 0.06
509 0.07
510 0.08
511 0.08
512 0.09
513 0.09
514 0.09
515 0.09
516 0.1
517 0.1
518 0.1
519 0.11
520 0.11
521 0.1
522 0.1
523 0.1
524 0.11
525 0.11
526 0.1
527 0.1
528 0.11
529 0.12
530 0.11
531 0.15
532 0.18
533 0.17
534 0.21
535 0.22
536 0.21
537 0.21
538 0.21
539 0.19
540 0.15
541 0.15
542 0.14
543 0.17
544 0.16
545 0.17
546 0.17
547 0.16
548 0.16
549 0.15
550 0.12
551 0.1
552 0.09
553 0.09
554 0.1
555 0.12
556 0.12
557 0.11
558 0.11
559 0.1
560 0.1
561 0.14
562 0.15
563 0.18
564 0.25
565 0.26
566 0.26
567 0.28
568 0.28
569 0.28
570 0.3
571 0.26
572 0.21
573 0.23
574 0.25
575 0.26
576 0.25
577 0.21
578 0.15
579 0.14
580 0.13
581 0.11
582 0.09
583 0.07
584 0.08
585 0.12
586 0.14
587 0.15
588 0.19
589 0.22
590 0.3
591 0.35
592 0.4
593 0.42
594 0.41
595 0.43
596 0.44
597 0.48
598 0.5
599 0.49
600 0.48
601 0.5
602 0.5
603 0.46
604 0.45
605 0.4
606 0.33
607 0.32
608 0.26
609 0.26
610 0.26
611 0.26
612 0.23
613 0.22
614 0.2
615 0.16
616 0.16
617 0.09
618 0.09
619 0.09
620 0.12
621 0.13
622 0.12
623 0.12
624 0.12
625 0.12
626 0.13
627 0.12
628 0.1
629 0.1
630 0.1
631 0.11
632 0.12
633 0.15
634 0.2
635 0.3
636 0.35
637 0.44
638 0.55
639 0.64
640 0.73
641 0.8
642 0.85
643 0.87
644 0.91
645 0.92
646 0.89
647 0.89
648 0.85
649 0.82
650 0.77
651 0.68
652 0.58
653 0.49
654 0.41
655 0.31
656 0.26
657 0.2
658 0.13
659 0.15
660 0.14
661 0.16
662 0.16
663 0.16
664 0.15
665 0.15
666 0.15
667 0.12
668 0.12
669 0.1
670 0.09
671 0.08
672 0.08
673 0.07
674 0.06
675 0.06
676 0.06
677 0.06
678 0.06
679 0.09
680 0.11
681 0.12
682 0.15
683 0.21
684 0.21
685 0.21
686 0.23
687 0.22
688 0.26
689 0.29
690 0.31
691 0.28
692 0.31
693 0.3
694 0.32
695 0.33
696 0.34
697 0.36
698 0.33
699 0.31
700 0.3
701 0.3
702 0.27
703 0.25
704 0.21
705 0.19
706 0.21
707 0.24
708 0.24
709 0.26
710 0.28
711 0.34
712 0.31
713 0.29
714 0.31
715 0.3
716 0.29
717 0.3
718 0.27
719 0.21
720 0.2
721 0.18
722 0.14
723 0.12
724 0.12
725 0.09
726 0.09
727 0.09
728 0.09
729 0.09
730 0.08
731 0.12
732 0.14
733 0.18
734 0.18
735 0.19
736 0.19
737 0.2
738 0.26
739 0.27