Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1E4TBK9

Protein Details
Accession A0A1E4TBK9    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
296-315ATAPAPEHRKNIKNKLKKFRHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
304-315RKNIKNKLKKFR
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 11, mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR015381  XLF_N  
IPR038051  XRCC4-like_N_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006302  P:double-strand break repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF09302  XLF  
CDD cd22285  HD_XLF_N  
Amino Acid Sequences MSLIGPWTRLKGLKKRSPYYALFNSNGAGYKLVVTDLRQMWEEECDEACLRSKAAQFNCPVDPTLPGQGQALVKHLMDTIYSMRSMEMQLDADSLTLTTHEPLSSGDQLDWTYTLAWTPMDLSGLIYTLMQNIIAQKRYSKQLEHDIALKDYHIRAMLDERKRLGLNDYLPARHPEALTPHEHIHISVNYEDIRHSNDMIDMSLQDMYSVDSTPETLDQSPVPTSTSSGGRKKLQSVVTKRKRPDAEAMIKEMTDKPEPEVKKEGTKRKLNSVVAARHQVKQQKSTTESDLVPSTATAPAPEHRKNIKNKLKKFR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.67
2 0.7
3 0.74
4 0.76
5 0.72
6 0.71
7 0.7
8 0.67
9 0.58
10 0.53
11 0.46
12 0.4
13 0.36
14 0.28
15 0.2
16 0.13
17 0.13
18 0.12
19 0.13
20 0.12
21 0.12
22 0.19
23 0.2
24 0.22
25 0.22
26 0.22
27 0.22
28 0.24
29 0.23
30 0.18
31 0.16
32 0.17
33 0.17
34 0.17
35 0.19
36 0.17
37 0.17
38 0.19
39 0.23
40 0.28
41 0.32
42 0.37
43 0.37
44 0.4
45 0.42
46 0.38
47 0.35
48 0.28
49 0.27
50 0.23
51 0.25
52 0.21
53 0.19
54 0.18
55 0.21
56 0.22
57 0.2
58 0.2
59 0.16
60 0.16
61 0.16
62 0.16
63 0.12
64 0.1
65 0.12
66 0.11
67 0.11
68 0.11
69 0.1
70 0.1
71 0.11
72 0.11
73 0.1
74 0.09
75 0.09
76 0.09
77 0.09
78 0.09
79 0.08
80 0.07
81 0.06
82 0.05
83 0.05
84 0.05
85 0.06
86 0.06
87 0.06
88 0.07
89 0.08
90 0.12
91 0.13
92 0.13
93 0.12
94 0.12
95 0.12
96 0.13
97 0.12
98 0.08
99 0.07
100 0.06
101 0.06
102 0.06
103 0.06
104 0.05
105 0.06
106 0.06
107 0.06
108 0.06
109 0.06
110 0.06
111 0.06
112 0.06
113 0.05
114 0.05
115 0.05
116 0.05
117 0.04
118 0.05
119 0.08
120 0.1
121 0.12
122 0.13
123 0.14
124 0.17
125 0.23
126 0.25
127 0.23
128 0.24
129 0.32
130 0.34
131 0.33
132 0.35
133 0.3
134 0.29
135 0.27
136 0.24
137 0.16
138 0.13
139 0.12
140 0.09
141 0.08
142 0.07
143 0.14
144 0.21
145 0.23
146 0.25
147 0.25
148 0.26
149 0.26
150 0.26
151 0.22
152 0.19
153 0.17
154 0.2
155 0.21
156 0.2
157 0.2
158 0.22
159 0.21
160 0.19
161 0.17
162 0.14
163 0.16
164 0.18
165 0.2
166 0.21
167 0.2
168 0.2
169 0.2
170 0.19
171 0.18
172 0.16
173 0.16
174 0.13
175 0.13
176 0.12
177 0.12
178 0.12
179 0.1
180 0.13
181 0.11
182 0.12
183 0.11
184 0.12
185 0.12
186 0.11
187 0.11
188 0.07
189 0.08
190 0.08
191 0.07
192 0.06
193 0.06
194 0.06
195 0.07
196 0.07
197 0.06
198 0.06
199 0.06
200 0.07
201 0.08
202 0.09
203 0.09
204 0.1
205 0.1
206 0.12
207 0.12
208 0.12
209 0.12
210 0.11
211 0.11
212 0.13
213 0.19
214 0.24
215 0.28
216 0.33
217 0.37
218 0.39
219 0.42
220 0.46
221 0.47
222 0.5
223 0.55
224 0.61
225 0.66
226 0.72
227 0.71
228 0.74
229 0.7
230 0.65
231 0.63
232 0.62
233 0.62
234 0.57
235 0.58
236 0.5
237 0.46
238 0.44
239 0.37
240 0.31
241 0.25
242 0.23
243 0.22
244 0.29
245 0.31
246 0.34
247 0.38
248 0.37
249 0.44
250 0.52
251 0.59
252 0.6
253 0.68
254 0.67
255 0.7
256 0.76
257 0.68
258 0.67
259 0.65
260 0.63
261 0.6
262 0.65
263 0.58
264 0.53
265 0.56
266 0.56
267 0.53
268 0.53
269 0.53
270 0.52
271 0.54
272 0.55
273 0.55
274 0.52
275 0.47
276 0.43
277 0.39
278 0.31
279 0.27
280 0.22
281 0.19
282 0.16
283 0.15
284 0.13
285 0.14
286 0.19
287 0.27
288 0.32
289 0.38
290 0.45
291 0.53
292 0.62
293 0.7
294 0.75
295 0.78