Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H2APU6

Protein Details
Accession H2APU6    Localization Confidence High Confidence Score 19.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
15-36KASLKFKPKMVARRSKEERDASHydrophilic
45-74VGKPRNDKAKTTRRPNNQQQKRVPRYLQNTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
16-58ASLKFKPKMVARRSKEERDASVPKVKVEEVGKPRNDKAKTTRR
318-328KKDDAAKFKKR
Subcellular Location(s) nucl 19, mito 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007811  RPC4  
Gene Ontology GO:0005666  C:RNA polymerase III complex  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006383  P:transcription by RNA polymerase III  
KEGG kaf:KAFR_0B00980  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF05132  RNA_pol_Rpc4  
Amino Acid Sequences MSGRLPSLKDSSGGKASLKFKPKMVARRSKEERDASVPKVKVEEVGKPRNDKAKTTRRPNNQQQKRVPRYLQNTHVVSSGPLAAGNFVESSRSDMRRGFVKMDGSGSSLVQKGLQTIENDAGESEDEDDDKESKNKSKFNMGREYSVHEHAEDEPSDVSDAELDEQEVQARMIEQMFPVRPVRIRHEDVEAVKKEIQDSLTETSTREPTPSVPSLEKIKVEDDSMNLNNTLRDKEEELKEKLNKLNITSVDEEEVAAEAAQLISDYKHIVQKLEKINNKPEKFVMFQFPYRLPQFEDLTLKKEDKTGEELPAAGDKGKKDDAAKFKKREAKTDVKATTIESKSIPQSELTGNIGSIRVHKSGKLSIKIGDAVMDISRGSETTFLQDVIALDENEEHPGVELMGRISGKFVVTPKI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.32
2 0.35
3 0.39
4 0.44
5 0.5
6 0.48
7 0.46
8 0.53
9 0.59
10 0.62
11 0.67
12 0.7
13 0.68
14 0.76
15 0.81
16 0.81
17 0.81
18 0.77
19 0.72
20 0.7
21 0.69
22 0.64
23 0.64
24 0.57
25 0.49
26 0.46
27 0.41
28 0.38
29 0.35
30 0.38
31 0.39
32 0.47
33 0.51
34 0.53
35 0.58
36 0.61
37 0.61
38 0.59
39 0.6
40 0.62
41 0.67
42 0.73
43 0.77
44 0.79
45 0.87
46 0.91
47 0.91
48 0.91
49 0.91
50 0.9
51 0.92
52 0.9
53 0.88
54 0.83
55 0.81
56 0.8
57 0.78
58 0.75
59 0.72
60 0.65
61 0.57
62 0.52
63 0.43
64 0.34
65 0.27
66 0.2
67 0.12
68 0.1
69 0.09
70 0.09
71 0.08
72 0.09
73 0.08
74 0.07
75 0.08
76 0.07
77 0.13
78 0.19
79 0.21
80 0.22
81 0.23
82 0.26
83 0.3
84 0.33
85 0.3
86 0.28
87 0.29
88 0.27
89 0.28
90 0.26
91 0.22
92 0.2
93 0.18
94 0.16
95 0.14
96 0.13
97 0.12
98 0.12
99 0.11
100 0.12
101 0.15
102 0.13
103 0.15
104 0.17
105 0.16
106 0.16
107 0.15
108 0.13
109 0.1
110 0.1
111 0.09
112 0.07
113 0.07
114 0.07
115 0.09
116 0.09
117 0.11
118 0.14
119 0.15
120 0.22
121 0.27
122 0.31
123 0.32
124 0.42
125 0.46
126 0.49
127 0.56
128 0.51
129 0.5
130 0.48
131 0.51
132 0.44
133 0.42
134 0.35
135 0.25
136 0.24
137 0.21
138 0.23
139 0.17
140 0.15
141 0.11
142 0.11
143 0.11
144 0.1
145 0.09
146 0.06
147 0.06
148 0.06
149 0.05
150 0.06
151 0.05
152 0.05
153 0.06
154 0.06
155 0.06
156 0.05
157 0.05
158 0.06
159 0.06
160 0.06
161 0.06
162 0.09
163 0.1
164 0.12
165 0.13
166 0.13
167 0.16
168 0.19
169 0.26
170 0.29
171 0.32
172 0.31
173 0.34
174 0.36
175 0.35
176 0.39
177 0.33
178 0.29
179 0.28
180 0.26
181 0.23
182 0.21
183 0.19
184 0.12
185 0.14
186 0.14
187 0.14
188 0.14
189 0.14
190 0.14
191 0.16
192 0.15
193 0.13
194 0.11
195 0.11
196 0.16
197 0.17
198 0.18
199 0.17
200 0.18
201 0.22
202 0.24
203 0.23
204 0.19
205 0.18
206 0.16
207 0.17
208 0.16
209 0.12
210 0.15
211 0.15
212 0.14
213 0.14
214 0.13
215 0.13
216 0.13
217 0.13
218 0.1
219 0.11
220 0.13
221 0.18
222 0.23
223 0.28
224 0.3
225 0.35
226 0.37
227 0.39
228 0.39
229 0.39
230 0.35
231 0.31
232 0.33
233 0.28
234 0.29
235 0.27
236 0.25
237 0.21
238 0.2
239 0.18
240 0.12
241 0.11
242 0.07
243 0.05
244 0.05
245 0.03
246 0.03
247 0.03
248 0.03
249 0.03
250 0.03
251 0.04
252 0.05
253 0.07
254 0.1
255 0.11
256 0.13
257 0.15
258 0.23
259 0.31
260 0.39
261 0.44
262 0.45
263 0.55
264 0.63
265 0.62
266 0.56
267 0.5
268 0.45
269 0.42
270 0.4
271 0.39
272 0.32
273 0.33
274 0.35
275 0.34
276 0.36
277 0.34
278 0.32
279 0.27
280 0.27
281 0.27
282 0.27
283 0.32
284 0.28
285 0.3
286 0.32
287 0.31
288 0.27
289 0.28
290 0.26
291 0.22
292 0.28
293 0.27
294 0.27
295 0.26
296 0.26
297 0.23
298 0.24
299 0.21
300 0.16
301 0.16
302 0.13
303 0.17
304 0.19
305 0.2
306 0.22
307 0.29
308 0.38
309 0.46
310 0.55
311 0.56
312 0.63
313 0.69
314 0.69
315 0.69
316 0.67
317 0.67
318 0.65
319 0.7
320 0.63
321 0.56
322 0.54
323 0.49
324 0.49
325 0.4
326 0.35
327 0.26
328 0.28
329 0.29
330 0.31
331 0.29
332 0.21
333 0.23
334 0.22
335 0.24
336 0.23
337 0.19
338 0.17
339 0.17
340 0.18
341 0.15
342 0.17
343 0.18
344 0.2
345 0.2
346 0.22
347 0.26
348 0.33
349 0.4
350 0.42
351 0.4
352 0.39
353 0.41
354 0.41
355 0.36
356 0.29
357 0.21
358 0.17
359 0.15
360 0.13
361 0.1
362 0.09
363 0.09
364 0.08
365 0.08
366 0.09
367 0.09
368 0.13
369 0.15
370 0.14
371 0.14
372 0.15
373 0.15
374 0.17
375 0.19
376 0.14
377 0.14
378 0.15
379 0.16
380 0.17
381 0.17
382 0.13
383 0.11
384 0.11
385 0.11
386 0.1
387 0.1
388 0.09
389 0.13
390 0.13
391 0.13
392 0.14
393 0.15
394 0.15
395 0.17