Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1E4TDX7

Protein Details
Accession A0A1E4TDX7    Localization Confidence High Confidence Score 15.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
219-246LPESDYKPQKIKKRKRKDRSAESRQTTDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
226-237PQKIKKRKRKDR
494-502GNGKRKSRK
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 11, mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045347  HIND  
IPR005011  SNU66/SART1  
Gene Ontology GO:0046540  C:U4/U6 x U5 tri-snRNP complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF19252  HIND  
PF03343  SART-1  
Amino Acid Sequences MARELSIDETNKIRIALGLRPIVIANEASEPSTTTESKPENATESKNDIAHRIRQAKARIDRSRHSKQLKEPLTTAEWLGQIDFTVTSGDSATAVPKDSSAYTSEDISHLKVAPIDSSSFQSADSSAILTLRDTSVLQDSDDALEVSAKKPRKSKQSSLRMSFADHTEDTDQLVTLANLEQAIAASEVIEDTTQLDLGTRASKPLVQTVYTLEETSERLPESDYKPQKIKKRKRKDRSAESRQTTDTDDFIEAVKANLQLDAEEDYDNALEHNRLQALKQRKKDIVALMKQAEEAERNIAPMADSEESDLVIDGTKSFVESFEPGSNVEQTAVDNDRVADNENIDCVTTDEFTDENNNTDANVANTKDGGLADILQQLTKTGVIHNDDEATEKLKRQREQLRANHEMKLRYAMKAREQQDIKESQRDILKRLTPKEKEELAEKQKKEMDKVNAELARERLKNYKPDVKLEYRNEEGKLLSTKEAYKELSHKFHGNGKRKSRK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.21
3 0.24
4 0.28
5 0.29
6 0.28
7 0.28
8 0.28
9 0.26
10 0.24
11 0.19
12 0.14
13 0.14
14 0.14
15 0.14
16 0.14
17 0.14
18 0.16
19 0.2
20 0.2
21 0.18
22 0.25
23 0.27
24 0.3
25 0.32
26 0.31
27 0.32
28 0.35
29 0.38
30 0.36
31 0.38
32 0.39
33 0.39
34 0.38
35 0.38
36 0.39
37 0.42
38 0.46
39 0.48
40 0.49
41 0.53
42 0.59
43 0.62
44 0.67
45 0.7
46 0.69
47 0.7
48 0.74
49 0.76
50 0.79
51 0.79
52 0.77
53 0.74
54 0.74
55 0.78
56 0.76
57 0.72
58 0.64
59 0.59
60 0.54
61 0.48
62 0.4
63 0.32
64 0.26
65 0.21
66 0.2
67 0.15
68 0.11
69 0.11
70 0.1
71 0.07
72 0.07
73 0.07
74 0.07
75 0.07
76 0.07
77 0.07
78 0.07
79 0.09
80 0.09
81 0.11
82 0.1
83 0.1
84 0.12
85 0.12
86 0.13
87 0.13
88 0.16
89 0.16
90 0.17
91 0.18
92 0.18
93 0.18
94 0.18
95 0.18
96 0.14
97 0.14
98 0.15
99 0.14
100 0.13
101 0.14
102 0.14
103 0.14
104 0.16
105 0.17
106 0.15
107 0.15
108 0.14
109 0.13
110 0.12
111 0.11
112 0.09
113 0.07
114 0.08
115 0.08
116 0.08
117 0.08
118 0.07
119 0.08
120 0.08
121 0.09
122 0.12
123 0.12
124 0.12
125 0.12
126 0.12
127 0.12
128 0.12
129 0.11
130 0.07
131 0.09
132 0.09
133 0.1
134 0.15
135 0.19
136 0.22
137 0.3
138 0.36
139 0.46
140 0.53
141 0.63
142 0.67
143 0.74
144 0.8
145 0.78
146 0.75
147 0.65
148 0.59
149 0.51
150 0.42
151 0.35
152 0.25
153 0.23
154 0.19
155 0.19
156 0.17
157 0.15
158 0.13
159 0.09
160 0.09
161 0.06
162 0.06
163 0.06
164 0.05
165 0.05
166 0.05
167 0.05
168 0.04
169 0.05
170 0.05
171 0.04
172 0.04
173 0.04
174 0.04
175 0.04
176 0.04
177 0.03
178 0.04
179 0.04
180 0.04
181 0.04
182 0.05
183 0.05
184 0.06
185 0.08
186 0.08
187 0.08
188 0.09
189 0.11
190 0.11
191 0.16
192 0.16
193 0.15
194 0.15
195 0.16
196 0.2
197 0.19
198 0.18
199 0.13
200 0.13
201 0.13
202 0.13
203 0.12
204 0.09
205 0.08
206 0.09
207 0.14
208 0.17
209 0.25
210 0.28
211 0.31
212 0.37
213 0.43
214 0.51
215 0.58
216 0.65
217 0.67
218 0.74
219 0.82
220 0.86
221 0.92
222 0.93
223 0.93
224 0.93
225 0.93
226 0.91
227 0.83
228 0.75
229 0.65
230 0.56
231 0.47
232 0.37
233 0.27
234 0.18
235 0.15
236 0.12
237 0.11
238 0.1
239 0.08
240 0.07
241 0.08
242 0.07
243 0.07
244 0.07
245 0.06
246 0.06
247 0.07
248 0.08
249 0.08
250 0.07
251 0.07
252 0.07
253 0.07
254 0.07
255 0.06
256 0.05
257 0.04
258 0.05
259 0.06
260 0.07
261 0.07
262 0.08
263 0.15
264 0.26
265 0.33
266 0.38
267 0.43
268 0.43
269 0.45
270 0.49
271 0.49
272 0.47
273 0.44
274 0.43
275 0.39
276 0.37
277 0.35
278 0.31
279 0.24
280 0.16
281 0.13
282 0.11
283 0.1
284 0.1
285 0.1
286 0.09
287 0.09
288 0.08
289 0.1
290 0.08
291 0.08
292 0.09
293 0.09
294 0.09
295 0.09
296 0.08
297 0.05
298 0.05
299 0.05
300 0.04
301 0.04
302 0.04
303 0.05
304 0.05
305 0.05
306 0.06
307 0.07
308 0.1
309 0.11
310 0.12
311 0.12
312 0.14
313 0.14
314 0.13
315 0.12
316 0.1
317 0.08
318 0.11
319 0.12
320 0.11
321 0.11
322 0.11
323 0.11
324 0.11
325 0.13
326 0.11
327 0.1
328 0.1
329 0.11
330 0.1
331 0.1
332 0.1
333 0.08
334 0.08
335 0.07
336 0.07
337 0.08
338 0.08
339 0.08
340 0.12
341 0.12
342 0.12
343 0.13
344 0.12
345 0.11
346 0.12
347 0.12
348 0.1
349 0.13
350 0.11
351 0.11
352 0.11
353 0.12
354 0.12
355 0.11
356 0.1
357 0.07
358 0.07
359 0.08
360 0.11
361 0.11
362 0.1
363 0.1
364 0.1
365 0.1
366 0.1
367 0.1
368 0.08
369 0.12
370 0.15
371 0.17
372 0.17
373 0.18
374 0.17
375 0.2
376 0.19
377 0.18
378 0.17
379 0.2
380 0.26
381 0.32
382 0.35
383 0.42
384 0.51
385 0.57
386 0.66
387 0.7
388 0.72
389 0.74
390 0.73
391 0.7
392 0.65
393 0.57
394 0.48
395 0.49
396 0.41
397 0.36
398 0.4
399 0.38
400 0.42
401 0.49
402 0.5
403 0.5
404 0.5
405 0.49
406 0.5
407 0.53
408 0.49
409 0.48
410 0.46
411 0.41
412 0.46
413 0.45
414 0.42
415 0.42
416 0.45
417 0.45
418 0.52
419 0.58
420 0.56
421 0.6
422 0.64
423 0.61
424 0.57
425 0.55
426 0.57
427 0.58
428 0.62
429 0.57
430 0.56
431 0.56
432 0.57
433 0.56
434 0.55
435 0.53
436 0.51
437 0.54
438 0.56
439 0.53
440 0.51
441 0.5
442 0.45
443 0.44
444 0.39
445 0.38
446 0.38
447 0.42
448 0.49
449 0.53
450 0.59
451 0.55
452 0.61
453 0.66
454 0.66
455 0.7
456 0.69
457 0.68
458 0.64
459 0.64
460 0.58
461 0.52
462 0.44
463 0.39
464 0.36
465 0.32
466 0.29
467 0.28
468 0.31
469 0.32
470 0.36
471 0.34
472 0.34
473 0.39
474 0.44
475 0.48
476 0.49
477 0.5
478 0.49
479 0.56
480 0.61
481 0.63
482 0.66