Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H2B1B3

Protein Details
Accession H2B1B3    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
2-28SFTSLLPPPKRESKRKQVDVKRVEAERHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 12.5, mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017862  SKI-int_prot_SKIP  
IPR004015  SKI-int_prot_SKIP_SNW-dom  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
KEGG kaf:KAFR_0K00580  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF02731  SKIP_SNW  
Amino Acid Sequences MSFTSLLPPPKRESKRKQVDVKRVEAERLLSALNKDKVIEESIDEQKTKSDPAIQIASQVNFKEFVPLRQQNFGLDVPLPSQERIDETYNKTRSFLQKLVSKDQQKKLSSVNKPDTININSQTIQVTTRQQDPLQPNIHRKSAKIYTPQLLENNAPIPTLHTEAEKPSKEEREKWKIPTFVSQWKNQKGYTVDRAGFGTRTGEPGGISGKFIELSEAIEKVDMEKRREIQLKYEEKKNLMEKEVKIKEDKLRNLAERARYHGRKQDGHVKKETSVVEQSSRGNILVERLKELAYREGRDVSEKVILGTAKATKQPELNYDSRLFIKGASTQRSENQVYDNPLFVQQDIDSIYRTNLNKLDDMVENTNDEGSVMDRVTREVKGGQQERSGPVMFTKAEDQLSSDKKKSFGLEKESK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.74
2 0.81
3 0.86
4 0.9
5 0.9
6 0.92
7 0.89
8 0.87
9 0.83
10 0.75
11 0.67
12 0.59
13 0.51
14 0.42
15 0.35
16 0.28
17 0.22
18 0.23
19 0.29
20 0.29
21 0.27
22 0.26
23 0.26
24 0.27
25 0.28
26 0.25
27 0.2
28 0.23
29 0.29
30 0.32
31 0.31
32 0.29
33 0.29
34 0.3
35 0.29
36 0.24
37 0.25
38 0.24
39 0.29
40 0.33
41 0.3
42 0.34
43 0.36
44 0.36
45 0.32
46 0.3
47 0.26
48 0.22
49 0.22
50 0.25
51 0.22
52 0.25
53 0.32
54 0.39
55 0.41
56 0.45
57 0.45
58 0.38
59 0.4
60 0.36
61 0.28
62 0.21
63 0.19
64 0.15
65 0.19
66 0.19
67 0.16
68 0.16
69 0.14
70 0.16
71 0.19
72 0.23
73 0.25
74 0.3
75 0.4
76 0.44
77 0.44
78 0.42
79 0.45
80 0.47
81 0.48
82 0.45
83 0.42
84 0.42
85 0.47
86 0.54
87 0.56
88 0.58
89 0.6
90 0.65
91 0.67
92 0.63
93 0.61
94 0.62
95 0.63
96 0.62
97 0.63
98 0.62
99 0.59
100 0.58
101 0.58
102 0.55
103 0.48
104 0.45
105 0.37
106 0.33
107 0.28
108 0.27
109 0.25
110 0.2
111 0.18
112 0.16
113 0.19
114 0.19
115 0.23
116 0.24
117 0.24
118 0.31
119 0.33
120 0.38
121 0.4
122 0.42
123 0.46
124 0.48
125 0.54
126 0.48
127 0.45
128 0.45
129 0.44
130 0.46
131 0.44
132 0.45
133 0.43
134 0.44
135 0.46
136 0.4
137 0.36
138 0.3
139 0.24
140 0.22
141 0.17
142 0.15
143 0.12
144 0.12
145 0.12
146 0.14
147 0.13
148 0.12
149 0.13
150 0.17
151 0.24
152 0.23
153 0.24
154 0.26
155 0.34
156 0.35
157 0.42
158 0.48
159 0.51
160 0.54
161 0.58
162 0.6
163 0.55
164 0.53
165 0.53
166 0.48
167 0.47
168 0.46
169 0.47
170 0.49
171 0.51
172 0.52
173 0.45
174 0.45
175 0.39
176 0.41
177 0.4
178 0.37
179 0.32
180 0.3
181 0.31
182 0.27
183 0.24
184 0.19
185 0.15
186 0.1
187 0.11
188 0.1
189 0.1
190 0.09
191 0.09
192 0.11
193 0.08
194 0.08
195 0.07
196 0.06
197 0.07
198 0.06
199 0.06
200 0.05
201 0.06
202 0.07
203 0.07
204 0.07
205 0.07
206 0.07
207 0.08
208 0.13
209 0.15
210 0.17
211 0.2
212 0.22
213 0.29
214 0.35
215 0.34
216 0.35
217 0.41
218 0.48
219 0.49
220 0.54
221 0.5
222 0.46
223 0.5
224 0.48
225 0.42
226 0.36
227 0.39
228 0.33
229 0.41
230 0.43
231 0.4
232 0.37
233 0.38
234 0.41
235 0.44
236 0.45
237 0.41
238 0.42
239 0.42
240 0.45
241 0.46
242 0.46
243 0.39
244 0.42
245 0.46
246 0.45
247 0.46
248 0.48
249 0.49
250 0.46
251 0.49
252 0.53
253 0.52
254 0.54
255 0.56
256 0.52
257 0.47
258 0.49
259 0.45
260 0.38
261 0.33
262 0.3
263 0.26
264 0.26
265 0.26
266 0.22
267 0.22
268 0.18
269 0.15
270 0.13
271 0.15
272 0.18
273 0.17
274 0.18
275 0.18
276 0.18
277 0.19
278 0.21
279 0.24
280 0.24
281 0.25
282 0.25
283 0.27
284 0.27
285 0.3
286 0.28
287 0.22
288 0.22
289 0.2
290 0.18
291 0.18
292 0.17
293 0.14
294 0.16
295 0.17
296 0.15
297 0.2
298 0.21
299 0.21
300 0.24
301 0.26
302 0.3
303 0.33
304 0.33
305 0.34
306 0.34
307 0.34
308 0.32
309 0.31
310 0.26
311 0.19
312 0.19
313 0.22
314 0.27
315 0.29
316 0.31
317 0.31
318 0.35
319 0.41
320 0.41
321 0.35
322 0.34
323 0.33
324 0.36
325 0.35
326 0.33
327 0.27
328 0.28
329 0.28
330 0.22
331 0.2
332 0.14
333 0.15
334 0.16
335 0.16
336 0.13
337 0.13
338 0.15
339 0.19
340 0.2
341 0.23
342 0.24
343 0.26
344 0.26
345 0.27
346 0.29
347 0.26
348 0.3
349 0.29
350 0.26
351 0.24
352 0.23
353 0.22
354 0.18
355 0.16
356 0.11
357 0.09
358 0.1
359 0.09
360 0.11
361 0.11
362 0.14
363 0.17
364 0.17
365 0.18
366 0.19
367 0.24
368 0.32
369 0.38
370 0.39
371 0.41
372 0.45
373 0.46
374 0.48
375 0.43
376 0.33
377 0.3
378 0.3
379 0.25
380 0.23
381 0.24
382 0.23
383 0.23
384 0.23
385 0.24
386 0.28
387 0.36
388 0.4
389 0.42
390 0.42
391 0.42
392 0.46
393 0.49
394 0.49
395 0.5