Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1E4TAB8

Protein Details
Accession A0A1E4TAB8    Localization Confidence High Confidence Score 20.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
147-168NESAKSKKAKSKKKAALKEAENHydrophilic
245-277SSKPAKSSKPPKSKHNKPTKHSSKKSKPANSANHydrophilic
293-315SPSDTNKSKKRSKKTPSVAKPSTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
148-200ESAKSKKAKSKKKAALKEAENGRSKAKASKPSKTAKSSKSAKPGKRERAAAAG
247-272KPAKSSKPPKSKHNKPTKHSSKKSKP
300-306SKKRSKK
Subcellular Location(s) nucl 11, cyto_nucl 10, cyto 7, mito 5, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR005120  UPF3_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF03467  Smg4_UPF3  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd00590  RRM_SF  
Amino Acid Sequences MKVHVRNIPYDATEADFAKHLIQHASNLPADAAVYMRFEPGKKERMTRLECPGYAYVTFKTEELARSFMDSVSGTSMHGHTELSGSSRISVEPAINQDTPVKRENSPDPLNNTFRKNVMYLKWKDPNYVVVPPKSEKSQKGKNVDGNESAKSKKAKSKKKAALKEAENGRSKAKASKPSKTAKSSKSAKPGKRERAAAAGAAAAEKGPAAPTEIITSGNSKGPDHQPTADISTDEKDKQPQTEASSKPAKSSKPPKSKHNKPTKHSSKKSKPANSANDTNASHASNPSATEPSPSDTNKSKKRSKKTPSVAKPSTSETASKKNTTPAIEVRAGLALDLIVRSSEQFLLLAESSQNSIPKPHPFGVPHPHPKGPLDYACGSLFDFPALRFFYTSFMGKDQYQAGNPPPPGYEQSSSDPQVQDRAFFGNNQQGGYPPQGGYSPQGGYPPQGYPPQGYQQGYPPQPGYPPQGGYPQQGYGQPVYQQQQQAPGMDGTSCLLACLGALCVCCALDALT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.23
2 0.21
3 0.19
4 0.18
5 0.18
6 0.18
7 0.17
8 0.19
9 0.2
10 0.23
11 0.25
12 0.29
13 0.28
14 0.26
15 0.24
16 0.2
17 0.19
18 0.15
19 0.12
20 0.08
21 0.1
22 0.1
23 0.12
24 0.14
25 0.15
26 0.22
27 0.28
28 0.36
29 0.38
30 0.44
31 0.5
32 0.59
33 0.65
34 0.64
35 0.67
36 0.65
37 0.61
38 0.59
39 0.53
40 0.45
41 0.39
42 0.35
43 0.27
44 0.22
45 0.23
46 0.17
47 0.18
48 0.18
49 0.21
50 0.21
51 0.22
52 0.2
53 0.22
54 0.23
55 0.21
56 0.2
57 0.16
58 0.14
59 0.15
60 0.14
61 0.12
62 0.13
63 0.13
64 0.12
65 0.12
66 0.11
67 0.09
68 0.1
69 0.1
70 0.11
71 0.13
72 0.12
73 0.13
74 0.13
75 0.13
76 0.13
77 0.14
78 0.13
79 0.14
80 0.17
81 0.21
82 0.2
83 0.21
84 0.26
85 0.28
86 0.31
87 0.33
88 0.32
89 0.29
90 0.35
91 0.4
92 0.42
93 0.45
94 0.47
95 0.48
96 0.52
97 0.57
98 0.55
99 0.53
100 0.47
101 0.42
102 0.39
103 0.35
104 0.34
105 0.34
106 0.4
107 0.41
108 0.47
109 0.54
110 0.52
111 0.53
112 0.48
113 0.48
114 0.43
115 0.46
116 0.42
117 0.37
118 0.4
119 0.39
120 0.41
121 0.4
122 0.42
123 0.42
124 0.45
125 0.52
126 0.56
127 0.61
128 0.65
129 0.65
130 0.64
131 0.6
132 0.58
133 0.51
134 0.46
135 0.42
136 0.36
137 0.35
138 0.33
139 0.33
140 0.36
141 0.43
142 0.51
143 0.58
144 0.68
145 0.72
146 0.8
147 0.84
148 0.84
149 0.83
150 0.76
151 0.75
152 0.71
153 0.69
154 0.63
155 0.55
156 0.48
157 0.41
158 0.39
159 0.38
160 0.37
161 0.39
162 0.41
163 0.48
164 0.53
165 0.6
166 0.66
167 0.67
168 0.69
169 0.63
170 0.67
171 0.67
172 0.65
173 0.67
174 0.69
175 0.67
176 0.69
177 0.74
178 0.74
179 0.72
180 0.69
181 0.61
182 0.57
183 0.52
184 0.42
185 0.33
186 0.23
187 0.17
188 0.14
189 0.11
190 0.05
191 0.04
192 0.04
193 0.03
194 0.03
195 0.03
196 0.05
197 0.06
198 0.06
199 0.08
200 0.09
201 0.09
202 0.1
203 0.11
204 0.11
205 0.13
206 0.13
207 0.12
208 0.15
209 0.19
210 0.23
211 0.23
212 0.23
213 0.21
214 0.22
215 0.24
216 0.21
217 0.17
218 0.14
219 0.13
220 0.15
221 0.15
222 0.15
223 0.17
224 0.17
225 0.18
226 0.2
227 0.21
228 0.23
229 0.3
230 0.3
231 0.31
232 0.37
233 0.36
234 0.37
235 0.38
236 0.35
237 0.36
238 0.45
239 0.5
240 0.53
241 0.58
242 0.64
243 0.71
244 0.8
245 0.82
246 0.83
247 0.81
248 0.75
249 0.82
250 0.83
251 0.84
252 0.82
253 0.82
254 0.81
255 0.82
256 0.87
257 0.83
258 0.8
259 0.78
260 0.78
261 0.73
262 0.67
263 0.59
264 0.55
265 0.47
266 0.4
267 0.33
268 0.24
269 0.19
270 0.15
271 0.14
272 0.1
273 0.1
274 0.1
275 0.1
276 0.1
277 0.11
278 0.12
279 0.13
280 0.17
281 0.16
282 0.19
283 0.24
284 0.33
285 0.39
286 0.46
287 0.53
288 0.58
289 0.68
290 0.74
291 0.76
292 0.79
293 0.81
294 0.84
295 0.85
296 0.86
297 0.8
298 0.72
299 0.65
300 0.58
301 0.51
302 0.41
303 0.36
304 0.29
305 0.34
306 0.35
307 0.36
308 0.33
309 0.35
310 0.37
311 0.35
312 0.36
313 0.3
314 0.32
315 0.31
316 0.29
317 0.25
318 0.22
319 0.2
320 0.16
321 0.12
322 0.06
323 0.05
324 0.05
325 0.04
326 0.03
327 0.03
328 0.04
329 0.06
330 0.06
331 0.06
332 0.06
333 0.06
334 0.08
335 0.08
336 0.08
337 0.07
338 0.08
339 0.09
340 0.1
341 0.11
342 0.09
343 0.13
344 0.16
345 0.21
346 0.26
347 0.27
348 0.31
349 0.32
350 0.39
351 0.45
352 0.52
353 0.55
354 0.55
355 0.55
356 0.51
357 0.51
358 0.48
359 0.44
360 0.37
361 0.32
362 0.29
363 0.3
364 0.28
365 0.27
366 0.22
367 0.18
368 0.16
369 0.12
370 0.11
371 0.09
372 0.12
373 0.13
374 0.13
375 0.13
376 0.13
377 0.15
378 0.17
379 0.19
380 0.16
381 0.16
382 0.18
383 0.18
384 0.2
385 0.22
386 0.21
387 0.21
388 0.23
389 0.25
390 0.29
391 0.29
392 0.28
393 0.24
394 0.25
395 0.27
396 0.29
397 0.28
398 0.25
399 0.3
400 0.35
401 0.36
402 0.38
403 0.36
404 0.31
405 0.36
406 0.32
407 0.28
408 0.24
409 0.25
410 0.21
411 0.21
412 0.24
413 0.25
414 0.25
415 0.25
416 0.23
417 0.21
418 0.23
419 0.26
420 0.24
421 0.17
422 0.16
423 0.17
424 0.18
425 0.19
426 0.2
427 0.18
428 0.17
429 0.19
430 0.19
431 0.2
432 0.22
433 0.2
434 0.21
435 0.24
436 0.25
437 0.26
438 0.3
439 0.34
440 0.38
441 0.38
442 0.36
443 0.4
444 0.47
445 0.46
446 0.45
447 0.4
448 0.35
449 0.36
450 0.39
451 0.38
452 0.34
453 0.33
454 0.31
455 0.39
456 0.4
457 0.42
458 0.4
459 0.35
460 0.33
461 0.34
462 0.35
463 0.29
464 0.29
465 0.27
466 0.31
467 0.33
468 0.36
469 0.38
470 0.36
471 0.41
472 0.41
473 0.39
474 0.36
475 0.33
476 0.28
477 0.23
478 0.22
479 0.15
480 0.14
481 0.12
482 0.09
483 0.08
484 0.07
485 0.07
486 0.07
487 0.08
488 0.08
489 0.09
490 0.09
491 0.1
492 0.1
493 0.1