Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1E4TB24

Protein Details
Accession A0A1E4TB24    Localization Confidence Low Confidence Score 9.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
16-39QAIADRIRKPPRGRYAQKCVEHQIHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 13.5, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000690  Matrin/U1-C_Znf_C2H2  
IPR003604  Matrin/U1-like-C_Znf_C2H2  
IPR031774  SF3A3_dom  
IPR024598  SF3a60/Prp9_C  
IPR036236  Znf_C2H2_sf  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF16837  SF3A3  
PF11931  SF3a60_Prp9_C  
PF12874  zf-met  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50171  ZF_MATRIN  
Amino Acid Sequences METLRHAYEDIERLEQAIADRIRKPPRGRYAQKCVEHQIKRFLDEALLQAEFIVNNPIEEELKTITDFDREYKRLKLSYVTYPDRSIPDNTYSKLPWQTDNDPALVRFTDEEVFGKFLDLNVLFETYTSLKGASDVNYDTFVSSFDTLVRDLPDSGQSYFTFLTDLQSYLVDFIRRSEPLYDLDKFLAQTEADFQSQWVANTGKIDGIAPAAGSETMFCDACQKHFKTTTYDSHLRGKKHLRNAQAVSADSHNSDIKLGTPEYEKQRTLYCILKLAEYLRPVIKATVENNERKQAMTTRERQLEQQAIRTEYDDPSMFESKLEVDSDSDSDDLTKSHNPLKVPLGWDGKPIPLWLYKLQGLNMEFTCEICGNYLYRGRKAFEQHFTEQRHLNGLNVLGIQSPEAMKEITSIQEALDLWNIIKTNQRKERSKEENAVEMEDENGNVMSAKIYEDLKKQGIL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.24
3 0.2
4 0.22
5 0.23
6 0.25
7 0.28
8 0.35
9 0.44
10 0.51
11 0.57
12 0.59
13 0.66
14 0.73
15 0.79
16 0.81
17 0.83
18 0.85
19 0.85
20 0.8
21 0.79
22 0.78
23 0.75
24 0.7
25 0.7
26 0.62
27 0.59
28 0.54
29 0.46
30 0.38
31 0.33
32 0.3
33 0.22
34 0.2
35 0.16
36 0.15
37 0.15
38 0.13
39 0.11
40 0.13
41 0.1
42 0.1
43 0.1
44 0.12
45 0.12
46 0.12
47 0.14
48 0.11
49 0.13
50 0.13
51 0.14
52 0.13
53 0.15
54 0.16
55 0.19
56 0.26
57 0.28
58 0.31
59 0.35
60 0.4
61 0.39
62 0.4
63 0.41
64 0.37
65 0.43
66 0.49
67 0.49
68 0.46
69 0.47
70 0.48
71 0.44
72 0.42
73 0.36
74 0.31
75 0.32
76 0.34
77 0.33
78 0.35
79 0.33
80 0.36
81 0.39
82 0.37
83 0.35
84 0.37
85 0.39
86 0.43
87 0.44
88 0.4
89 0.35
90 0.33
91 0.3
92 0.23
93 0.2
94 0.13
95 0.13
96 0.12
97 0.12
98 0.13
99 0.12
100 0.13
101 0.12
102 0.12
103 0.1
104 0.09
105 0.13
106 0.12
107 0.12
108 0.11
109 0.12
110 0.11
111 0.11
112 0.13
113 0.1
114 0.11
115 0.1
116 0.09
117 0.08
118 0.1
119 0.11
120 0.11
121 0.12
122 0.12
123 0.13
124 0.14
125 0.14
126 0.13
127 0.12
128 0.11
129 0.1
130 0.1
131 0.09
132 0.09
133 0.1
134 0.1
135 0.11
136 0.12
137 0.1
138 0.1
139 0.11
140 0.14
141 0.15
142 0.15
143 0.16
144 0.15
145 0.17
146 0.16
147 0.15
148 0.13
149 0.11
150 0.12
151 0.1
152 0.11
153 0.09
154 0.09
155 0.09
156 0.09
157 0.1
158 0.09
159 0.08
160 0.1
161 0.13
162 0.13
163 0.14
164 0.14
165 0.15
166 0.17
167 0.22
168 0.21
169 0.19
170 0.19
171 0.19
172 0.18
173 0.17
174 0.14
175 0.09
176 0.09
177 0.11
178 0.12
179 0.11
180 0.11
181 0.1
182 0.12
183 0.13
184 0.13
185 0.12
186 0.11
187 0.11
188 0.12
189 0.12
190 0.09
191 0.09
192 0.09
193 0.06
194 0.06
195 0.05
196 0.04
197 0.04
198 0.04
199 0.04
200 0.04
201 0.03
202 0.04
203 0.05
204 0.05
205 0.05
206 0.1
207 0.1
208 0.14
209 0.21
210 0.21
211 0.24
212 0.28
213 0.29
214 0.3
215 0.35
216 0.37
217 0.39
218 0.42
219 0.4
220 0.45
221 0.48
222 0.43
223 0.45
224 0.48
225 0.46
226 0.52
227 0.55
228 0.51
229 0.54
230 0.55
231 0.53
232 0.46
233 0.41
234 0.32
235 0.28
236 0.23
237 0.16
238 0.16
239 0.12
240 0.1
241 0.1
242 0.08
243 0.08
244 0.1
245 0.1
246 0.1
247 0.11
248 0.16
249 0.22
250 0.26
251 0.25
252 0.24
253 0.26
254 0.27
255 0.28
256 0.28
257 0.22
258 0.24
259 0.24
260 0.23
261 0.22
262 0.22
263 0.21
264 0.18
265 0.19
266 0.14
267 0.15
268 0.15
269 0.15
270 0.14
271 0.14
272 0.15
273 0.21
274 0.26
275 0.3
276 0.32
277 0.36
278 0.35
279 0.33
280 0.33
281 0.3
282 0.32
283 0.35
284 0.39
285 0.42
286 0.47
287 0.47
288 0.47
289 0.47
290 0.47
291 0.41
292 0.4
293 0.36
294 0.33
295 0.33
296 0.32
297 0.29
298 0.22
299 0.23
300 0.17
301 0.15
302 0.17
303 0.19
304 0.18
305 0.16
306 0.16
307 0.14
308 0.15
309 0.15
310 0.11
311 0.09
312 0.11
313 0.11
314 0.12
315 0.1
316 0.09
317 0.09
318 0.09
319 0.08
320 0.1
321 0.12
322 0.14
323 0.19
324 0.22
325 0.22
326 0.26
327 0.3
328 0.31
329 0.3
330 0.35
331 0.35
332 0.32
333 0.35
334 0.33
335 0.3
336 0.27
337 0.25
338 0.21
339 0.18
340 0.21
341 0.2
342 0.23
343 0.25
344 0.26
345 0.27
346 0.29
347 0.27
348 0.27
349 0.25
350 0.24
351 0.2
352 0.18
353 0.2
354 0.15
355 0.14
356 0.12
357 0.13
358 0.11
359 0.15
360 0.21
361 0.22
362 0.27
363 0.3
364 0.31
365 0.35
366 0.42
367 0.46
368 0.48
369 0.52
370 0.53
371 0.58
372 0.6
373 0.59
374 0.54
375 0.48
376 0.45
377 0.39
378 0.34
379 0.28
380 0.24
381 0.21
382 0.18
383 0.17
384 0.12
385 0.12
386 0.11
387 0.1
388 0.09
389 0.08
390 0.09
391 0.09
392 0.08
393 0.1
394 0.11
395 0.12
396 0.13
397 0.13
398 0.11
399 0.14
400 0.14
401 0.14
402 0.15
403 0.14
404 0.12
405 0.15
406 0.15
407 0.13
408 0.21
409 0.26
410 0.35
411 0.44
412 0.53
413 0.59
414 0.66
415 0.76
416 0.77
417 0.8
418 0.78
419 0.74
420 0.73
421 0.65
422 0.61
423 0.51
424 0.42
425 0.35
426 0.26
427 0.21
428 0.14
429 0.12
430 0.1
431 0.09
432 0.09
433 0.07
434 0.07
435 0.09
436 0.1
437 0.14
438 0.18
439 0.23
440 0.29