Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1E3PNB6

Protein Details
Accession A0A1E3PNB6    Localization Confidence High Confidence Score 25.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
192-240KDDPQPKASKKAKRDKKKAEKKAEIKDKDDKKKKKKKKVEKGKVESVDNBasic
336-368SLSERPPKSKSNKKPNSARKKKSVKSDEAKTPSHydrophilic
373-402SPDTATPKNPSRTRKPAKKKEPTNANSQADHydrophilic
416-444GDKGGVSINRRRNNKPKDGDKKSARPSGDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
68-71SKKK
197-235PKASKKAKRDKKKAEKKAEIKDKDDKKKKKKKKVEKGKV
245-280TSKSARTRGEKKAKSKAAKEVNGDKKSANRNKASKK
340-364RPPKSKSNKKPNSARKKKSVKSDEA
379-392PKNPSRTRKPAKKK
425-440RRRNNKPKDGDKKSAR
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR039722  Upf3  
IPR005120  UPF3_dom  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0000184  P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay  
Pfam View protein in Pfam  
PF03467  Smg4_UPF3  
CDD cd12455  RRM_like_Smg4_UPF3  
Amino Acid Sequences MESVFTTEIVEVSHPELVEVEHETQPQLSRSYQEGLDDKKDLSEEKEKSVSVTTGKSNNKASHGSSKSKKKLKIIVRQLPPTLDEEEFFDSIKEWVNDETTSVKYYVQGKIPKNPSKNTQVSRAYICFRNETYLIDFFNAFNGTVLSDLKNVKYLSLIEYAPFQAVPVESPIDKKEATIEQDSHYIRFVEGKDDPQPKASKKAKRDKKKAEKKAEIKDKDDKKKKKKKKVEKGKVESVDNTKDNTSKSARTRGEKKAKSKAAKEVNGDKKSANRNKASKKSTVSTEKPVIIKSTDSTPTVTASSSSTIKPSLPLSFNAQPFVPSAIPVFEPVLDASLSERPPKSKSNKKPNSARKKKSVKSDEAKTPSAGTGSPDTATPKNPSRTRKPAKKKEPTNANSQADKPLSVSNTVEQQQGDKGGVSINRRRNNKPKDGDKKSARPSGDI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.13
2 0.12
3 0.13
4 0.12
5 0.13
6 0.16
7 0.17
8 0.18
9 0.19
10 0.19
11 0.21
12 0.23
13 0.24
14 0.23
15 0.2
16 0.21
17 0.24
18 0.27
19 0.26
20 0.28
21 0.32
22 0.34
23 0.37
24 0.36
25 0.32
26 0.3
27 0.31
28 0.27
29 0.28
30 0.32
31 0.31
32 0.34
33 0.37
34 0.36
35 0.36
36 0.37
37 0.33
38 0.27
39 0.28
40 0.28
41 0.33
42 0.38
43 0.41
44 0.45
45 0.46
46 0.47
47 0.47
48 0.47
49 0.48
50 0.5
51 0.54
52 0.57
53 0.64
54 0.69
55 0.74
56 0.76
57 0.74
58 0.77
59 0.77
60 0.79
61 0.79
62 0.8
63 0.79
64 0.79
65 0.73
66 0.65
67 0.56
68 0.48
69 0.41
70 0.31
71 0.24
72 0.21
73 0.22
74 0.21
75 0.19
76 0.16
77 0.13
78 0.14
79 0.17
80 0.15
81 0.12
82 0.13
83 0.15
84 0.15
85 0.15
86 0.18
87 0.15
88 0.16
89 0.16
90 0.15
91 0.17
92 0.21
93 0.24
94 0.28
95 0.35
96 0.37
97 0.45
98 0.55
99 0.59
100 0.61
101 0.62
102 0.61
103 0.63
104 0.68
105 0.62
106 0.62
107 0.59
108 0.56
109 0.56
110 0.53
111 0.47
112 0.44
113 0.42
114 0.36
115 0.32
116 0.32
117 0.28
118 0.27
119 0.26
120 0.23
121 0.22
122 0.19
123 0.19
124 0.15
125 0.16
126 0.14
127 0.11
128 0.09
129 0.08
130 0.07
131 0.08
132 0.08
133 0.07
134 0.1
135 0.11
136 0.11
137 0.16
138 0.15
139 0.15
140 0.15
141 0.15
142 0.15
143 0.17
144 0.16
145 0.12
146 0.14
147 0.14
148 0.13
149 0.12
150 0.09
151 0.07
152 0.07
153 0.07
154 0.07
155 0.08
156 0.08
157 0.1
158 0.11
159 0.13
160 0.12
161 0.12
162 0.14
163 0.15
164 0.19
165 0.2
166 0.21
167 0.2
168 0.26
169 0.26
170 0.24
171 0.21
172 0.18
173 0.15
174 0.17
175 0.16
176 0.14
177 0.15
178 0.17
179 0.23
180 0.27
181 0.27
182 0.29
183 0.33
184 0.3
185 0.39
186 0.45
187 0.45
188 0.51
189 0.62
190 0.67
191 0.74
192 0.83
193 0.84
194 0.88
195 0.91
196 0.92
197 0.91
198 0.91
199 0.88
200 0.87
201 0.87
202 0.79
203 0.73
204 0.72
205 0.7
206 0.71
207 0.73
208 0.73
209 0.74
210 0.81
211 0.86
212 0.88
213 0.9
214 0.91
215 0.92
216 0.94
217 0.94
218 0.94
219 0.91
220 0.89
221 0.81
222 0.71
223 0.63
224 0.56
225 0.5
226 0.39
227 0.33
228 0.25
229 0.23
230 0.22
231 0.23
232 0.22
233 0.23
234 0.26
235 0.33
236 0.37
237 0.41
238 0.48
239 0.55
240 0.63
241 0.64
242 0.67
243 0.68
244 0.72
245 0.72
246 0.69
247 0.67
248 0.66
249 0.64
250 0.62
251 0.62
252 0.63
253 0.59
254 0.56
255 0.47
256 0.44
257 0.5
258 0.52
259 0.5
260 0.47
261 0.54
262 0.63
263 0.72
264 0.7
265 0.66
266 0.63
267 0.59
268 0.59
269 0.59
270 0.53
271 0.51
272 0.5
273 0.48
274 0.44
275 0.42
276 0.36
277 0.28
278 0.25
279 0.2
280 0.2
281 0.19
282 0.19
283 0.19
284 0.18
285 0.18
286 0.18
287 0.17
288 0.12
289 0.11
290 0.13
291 0.13
292 0.13
293 0.13
294 0.14
295 0.14
296 0.15
297 0.16
298 0.18
299 0.18
300 0.19
301 0.25
302 0.3
303 0.31
304 0.3
305 0.28
306 0.24
307 0.23
308 0.25
309 0.18
310 0.12
311 0.12
312 0.12
313 0.12
314 0.12
315 0.12
316 0.09
317 0.09
318 0.09
319 0.1
320 0.08
321 0.08
322 0.09
323 0.13
324 0.14
325 0.18
326 0.2
327 0.21
328 0.25
329 0.34
330 0.42
331 0.48
332 0.58
333 0.65
334 0.73
335 0.8
336 0.87
337 0.89
338 0.91
339 0.92
340 0.9
341 0.89
342 0.9
343 0.87
344 0.87
345 0.85
346 0.84
347 0.82
348 0.81
349 0.81
350 0.76
351 0.72
352 0.62
353 0.54
354 0.44
355 0.36
356 0.28
357 0.21
358 0.19
359 0.18
360 0.17
361 0.17
362 0.21
363 0.22
364 0.25
365 0.28
366 0.32
367 0.41
368 0.47
369 0.55
370 0.6
371 0.7
372 0.77
373 0.82
374 0.85
375 0.87
376 0.91
377 0.94
378 0.94
379 0.93
380 0.93
381 0.86
382 0.85
383 0.84
384 0.78
385 0.72
386 0.64
387 0.61
388 0.51
389 0.48
390 0.39
391 0.34
392 0.3
393 0.28
394 0.28
395 0.23
396 0.29
397 0.3
398 0.31
399 0.26
400 0.26
401 0.26
402 0.26
403 0.24
404 0.17
405 0.16
406 0.18
407 0.22
408 0.27
409 0.34
410 0.42
411 0.49
412 0.56
413 0.65
414 0.71
415 0.77
416 0.8
417 0.82
418 0.83
419 0.86
420 0.88
421 0.9
422 0.89
423 0.89
424 0.87
425 0.85