Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H2AVX7

Protein Details
Accession H2AVX7    Localization Confidence Low Confidence Score 6.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-21MREREKKTGRKCTSRIVSRKYBasic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) mito 20, nucl 3.5, cyto_nucl 3.5, cyto 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR016487  Lsm6/sSmF  
IPR010920  LSM_dom_sf  
IPR047575  Sm  
IPR001163  Sm_dom_euk/arc  
Gene Ontology GO:0120114  C:Sm-like protein family complex  
GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
KEGG kaf:KAFR_0E03760  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01423  LSM  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS52002  SM  
Amino Acid Sequences MREREKKTGRKCTSRIVSRKYIPLAVLSLVTRVSLQLSKLLHHIMSETSTVSTQFLSDIIGKPVNVKLHSGMLYTGLLQSIDGFMNVALAQVTEHYESKENGLLTKYNSDVFLRGTQVMYISEV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.82
2 0.81
3 0.77
4 0.77
5 0.71
6 0.74
7 0.66
8 0.58
9 0.48
10 0.41
11 0.35
12 0.26
13 0.23
14 0.16
15 0.14
16 0.11
17 0.11
18 0.09
19 0.08
20 0.09
21 0.09
22 0.09
23 0.13
24 0.13
25 0.14
26 0.15
27 0.17
28 0.14
29 0.13
30 0.13
31 0.1
32 0.11
33 0.1
34 0.09
35 0.08
36 0.08
37 0.09
38 0.08
39 0.07
40 0.06
41 0.06
42 0.05
43 0.06
44 0.07
45 0.08
46 0.09
47 0.1
48 0.09
49 0.1
50 0.13
51 0.14
52 0.13
53 0.13
54 0.12
55 0.14
56 0.15
57 0.14
58 0.12
59 0.11
60 0.1
61 0.1
62 0.09
63 0.06
64 0.06
65 0.05
66 0.05
67 0.05
68 0.05
69 0.05
70 0.05
71 0.04
72 0.05
73 0.05
74 0.05
75 0.04
76 0.04
77 0.04
78 0.04
79 0.06
80 0.08
81 0.09
82 0.1
83 0.13
84 0.14
85 0.16
86 0.19
87 0.17
88 0.17
89 0.19
90 0.19
91 0.19
92 0.23
93 0.22
94 0.2
95 0.21
96 0.21
97 0.2
98 0.21
99 0.22
100 0.21
101 0.21
102 0.2
103 0.19
104 0.19