Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1E3PMX6

Protein Details
Accession A0A1E3PMX6    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
258-286AEIANGTYKAPRKRRRHKPKDSSSEGLPKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
266-277KAPRKRRRHKPK
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 12.5, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011665  BRF1_TBP-bd_dom  
IPR036915  Cyclin-like_sf  
IPR000812  TFIIB  
IPR023486  TFIIB_CS  
IPR013150  TFIIB_cyclin  
Gene Ontology GO:0017025  F:TBP-class protein binding  
GO:0070897  P:transcription preinitiation complex assembly  
Pfam View protein in Pfam  
PF07741  BRF1  
PF00382  TFIIB  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00782  TFIIB  
Amino Acid Sequences MNDAVRLVQRMGKDWLHEGRRPAGVAAACLYLAARMNNFRRSKAEIVFFAKIAEETLQRRLDEFKNTTAGKLSVQDFRGTNIESEADPPSFTKHRAAEEKMYEELEALEDAKRAGQPEPTNKLLDEDVQTLIDEVTRGETDIEKSLNESVPREIISSTNISPTGTNGNSSPMSSSSTTKSIVDSILRRHLHPEVPVIQWATPPSQVNDHPEDLSDVDDDEIDSFVLNPEEVEIKSRVWMTLNRDYILEQERKRLKMEAEIANGTYKAPRKRRRHKPKDSSSEGLPKDASESTKAMLQQRTFSKKINYAAIDNLFKKES
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.32
2 0.4
3 0.43
4 0.45
5 0.46
6 0.45
7 0.46
8 0.44
9 0.38
10 0.34
11 0.28
12 0.26
13 0.23
14 0.18
15 0.15
16 0.14
17 0.14
18 0.1
19 0.11
20 0.11
21 0.12
22 0.2
23 0.25
24 0.34
25 0.37
26 0.38
27 0.41
28 0.46
29 0.49
30 0.47
31 0.47
32 0.44
33 0.48
34 0.47
35 0.42
36 0.36
37 0.3
38 0.25
39 0.2
40 0.17
41 0.15
42 0.15
43 0.22
44 0.25
45 0.24
46 0.26
47 0.3
48 0.31
49 0.35
50 0.36
51 0.33
52 0.37
53 0.37
54 0.37
55 0.34
56 0.32
57 0.24
58 0.25
59 0.25
60 0.23
61 0.24
62 0.26
63 0.24
64 0.25
65 0.27
66 0.23
67 0.21
68 0.16
69 0.16
70 0.13
71 0.15
72 0.15
73 0.13
74 0.12
75 0.12
76 0.16
77 0.17
78 0.18
79 0.22
80 0.22
81 0.28
82 0.34
83 0.38
84 0.4
85 0.42
86 0.43
87 0.38
88 0.36
89 0.29
90 0.23
91 0.19
92 0.13
93 0.1
94 0.07
95 0.07
96 0.06
97 0.07
98 0.07
99 0.08
100 0.09
101 0.1
102 0.14
103 0.19
104 0.26
105 0.31
106 0.33
107 0.33
108 0.32
109 0.32
110 0.27
111 0.24
112 0.19
113 0.15
114 0.13
115 0.13
116 0.12
117 0.11
118 0.1
119 0.08
120 0.06
121 0.04
122 0.05
123 0.05
124 0.05
125 0.06
126 0.07
127 0.08
128 0.09
129 0.1
130 0.08
131 0.09
132 0.11
133 0.12
134 0.12
135 0.12
136 0.11
137 0.11
138 0.12
139 0.11
140 0.1
141 0.09
142 0.1
143 0.11
144 0.11
145 0.11
146 0.11
147 0.1
148 0.1
149 0.11
150 0.13
151 0.11
152 0.11
153 0.1
154 0.13
155 0.13
156 0.13
157 0.13
158 0.09
159 0.12
160 0.13
161 0.14
162 0.13
163 0.15
164 0.16
165 0.16
166 0.15
167 0.13
168 0.13
169 0.15
170 0.15
171 0.17
172 0.24
173 0.25
174 0.25
175 0.27
176 0.28
177 0.27
178 0.26
179 0.27
180 0.22
181 0.22
182 0.23
183 0.22
184 0.19
185 0.18
186 0.18
187 0.15
188 0.14
189 0.14
190 0.14
191 0.17
192 0.18
193 0.22
194 0.25
195 0.25
196 0.23
197 0.22
198 0.22
199 0.19
200 0.18
201 0.13
202 0.09
203 0.07
204 0.07
205 0.07
206 0.06
207 0.06
208 0.05
209 0.05
210 0.04
211 0.05
212 0.05
213 0.05
214 0.04
215 0.05
216 0.07
217 0.07
218 0.11
219 0.11
220 0.11
221 0.14
222 0.14
223 0.14
224 0.15
225 0.19
226 0.24
227 0.31
228 0.33
229 0.32
230 0.32
231 0.31
232 0.33
233 0.36
234 0.35
235 0.28
236 0.35
237 0.4
238 0.42
239 0.44
240 0.43
241 0.38
242 0.39
243 0.45
244 0.42
245 0.41
246 0.4
247 0.39
248 0.36
249 0.35
250 0.27
251 0.25
252 0.25
253 0.3
254 0.39
255 0.49
256 0.58
257 0.69
258 0.8
259 0.87
260 0.92
261 0.94
262 0.95
263 0.96
264 0.95
265 0.92
266 0.86
267 0.81
268 0.79
269 0.69
270 0.61
271 0.5
272 0.39
273 0.34
274 0.32
275 0.27
276 0.21
277 0.22
278 0.2
279 0.23
280 0.27
281 0.3
282 0.34
283 0.34
284 0.38
285 0.46
286 0.53
287 0.52
288 0.54
289 0.55
290 0.55
291 0.58
292 0.59
293 0.54
294 0.48
295 0.52
296 0.53
297 0.52
298 0.47