Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H2APJ9

Protein Details
Accession H2APJ9    Localization Confidence High Confidence Score 20.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
130-150VLSGRIRKTPRRKFHLKSMTFHydrophilic
442-472GIWMKEMKNKKRDALRQIRKRKAKDNNVILIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
137-141KTPRR
448-465MKNKKRDALRQIRKRKAK
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG kaf:KAFR_0A08650  -  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MGSIAKRIFVGNLNENLDDSLAFLHSRFQKFGSCKDDSFEKHSNFAYLNMSFNDEKDFQKLKSTFNNMKFKGNQLKIDLAKPSWESNWESQLEKDKVENEKKQKFIEQKNWEFYKKMKNINMSWTDRRQVLSGRIRKTPRRKFHLKSMTFRVNVNGSLKVYKCYKTKLWGYEKNKELMDLVYKFVGGKWRNGYDHIVDRLDYSRSVNSIKFPNKENKNSTLTISNEGTNIEDEEHLSEEEKQKNNDVLTDLLSRFDFDKSVAVVDSDEAEAFGFSDHEEDTVGMNEQKSYLEAQNVSTTHQEYNMQDDAKDEEGGEDEPMPTFGFSNAETTQIKESTTSNTETLRSLFNPEQIDTTAASFKLMDEKNDDIDESKTIPETQIADIMEREPEAIRENNPESKNHLFFPHFNSPFLVGQTQLSKIKRTNNNILDNWEDEFWENRGIWMKEMKNKKRDALRQIRKRKAKDNNVILI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.37
2 0.37
3 0.34
4 0.29
5 0.22
6 0.15
7 0.11
8 0.09
9 0.09
10 0.08
11 0.15
12 0.23
13 0.26
14 0.27
15 0.28
16 0.35
17 0.39
18 0.47
19 0.48
20 0.45
21 0.42
22 0.45
23 0.51
24 0.47
25 0.51
26 0.51
27 0.46
28 0.45
29 0.45
30 0.44
31 0.36
32 0.35
33 0.32
34 0.24
35 0.25
36 0.22
37 0.26
38 0.23
39 0.23
40 0.26
41 0.23
42 0.23
43 0.28
44 0.31
45 0.27
46 0.36
47 0.38
48 0.38
49 0.45
50 0.53
51 0.54
52 0.6
53 0.7
54 0.62
55 0.68
56 0.65
57 0.64
58 0.66
59 0.62
60 0.57
61 0.5
62 0.56
63 0.51
64 0.52
65 0.47
66 0.37
67 0.36
68 0.33
69 0.32
70 0.26
71 0.27
72 0.28
73 0.28
74 0.33
75 0.32
76 0.31
77 0.31
78 0.39
79 0.37
80 0.34
81 0.32
82 0.32
83 0.39
84 0.46
85 0.52
86 0.53
87 0.59
88 0.62
89 0.63
90 0.65
91 0.65
92 0.66
93 0.68
94 0.68
95 0.68
96 0.73
97 0.75
98 0.69
99 0.62
100 0.57
101 0.58
102 0.54
103 0.55
104 0.51
105 0.53
106 0.54
107 0.61
108 0.64
109 0.6
110 0.59
111 0.55
112 0.53
113 0.47
114 0.46
115 0.39
116 0.35
117 0.37
118 0.4
119 0.43
120 0.44
121 0.5
122 0.56
123 0.64
124 0.71
125 0.72
126 0.72
127 0.74
128 0.8
129 0.77
130 0.82
131 0.83
132 0.79
133 0.75
134 0.74
135 0.73
136 0.64
137 0.59
138 0.51
139 0.42
140 0.38
141 0.33
142 0.27
143 0.2
144 0.22
145 0.22
146 0.23
147 0.24
148 0.27
149 0.27
150 0.3
151 0.32
152 0.36
153 0.42
154 0.48
155 0.54
156 0.59
157 0.63
158 0.67
159 0.67
160 0.63
161 0.56
162 0.47
163 0.38
164 0.3
165 0.28
166 0.2
167 0.18
168 0.14
169 0.14
170 0.14
171 0.14
172 0.21
173 0.16
174 0.2
175 0.23
176 0.27
177 0.28
178 0.3
179 0.31
180 0.27
181 0.3
182 0.28
183 0.24
184 0.21
185 0.21
186 0.21
187 0.19
188 0.16
189 0.13
190 0.11
191 0.12
192 0.14
193 0.14
194 0.15
195 0.22
196 0.27
197 0.27
198 0.3
199 0.38
200 0.43
201 0.5
202 0.51
203 0.49
204 0.48
205 0.47
206 0.45
207 0.4
208 0.35
209 0.31
210 0.28
211 0.23
212 0.18
213 0.17
214 0.16
215 0.12
216 0.1
217 0.07
218 0.06
219 0.06
220 0.06
221 0.07
222 0.06
223 0.07
224 0.09
225 0.14
226 0.19
227 0.22
228 0.22
229 0.23
230 0.25
231 0.25
232 0.23
233 0.19
234 0.14
235 0.14
236 0.16
237 0.14
238 0.13
239 0.13
240 0.12
241 0.12
242 0.11
243 0.1
244 0.07
245 0.08
246 0.08
247 0.09
248 0.08
249 0.07
250 0.07
251 0.07
252 0.07
253 0.06
254 0.05
255 0.05
256 0.05
257 0.04
258 0.04
259 0.04
260 0.03
261 0.03
262 0.04
263 0.04
264 0.04
265 0.05
266 0.05
267 0.06
268 0.06
269 0.07
270 0.07
271 0.07
272 0.07
273 0.08
274 0.07
275 0.08
276 0.1
277 0.1
278 0.12
279 0.12
280 0.13
281 0.17
282 0.17
283 0.18
284 0.17
285 0.17
286 0.15
287 0.16
288 0.18
289 0.14
290 0.19
291 0.21
292 0.2
293 0.18
294 0.18
295 0.2
296 0.18
297 0.17
298 0.12
299 0.09
300 0.1
301 0.1
302 0.1
303 0.08
304 0.07
305 0.07
306 0.08
307 0.07
308 0.06
309 0.06
310 0.06
311 0.07
312 0.07
313 0.11
314 0.11
315 0.15
316 0.15
317 0.16
318 0.19
319 0.18
320 0.18
321 0.15
322 0.16
323 0.17
324 0.2
325 0.21
326 0.19
327 0.2
328 0.21
329 0.21
330 0.21
331 0.19
332 0.17
333 0.21
334 0.21
335 0.24
336 0.25
337 0.25
338 0.25
339 0.23
340 0.23
341 0.18
342 0.18
343 0.15
344 0.13
345 0.13
346 0.11
347 0.11
348 0.18
349 0.18
350 0.18
351 0.2
352 0.22
353 0.24
354 0.25
355 0.25
356 0.18
357 0.18
358 0.18
359 0.15
360 0.14
361 0.13
362 0.13
363 0.13
364 0.14
365 0.15
366 0.15
367 0.17
368 0.17
369 0.16
370 0.17
371 0.17
372 0.15
373 0.13
374 0.13
375 0.09
376 0.1
377 0.13
378 0.15
379 0.16
380 0.23
381 0.27
382 0.34
383 0.35
384 0.36
385 0.39
386 0.44
387 0.44
388 0.4
389 0.41
390 0.37
391 0.38
392 0.45
393 0.5
394 0.44
395 0.42
396 0.42
397 0.4
398 0.37
399 0.36
400 0.29
401 0.19
402 0.2
403 0.22
404 0.24
405 0.27
406 0.28
407 0.3
408 0.34
409 0.43
410 0.5
411 0.56
412 0.62
413 0.64
414 0.7
415 0.67
416 0.67
417 0.61
418 0.54
419 0.47
420 0.37
421 0.29
422 0.22
423 0.22
424 0.19
425 0.19
426 0.18
427 0.18
428 0.26
429 0.25
430 0.27
431 0.33
432 0.38
433 0.43
434 0.54
435 0.61
436 0.62
437 0.67
438 0.72
439 0.74
440 0.77
441 0.8
442 0.8
443 0.82
444 0.84
445 0.89
446 0.92
447 0.91
448 0.9
449 0.89
450 0.89
451 0.89
452 0.89