Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

G3B979

Protein Details
Accession G3B979    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
294-322PEKDDPQKKEPPKPQSKPQKKPVHGHAPIBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
301-315KKEPPKPQSKPQKKP
Subcellular Location(s) nucl 16, cyto 9, mito_nucl 9
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR044538  Vta1-like  
IPR039431  Vta1/CALS_N  
IPR023175  Vta1/CALS_N_sf  
IPR041212  Vta1_C  
Gene Ontology GO:0010008  C:endosome membrane  
GO:0032511  P:late endosome to vacuole transport via multivesicular body sorting pathway  
GO:0015031  P:protein transport  
KEGG cten:CANTEDRAFT_115280  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04652  Vta1  
PF18097  Vta1_C  
Amino Acid Sequences MISDIPESLKTNKDIVPYIVRSNELEDINPIVSYYCKIYVLEHILNKKLHKDDKEVEAFTIHLLDDTELMKTSDDDSLTKVLNDKNLSINVVFSFSLKIFNGCIHELNNYTGAKLALVNKIKACLNFMSLTEVFKNDDIDFSSLTGGKYTSYDEFNKFNKDRIKLLKYNLSKLIKDEIEIKGEQDELDQELQRMESEFKEAEDEEPKEAEDETSKEDLPQETLPSLGSPEIKASSEDPPQFIDSEPEEPVTLPGVPHFSPDDDNDIKLPGAPQFLPHDDLSHINKTSAIHVFEPEKDDPQKKEPPKPQSKPQKKPVHGHAPITKEHINSILDRQESMTKAQKHCKFAVSALNYEDLDTAEKEVLQALEMIRLVKQAGTE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.33
2 0.34
3 0.39
4 0.38
5 0.41
6 0.39
7 0.38
8 0.35
9 0.35
10 0.36
11 0.28
12 0.25
13 0.22
14 0.22
15 0.21
16 0.2
17 0.16
18 0.12
19 0.12
20 0.12
21 0.14
22 0.13
23 0.14
24 0.15
25 0.16
26 0.22
27 0.29
28 0.33
29 0.35
30 0.38
31 0.42
32 0.45
33 0.46
34 0.46
35 0.47
36 0.49
37 0.48
38 0.52
39 0.52
40 0.58
41 0.62
42 0.56
43 0.49
44 0.42
45 0.38
46 0.3
47 0.25
48 0.15
49 0.09
50 0.08
51 0.08
52 0.09
53 0.09
54 0.09
55 0.09
56 0.1
57 0.09
58 0.09
59 0.11
60 0.12
61 0.13
62 0.12
63 0.14
64 0.16
65 0.16
66 0.16
67 0.19
68 0.18
69 0.22
70 0.24
71 0.23
72 0.24
73 0.25
74 0.26
75 0.22
76 0.22
77 0.16
78 0.17
79 0.15
80 0.12
81 0.12
82 0.11
83 0.14
84 0.13
85 0.13
86 0.12
87 0.13
88 0.16
89 0.16
90 0.17
91 0.15
92 0.17
93 0.17
94 0.18
95 0.21
96 0.17
97 0.16
98 0.16
99 0.15
100 0.13
101 0.14
102 0.16
103 0.18
104 0.21
105 0.23
106 0.23
107 0.25
108 0.27
109 0.25
110 0.24
111 0.18
112 0.18
113 0.17
114 0.17
115 0.2
116 0.19
117 0.2
118 0.18
119 0.17
120 0.16
121 0.15
122 0.17
123 0.11
124 0.11
125 0.11
126 0.12
127 0.11
128 0.11
129 0.11
130 0.11
131 0.1
132 0.1
133 0.08
134 0.08
135 0.08
136 0.1
137 0.1
138 0.13
139 0.16
140 0.18
141 0.23
142 0.24
143 0.32
144 0.3
145 0.34
146 0.37
147 0.37
148 0.4
149 0.44
150 0.49
151 0.45
152 0.48
153 0.52
154 0.48
155 0.49
156 0.51
157 0.46
158 0.38
159 0.36
160 0.37
161 0.28
162 0.26
163 0.26
164 0.2
165 0.2
166 0.2
167 0.18
168 0.14
169 0.14
170 0.13
171 0.09
172 0.08
173 0.07
174 0.08
175 0.08
176 0.08
177 0.08
178 0.08
179 0.08
180 0.08
181 0.08
182 0.06
183 0.09
184 0.08
185 0.08
186 0.1
187 0.1
188 0.11
189 0.14
190 0.15
191 0.13
192 0.13
193 0.13
194 0.12
195 0.12
196 0.11
197 0.08
198 0.08
199 0.11
200 0.13
201 0.13
202 0.13
203 0.14
204 0.14
205 0.15
206 0.15
207 0.12
208 0.1
209 0.11
210 0.1
211 0.09
212 0.09
213 0.08
214 0.08
215 0.07
216 0.08
217 0.09
218 0.1
219 0.11
220 0.12
221 0.14
222 0.2
223 0.2
224 0.2
225 0.21
226 0.21
227 0.21
228 0.19
229 0.18
230 0.14
231 0.15
232 0.15
233 0.14
234 0.13
235 0.13
236 0.13
237 0.11
238 0.1
239 0.07
240 0.08
241 0.11
242 0.1
243 0.12
244 0.12
245 0.12
246 0.14
247 0.15
248 0.21
249 0.19
250 0.2
251 0.18
252 0.18
253 0.17
254 0.16
255 0.16
256 0.1
257 0.12
258 0.12
259 0.14
260 0.17
261 0.19
262 0.22
263 0.21
264 0.21
265 0.19
266 0.24
267 0.26
268 0.26
269 0.25
270 0.22
271 0.23
272 0.23
273 0.25
274 0.25
275 0.23
276 0.19
277 0.21
278 0.23
279 0.23
280 0.28
281 0.26
282 0.27
283 0.31
284 0.35
285 0.37
286 0.42
287 0.5
288 0.53
289 0.61
290 0.65
291 0.7
292 0.76
293 0.79
294 0.82
295 0.83
296 0.87
297 0.87
298 0.89
299 0.89
300 0.85
301 0.86
302 0.86
303 0.86
304 0.8
305 0.77
306 0.73
307 0.66
308 0.61
309 0.59
310 0.52
311 0.41
312 0.37
313 0.33
314 0.29
315 0.26
316 0.3
317 0.29
318 0.26
319 0.26
320 0.27
321 0.28
322 0.28
323 0.31
324 0.35
325 0.37
326 0.43
327 0.53
328 0.58
329 0.59
330 0.61
331 0.61
332 0.54
333 0.51
334 0.53
335 0.48
336 0.44
337 0.39
338 0.39
339 0.34
340 0.32
341 0.29
342 0.2
343 0.18
344 0.15
345 0.15
346 0.12
347 0.12
348 0.12
349 0.14
350 0.13
351 0.11
352 0.12
353 0.11
354 0.13
355 0.14
356 0.15
357 0.13
358 0.14
359 0.14