Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H2ARV1

Protein Details
Accession H2ARV1    Localization Confidence High Confidence Score 23.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
61-85KSQVEEVPKKSKKEKKVIKDFPLLEHydrophilic
387-414DDEATRRQKRKSKNFKKQRLPPANQLPSHydrophilic
807-833QVHKQTATVKWDKKRKKYVNMQGIDNKHydrophilic
889-915GQKTVRGKFKHKQMKSPKLPDKFRDDYBasic
945-973KSTEQIRKERMAKENRRAKNARPSKKRKFBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
69-76KKSKKEKK
392-405RRQKRKSKNFKKQR
689-691RRR
894-934RGKFKHKQMKSPKLPDKFRDDYEKQKKKVASALARGAHVKG
941-973KNELKSTEQIRKERMAKENRRAKNARPSKKRKF
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012541  DBP10_C  
IPR033517  DDX54/DBP10_DEAD-box_helicase  
IPR011545  DEAD/DEAH_box_helicase_dom  
IPR014001  Helicase_ATP-bd  
IPR001650  Helicase_C  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR014014  RNA_helicase_DEAD_Q_motif  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0016787  F:hydrolase activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0003724  F:RNA helicase activity  
KEGG kaf:KAFR_0C01060  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08147  DBP10CT  
PF00270  DEAD  
PF00271  Helicase_C  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51192  HELICASE_ATP_BIND_1  
PS51194  HELICASE_CTER  
PS51195  Q_MOTIF  
CDD cd17959  DEADc_DDX54  
cd18787  SF2_C_DEAD  
Amino Acid Sequences MVALNKRTLQEHDSDSETESANEFDIASNIALNSSDSDSDSDVDEQDGEVEDIISYSDDEKSQVEEVPKKSKKEKKVIKDFPLLELSDDEDSKKQANDNDDDVNSYFSTNNLNTKTKHKKGSFASFGLSKLILTNISKRGFRQPTPIQRKTIPLILQSRDIVGMARTGSGKTAAFVLPMIEKLKTHSSKIGARAIILSPSRELAMQTHNVFKEFSKGSDLRSVLLTGGDSLEDQFGMIMANPDVIIATPGRFLHLKVEMNLDLKSVEYICFDEADRLFEMGFQEQLNELIYSLPSNRQTLLFSATLPSSLVDFAKAGLTNPVLVRLDTETKISENLEMLFLSIKNEEREANLLYLLQEEICIPLATEEQIKKLNNESKIDDDSDSEDDEATRRQKRKSKNFKKQRLPPANQLPSEKATIIFVPTRHHVEYISQLLKDCGYLVSYIYGTLDQRARNRQLYNFRLGLTSILVVTDVAARGVDIPMLANVINFSLPVSSKVFVHRVGRTARAGNRGWAYSIVSENELPYLLDLELFLGKKILLTSMYDATCDIMKKKWVSEGKSELTFQDPKPSYTNRMVLGSAPRLQVEDLNDLYTGVLSGSFDLKMMKQTALKAEKLYFRTRTSASPESMKRSKEIILSGWDEQNIRFGKNVEKEKFQFLAKLQNRHNKETVFEFARNPDDEMSVLMKRRRRQLAPIQRKAEERRELMEKERLAGLTHRIEDQILKGDDFEAGYTVPEDALKEFEDADKVLEASNKKSEQKTFRDENFFLSHYAPTSAIQDQQYKLSTGFTNAAAEAAYDLNSDDKVQVHKQTATVKWDKKRKKYVNMQGIDNKKYIVGESGQKIAASFRSGKFEEWSKARKLKPLKVGARESTMQTNLLSNPTENNSNGQKTVRGKFKHKQMKSPKLPDKFRDDYEKQKKKVASALARGAHVKGYSGPGMKNELKSTEQIRKERMAKENRRAKNARPSKKRKF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.35
2 0.34
3 0.32
4 0.29
5 0.25
6 0.21
7 0.18
8 0.15
9 0.14
10 0.12
11 0.1
12 0.1
13 0.11
14 0.1
15 0.1
16 0.09
17 0.09
18 0.09
19 0.09
20 0.11
21 0.11
22 0.12
23 0.12
24 0.14
25 0.15
26 0.16
27 0.17
28 0.16
29 0.14
30 0.14
31 0.13
32 0.12
33 0.11
34 0.12
35 0.1
36 0.08
37 0.08
38 0.07
39 0.07
40 0.07
41 0.07
42 0.06
43 0.08
44 0.09
45 0.09
46 0.11
47 0.12
48 0.14
49 0.15
50 0.19
51 0.24
52 0.3
53 0.35
54 0.45
55 0.5
56 0.54
57 0.63
58 0.69
59 0.72
60 0.76
61 0.81
62 0.81
63 0.86
64 0.9
65 0.88
66 0.88
67 0.79
68 0.73
69 0.68
70 0.57
71 0.47
72 0.37
73 0.32
74 0.24
75 0.23
76 0.21
77 0.18
78 0.19
79 0.2
80 0.21
81 0.22
82 0.24
83 0.3
84 0.33
85 0.35
86 0.38
87 0.36
88 0.37
89 0.34
90 0.31
91 0.25
92 0.21
93 0.17
94 0.13
95 0.18
96 0.17
97 0.24
98 0.27
99 0.31
100 0.33
101 0.43
102 0.53
103 0.56
104 0.64
105 0.61
106 0.64
107 0.68
108 0.76
109 0.72
110 0.63
111 0.6
112 0.51
113 0.49
114 0.42
115 0.34
116 0.23
117 0.17
118 0.16
119 0.15
120 0.15
121 0.21
122 0.26
123 0.3
124 0.31
125 0.33
126 0.43
127 0.46
128 0.47
129 0.5
130 0.53
131 0.61
132 0.7
133 0.73
134 0.68
135 0.64
136 0.67
137 0.61
138 0.58
139 0.5
140 0.46
141 0.48
142 0.44
143 0.45
144 0.39
145 0.36
146 0.29
147 0.26
148 0.2
149 0.14
150 0.13
151 0.1
152 0.11
153 0.11
154 0.1
155 0.11
156 0.13
157 0.12
158 0.11
159 0.13
160 0.12
161 0.11
162 0.11
163 0.12
164 0.11
165 0.13
166 0.14
167 0.12
168 0.12
169 0.16
170 0.25
171 0.27
172 0.28
173 0.31
174 0.35
175 0.4
176 0.45
177 0.48
178 0.39
179 0.37
180 0.36
181 0.32
182 0.32
183 0.27
184 0.23
185 0.17
186 0.17
187 0.17
188 0.15
189 0.15
190 0.13
191 0.16
192 0.21
193 0.22
194 0.27
195 0.27
196 0.28
197 0.28
198 0.25
199 0.27
200 0.23
201 0.23
202 0.24
203 0.25
204 0.27
205 0.33
206 0.33
207 0.27
208 0.27
209 0.26
210 0.18
211 0.18
212 0.15
213 0.08
214 0.08
215 0.07
216 0.06
217 0.06
218 0.06
219 0.06
220 0.05
221 0.05
222 0.04
223 0.04
224 0.05
225 0.05
226 0.05
227 0.05
228 0.05
229 0.05
230 0.05
231 0.05
232 0.06
233 0.05
234 0.06
235 0.08
236 0.08
237 0.1
238 0.11
239 0.11
240 0.15
241 0.2
242 0.22
243 0.21
244 0.25
245 0.25
246 0.26
247 0.26
248 0.22
249 0.16
250 0.14
251 0.14
252 0.1
253 0.08
254 0.08
255 0.09
256 0.09
257 0.1
258 0.1
259 0.13
260 0.13
261 0.15
262 0.15
263 0.14
264 0.13
265 0.13
266 0.15
267 0.11
268 0.12
269 0.09
270 0.09
271 0.09
272 0.09
273 0.09
274 0.08
275 0.07
276 0.07
277 0.07
278 0.07
279 0.08
280 0.12
281 0.13
282 0.14
283 0.15
284 0.15
285 0.16
286 0.17
287 0.2
288 0.16
289 0.14
290 0.15
291 0.14
292 0.13
293 0.12
294 0.11
295 0.07
296 0.08
297 0.08
298 0.07
299 0.07
300 0.07
301 0.08
302 0.08
303 0.08
304 0.09
305 0.09
306 0.11
307 0.1
308 0.13
309 0.12
310 0.12
311 0.13
312 0.13
313 0.17
314 0.16
315 0.17
316 0.15
317 0.15
318 0.16
319 0.15
320 0.13
321 0.1
322 0.1
323 0.1
324 0.09
325 0.08
326 0.08
327 0.08
328 0.08
329 0.09
330 0.1
331 0.1
332 0.12
333 0.12
334 0.12
335 0.14
336 0.14
337 0.13
338 0.12
339 0.11
340 0.1
341 0.1
342 0.09
343 0.07
344 0.05
345 0.05
346 0.06
347 0.06
348 0.06
349 0.05
350 0.06
351 0.06
352 0.07
353 0.11
354 0.1
355 0.12
356 0.17
357 0.17
358 0.18
359 0.25
360 0.3
361 0.3
362 0.32
363 0.32
364 0.31
365 0.33
366 0.33
367 0.27
368 0.22
369 0.2
370 0.18
371 0.17
372 0.13
373 0.11
374 0.1
375 0.1
376 0.13
377 0.16
378 0.22
379 0.25
380 0.32
381 0.4
382 0.5
383 0.61
384 0.69
385 0.75
386 0.79
387 0.86
388 0.9
389 0.93
390 0.92
391 0.92
392 0.91
393 0.85
394 0.83
395 0.83
396 0.78
397 0.7
398 0.62
399 0.54
400 0.45
401 0.41
402 0.32
403 0.21
404 0.16
405 0.14
406 0.14
407 0.13
408 0.12
409 0.13
410 0.15
411 0.18
412 0.18
413 0.18
414 0.16
415 0.16
416 0.19
417 0.22
418 0.21
419 0.18
420 0.17
421 0.17
422 0.17
423 0.16
424 0.12
425 0.07
426 0.05
427 0.05
428 0.05
429 0.06
430 0.06
431 0.06
432 0.06
433 0.06
434 0.06
435 0.08
436 0.11
437 0.13
438 0.17
439 0.23
440 0.26
441 0.3
442 0.32
443 0.36
444 0.42
445 0.43
446 0.44
447 0.39
448 0.36
449 0.32
450 0.3
451 0.24
452 0.15
453 0.12
454 0.07
455 0.05
456 0.05
457 0.04
458 0.04
459 0.04
460 0.04
461 0.04
462 0.03
463 0.03
464 0.04
465 0.04
466 0.04
467 0.03
468 0.03
469 0.03
470 0.04
471 0.04
472 0.03
473 0.03
474 0.04
475 0.04
476 0.03
477 0.04
478 0.04
479 0.04
480 0.06
481 0.08
482 0.08
483 0.09
484 0.11
485 0.13
486 0.15
487 0.19
488 0.18
489 0.21
490 0.23
491 0.25
492 0.24
493 0.27
494 0.27
495 0.29
496 0.28
497 0.27
498 0.27
499 0.24
500 0.23
501 0.19
502 0.17
503 0.12
504 0.13
505 0.1
506 0.1
507 0.09
508 0.09
509 0.08
510 0.08
511 0.06
512 0.05
513 0.06
514 0.05
515 0.04
516 0.04
517 0.05
518 0.07
519 0.07
520 0.07
521 0.06
522 0.06
523 0.06
524 0.06
525 0.06
526 0.05
527 0.06
528 0.08
529 0.12
530 0.12
531 0.11
532 0.11
533 0.11
534 0.12
535 0.12
536 0.11
537 0.09
538 0.14
539 0.15
540 0.15
541 0.22
542 0.26
543 0.29
544 0.34
545 0.39
546 0.38
547 0.38
548 0.38
549 0.31
550 0.3
551 0.3
552 0.24
553 0.27
554 0.25
555 0.25
556 0.29
557 0.31
558 0.32
559 0.33
560 0.36
561 0.28
562 0.28
563 0.26
564 0.24
565 0.26
566 0.23
567 0.22
568 0.19
569 0.18
570 0.17
571 0.17
572 0.17
573 0.15
574 0.16
575 0.13
576 0.13
577 0.13
578 0.13
579 0.12
580 0.1
581 0.08
582 0.04
583 0.04
584 0.03
585 0.04
586 0.05
587 0.05
588 0.05
589 0.06
590 0.06
591 0.09
592 0.11
593 0.12
594 0.13
595 0.14
596 0.22
597 0.25
598 0.26
599 0.25
600 0.27
601 0.31
602 0.34
603 0.38
604 0.34
605 0.32
606 0.35
607 0.34
608 0.34
609 0.36
610 0.37
611 0.33
612 0.36
613 0.37
614 0.41
615 0.44
616 0.42
617 0.36
618 0.34
619 0.34
620 0.3
621 0.28
622 0.23
623 0.22
624 0.24
625 0.24
626 0.23
627 0.22
628 0.2
629 0.18
630 0.22
631 0.19
632 0.17
633 0.16
634 0.16
635 0.22
636 0.29
637 0.38
638 0.35
639 0.4
640 0.42
641 0.45
642 0.46
643 0.4
644 0.36
645 0.28
646 0.36
647 0.35
648 0.41
649 0.44
650 0.5
651 0.55
652 0.56
653 0.59
654 0.49
655 0.46
656 0.41
657 0.4
658 0.35
659 0.32
660 0.28
661 0.27
662 0.3
663 0.29
664 0.26
665 0.21
666 0.17
667 0.16
668 0.16
669 0.16
670 0.15
671 0.18
672 0.22
673 0.26
674 0.3
675 0.39
676 0.45
677 0.45
678 0.52
679 0.59
680 0.66
681 0.72
682 0.77
683 0.73
684 0.68
685 0.72
686 0.69
687 0.67
688 0.62
689 0.53
690 0.48
691 0.49
692 0.48
693 0.46
694 0.47
695 0.38
696 0.33
697 0.32
698 0.28
699 0.24
700 0.24
701 0.24
702 0.21
703 0.22
704 0.21
705 0.2
706 0.2
707 0.2
708 0.19
709 0.21
710 0.18
711 0.17
712 0.16
713 0.16
714 0.16
715 0.15
716 0.14
717 0.07
718 0.06
719 0.06
720 0.06
721 0.06
722 0.06
723 0.06
724 0.07
725 0.07
726 0.08
727 0.09
728 0.09
729 0.09
730 0.1
731 0.11
732 0.11
733 0.11
734 0.1
735 0.09
736 0.1
737 0.14
738 0.15
739 0.17
740 0.24
741 0.27
742 0.32
743 0.36
744 0.43
745 0.47
746 0.53
747 0.58
748 0.59
749 0.61
750 0.65
751 0.61
752 0.58
753 0.53
754 0.47
755 0.4
756 0.33
757 0.27
758 0.2
759 0.21
760 0.16
761 0.13
762 0.16
763 0.15
764 0.18
765 0.21
766 0.24
767 0.24
768 0.27
769 0.28
770 0.25
771 0.24
772 0.23
773 0.21
774 0.19
775 0.2
776 0.17
777 0.17
778 0.15
779 0.15
780 0.12
781 0.11
782 0.09
783 0.08
784 0.07
785 0.06
786 0.06
787 0.07
788 0.07
789 0.08
790 0.08
791 0.1
792 0.15
793 0.19
794 0.24
795 0.27
796 0.28
797 0.32
798 0.38
799 0.4
800 0.44
801 0.5
802 0.53
803 0.58
804 0.67
805 0.72
806 0.75
807 0.82
808 0.84
809 0.85
810 0.88
811 0.89
812 0.9
813 0.84
814 0.81
815 0.79
816 0.76
817 0.69
818 0.58
819 0.48
820 0.38
821 0.34
822 0.27
823 0.22
824 0.18
825 0.21
826 0.23
827 0.26
828 0.26
829 0.25
830 0.25
831 0.24
832 0.22
833 0.19
834 0.22
835 0.21
836 0.27
837 0.28
838 0.3
839 0.32
840 0.36
841 0.39
842 0.41
843 0.45
844 0.47
845 0.54
846 0.56
847 0.6
848 0.64
849 0.65
850 0.68
851 0.73
852 0.73
853 0.74
854 0.78
855 0.73
856 0.69
857 0.63
858 0.56
859 0.51
860 0.44
861 0.36
862 0.29
863 0.28
864 0.24
865 0.25
866 0.23
867 0.18
868 0.2
869 0.22
870 0.25
871 0.23
872 0.27
873 0.31
874 0.32
875 0.34
876 0.33
877 0.36
878 0.39
879 0.47
880 0.51
881 0.51
882 0.57
883 0.62
884 0.72
885 0.76
886 0.74
887 0.77
888 0.79
889 0.83
890 0.85
891 0.88
892 0.87
893 0.86
894 0.89
895 0.85
896 0.83
897 0.78
898 0.72
899 0.72
900 0.67
901 0.68
902 0.71
903 0.75
904 0.68
905 0.7
906 0.68
907 0.62
908 0.64
909 0.63
910 0.61
911 0.59
912 0.65
913 0.6
914 0.59
915 0.56
916 0.5
917 0.42
918 0.33
919 0.26
920 0.2
921 0.22
922 0.24
923 0.26
924 0.26
925 0.26
926 0.34
927 0.37
928 0.39
929 0.38
930 0.37
931 0.36
932 0.4
933 0.45
934 0.46
935 0.5
936 0.53
937 0.55
938 0.6
939 0.65
940 0.68
941 0.71
942 0.72
943 0.74
944 0.78
945 0.82
946 0.81
947 0.84
948 0.81
949 0.79
950 0.8
951 0.8
952 0.8
953 0.82