Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1E3PCK4

Protein Details
Accession A0A1E3PCK4    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
612-633PTNSAGKRRKASKTVPGARKIGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
617-659GKRRKASKTVPGARKIGGKTLPGGSPQNSGGVGPSPSKKAKKG
Subcellular Location(s) nucl 25, cyto_nucl 14.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR021950  Spt20  
IPR046468  Spt20-like_SEP  
Gene Ontology GO:0000124  C:SAGA complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF12090  Spt20  
Amino Acid Sequences MSTNIRATESTNGLNKGGLDSVQPATKTPKAVNESPNFSQNPSNMADRRKKIYNFAETPEAILAKYSQEPPSLELHIHHHHYRFGNQEGIIPRNSEMIKIFIQYIQQGQIPPSATEVFRDAGIRFYEGCIIIKITDHRNAVMTEKDEDSAENQGTAKETVDDEVSSKAPLDDPDTTAAQQRSYISLLRPTSLSLYHDLMYTSDPSHGRFTDQLAVNMESEILSLTVRNIDLTVKEKPVDLSPIIYTKVAEQTTTIPRPSYKTIKEAVSHLHHHRPLGKKAVRPLHSDLTHPSSSSFETMMLIMDESERGERSKMANSGGANSSNSSQFMRLSFIEQWRKKRDRMRATQKAQAQLQRSQKGQGQSQSGLPGQQPVQKSGIPGQPVQGQGQNPRQLQQQQQLQQLQQHHPGQPSQQQQLQQQQQQSQYQQQQQHQQYQQSQQPTQSYQQVRNNTSVPQPNSAGMPNMTGQNSYQQHLQRSNAMLQQKQQQLPLGQQQPSPSQQQSQLGNIQRNPITGLPKITQAQFAQLTPQQQQMIRMQHQQQMQLYQAKKMAAANNNNNNNSNSNPNNLNFNSPNMGNTINSPGSPNNGIYQGQQMQAASPSSRQSTPGINPTNSAGKRRKASKTVPGARKIGGKTLPGGSPQNSGGVGPSPSKKAKKG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.32
2 0.29
3 0.25
4 0.23
5 0.18
6 0.14
7 0.16
8 0.18
9 0.2
10 0.2
11 0.21
12 0.26
13 0.29
14 0.32
15 0.31
16 0.38
17 0.41
18 0.48
19 0.56
20 0.56
21 0.6
22 0.59
23 0.63
24 0.56
25 0.51
26 0.49
27 0.41
28 0.37
29 0.33
30 0.38
31 0.36
32 0.44
33 0.51
34 0.51
35 0.57
36 0.61
37 0.61
38 0.62
39 0.66
40 0.67
41 0.62
42 0.61
43 0.62
44 0.53
45 0.52
46 0.45
47 0.36
48 0.25
49 0.22
50 0.18
51 0.14
52 0.18
53 0.2
54 0.2
55 0.23
56 0.25
57 0.26
58 0.3
59 0.29
60 0.26
61 0.24
62 0.28
63 0.31
64 0.35
65 0.37
66 0.35
67 0.39
68 0.41
69 0.44
70 0.43
71 0.4
72 0.39
73 0.35
74 0.39
75 0.37
76 0.37
77 0.33
78 0.29
79 0.26
80 0.27
81 0.27
82 0.23
83 0.2
84 0.2
85 0.2
86 0.2
87 0.21
88 0.17
89 0.18
90 0.18
91 0.19
92 0.18
93 0.19
94 0.18
95 0.18
96 0.21
97 0.21
98 0.19
99 0.2
100 0.2
101 0.18
102 0.19
103 0.2
104 0.17
105 0.16
106 0.17
107 0.14
108 0.16
109 0.17
110 0.17
111 0.15
112 0.15
113 0.17
114 0.16
115 0.17
116 0.14
117 0.14
118 0.13
119 0.15
120 0.18
121 0.19
122 0.24
123 0.25
124 0.24
125 0.26
126 0.26
127 0.26
128 0.26
129 0.24
130 0.21
131 0.21
132 0.2
133 0.19
134 0.18
135 0.17
136 0.17
137 0.15
138 0.14
139 0.13
140 0.13
141 0.14
142 0.14
143 0.13
144 0.1
145 0.11
146 0.11
147 0.11
148 0.11
149 0.1
150 0.12
151 0.12
152 0.11
153 0.11
154 0.1
155 0.1
156 0.11
157 0.14
158 0.14
159 0.15
160 0.18
161 0.19
162 0.19
163 0.24
164 0.23
165 0.19
166 0.19
167 0.18
168 0.18
169 0.18
170 0.2
171 0.16
172 0.22
173 0.22
174 0.21
175 0.21
176 0.19
177 0.19
178 0.19
179 0.19
180 0.15
181 0.17
182 0.16
183 0.16
184 0.15
185 0.14
186 0.14
187 0.14
188 0.11
189 0.13
190 0.14
191 0.15
192 0.19
193 0.18
194 0.19
195 0.19
196 0.21
197 0.24
198 0.25
199 0.25
200 0.24
201 0.25
202 0.23
203 0.22
204 0.19
205 0.12
206 0.1
207 0.08
208 0.05
209 0.04
210 0.04
211 0.04
212 0.06
213 0.06
214 0.06
215 0.06
216 0.07
217 0.09
218 0.12
219 0.15
220 0.15
221 0.16
222 0.16
223 0.17
224 0.17
225 0.19
226 0.16
227 0.15
228 0.14
229 0.16
230 0.16
231 0.15
232 0.14
233 0.12
234 0.17
235 0.15
236 0.14
237 0.13
238 0.17
239 0.23
240 0.26
241 0.25
242 0.21
243 0.22
244 0.26
245 0.3
246 0.33
247 0.29
248 0.31
249 0.34
250 0.36
251 0.36
252 0.34
253 0.34
254 0.31
255 0.34
256 0.34
257 0.37
258 0.35
259 0.35
260 0.39
261 0.4
262 0.4
263 0.45
264 0.45
265 0.41
266 0.48
267 0.55
268 0.51
269 0.5
270 0.51
271 0.48
272 0.45
273 0.43
274 0.38
275 0.36
276 0.33
277 0.28
278 0.24
279 0.18
280 0.18
281 0.17
282 0.14
283 0.08
284 0.08
285 0.08
286 0.08
287 0.06
288 0.06
289 0.05
290 0.04
291 0.04
292 0.04
293 0.05
294 0.05
295 0.06
296 0.06
297 0.08
298 0.1
299 0.13
300 0.14
301 0.15
302 0.17
303 0.17
304 0.19
305 0.19
306 0.18
307 0.14
308 0.13
309 0.13
310 0.11
311 0.12
312 0.1
313 0.09
314 0.09
315 0.09
316 0.11
317 0.1
318 0.12
319 0.15
320 0.21
321 0.3
322 0.33
323 0.4
324 0.47
325 0.5
326 0.54
327 0.58
328 0.62
329 0.63
330 0.69
331 0.73
332 0.74
333 0.75
334 0.75
335 0.71
336 0.66
337 0.59
338 0.53
339 0.46
340 0.42
341 0.46
342 0.43
343 0.4
344 0.38
345 0.37
346 0.36
347 0.36
348 0.33
349 0.29
350 0.26
351 0.27
352 0.26
353 0.23
354 0.21
355 0.17
356 0.16
357 0.14
358 0.17
359 0.16
360 0.16
361 0.18
362 0.18
363 0.19
364 0.22
365 0.23
366 0.21
367 0.21
368 0.2
369 0.22
370 0.22
371 0.22
372 0.21
373 0.19
374 0.23
375 0.29
376 0.34
377 0.31
378 0.31
379 0.34
380 0.35
381 0.39
382 0.4
383 0.41
384 0.4
385 0.46
386 0.47
387 0.44
388 0.44
389 0.45
390 0.41
391 0.4
392 0.39
393 0.35
394 0.34
395 0.34
396 0.33
397 0.35
398 0.37
399 0.33
400 0.33
401 0.34
402 0.37
403 0.45
404 0.48
405 0.45
406 0.44
407 0.44
408 0.46
409 0.46
410 0.44
411 0.42
412 0.43
413 0.45
414 0.48
415 0.48
416 0.53
417 0.53
418 0.59
419 0.56
420 0.54
421 0.53
422 0.53
423 0.53
424 0.49
425 0.46
426 0.41
427 0.4
428 0.38
429 0.36
430 0.38
431 0.37
432 0.39
433 0.44
434 0.48
435 0.47
436 0.48
437 0.46
438 0.4
439 0.42
440 0.42
441 0.37
442 0.33
443 0.32
444 0.29
445 0.3
446 0.28
447 0.24
448 0.16
449 0.15
450 0.13
451 0.15
452 0.14
453 0.13
454 0.13
455 0.19
456 0.21
457 0.21
458 0.25
459 0.26
460 0.31
461 0.34
462 0.36
463 0.32
464 0.33
465 0.35
466 0.34
467 0.35
468 0.32
469 0.32
470 0.39
471 0.42
472 0.41
473 0.39
474 0.38
475 0.35
476 0.37
477 0.42
478 0.4
479 0.35
480 0.34
481 0.36
482 0.36
483 0.38
484 0.39
485 0.32
486 0.29
487 0.31
488 0.36
489 0.35
490 0.35
491 0.39
492 0.39
493 0.42
494 0.4
495 0.42
496 0.37
497 0.35
498 0.34
499 0.3
500 0.28
501 0.25
502 0.28
503 0.23
504 0.27
505 0.29
506 0.28
507 0.29
508 0.25
509 0.28
510 0.26
511 0.25
512 0.25
513 0.25
514 0.27
515 0.25
516 0.28
517 0.26
518 0.26
519 0.3
520 0.32
521 0.37
522 0.38
523 0.44
524 0.44
525 0.46
526 0.48
527 0.49
528 0.45
529 0.4
530 0.4
531 0.4
532 0.37
533 0.35
534 0.35
535 0.31
536 0.3
537 0.31
538 0.33
539 0.34
540 0.42
541 0.48
542 0.55
543 0.62
544 0.63
545 0.61
546 0.56
547 0.51
548 0.44
549 0.42
550 0.35
551 0.33
552 0.35
553 0.34
554 0.39
555 0.37
556 0.41
557 0.35
558 0.36
559 0.35
560 0.3
561 0.3
562 0.25
563 0.25
564 0.18
565 0.19
566 0.22
567 0.19
568 0.19
569 0.21
570 0.2
571 0.23
572 0.25
573 0.24
574 0.2
575 0.22
576 0.23
577 0.21
578 0.27
579 0.26
580 0.25
581 0.25
582 0.23
583 0.21
584 0.22
585 0.23
586 0.18
587 0.17
588 0.2
589 0.23
590 0.23
591 0.25
592 0.25
593 0.3
594 0.34
595 0.41
596 0.45
597 0.41
598 0.42
599 0.43
600 0.5
601 0.46
602 0.49
603 0.47
604 0.48
605 0.56
606 0.63
607 0.69
608 0.68
609 0.74
610 0.75
611 0.79
612 0.81
613 0.82
614 0.8
615 0.75
616 0.69
617 0.68
618 0.6
619 0.56
620 0.5
621 0.43
622 0.4
623 0.41
624 0.4
625 0.37
626 0.4
627 0.34
628 0.33
629 0.32
630 0.3
631 0.26
632 0.24
633 0.21
634 0.19
635 0.2
636 0.21
637 0.24
638 0.29
639 0.37