FuNGI

A0A1E3PQ56

Protein Details

Accession

A0A1E3PQ56

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

11.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
433-457	LMQVRGKDFTKNKNKMKKGAYRGGS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 23, cyto_nucl 13

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007718 Srp40_C
Gene Ontology	GO:0005730 C:nucleolus
Pfam	View protein in Pfam PF05022 SRP40_C

Amino Acid Sequences

MAVSTPTSTTFKATSKNTGKSKKTIKESSSETTSESSDSSSSDSSSSNSSSDSSSSDSSDSDSSSSSDSSSSDSSSDEDSESEEKEIVTPIGEKRKRSVSPKPSNSVSESSSDSSSGSSSESNSSSSSSSDSDSDSESEVEVQTKRARTSSPVASKSSSSESSSDSESSSESSSESSDSEDEENEKKKEKLVSSEPASLSSCSSSSDSSSSSDSDSDSDSISSDSEPEEGKIKEKEEKTASSKPLSSSSESSSSDSSSSDSDSSSSDSDSSSSDSDSSDSESEEKENETKGKLVSAKTSTPSPTPSSSDSSSSSSSSDSSSSDSSSSSDSDSSDSDSSDSDSSDSDEEEKDEEKVVQTSVVFSSFSSRSNTGTPIPEGYIPAATEEENLLKPGQRHHFSRIDRSKIGFENYAVMDNTYKGAAGTWGEGANDKLMQVRGKDFTKNKNKMKKGAYRGGSITMASGSYKFQD

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.42
2	0.48
3	0.57
4	0.63
5	0.69
6	0.71
7	0.73
8	0.8
9	0.78
10	0.79
11	0.79
12	0.73
13	0.71
14	0.72
15	0.69
16	0.64
17	0.55
18	0.48
19	0.4
20	0.38
21	0.31
22	0.25
23	0.19
24	0.15
25	0.15
26	0.15
27	0.14
28	0.14
29	0.14
30	0.14
31	0.14
32	0.17
33	0.18
34	0.15
35	0.15
36	0.16
37	0.16
38	0.16
39	0.17
40	0.17
41	0.17
42	0.18
43	0.18
44	0.17
45	0.18
46	0.18
47	0.17
48	0.14
49	0.14
50	0.13
51	0.14
52	0.14
53	0.12
54	0.12
55	0.11
56	0.14
57	0.14
58	0.14
59	0.13
60	0.13
61	0.14
62	0.15
63	0.16
64	0.13
65	0.12
66	0.14
67	0.15
68	0.16
69	0.15
70	0.13
71	0.12
72	0.13
73	0.14
74	0.11
75	0.1
76	0.12
77	0.16
78	0.27
79	0.3
80	0.31
81	0.35
82	0.44
83	0.49
84	0.54
85	0.59
86	0.6
87	0.67
88	0.74
89	0.75
90	0.7
91	0.68
92	0.64
93	0.57
94	0.47
95	0.39
96	0.34
97	0.3
98	0.26
99	0.23
100	0.19
101	0.16
102	0.14
103	0.12
104	0.1
105	0.09
106	0.1
107	0.12
108	0.13
109	0.13
110	0.14
111	0.15
112	0.14
113	0.14
114	0.14
115	0.13
116	0.13
117	0.13
118	0.14
119	0.13
120	0.14
121	0.14
122	0.13
123	0.12
124	0.11
125	0.11
126	0.1
127	0.12
128	0.11
129	0.13
130	0.17
131	0.19
132	0.2
133	0.21
134	0.21
135	0.23
136	0.29
137	0.36
138	0.4
139	0.41
140	0.42
141	0.42
142	0.41
143	0.39
144	0.37
145	0.3
146	0.23
147	0.21
148	0.21
149	0.21
150	0.22
151	0.2
152	0.16
153	0.14
154	0.13
155	0.13
156	0.11
157	0.1
158	0.08
159	0.08
160	0.08
161	0.09
162	0.08
163	0.08
164	0.08
165	0.09
166	0.09
167	0.09
168	0.12
169	0.15
170	0.19
171	0.19
172	0.22
173	0.21
174	0.24
175	0.29
176	0.28
177	0.31
178	0.32
179	0.38
180	0.39
181	0.44
182	0.41
183	0.37
184	0.36
185	0.3
186	0.25
187	0.18
188	0.14
189	0.1
190	0.11
191	0.1
192	0.1
193	0.11
194	0.11
195	0.12
196	0.13
197	0.12
198	0.11
199	0.11
200	0.1
201	0.1
202	0.1
203	0.09
204	0.08
205	0.08
206	0.07
207	0.07
208	0.07
209	0.06
210	0.06
211	0.05
212	0.06
213	0.06
214	0.07
215	0.1
216	0.1
217	0.13
218	0.14
219	0.15
220	0.21
221	0.21
222	0.26
223	0.25
224	0.29
225	0.33
226	0.38
227	0.39
228	0.35
229	0.36
230	0.32
231	0.33
232	0.31
233	0.28
234	0.23
235	0.23
236	0.25
237	0.24
238	0.24
239	0.2
240	0.19
241	0.16
242	0.15
243	0.13
244	0.1
245	0.1
246	0.09
247	0.08
248	0.08
249	0.08
250	0.1
251	0.09
252	0.09
253	0.08
254	0.08
255	0.08
256	0.08
257	0.09
258	0.08
259	0.08
260	0.08
261	0.08
262	0.09
263	0.08
264	0.1
265	0.09
266	0.09
267	0.09
268	0.1
269	0.1
270	0.1
271	0.11
272	0.1
273	0.12
274	0.13
275	0.13
276	0.14
277	0.14
278	0.17
279	0.19
280	0.19
281	0.22
282	0.24
283	0.25
284	0.25
285	0.27
286	0.26
287	0.24
288	0.26
289	0.25
290	0.24
291	0.25
292	0.26
293	0.28
294	0.28
295	0.29
296	0.27
297	0.27
298	0.26
299	0.24
300	0.21
301	0.17
302	0.16
303	0.15
304	0.13
305	0.11
306	0.13
307	0.14
308	0.14
309	0.13
310	0.13
311	0.13
312	0.13
313	0.13
314	0.11
315	0.1
316	0.1
317	0.11
318	0.11
319	0.13
320	0.13
321	0.12
322	0.12
323	0.12
324	0.13
325	0.12
326	0.12
327	0.09
328	0.09
329	0.1
330	0.1
331	0.1
332	0.1
333	0.1
334	0.11
335	0.12
336	0.12
337	0.12
338	0.12
339	0.12
340	0.12
341	0.13
342	0.12
343	0.12
344	0.11
345	0.12
346	0.12
347	0.12
348	0.11
349	0.09
350	0.14
351	0.14
352	0.16
353	0.19
354	0.19
355	0.2
356	0.22
357	0.25
358	0.24
359	0.26
360	0.26
361	0.23
362	0.24
363	0.22
364	0.21
365	0.2
366	0.17
367	0.14
368	0.14
369	0.13
370	0.11
371	0.11
372	0.11
373	0.13
374	0.12
375	0.13
376	0.13
377	0.15
378	0.16
379	0.24
380	0.32
381	0.35
382	0.38
383	0.44
384	0.52
385	0.54
386	0.64
387	0.65
388	0.63
389	0.62
390	0.61
391	0.59
392	0.54
393	0.54
394	0.45
395	0.37
396	0.34
397	0.31
398	0.31
399	0.26
400	0.23
401	0.19
402	0.17
403	0.18
404	0.13
405	0.12
406	0.08
407	0.09
408	0.1
409	0.1
410	0.1
411	0.11
412	0.12
413	0.12
414	0.13
415	0.14
416	0.14
417	0.13
418	0.12
419	0.14
420	0.17
421	0.19
422	0.21
423	0.25
424	0.29
425	0.32
426	0.41
427	0.44
428	0.52
429	0.6
430	0.68
431	0.73
432	0.78
433	0.83
434	0.83
435	0.86
436	0.85
437	0.84
438	0.84
439	0.78
440	0.73
441	0.68
442	0.63
443	0.54
444	0.44
445	0.35
446	0.26
447	0.22
448	0.17
449	0.15

A0A1E3PQ56

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer