Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H2AY40

Protein Details
Accession H2AY40    Localization Confidence High Confidence Score 17.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
8-38AGNSVKIRNDKPKSKTQSKNLSKAKGKKYTLHydrophilic
373-393SEYFRQSKLKKHDWKDIPQSLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
19-34PKSKTQSKNLSKAKGK
Subcellular Location(s) nucl 21, mito 3, cyto 1, pero 1, cysk 1, cyto_pero 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR029060  PIN-like_dom_sf  
IPR002716  PIN_dom  
Gene Ontology GO:0004540  F:RNA nuclease activity  
KEGG kaf:KAFR_0G02580  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF13638  PIN_4  
CDD cd18727  PIN_Swt1-like  
Amino Acid Sequences MSLQSVHAGNSVKIRNDKPKSKTQSKNLSKAKGKKYTLNDLDDLIGINKGNKQENLSMLPDEEDIEMTEAKPEECAPSMLHLVNDIKVCENLNTHVNNRQATTLDTAINDTIKTKRPTMFIVDTNFILSHLTILEDIRKLFSKFYHSIVIPITVMKELDGLKNSNKVNEIEPGATRKKQSSIGELARTANNWIYENLANVGSGVVGQKLRQRLNPNTTKDDSILDCCLYFKDNLKDFVILLSNDKNLCLKALTEDVLTVSYREGMTGGLIAEKVYQENMLRLGAQDGYSNYQGSLNNDQSVSQENIIQSNINFQELSEYIFSEVRNILQKAITYVITQEYGEDTELIGFEADHLLTFESICDCLYEYWVSVFSEYFRQSKLKKHDWKDIPQSLVSIPHDKAALLNFTEFWREILEHLFIKRSAQENEQMESCFQQWGYLISNI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.45
2 0.52
3 0.59
4 0.67
5 0.66
6 0.72
7 0.77
8 0.8
9 0.84
10 0.83
11 0.85
12 0.85
13 0.89
14 0.87
15 0.87
16 0.86
17 0.86
18 0.86
19 0.85
20 0.8
21 0.78
22 0.76
23 0.78
24 0.75
25 0.71
26 0.62
27 0.53
28 0.49
29 0.41
30 0.34
31 0.24
32 0.18
33 0.12
34 0.13
35 0.15
36 0.18
37 0.23
38 0.23
39 0.27
40 0.3
41 0.34
42 0.36
43 0.35
44 0.32
45 0.28
46 0.27
47 0.23
48 0.2
49 0.16
50 0.12
51 0.1
52 0.11
53 0.11
54 0.1
55 0.12
56 0.12
57 0.11
58 0.12
59 0.12
60 0.13
61 0.14
62 0.15
63 0.13
64 0.15
65 0.19
66 0.19
67 0.18
68 0.19
69 0.19
70 0.2
71 0.21
72 0.18
73 0.16
74 0.16
75 0.18
76 0.16
77 0.16
78 0.16
79 0.2
80 0.22
81 0.24
82 0.29
83 0.33
84 0.33
85 0.32
86 0.31
87 0.26
88 0.25
89 0.26
90 0.22
91 0.19
92 0.18
93 0.18
94 0.17
95 0.17
96 0.15
97 0.13
98 0.15
99 0.21
100 0.24
101 0.27
102 0.3
103 0.32
104 0.34
105 0.4
106 0.41
107 0.37
108 0.38
109 0.36
110 0.32
111 0.31
112 0.28
113 0.21
114 0.16
115 0.11
116 0.08
117 0.06
118 0.06
119 0.06
120 0.06
121 0.09
122 0.1
123 0.1
124 0.11
125 0.14
126 0.14
127 0.15
128 0.17
129 0.22
130 0.23
131 0.25
132 0.28
133 0.26
134 0.27
135 0.26
136 0.26
137 0.18
138 0.16
139 0.15
140 0.1
141 0.1
142 0.08
143 0.09
144 0.09
145 0.11
146 0.13
147 0.14
148 0.15
149 0.21
150 0.22
151 0.21
152 0.22
153 0.22
154 0.21
155 0.22
156 0.22
157 0.18
158 0.19
159 0.22
160 0.24
161 0.25
162 0.25
163 0.23
164 0.24
165 0.29
166 0.3
167 0.3
168 0.34
169 0.36
170 0.36
171 0.36
172 0.35
173 0.29
174 0.27
175 0.23
176 0.17
177 0.14
178 0.13
179 0.11
180 0.13
181 0.12
182 0.12
183 0.12
184 0.11
185 0.09
186 0.08
187 0.08
188 0.05
189 0.05
190 0.05
191 0.05
192 0.05
193 0.06
194 0.09
195 0.15
196 0.16
197 0.21
198 0.27
199 0.33
200 0.42
201 0.49
202 0.5
203 0.51
204 0.51
205 0.47
206 0.41
207 0.37
208 0.29
209 0.23
210 0.19
211 0.13
212 0.12
213 0.11
214 0.11
215 0.1
216 0.1
217 0.12
218 0.17
219 0.2
220 0.22
221 0.23
222 0.23
223 0.22
224 0.22
225 0.19
226 0.13
227 0.13
228 0.11
229 0.12
230 0.12
231 0.12
232 0.12
233 0.1
234 0.1
235 0.09
236 0.08
237 0.08
238 0.09
239 0.1
240 0.09
241 0.09
242 0.09
243 0.09
244 0.09
245 0.07
246 0.06
247 0.07
248 0.06
249 0.06
250 0.06
251 0.05
252 0.05
253 0.06
254 0.06
255 0.05
256 0.05
257 0.05
258 0.05
259 0.05
260 0.06
261 0.05
262 0.07
263 0.07
264 0.08
265 0.09
266 0.08
267 0.08
268 0.08
269 0.09
270 0.09
271 0.08
272 0.09
273 0.09
274 0.12
275 0.12
276 0.12
277 0.11
278 0.13
279 0.14
280 0.17
281 0.22
282 0.21
283 0.21
284 0.21
285 0.21
286 0.2
287 0.22
288 0.2
289 0.14
290 0.15
291 0.14
292 0.15
293 0.15
294 0.15
295 0.11
296 0.16
297 0.16
298 0.14
299 0.14
300 0.13
301 0.16
302 0.15
303 0.18
304 0.12
305 0.11
306 0.12
307 0.14
308 0.14
309 0.12
310 0.13
311 0.13
312 0.18
313 0.18
314 0.18
315 0.18
316 0.18
317 0.18
318 0.2
319 0.18
320 0.12
321 0.13
322 0.14
323 0.13
324 0.13
325 0.11
326 0.11
327 0.11
328 0.11
329 0.1
330 0.08
331 0.08
332 0.08
333 0.07
334 0.06
335 0.05
336 0.05
337 0.06
338 0.06
339 0.05
340 0.06
341 0.06
342 0.06
343 0.06
344 0.07
345 0.07
346 0.07
347 0.07
348 0.07
349 0.08
350 0.08
351 0.11
352 0.11
353 0.1
354 0.11
355 0.13
356 0.12
357 0.12
358 0.12
359 0.11
360 0.17
361 0.19
362 0.2
363 0.21
364 0.27
365 0.3
366 0.39
367 0.47
368 0.52
369 0.59
370 0.64
371 0.73
372 0.75
373 0.81
374 0.82
375 0.8
376 0.73
377 0.63
378 0.58
379 0.49
380 0.46
381 0.4
382 0.35
383 0.28
384 0.27
385 0.26
386 0.24
387 0.25
388 0.21
389 0.21
390 0.18
391 0.18
392 0.17
393 0.18
394 0.22
395 0.21
396 0.18
397 0.17
398 0.16
399 0.16
400 0.19
401 0.21
402 0.2
403 0.22
404 0.25
405 0.22
406 0.24
407 0.29
408 0.31
409 0.31
410 0.33
411 0.4
412 0.39
413 0.43
414 0.42
415 0.39
416 0.34
417 0.33
418 0.29
419 0.24
420 0.2
421 0.18
422 0.16
423 0.17