Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H2AQ38

Protein Details
Accession H2AQ38    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
59-86VAIADSKSKKKVKKNRKKEFDYSNYSTRHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
65-76KSKKKVKKNRKK
429-436KQRKDKKK
Subcellular Location(s) nucl 13, mito 11, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR020103  PsdUridine_synth_cat_dom_sf  
IPR001406  PsdUridine_synth_TruA  
IPR020097  PsdUridine_synth_TruA_a/b_dom  
IPR020095  PsdUridine_synth_TruA_C  
IPR041707  Pus3-like  
IPR020094  TruA/RsuA/RluB/E/F_N  
Gene Ontology GO:0009982  F:pseudouridine synthase activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0001522  P:pseudouridine synthesis  
GO:0008033  P:tRNA processing  
KEGG kaf:KAFR_0B01890  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01416  PseudoU_synth_1  
CDD cd02569  PseudoU_synth_ScPus3  
Amino Acid Sequences MVSFSNFFKCARKTPIVGGSAGSATDGSKYAKWSKEQLVERIIELERDNIPNKRRIDTVAIADSKSKKKVKKNRKKEFDYSNYSTRFIALKFAYLGWNYNGLAIQKEVTKLPTVEGTILEAMNKCKLIPSMVPQEYNFSRCGRTDKGVSAMNQVISLRVRSNLTEEEQMDPQNDVREIQYVTILNQLLPADIRVFAVSLRPPPGFDARFSCKARHYKYIFHNSGLNLTKMEEAAKFFEGEHDFRNFCKIDGSKQITNYKRTILSAKILKISNNFYCFDLIGSAFLWHQVRCMMANLFLVGQELEEPQLIPDMMDVVKTPQKPIYEMASDVPLLLYDCKFPDDVEWIETNVDDYKSIKYGKAVDALTLNYQIKTKVAEVFKQILHFEDVDFTDKTRINLGDGKGKIVNKYEKMMDREVMQTVETINAKFKQRKDKKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.53
2 0.59
3 0.55
4 0.5
5 0.43
6 0.37
7 0.31
8 0.27
9 0.2
10 0.12
11 0.09
12 0.1
13 0.11
14 0.12
15 0.13
16 0.19
17 0.26
18 0.31
19 0.35
20 0.41
21 0.47
22 0.53
23 0.57
24 0.58
25 0.57
26 0.53
27 0.5
28 0.47
29 0.39
30 0.32
31 0.27
32 0.25
33 0.22
34 0.25
35 0.29
36 0.31
37 0.36
38 0.41
39 0.44
40 0.43
41 0.42
42 0.41
43 0.44
44 0.42
45 0.43
46 0.43
47 0.42
48 0.4
49 0.43
50 0.45
51 0.43
52 0.47
53 0.49
54 0.49
55 0.58
56 0.68
57 0.74
58 0.8
59 0.85
60 0.88
61 0.92
62 0.93
63 0.91
64 0.9
65 0.88
66 0.86
67 0.81
68 0.78
69 0.69
70 0.62
71 0.53
72 0.44
73 0.37
74 0.27
75 0.28
76 0.2
77 0.19
78 0.19
79 0.2
80 0.21
81 0.19
82 0.21
83 0.16
84 0.18
85 0.16
86 0.16
87 0.16
88 0.14
89 0.14
90 0.13
91 0.13
92 0.12
93 0.13
94 0.13
95 0.14
96 0.16
97 0.15
98 0.16
99 0.17
100 0.16
101 0.15
102 0.14
103 0.14
104 0.13
105 0.13
106 0.13
107 0.12
108 0.12
109 0.13
110 0.13
111 0.11
112 0.12
113 0.13
114 0.14
115 0.15
116 0.2
117 0.28
118 0.3
119 0.32
120 0.3
121 0.35
122 0.34
123 0.34
124 0.3
125 0.22
126 0.21
127 0.21
128 0.26
129 0.24
130 0.26
131 0.27
132 0.27
133 0.29
134 0.31
135 0.3
136 0.29
137 0.27
138 0.24
139 0.21
140 0.19
141 0.17
142 0.14
143 0.15
144 0.11
145 0.11
146 0.12
147 0.12
148 0.15
149 0.16
150 0.17
151 0.2
152 0.2
153 0.21
154 0.21
155 0.21
156 0.19
157 0.17
158 0.15
159 0.13
160 0.13
161 0.11
162 0.1
163 0.12
164 0.11
165 0.11
166 0.12
167 0.11
168 0.11
169 0.14
170 0.13
171 0.11
172 0.12
173 0.11
174 0.09
175 0.09
176 0.09
177 0.06
178 0.06
179 0.07
180 0.05
181 0.05
182 0.05
183 0.07
184 0.08
185 0.1
186 0.12
187 0.12
188 0.12
189 0.15
190 0.2
191 0.19
192 0.19
193 0.22
194 0.25
195 0.33
196 0.34
197 0.34
198 0.35
199 0.42
200 0.45
201 0.48
202 0.45
203 0.46
204 0.52
205 0.61
206 0.56
207 0.49
208 0.48
209 0.39
210 0.42
211 0.36
212 0.28
213 0.18
214 0.17
215 0.16
216 0.13
217 0.14
218 0.09
219 0.08
220 0.1
221 0.1
222 0.1
223 0.09
224 0.13
225 0.15
226 0.15
227 0.16
228 0.17
229 0.17
230 0.17
231 0.21
232 0.17
233 0.15
234 0.19
235 0.18
236 0.19
237 0.28
238 0.34
239 0.32
240 0.37
241 0.45
242 0.44
243 0.48
244 0.45
245 0.39
246 0.34
247 0.33
248 0.31
249 0.25
250 0.27
251 0.28
252 0.28
253 0.3
254 0.29
255 0.29
256 0.29
257 0.32
258 0.3
259 0.28
260 0.28
261 0.24
262 0.24
263 0.22
264 0.19
265 0.15
266 0.11
267 0.09
268 0.08
269 0.08
270 0.07
271 0.09
272 0.1
273 0.09
274 0.1
275 0.1
276 0.1
277 0.1
278 0.13
279 0.11
280 0.11
281 0.11
282 0.11
283 0.1
284 0.1
285 0.09
286 0.07
287 0.06
288 0.05
289 0.06
290 0.06
291 0.06
292 0.06
293 0.05
294 0.07
295 0.07
296 0.06
297 0.05
298 0.07
299 0.06
300 0.07
301 0.07
302 0.09
303 0.15
304 0.15
305 0.17
306 0.19
307 0.21
308 0.22
309 0.25
310 0.26
311 0.23
312 0.24
313 0.23
314 0.21
315 0.2
316 0.18
317 0.16
318 0.1
319 0.09
320 0.1
321 0.09
322 0.09
323 0.1
324 0.11
325 0.12
326 0.12
327 0.13
328 0.15
329 0.16
330 0.18
331 0.18
332 0.18
333 0.18
334 0.18
335 0.17
336 0.15
337 0.14
338 0.11
339 0.11
340 0.13
341 0.16
342 0.18
343 0.18
344 0.19
345 0.23
346 0.25
347 0.3
348 0.28
349 0.26
350 0.26
351 0.27
352 0.26
353 0.27
354 0.25
355 0.19
356 0.2
357 0.19
358 0.18
359 0.19
360 0.2
361 0.22
362 0.24
363 0.27
364 0.32
365 0.36
366 0.36
367 0.37
368 0.35
369 0.3
370 0.29
371 0.26
372 0.21
373 0.19
374 0.19
375 0.2
376 0.2
377 0.19
378 0.22
379 0.23
380 0.24
381 0.26
382 0.25
383 0.25
384 0.31
385 0.33
386 0.36
387 0.34
388 0.38
389 0.37
390 0.39
391 0.38
392 0.4
393 0.46
394 0.4
395 0.45
396 0.48
397 0.5
398 0.54
399 0.55
400 0.49
401 0.43
402 0.43
403 0.4
404 0.34
405 0.27
406 0.22
407 0.18
408 0.21
409 0.2
410 0.18
411 0.21
412 0.26
413 0.34
414 0.4
415 0.47
416 0.54