Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1E3PRC2

Protein Details
Accession A0A1E3PRC2    Localization Confidence High Confidence Score 15.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
482-504GFEATKQQRKRAAKKAKTEGKEEHydrophilic
520-549SNGMSKSDQRKAKKAKQKERKAFNPYGESEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
490-498RKRAAKKAK
529-573RKAKKAKQKERKAFNPYGESEEGPKGAKKVFRPHGGRTMTFKSKR
Subcellular Location(s) nucl 14.5, cyto_nucl 14.333, cyto 11, cyto_mito 6.999
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002562  3'-5'_exonuclease_dom  
IPR010997  HRDC-like_sf  
IPR002121  HRDC_dom  
IPR044876  HRDC_dom_sf  
IPR012337  RNaseH-like_sf  
IPR036397  RNaseH_sf  
IPR045092  Rrp6-like  
Gene Ontology GO:0000175  F:3'-5'-RNA exonuclease activity  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0000166  F:nucleotide binding  
GO:0000467  P:exonucleolytic trimming to generate mature 3'-end of 5.8S rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
Pfam View protein in Pfam  
PF01612  DNA_pol_A_exo1  
PF00570  HRDC  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50967  HRDC  
CDD cd06147  Rrp6p_like_exo  
Amino Acid Sequences MVKKLKHSSEIAVDLEHHDYRTFSGFVCLMQVSNRDEDWIVDTLELRTELEVLNQVFTDPKIIKVFHGAYMDIIWLQRDFGLYVVNLFDTFHASSALGLPRRSLAYLLENYANFKTSKKYQLADWRIRPLPAPMVHYARADTHFLLNIFDSLRNQLLTSENGDQRMNKVLEESRITAAKRYEIPGLDPNSKISGHGPDGWEKQFGRDPSRHPKRMPIIKALFSWRDSVARREDESVRYVMPEHILQGLAVLAPTDAAGVLSVSNSIPLYVRSNAKTIAKVIKKAKELIDDSRSDDTNEQFRLSPVVDDFDNATNAEDNAYADVNENEEATVESSKLFQIAFASQRDLITHNIDNPRFELDSVSLLWGSSHNKTKLSWKVDSPEFINRQSILKNQLVLTVPVPPLNADGTVMNIDSPEEAEIVEDIPEHEYVEPKGETKIKSNSDILIVKSFGKNNNSASKRKTEGVTEDIIDLELEKEEDDGFEATKQQRKRAAKKAKTEGKEEEEFKAFDYTSAGSVLSNGMSKSDQRKAKKAKQKERKAFNPYGESEEGPKGAKKVFRPHGGRTMTFKSKR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.31
2 0.32
3 0.28
4 0.22
5 0.19
6 0.18
7 0.19
8 0.22
9 0.2
10 0.16
11 0.19
12 0.18
13 0.18
14 0.2
15 0.18
16 0.15
17 0.17
18 0.21
19 0.2
20 0.22
21 0.22
22 0.21
23 0.21
24 0.22
25 0.22
26 0.2
27 0.17
28 0.15
29 0.16
30 0.14
31 0.16
32 0.15
33 0.12
34 0.11
35 0.11
36 0.11
37 0.11
38 0.16
39 0.15
40 0.15
41 0.15
42 0.15
43 0.15
44 0.15
45 0.19
46 0.15
47 0.18
48 0.22
49 0.23
50 0.23
51 0.3
52 0.31
53 0.3
54 0.31
55 0.27
56 0.23
57 0.23
58 0.23
59 0.16
60 0.14
61 0.11
62 0.09
63 0.09
64 0.09
65 0.1
66 0.09
67 0.09
68 0.1
69 0.09
70 0.1
71 0.1
72 0.1
73 0.09
74 0.09
75 0.09
76 0.11
77 0.11
78 0.1
79 0.11
80 0.1
81 0.11
82 0.15
83 0.2
84 0.19
85 0.19
86 0.2
87 0.21
88 0.22
89 0.22
90 0.19
91 0.16
92 0.19
93 0.21
94 0.23
95 0.25
96 0.24
97 0.26
98 0.26
99 0.25
100 0.19
101 0.18
102 0.21
103 0.24
104 0.33
105 0.35
106 0.36
107 0.41
108 0.51
109 0.6
110 0.64
111 0.62
112 0.62
113 0.59
114 0.58
115 0.52
116 0.44
117 0.42
118 0.35
119 0.34
120 0.31
121 0.33
122 0.35
123 0.34
124 0.32
125 0.28
126 0.27
127 0.25
128 0.22
129 0.19
130 0.19
131 0.18
132 0.18
133 0.15
134 0.14
135 0.13
136 0.13
137 0.12
138 0.12
139 0.13
140 0.13
141 0.12
142 0.13
143 0.14
144 0.14
145 0.17
146 0.21
147 0.21
148 0.23
149 0.24
150 0.23
151 0.23
152 0.28
153 0.25
154 0.19
155 0.21
156 0.21
157 0.24
158 0.26
159 0.27
160 0.22
161 0.25
162 0.25
163 0.25
164 0.24
165 0.24
166 0.23
167 0.23
168 0.24
169 0.21
170 0.24
171 0.27
172 0.31
173 0.3
174 0.28
175 0.28
176 0.26
177 0.26
178 0.23
179 0.19
180 0.18
181 0.17
182 0.2
183 0.2
184 0.23
185 0.27
186 0.27
187 0.29
188 0.25
189 0.25
190 0.27
191 0.28
192 0.29
193 0.29
194 0.35
195 0.43
196 0.53
197 0.56
198 0.53
199 0.58
200 0.62
201 0.67
202 0.64
203 0.62
204 0.56
205 0.53
206 0.54
207 0.5
208 0.43
209 0.35
210 0.33
211 0.25
212 0.25
213 0.24
214 0.26
215 0.26
216 0.27
217 0.27
218 0.29
219 0.3
220 0.28
221 0.29
222 0.26
223 0.2
224 0.18
225 0.18
226 0.15
227 0.13
228 0.11
229 0.1
230 0.09
231 0.09
232 0.08
233 0.07
234 0.07
235 0.05
236 0.05
237 0.04
238 0.03
239 0.03
240 0.03
241 0.03
242 0.02
243 0.02
244 0.02
245 0.02
246 0.03
247 0.03
248 0.03
249 0.03
250 0.04
251 0.04
252 0.04
253 0.04
254 0.06
255 0.09
256 0.11
257 0.14
258 0.15
259 0.16
260 0.18
261 0.19
262 0.19
263 0.19
264 0.25
265 0.24
266 0.3
267 0.34
268 0.37
269 0.38
270 0.4
271 0.39
272 0.37
273 0.37
274 0.35
275 0.34
276 0.29
277 0.3
278 0.29
279 0.27
280 0.22
281 0.21
282 0.18
283 0.18
284 0.18
285 0.16
286 0.14
287 0.14
288 0.15
289 0.14
290 0.13
291 0.09
292 0.1
293 0.08
294 0.09
295 0.1
296 0.09
297 0.1
298 0.09
299 0.09
300 0.08
301 0.08
302 0.08
303 0.06
304 0.06
305 0.06
306 0.06
307 0.06
308 0.06
309 0.06
310 0.07
311 0.07
312 0.06
313 0.05
314 0.06
315 0.06
316 0.06
317 0.06
318 0.05
319 0.06
320 0.06
321 0.06
322 0.07
323 0.06
324 0.05
325 0.07
326 0.09
327 0.12
328 0.12
329 0.14
330 0.14
331 0.14
332 0.15
333 0.15
334 0.15
335 0.16
336 0.15
337 0.19
338 0.24
339 0.25
340 0.25
341 0.24
342 0.25
343 0.21
344 0.2
345 0.17
346 0.11
347 0.12
348 0.12
349 0.12
350 0.09
351 0.08
352 0.09
353 0.09
354 0.11
355 0.14
356 0.2
357 0.21
358 0.23
359 0.24
360 0.32
361 0.38
362 0.41
363 0.41
364 0.37
365 0.42
366 0.43
367 0.44
368 0.39
369 0.39
370 0.36
371 0.34
372 0.33
373 0.28
374 0.27
375 0.27
376 0.28
377 0.25
378 0.24
379 0.24
380 0.22
381 0.25
382 0.25
383 0.24
384 0.21
385 0.19
386 0.18
387 0.17
388 0.17
389 0.13
390 0.13
391 0.13
392 0.12
393 0.08
394 0.08
395 0.08
396 0.09
397 0.09
398 0.07
399 0.06
400 0.06
401 0.06
402 0.06
403 0.05
404 0.05
405 0.05
406 0.05
407 0.05
408 0.06
409 0.06
410 0.05
411 0.05
412 0.07
413 0.07
414 0.07
415 0.08
416 0.09
417 0.1
418 0.14
419 0.14
420 0.13
421 0.17
422 0.22
423 0.23
424 0.28
425 0.35
426 0.35
427 0.38
428 0.39
429 0.36
430 0.37
431 0.37
432 0.33
433 0.28
434 0.26
435 0.24
436 0.25
437 0.27
438 0.27
439 0.29
440 0.3
441 0.33
442 0.42
443 0.45
444 0.47
445 0.48
446 0.5
447 0.5
448 0.5
449 0.47
450 0.42
451 0.42
452 0.41
453 0.39
454 0.33
455 0.29
456 0.25
457 0.23
458 0.18
459 0.13
460 0.09
461 0.07
462 0.06
463 0.06
464 0.06
465 0.06
466 0.06
467 0.08
468 0.08
469 0.08
470 0.09
471 0.14
472 0.19
473 0.26
474 0.29
475 0.34
476 0.42
477 0.52
478 0.61
479 0.66
480 0.73
481 0.75
482 0.83
483 0.87
484 0.87
485 0.82
486 0.79
487 0.76
488 0.71
489 0.7
490 0.62
491 0.55
492 0.49
493 0.45
494 0.39
495 0.35
496 0.28
497 0.21
498 0.21
499 0.17
500 0.14
501 0.15
502 0.13
503 0.1
504 0.1
505 0.11
506 0.1
507 0.1
508 0.09
509 0.1
510 0.12
511 0.17
512 0.24
513 0.31
514 0.39
515 0.44
516 0.55
517 0.64
518 0.73
519 0.78
520 0.83
521 0.85
522 0.88
523 0.93
524 0.93
525 0.93
526 0.92
527 0.91
528 0.88
529 0.84
530 0.81
531 0.72
532 0.69
533 0.61
534 0.53
535 0.47
536 0.42
537 0.36
538 0.3
539 0.3
540 0.26
541 0.28
542 0.32
543 0.35
544 0.43
545 0.51
546 0.59
547 0.63
548 0.67
549 0.72
550 0.73
551 0.69
552 0.66
553 0.65