Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H2AVN4

Protein Details
Accession H2AVN4    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
10-30NNPLARLNKHNERQSKNYNNVHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 14, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR024111  PEX5/PEX5L  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
IPR019734  TPR_repeat  
Gene Ontology GO:0005777  C:peroxisome  
KEGG kaf:KAFR_0E02820  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF13432  TPR_16  
PF13181  TPR_8  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50005  TPR  
Amino Acid Sequences MNVTDCSVSNNPLARLNKHNERQSKNYNNVSGSRLNSEQIKSSQNDFKTATHVMSNTSRQMMNNFINPMVASSGAALNMGHSPMQTANSPMDAIRSHQVPSPPHEQAISFKPTATGSWSTEFQKDGLVSQKVPAAVAKSDSFRQNHFQQPLHPNLRYSRTMVQSSQLPLQQREIITPSASHNATADWDQQFKDLENEVSQTLKVSEQDTDAIIDTDYQTDFQHVWDSLQQDQDELINTRKYGTRIHENAIYNFATENEYKDNVNAYKIGCILMENGAKLSEAAMAFEAAVQQNPTHVDAWLKLGLVQTQNEKEINGISALETCLKLDPKNLEALKTLATGYINEGYDMSAFITLSKVIESKYPNLDSSIDQEINLLESELEDPPNLNEKITKKFLKLANQLPGVDSDIQLCLGLLYYANDDFDKTIECFKAALNENPTDELMWNRLGAALANSNRSEDSIKAYYKAIQLKPSFVRARYNLAVACMNIHCYKEAAEHLLTALSMHEVGTPNGKAIPEGLVIDSHNDNIMETLKRVFIALNRNDLADKVEPRMKLAEFRNEFTF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.38
2 0.45
3 0.51
4 0.57
5 0.61
6 0.69
7 0.7
8 0.74
9 0.78
10 0.8
11 0.81
12 0.8
13 0.79
14 0.75
15 0.7
16 0.66
17 0.62
18 0.56
19 0.49
20 0.45
21 0.39
22 0.36
23 0.37
24 0.36
25 0.36
26 0.34
27 0.37
28 0.35
29 0.4
30 0.44
31 0.4
32 0.44
33 0.41
34 0.39
35 0.38
36 0.37
37 0.33
38 0.29
39 0.28
40 0.27
41 0.3
42 0.33
43 0.31
44 0.32
45 0.32
46 0.3
47 0.32
48 0.34
49 0.32
50 0.33
51 0.31
52 0.28
53 0.27
54 0.26
55 0.25
56 0.19
57 0.15
58 0.1
59 0.09
60 0.09
61 0.09
62 0.09
63 0.08
64 0.08
65 0.09
66 0.09
67 0.08
68 0.07
69 0.09
70 0.1
71 0.13
72 0.12
73 0.13
74 0.14
75 0.15
76 0.15
77 0.14
78 0.15
79 0.14
80 0.16
81 0.18
82 0.18
83 0.18
84 0.21
85 0.26
86 0.26
87 0.32
88 0.36
89 0.34
90 0.34
91 0.33
92 0.31
93 0.3
94 0.33
95 0.33
96 0.26
97 0.24
98 0.25
99 0.25
100 0.24
101 0.25
102 0.22
103 0.19
104 0.22
105 0.25
106 0.26
107 0.27
108 0.27
109 0.23
110 0.22
111 0.19
112 0.18
113 0.22
114 0.22
115 0.21
116 0.21
117 0.24
118 0.21
119 0.21
120 0.2
121 0.15
122 0.14
123 0.16
124 0.17
125 0.17
126 0.21
127 0.26
128 0.27
129 0.28
130 0.33
131 0.36
132 0.43
133 0.45
134 0.43
135 0.45
136 0.5
137 0.56
138 0.56
139 0.51
140 0.46
141 0.46
142 0.5
143 0.44
144 0.41
145 0.38
146 0.36
147 0.38
148 0.36
149 0.34
150 0.33
151 0.33
152 0.33
153 0.29
154 0.27
155 0.25
156 0.27
157 0.28
158 0.24
159 0.23
160 0.22
161 0.21
162 0.18
163 0.18
164 0.18
165 0.19
166 0.19
167 0.17
168 0.15
169 0.14
170 0.15
171 0.15
172 0.17
173 0.14
174 0.16
175 0.16
176 0.17
177 0.17
178 0.16
179 0.17
180 0.14
181 0.14
182 0.13
183 0.14
184 0.13
185 0.13
186 0.12
187 0.1
188 0.1
189 0.09
190 0.1
191 0.1
192 0.1
193 0.1
194 0.11
195 0.11
196 0.11
197 0.1
198 0.09
199 0.08
200 0.08
201 0.07
202 0.07
203 0.07
204 0.07
205 0.07
206 0.08
207 0.08
208 0.08
209 0.1
210 0.09
211 0.1
212 0.12
213 0.14
214 0.14
215 0.17
216 0.16
217 0.14
218 0.14
219 0.14
220 0.13
221 0.12
222 0.13
223 0.11
224 0.12
225 0.13
226 0.15
227 0.16
228 0.19
229 0.22
230 0.29
231 0.3
232 0.33
233 0.38
234 0.37
235 0.36
236 0.35
237 0.3
238 0.21
239 0.19
240 0.17
241 0.13
242 0.11
243 0.12
244 0.11
245 0.12
246 0.12
247 0.12
248 0.14
249 0.13
250 0.13
251 0.13
252 0.11
253 0.12
254 0.12
255 0.12
256 0.09
257 0.08
258 0.08
259 0.1
260 0.1
261 0.09
262 0.09
263 0.08
264 0.08
265 0.08
266 0.07
267 0.06
268 0.05
269 0.06
270 0.06
271 0.06
272 0.06
273 0.06
274 0.06
275 0.04
276 0.05
277 0.05
278 0.05
279 0.06
280 0.07
281 0.08
282 0.08
283 0.08
284 0.08
285 0.09
286 0.12
287 0.11
288 0.1
289 0.1
290 0.1
291 0.12
292 0.13
293 0.13
294 0.14
295 0.14
296 0.16
297 0.15
298 0.14
299 0.13
300 0.12
301 0.11
302 0.08
303 0.07
304 0.05
305 0.06
306 0.07
307 0.07
308 0.07
309 0.07
310 0.08
311 0.1
312 0.1
313 0.12
314 0.14
315 0.14
316 0.21
317 0.21
318 0.21
319 0.21
320 0.21
321 0.19
322 0.17
323 0.16
324 0.1
325 0.1
326 0.09
327 0.1
328 0.12
329 0.11
330 0.1
331 0.1
332 0.1
333 0.09
334 0.09
335 0.08
336 0.05
337 0.05
338 0.05
339 0.05
340 0.05
341 0.05
342 0.06
343 0.06
344 0.06
345 0.1
346 0.13
347 0.16
348 0.21
349 0.23
350 0.23
351 0.24
352 0.25
353 0.22
354 0.23
355 0.25
356 0.2
357 0.18
358 0.18
359 0.16
360 0.15
361 0.14
362 0.1
363 0.05
364 0.05
365 0.07
366 0.07
367 0.08
368 0.07
369 0.07
370 0.08
371 0.15
372 0.15
373 0.13
374 0.18
375 0.21
376 0.27
377 0.34
378 0.36
379 0.31
380 0.38
381 0.43
382 0.48
383 0.52
384 0.52
385 0.52
386 0.52
387 0.5
388 0.44
389 0.4
390 0.33
391 0.27
392 0.2
393 0.13
394 0.11
395 0.11
396 0.1
397 0.09
398 0.06
399 0.05
400 0.05
401 0.04
402 0.05
403 0.06
404 0.07
405 0.08
406 0.08
407 0.08
408 0.08
409 0.09
410 0.1
411 0.1
412 0.14
413 0.14
414 0.14
415 0.14
416 0.14
417 0.21
418 0.22
419 0.27
420 0.27
421 0.29
422 0.29
423 0.3
424 0.3
425 0.23
426 0.21
427 0.17
428 0.15
429 0.14
430 0.13
431 0.11
432 0.11
433 0.11
434 0.1
435 0.11
436 0.15
437 0.16
438 0.19
439 0.19
440 0.2
441 0.2
442 0.21
443 0.21
444 0.15
445 0.2
446 0.23
447 0.24
448 0.24
449 0.25
450 0.28
451 0.32
452 0.4
453 0.36
454 0.39
455 0.39
456 0.44
457 0.46
458 0.51
459 0.5
460 0.44
461 0.49
462 0.43
463 0.49
464 0.44
465 0.45
466 0.37
467 0.34
468 0.34
469 0.26
470 0.26
471 0.19
472 0.21
473 0.19
474 0.2
475 0.18
476 0.17
477 0.18
478 0.18
479 0.2
480 0.2
481 0.19
482 0.18
483 0.18
484 0.18
485 0.16
486 0.13
487 0.11
488 0.07
489 0.07
490 0.07
491 0.09
492 0.1
493 0.12
494 0.16
495 0.16
496 0.16
497 0.18
498 0.18
499 0.15
500 0.15
501 0.17
502 0.13
503 0.14
504 0.14
505 0.13
506 0.13
507 0.17
508 0.16
509 0.14
510 0.14
511 0.13
512 0.13
513 0.13
514 0.16
515 0.14
516 0.15
517 0.17
518 0.16
519 0.16
520 0.17
521 0.17
522 0.19
523 0.27
524 0.3
525 0.36
526 0.36
527 0.37
528 0.37
529 0.35
530 0.35
531 0.31
532 0.3
533 0.28
534 0.33
535 0.32
536 0.34
537 0.39
538 0.36
539 0.37
540 0.41
541 0.46
542 0.45