Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H2B0V1

Protein Details
Accession H2B0V1    Localization Confidence High Confidence Score 20.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-45MPPKKNKQQAKPAKKKDNVDKTFGMKNKNRSTKVQKFIKQVQQQAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
4-17KKNKQQAKPAKKKD
53-56KRKK
256-269RKINAEKKANEKRK
Subcellular Location(s) nucl 24, mito 1, cyto 1, vacu 1, cyto_mito 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR032378  ZC3H15/TMA46_C  
IPR000571  Znf_CCCH  
IPR036855  Znf_CCCH_sf  
Gene Ontology GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0034641  P:cellular nitrogen compound metabolic process  
KEGG kaf:KAFR_0J01870  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF16543  DFRP_C  
PF00642  zf-CCCH  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50103  ZF_C3H1  
Amino Acid Sequences MPPKKNKQQAKPAKKKDNVDKTFGMKNKNRSTKVQKFIKQVQQQADPEKEEMKRKKLEAKKLQEAAEAERRALFNPVMDQRVRAGVDPKTVLCALFKLGNCNKGDKCKFSHDLNIGRRVEKKDLYQDARSEKEGDTMDQWDEEKLRSVILSKHGNPRTSTDKVCKYFIEAVENGKYGWFWVCPNNGDKCMYRHSLPEGFVLKTKEQKRLEKEALENQPKITLEEFLDTERNKLDKTKLTPITIANFAEWKKNHIIRKINAEKKANEKRKPCGREVIQKLLAENKHIEERYGSVMEDDEGTAWDLTEFTDALREAEHRDDDGIKDYGDGSNPTFEVRAN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.91
2 0.91
3 0.9
4 0.9
5 0.84
6 0.8
7 0.74
8 0.68
9 0.69
10 0.64
11 0.62
12 0.58
13 0.63
14 0.67
15 0.71
16 0.71
17 0.72
18 0.78
19 0.79
20 0.82
21 0.82
22 0.79
23 0.78
24 0.83
25 0.83
26 0.8
27 0.77
28 0.74
29 0.72
30 0.69
31 0.67
32 0.62
33 0.54
34 0.48
35 0.46
36 0.44
37 0.46
38 0.49
39 0.5
40 0.52
41 0.54
42 0.62
43 0.65
44 0.72
45 0.72
46 0.74
47 0.76
48 0.75
49 0.72
50 0.66
51 0.59
52 0.54
53 0.52
54 0.43
55 0.34
56 0.31
57 0.3
58 0.27
59 0.28
60 0.22
61 0.14
62 0.2
63 0.23
64 0.24
65 0.24
66 0.24
67 0.22
68 0.26
69 0.25
70 0.21
71 0.22
72 0.2
73 0.23
74 0.24
75 0.23
76 0.22
77 0.21
78 0.2
79 0.16
80 0.15
81 0.13
82 0.16
83 0.16
84 0.22
85 0.24
86 0.3
87 0.31
88 0.35
89 0.36
90 0.41
91 0.44
92 0.4
93 0.42
94 0.44
95 0.47
96 0.45
97 0.5
98 0.46
99 0.52
100 0.53
101 0.57
102 0.5
103 0.48
104 0.5
105 0.47
106 0.45
107 0.39
108 0.37
109 0.37
110 0.43
111 0.46
112 0.44
113 0.44
114 0.44
115 0.43
116 0.41
117 0.35
118 0.27
119 0.27
120 0.24
121 0.21
122 0.18
123 0.17
124 0.16
125 0.14
126 0.14
127 0.11
128 0.11
129 0.1
130 0.11
131 0.09
132 0.09
133 0.09
134 0.1
135 0.12
136 0.17
137 0.22
138 0.23
139 0.32
140 0.36
141 0.38
142 0.37
143 0.39
144 0.39
145 0.38
146 0.38
147 0.35
148 0.39
149 0.39
150 0.4
151 0.36
152 0.33
153 0.33
154 0.31
155 0.28
156 0.21
157 0.22
158 0.21
159 0.21
160 0.17
161 0.13
162 0.12
163 0.08
164 0.09
165 0.07
166 0.07
167 0.1
168 0.12
169 0.14
170 0.18
171 0.2
172 0.21
173 0.22
174 0.23
175 0.22
176 0.25
177 0.25
178 0.23
179 0.22
180 0.25
181 0.26
182 0.25
183 0.27
184 0.25
185 0.23
186 0.25
187 0.26
188 0.24
189 0.28
190 0.31
191 0.35
192 0.39
193 0.46
194 0.5
195 0.56
196 0.58
197 0.55
198 0.55
199 0.55
200 0.58
201 0.57
202 0.51
203 0.42
204 0.41
205 0.36
206 0.34
207 0.26
208 0.18
209 0.13
210 0.14
211 0.15
212 0.13
213 0.17
214 0.16
215 0.17
216 0.17
217 0.17
218 0.16
219 0.19
220 0.23
221 0.26
222 0.31
223 0.4
224 0.42
225 0.43
226 0.45
227 0.43
228 0.42
229 0.38
230 0.33
231 0.24
232 0.23
233 0.21
234 0.26
235 0.24
236 0.25
237 0.29
238 0.35
239 0.4
240 0.44
241 0.52
242 0.5
243 0.6
244 0.67
245 0.66
246 0.68
247 0.68
248 0.64
249 0.66
250 0.73
251 0.72
252 0.7
253 0.69
254 0.71
255 0.75
256 0.78
257 0.72
258 0.71
259 0.69
260 0.71
261 0.72
262 0.72
263 0.67
264 0.61
265 0.58
266 0.55
267 0.48
268 0.41
269 0.36
270 0.3
271 0.32
272 0.31
273 0.31
274 0.24
275 0.26
276 0.27
277 0.26
278 0.23
279 0.16
280 0.16
281 0.16
282 0.15
283 0.13
284 0.09
285 0.08
286 0.1
287 0.09
288 0.09
289 0.08
290 0.07
291 0.07
292 0.09
293 0.08
294 0.06
295 0.1
296 0.1
297 0.1
298 0.12
299 0.12
300 0.14
301 0.19
302 0.21
303 0.18
304 0.21
305 0.22
306 0.23
307 0.26
308 0.24
309 0.19
310 0.19
311 0.19
312 0.18
313 0.19
314 0.19
315 0.16
316 0.19
317 0.19
318 0.2