Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H2AYD3

Protein Details
Accession H2AYD3    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
143-165EAPTAKKDDKKDDKKPRGKPDEEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
129-198KKKKTDAKKDEGAKEAPTAKKDDKKDDKKPRGKPDEETLKKLREEAKAKKAAKKAANAAKEAQPAKDEKP
Subcellular Location(s) nucl 17, cyto_nucl 13.166, mito_nucl 10.832, cyto 6, cyto_mito 5.332
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036282  Glutathione-S-Trfase_C_sf  
IPR012340  NA-bd_OB-fold  
IPR002547  tRNA-bd_dom  
Gene Ontology GO:0000049  F:tRNA binding  
KEGG kaf:KAFR_0G03510  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01588  tRNA_bind  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50886  TRBD  
CDD cd10304  GST_C_Arc1p_N_like  
cd02799  tRNA_bind_EMAP-II_like  
Amino Acid Sequences MSELVSKFQSLSVSKETSSLSKEQSALEAQWDSILKSGQVESNLESINLFLRDNAFLLSTLHPTVSDVNVFEAVLPLLKQLVSSTKDSYAKFRHLLRWANYLQTLLEISESDKLVLNFDLELPREVIEKKKKTDAKKDEGAKEAPTAKKDDKKDDKKPRGKPDEETLKKLREEAKAKKAAKKAANAAKEAQPAKDEKPKPSVIDFRVGFIQKAIKHPDADSLYVSTIDVGDEEGPRTVCSGLVKHFPLEAMQERYVVVVCNLKPVNMRGIKSTAMVLCGSDDSKVEFVEPPAGSKAGDKVFFEGFGEEEPLKQLNPKKKIWEALQPHFSTNENLEVIFKDEESKEKPILKLTNAKGDSFKVASIANANVR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.29
2 0.31
3 0.31
4 0.3
5 0.32
6 0.32
7 0.29
8 0.31
9 0.32
10 0.3
11 0.31
12 0.31
13 0.27
14 0.26
15 0.23
16 0.18
17 0.2
18 0.2
19 0.17
20 0.16
21 0.16
22 0.13
23 0.14
24 0.16
25 0.15
26 0.17
27 0.18
28 0.18
29 0.21
30 0.21
31 0.19
32 0.17
33 0.15
34 0.16
35 0.15
36 0.13
37 0.1
38 0.12
39 0.13
40 0.13
41 0.13
42 0.11
43 0.1
44 0.13
45 0.14
46 0.15
47 0.14
48 0.14
49 0.13
50 0.14
51 0.15
52 0.14
53 0.14
54 0.12
55 0.13
56 0.13
57 0.13
58 0.12
59 0.1
60 0.09
61 0.08
62 0.08
63 0.06
64 0.06
65 0.06
66 0.06
67 0.07
68 0.13
69 0.15
70 0.18
71 0.2
72 0.25
73 0.31
74 0.31
75 0.38
76 0.37
77 0.4
78 0.41
79 0.43
80 0.44
81 0.47
82 0.54
83 0.5
84 0.52
85 0.48
86 0.46
87 0.43
88 0.36
89 0.29
90 0.22
91 0.19
92 0.11
93 0.1
94 0.07
95 0.08
96 0.1
97 0.1
98 0.1
99 0.11
100 0.11
101 0.12
102 0.12
103 0.12
104 0.09
105 0.1
106 0.12
107 0.11
108 0.12
109 0.11
110 0.11
111 0.12
112 0.13
113 0.2
114 0.28
115 0.33
116 0.35
117 0.44
118 0.5
119 0.56
120 0.66
121 0.67
122 0.65
123 0.67
124 0.72
125 0.67
126 0.65
127 0.58
128 0.48
129 0.43
130 0.41
131 0.35
132 0.29
133 0.3
134 0.31
135 0.36
136 0.39
137 0.46
138 0.5
139 0.58
140 0.67
141 0.73
142 0.79
143 0.81
144 0.86
145 0.87
146 0.85
147 0.79
148 0.72
149 0.7
150 0.7
151 0.64
152 0.62
153 0.55
154 0.49
155 0.46
156 0.46
157 0.41
158 0.38
159 0.42
160 0.44
161 0.49
162 0.54
163 0.57
164 0.6
165 0.59
166 0.59
167 0.56
168 0.53
169 0.52
170 0.49
171 0.49
172 0.44
173 0.42
174 0.38
175 0.39
176 0.35
177 0.27
178 0.22
179 0.22
180 0.24
181 0.3
182 0.3
183 0.28
184 0.33
185 0.35
186 0.35
187 0.37
188 0.41
189 0.33
190 0.38
191 0.35
192 0.3
193 0.32
194 0.31
195 0.26
196 0.2
197 0.23
198 0.17
199 0.21
200 0.25
201 0.23
202 0.24
203 0.24
204 0.29
205 0.27
206 0.26
207 0.22
208 0.18
209 0.17
210 0.16
211 0.15
212 0.09
213 0.07
214 0.06
215 0.05
216 0.04
217 0.05
218 0.06
219 0.06
220 0.07
221 0.07
222 0.08
223 0.08
224 0.08
225 0.08
226 0.09
227 0.11
228 0.13
229 0.17
230 0.18
231 0.18
232 0.18
233 0.17
234 0.16
235 0.18
236 0.2
237 0.2
238 0.2
239 0.2
240 0.19
241 0.2
242 0.19
243 0.15
244 0.12
245 0.12
246 0.12
247 0.19
248 0.19
249 0.19
250 0.21
251 0.22
252 0.3
253 0.29
254 0.3
255 0.26
256 0.29
257 0.29
258 0.27
259 0.29
260 0.2
261 0.17
262 0.16
263 0.13
264 0.12
265 0.12
266 0.11
267 0.09
268 0.09
269 0.09
270 0.1
271 0.1
272 0.1
273 0.1
274 0.11
275 0.17
276 0.17
277 0.17
278 0.18
279 0.19
280 0.18
281 0.18
282 0.22
283 0.19
284 0.22
285 0.2
286 0.21
287 0.21
288 0.22
289 0.21
290 0.17
291 0.13
292 0.12
293 0.14
294 0.11
295 0.11
296 0.13
297 0.13
298 0.13
299 0.18
300 0.25
301 0.31
302 0.38
303 0.43
304 0.49
305 0.54
306 0.62
307 0.61
308 0.64
309 0.63
310 0.65
311 0.69
312 0.63
313 0.58
314 0.52
315 0.48
316 0.41
317 0.34
318 0.3
319 0.22
320 0.2
321 0.2
322 0.19
323 0.21
324 0.19
325 0.17
326 0.16
327 0.17
328 0.23
329 0.26
330 0.3
331 0.32
332 0.36
333 0.38
334 0.42
335 0.46
336 0.47
337 0.52
338 0.52
339 0.57
340 0.54
341 0.54
342 0.49
343 0.46
344 0.45
345 0.36
346 0.32
347 0.23
348 0.22
349 0.21
350 0.22