FuNGI

H2ATA3

Protein Details

Accession

H2ATA3

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

11.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
103-122	GVAPRAKMNQQRARRFRSAR	Hydrophilic
982-1001	KNNYNNQQGRRYNNNSHQNY	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 17.5, cyto_nucl 11.5, cyto 4.5, mito 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR027073 5_3_exoribonuclease IPR041412 Xrn1_helical IPR004859 Xrn1_N IPR017151 Xrn2/3/4
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0004534 F:5'-3' RNA exonuclease activity GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0006353 P:DNA-templated transcription termination GO:0006397 P:mRNA processing GO:0006364 P:rRNA processing
KEGG	kaf:KAFR_0C06110 -
Pfam	View protein in Pfam PF17846 XRN_M PF03159 XRN_N
CDD	cd18673 PIN_XRN1-2-like

Amino Acid Sequences

MGVPSFFRWLSRKYPKIICPVLEEYPQVVDGVALPIDYASPNPNGELDNLYLDMNGIVHPCSHPENKPPPETEDEMLLAVFEYTNRVLNMARPRKVLLMAVDGVAPRAKMNQQRARRFRSARDAQIANEAREEELRERENYGEIIDDALKKKKTWDSNAITPGTPFMDKLAAALRYWTAFKLATDPGWKNLQVIISDATVPGEGEHKIMNFIRSQRADPEYNPNTTHCIYGLDADLIFLGLATHEPHFKILREDVFAQDNRKRTTFSDNMSEEEKELIMKKDAEKPFLWLHISVLREYLAAELWIPRLSFNFDLERAIDDWVFMCFFCGNDFLPHLPSLDVRENSIDILLDIWKVILPSLKTYMTCDGFLNLESVEILLKQLGDREPDIFKTRYIQEVRKQEAFERRRLQNGKNISKGQDRHPTIPNEQLQLYDTSGKLAAGSWNLTTSDMVRLKKEIMLANEGDPDAIAIVRAQSDKNNELVKNITEEEMEKVVDEANKRNFKVAELMKKKLSARKHKLEEEEQNADKDVEEDKENPMKKVKTEDENLTNEIKSEVEAAVQEEEDDNDDESSEESDVKNNIVKKSAGSIISSGDITSGVIDTDDNVKLYESGYRERYYTEKFHISKDEIEIVRRDMVRSYVEGVSWVLRYYYQGCASWNWYYPFHYAPFASDFFDIKDIKVEFDLGEPFLPYEQLMSVLPAASGHTLPPIFRPLMSEADSPIIDFYPPEFPIDMNGKKMSWQGIALLPFIDEKRLLEVVRAQYPKLSDAERSRNVRKEAILLISNKNVNYEKFSKKLYQSEDLADDFEIKFRHFKSGLSGIVSIDEEGFKLNSKLLCPLESTSLPELSTNLFLKALFKFTPLPANNKSVILNGYIPAEATLSVYDVDSILYKYGGNNFQRNNRFFGNDMKKNVVKVGPSGTTQYKPREGGYRSFFYFSNAKNANNTNRNGSYNNVHQQRGQQTNYRGARDSGGSYNNGYIKNNYNNQQGRRYNNNSHQNYNNNSDYNRGGYSGQSRYNNNGNYQNSRYQGGNEGYRRF

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.64
2	0.67
3	0.73
4	0.74
5	0.66
6	0.62
7	0.61
8	0.57
9	0.51
10	0.45
11	0.37
12	0.32
13	0.3
14	0.22
15	0.17
16	0.13
17	0.1
18	0.11
19	0.09
20	0.07
21	0.07
22	0.07
23	0.08
24	0.08
25	0.09
26	0.1
27	0.12
28	0.13
29	0.14
30	0.16
31	0.16
32	0.17
33	0.19
34	0.17
35	0.17
36	0.17
37	0.17
38	0.15
39	0.14
40	0.13
41	0.1
42	0.09
43	0.08
44	0.08
45	0.09
46	0.1
47	0.13
48	0.19
49	0.24
50	0.27
51	0.36
52	0.46
53	0.52
54	0.58
55	0.58
56	0.58
57	0.59
58	0.59
59	0.51
60	0.44
61	0.37
62	0.31
63	0.27
64	0.21
65	0.15
66	0.1
67	0.09
68	0.06
69	0.08
70	0.09
71	0.12
72	0.12
73	0.13
74	0.13
75	0.2
76	0.31
77	0.37
78	0.4
79	0.4
80	0.42
81	0.44
82	0.45
83	0.42
84	0.34
85	0.3
86	0.27
87	0.25
88	0.24
89	0.21
90	0.2
91	0.18
92	0.15
93	0.1
94	0.13
95	0.19
96	0.26
97	0.37
98	0.45
99	0.54
100	0.65
101	0.74
102	0.79
103	0.82
104	0.8
105	0.77
106	0.79
107	0.77
108	0.74
109	0.73
110	0.66
111	0.57
112	0.62
113	0.57
114	0.47
115	0.41
116	0.33
117	0.26
118	0.26
119	0.28
120	0.21
121	0.24
122	0.26
123	0.25
124	0.27
125	0.27
126	0.27
127	0.24
128	0.21
129	0.16
130	0.13
131	0.14
132	0.15
133	0.17
134	0.19
135	0.25
136	0.27
137	0.26
138	0.32
139	0.38
140	0.45
141	0.49
142	0.57
143	0.57
144	0.64
145	0.7
146	0.66
147	0.58
148	0.49
149	0.43
150	0.35
151	0.27
152	0.19
153	0.14
154	0.13
155	0.12
156	0.14
157	0.17
158	0.15
159	0.15
160	0.16
161	0.16
162	0.16
163	0.17
164	0.16
165	0.13
166	0.13
167	0.13
168	0.16
169	0.17
170	0.19
171	0.25
172	0.26
173	0.28
174	0.31
175	0.31
176	0.28
177	0.28
178	0.27
179	0.2
180	0.21
181	0.19
182	0.15
183	0.15
184	0.14
185	0.12
186	0.1
187	0.1
188	0.08
189	0.08
190	0.08
191	0.08
192	0.1
193	0.09
194	0.13
195	0.15
196	0.16
197	0.18
198	0.21
199	0.29
200	0.3
201	0.32
202	0.33
203	0.37
204	0.38
205	0.37
206	0.44
207	0.39
208	0.4
209	0.4
210	0.35
211	0.35
212	0.33
213	0.31
214	0.21
215	0.19
216	0.17
217	0.17
218	0.17
219	0.12
220	0.11
221	0.11
222	0.1
223	0.08
224	0.07
225	0.05
226	0.04
227	0.03
228	0.04
229	0.05
230	0.07
231	0.08
232	0.09
233	0.12
234	0.14
235	0.15
236	0.18
237	0.22
238	0.23
239	0.25
240	0.26
241	0.26
242	0.3
243	0.31
244	0.33
245	0.33
246	0.37
247	0.37
248	0.36
249	0.36
250	0.32
251	0.39
252	0.39
253	0.38
254	0.4
255	0.38
256	0.39
257	0.4
258	0.38
259	0.3
260	0.25
261	0.21
262	0.14
263	0.15
264	0.15
265	0.15
266	0.17
267	0.19
268	0.28
269	0.3
270	0.33
271	0.31
272	0.33
273	0.33
274	0.33
275	0.32
276	0.23
277	0.23
278	0.22
279	0.23
280	0.19
281	0.17
282	0.15
283	0.13
284	0.13
285	0.11
286	0.07
287	0.06
288	0.06
289	0.07
290	0.08
291	0.09
292	0.09
293	0.09
294	0.09
295	0.13
296	0.14
297	0.15
298	0.17
299	0.16
300	0.17
301	0.18
302	0.18
303	0.15
304	0.15
305	0.13
306	0.1
307	0.1
308	0.09
309	0.09
310	0.07
311	0.07
312	0.06
313	0.06
314	0.07
315	0.08
316	0.08
317	0.09
318	0.11
319	0.11
320	0.13
321	0.13
322	0.13
323	0.12
324	0.12
325	0.15
326	0.2
327	0.19
328	0.18
329	0.19
330	0.19
331	0.18
332	0.18
333	0.13
334	0.07
335	0.07
336	0.07
337	0.05
338	0.05
339	0.05
340	0.05
341	0.05
342	0.06
343	0.08
344	0.08
345	0.1
346	0.13
347	0.14
348	0.14
349	0.17
350	0.21
351	0.2
352	0.2
353	0.19
354	0.16
355	0.16
356	0.16
357	0.14
358	0.09
359	0.07
360	0.06
361	0.06
362	0.05
363	0.05
364	0.04
365	0.04
366	0.04
367	0.04
368	0.07
369	0.08
370	0.1
371	0.11
372	0.13
373	0.14
374	0.17
375	0.21
376	0.19
377	0.19
378	0.21
379	0.22
380	0.27
381	0.3
382	0.33
383	0.36
384	0.44
385	0.48
386	0.47
387	0.47
388	0.45
389	0.51
390	0.49
391	0.5
392	0.48
393	0.46
394	0.51
395	0.55
396	0.52
397	0.49
398	0.56
399	0.54
400	0.52
401	0.53
402	0.48
403	0.5
404	0.5
405	0.49
406	0.49
407	0.46
408	0.44
409	0.47
410	0.48
411	0.44
412	0.48
413	0.44
414	0.36
415	0.33
416	0.29
417	0.24
418	0.21
419	0.2
420	0.14
421	0.12
422	0.11
423	0.11
424	0.1
425	0.08
426	0.08
427	0.08
428	0.07
429	0.08
430	0.07
431	0.08
432	0.08
433	0.09
434	0.08
435	0.08
436	0.14
437	0.17
438	0.18
439	0.18
440	0.19
441	0.19
442	0.21
443	0.23
444	0.19
445	0.17
446	0.19
447	0.19
448	0.18
449	0.18
450	0.17
451	0.13
452	0.1
453	0.08
454	0.05
455	0.04
456	0.04
457	0.03
458	0.03
459	0.04
460	0.05
461	0.06
462	0.08
463	0.12
464	0.13
465	0.16
466	0.2
467	0.19
468	0.2
469	0.21
470	0.19
471	0.18
472	0.17
473	0.14
474	0.1
475	0.11
476	0.11
477	0.11
478	0.1
479	0.08
480	0.07
481	0.08
482	0.1
483	0.11
484	0.14
485	0.21
486	0.25
487	0.26
488	0.28
489	0.27
490	0.26
491	0.32
492	0.32
493	0.34
494	0.35
495	0.38
496	0.36
497	0.4
498	0.41
499	0.39
500	0.43
501	0.44
502	0.48
503	0.55
504	0.59
505	0.6
506	0.63
507	0.64
508	0.62
509	0.56
510	0.52
511	0.44
512	0.38
513	0.34
514	0.29
515	0.23
516	0.17
517	0.13
518	0.09
519	0.09
520	0.1
521	0.13
522	0.18
523	0.19
524	0.2
525	0.24
526	0.23
527	0.23
528	0.29
529	0.3
530	0.3
531	0.33
532	0.36
533	0.36
534	0.37
535	0.38
536	0.33
537	0.28
538	0.23
539	0.2
540	0.15
541	0.1
542	0.09
543	0.07
544	0.06
545	0.06
546	0.06
547	0.06
548	0.06
549	0.06
550	0.05
551	0.05
552	0.06
553	0.06
554	0.06
555	0.06
556	0.06
557	0.06
558	0.06
559	0.07
560	0.06
561	0.06
562	0.06
563	0.08
564	0.08
565	0.09
566	0.12
567	0.14
568	0.15
569	0.16
570	0.17
571	0.15
572	0.18
573	0.2
574	0.18
575	0.15
576	0.15
577	0.13
578	0.14
579	0.13
580	0.1
581	0.07
582	0.06
583	0.06
584	0.05
585	0.04
586	0.03
587	0.03
588	0.03
589	0.04
590	0.07
591	0.07
592	0.07
593	0.07
594	0.08
595	0.08
596	0.08
597	0.11
598	0.1
599	0.14
600	0.17
601	0.18
602	0.18
603	0.19
604	0.22
605	0.23
606	0.25
607	0.25
608	0.31
609	0.31
610	0.33
611	0.36
612	0.34
613	0.32
614	0.3
615	0.32
616	0.24
617	0.25
618	0.24
619	0.21
620	0.23
621	0.21
622	0.2
623	0.14
624	0.15
625	0.15
626	0.15
627	0.17
628	0.13
629	0.13
630	0.13
631	0.13
632	0.12
633	0.11
634	0.1
635	0.07
636	0.07
637	0.08
638	0.1
639	0.13
640	0.13
641	0.14
642	0.15
643	0.16
644	0.2
645	0.21
646	0.22
647	0.21
648	0.2
649	0.22
650	0.23
651	0.24
652	0.21
653	0.21
654	0.17
655	0.17
656	0.19
657	0.17
658	0.17
659	0.16
660	0.15
661	0.14
662	0.17
663	0.16
664	0.13
665	0.17
666	0.15
667	0.15
668	0.15
669	0.15
670	0.11
671	0.12
672	0.13
673	0.09
674	0.09
675	0.08
676	0.08
677	0.08
678	0.08
679	0.06
680	0.05
681	0.05
682	0.06
683	0.06
684	0.06
685	0.07
686	0.06
687	0.06
688	0.06
689	0.06
690	0.06
691	0.07
692	0.06
693	0.08
694	0.08
695	0.09
696	0.1
697	0.13
698	0.13
699	0.13
700	0.15
701	0.16
702	0.19
703	0.22
704	0.21
705	0.18
706	0.2
707	0.2
708	0.17
709	0.15
710	0.11
711	0.08
712	0.08
713	0.09
714	0.11
715	0.11
716	0.13
717	0.12
718	0.12
719	0.16
720	0.23
721	0.23
722	0.22
723	0.23
724	0.21
725	0.23
726	0.25
727	0.23
728	0.17
729	0.16
730	0.15
731	0.17
732	0.18
733	0.17
734	0.15
735	0.13
736	0.13
737	0.13
738	0.12
739	0.09
740	0.08
741	0.11
742	0.13
743	0.13
744	0.13
745	0.19
746	0.21
747	0.29
748	0.3
749	0.26
750	0.27
751	0.28
752	0.28
753	0.25
754	0.22
755	0.21
756	0.27
757	0.36
758	0.41
759	0.47
760	0.51
761	0.56
762	0.58
763	0.55
764	0.48
765	0.44
766	0.39
767	0.36
768	0.34
769	0.31
770	0.3
771	0.31
772	0.32
773	0.28
774	0.29
775	0.27
776	0.24
777	0.27
778	0.32
779	0.33
780	0.34
781	0.38
782	0.41
783	0.44
784	0.5
785	0.49
786	0.48
787	0.45
788	0.45
789	0.44
790	0.38
791	0.33
792	0.26
793	0.22
794	0.17
795	0.17
796	0.14
797	0.13
798	0.16
799	0.16
800	0.23
801	0.22
802	0.23
803	0.27
804	0.32
805	0.33
806	0.31
807	0.31
808	0.24
809	0.25
810	0.24
811	0.18
812	0.12
813	0.1
814	0.07
815	0.08
816	0.08
817	0.08
818	0.08
819	0.11
820	0.12
821	0.13
822	0.19
823	0.2
824	0.21
825	0.22
826	0.23
827	0.25
828	0.24
829	0.27
830	0.24
831	0.23
832	0.22
833	0.2
834	0.19
835	0.16
836	0.2
837	0.16
838	0.15
839	0.14
840	0.14
841	0.16
842	0.17
843	0.19
844	0.15
845	0.17
846	0.19
847	0.2
848	0.3
849	0.3
850	0.36
851	0.36
852	0.4
853	0.39
854	0.38
855	0.37
856	0.3
857	0.28
858	0.24
859	0.21
860	0.17
861	0.16
862	0.15
863	0.14
864	0.12
865	0.11
866	0.08
867	0.08
868	0.07
869	0.07
870	0.07
871	0.07
872	0.07
873	0.07
874	0.07
875	0.07
876	0.08
877	0.07
878	0.08
879	0.08
880	0.09
881	0.16
882	0.23
883	0.28
884	0.34
885	0.39
886	0.48
887	0.57
888	0.58
889	0.56
890	0.52
891	0.49
892	0.44
893	0.5
894	0.51
895	0.49
896	0.51
897	0.52
898	0.51
899	0.5
900	0.52
901	0.44
902	0.36
903	0.32
904	0.33
905	0.28
906	0.28
907	0.32
908	0.32
909	0.33
910	0.38
911	0.41
912	0.42
913	0.41
914	0.43
915	0.47
916	0.46
917	0.5
918	0.51
919	0.5
920	0.47
921	0.47
922	0.44
923	0.39
924	0.42
925	0.35
926	0.38
927	0.35
928	0.34
929	0.38
930	0.45
931	0.5
932	0.51
933	0.53
934	0.5
935	0.51
936	0.53
937	0.49
938	0.46
939	0.43
940	0.44
941	0.51
942	0.49
943	0.47
944	0.46
945	0.52
946	0.57
947	0.58
948	0.54
949	0.53
950	0.52
951	0.61
952	0.64
953	0.6
954	0.53
955	0.46
956	0.45
957	0.4
958	0.38
959	0.33
960	0.31
961	0.29
962	0.28
963	0.32
964	0.33
965	0.32
966	0.3
967	0.29
968	0.34
969	0.4
970	0.46
971	0.47
972	0.53
973	0.59
974	0.62
975	0.68
976	0.68
977	0.67
978	0.7
979	0.73
980	0.73
981	0.75
982	0.8
983	0.75
984	0.75
985	0.75
986	0.73
987	0.71
988	0.68
989	0.63
990	0.56
991	0.51
992	0.48
993	0.43
994	0.38
995	0.33
996	0.27
997	0.23
998	0.24
999	0.3
1000	0.33
1001	0.38
1002	0.4
1003	0.42
1004	0.46
1005	0.54
1006	0.53
1007	0.52
1008	0.55
1009	0.53
1010	0.55
1011	0.58
1012	0.58
1013	0.52
1014	0.51
1015	0.46
1016	0.4
1017	0.42
1018	0.4
1019	0.44

H2ATA3

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer