Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A1E3NJL6

Protein Details
Accession A0A1E3NJL6    Localization Confidence High Confidence Score 23.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
648-668PESKNEKKAPKRFKEYRTILRBasic
899-933GKASAGKNSTPRKKNDKPKKPRKPTKKQLAAQAAAHydrophilic
946-972ATSASEPPKKKRAPAKKKNAANTPVTPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
229-277GKSLPGKKVPGKSVPGKSLPGKSLPGKSLPGKSLPGKSLPGKSLPGKSL
895-925KGKAGKASAGKNSTPRKKNDKPKKPRKPTKK
952-964PPKKKRAPAKKKN
Subcellular Location(s) nucl 25, cyto_nucl 14.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR021950  Spt20  
IPR046468  Spt20-like_SEP  
Gene Ontology GO:0000124  C:SAGA complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF12090  Spt20  
Amino Acid Sequences MSTGGEPNNLGFDQNGQTNGLGSFMDPVNQMGMAQSPNQPSPVDHMGQLNQLNMNPMSQMNSISQGNQMGQMSQLNQMNQINHLAPAGVQMNLNAIGQINNQHQLGQMGQRGHVGQMNQMNNASQMGHMGQASPQQRQQGSEVRGWNPAYVQSLLRKIQPGPGMTKQQRFQQLLRSGELTRTDVQILQRHQQMLRQAQAVRQKQLHQRALQQQQQQQQTSSYSGKSIPGKSLPGKKVPGKSVPGKSLPGKSLPGKSLPGKSLPGKSLPGKSLPGKSLPGKTVSGKTVPGKSLPGTGTPEFSPSLSHASLGGKSLPVNSTSQRTSGTETPMQISTGMSLPVNSPLAANLISASPLNNINSPVNPAVNLSVNQPVNSPVNLPLNQHINQPVNRPVNQPVNEPVNKPVNQSVNQYMSQMSNAASLVQQQAGIPQGNQVNGSVNPSQAHLEQLKQQEHQKKLLQQRQQQKYFNLTAEQYDKLNVQQKQLLKLQYLRRKAKTQRFYESDQELLKKYENSPPSLDFHIHEEHYRFGHNENLIPKNDPAIKDFLTYVAKKKIPDALMEIIKDGNIQLYDGNIILRIYDHRIVDDASLLPPKEPTPVPSSESKDLGAMVPNINPSVPAANDSLENSSNQSPDKINANASTTSTEIPESKNEKKAPKRFKEYRTILRLTQSALYEDFCLTTDTQMFGDSFVLTYESEILTAITRSVNLQPTNNPYLQGRSLWPTSEMVFPHYDEKEDRMIFTHRQDMRELVKSKLNHKKRALTYENYDYKPLHQDGSQSNSKYEKLMLIMGKSSPHSNISASKQSVEVPRFERLRFIENLRHQNLIKKENNLRGVSSIQSPPVGYTSFGSVMGNINNQKSFSFQGKNADNSTMADGEVKSEDNGGNSTSAANSKGKAGKASAGKNSTPRKKNDKPKKPRKPTKKQLAAQAAAQAATEGIPDGTSATSASEPPKKKRAPAKKKNAANTPVTPAN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.21
3 0.19
4 0.18
5 0.19
6 0.19
7 0.16
8 0.12
9 0.1
10 0.12
11 0.11
12 0.13
13 0.12
14 0.13
15 0.13
16 0.13
17 0.13
18 0.1
19 0.12
20 0.12
21 0.14
22 0.19
23 0.22
24 0.24
25 0.26
26 0.26
27 0.24
28 0.3
29 0.33
30 0.29
31 0.27
32 0.29
33 0.29
34 0.35
35 0.35
36 0.3
37 0.26
38 0.25
39 0.27
40 0.24
41 0.22
42 0.18
43 0.17
44 0.18
45 0.17
46 0.19
47 0.16
48 0.2
49 0.2
50 0.2
51 0.22
52 0.2
53 0.2
54 0.22
55 0.2
56 0.16
57 0.17
58 0.19
59 0.18
60 0.21
61 0.24
62 0.21
63 0.25
64 0.28
65 0.28
66 0.27
67 0.29
68 0.24
69 0.21
70 0.21
71 0.16
72 0.13
73 0.16
74 0.15
75 0.12
76 0.12
77 0.11
78 0.13
79 0.14
80 0.14
81 0.1
82 0.09
83 0.09
84 0.11
85 0.16
86 0.17
87 0.19
88 0.19
89 0.19
90 0.2
91 0.2
92 0.22
93 0.22
94 0.23
95 0.21
96 0.22
97 0.24
98 0.24
99 0.24
100 0.24
101 0.19
102 0.21
103 0.27
104 0.28
105 0.27
106 0.27
107 0.26
108 0.24
109 0.24
110 0.19
111 0.11
112 0.11
113 0.1
114 0.11
115 0.11
116 0.1
117 0.11
118 0.17
119 0.2
120 0.22
121 0.25
122 0.3
123 0.31
124 0.32
125 0.36
126 0.39
127 0.4
128 0.42
129 0.45
130 0.4
131 0.45
132 0.43
133 0.38
134 0.3
135 0.29
136 0.26
137 0.22
138 0.23
139 0.22
140 0.28
141 0.29
142 0.31
143 0.32
144 0.29
145 0.34
146 0.36
147 0.34
148 0.34
149 0.39
150 0.47
151 0.5
152 0.56
153 0.54
154 0.56
155 0.62
156 0.6
157 0.56
158 0.55
159 0.57
160 0.53
161 0.52
162 0.47
163 0.39
164 0.38
165 0.38
166 0.32
167 0.25
168 0.24
169 0.22
170 0.22
171 0.26
172 0.29
173 0.3
174 0.32
175 0.35
176 0.37
177 0.36
178 0.37
179 0.4
180 0.4
181 0.4
182 0.39
183 0.36
184 0.38
185 0.47
186 0.48
187 0.46
188 0.44
189 0.47
190 0.51
191 0.6
192 0.63
193 0.57
194 0.6
195 0.64
196 0.69
197 0.69
198 0.68
199 0.64
200 0.64
201 0.67
202 0.61
203 0.52
204 0.46
205 0.41
206 0.38
207 0.34
208 0.27
209 0.22
210 0.21
211 0.25
212 0.28
213 0.28
214 0.27
215 0.28
216 0.32
217 0.37
218 0.46
219 0.45
220 0.46
221 0.51
222 0.53
223 0.57
224 0.57
225 0.57
226 0.55
227 0.59
228 0.59
229 0.58
230 0.54
231 0.53
232 0.51
233 0.49
234 0.45
235 0.4
236 0.38
237 0.37
238 0.39
239 0.36
240 0.35
241 0.35
242 0.37
243 0.38
244 0.36
245 0.35
246 0.35
247 0.37
248 0.38
249 0.36
250 0.35
251 0.35
252 0.37
253 0.38
254 0.36
255 0.35
256 0.35
257 0.37
258 0.38
259 0.36
260 0.35
261 0.35
262 0.37
263 0.38
264 0.35
265 0.34
266 0.32
267 0.33
268 0.33
269 0.31
270 0.29
271 0.29
272 0.31
273 0.32
274 0.3
275 0.29
276 0.27
277 0.25
278 0.27
279 0.24
280 0.23
281 0.24
282 0.23
283 0.24
284 0.22
285 0.23
286 0.19
287 0.18
288 0.16
289 0.12
290 0.17
291 0.14
292 0.14
293 0.14
294 0.15
295 0.15
296 0.15
297 0.14
298 0.1
299 0.1
300 0.12
301 0.11
302 0.11
303 0.13
304 0.14
305 0.18
306 0.18
307 0.19
308 0.19
309 0.2
310 0.23
311 0.24
312 0.27
313 0.25
314 0.25
315 0.26
316 0.25
317 0.24
318 0.19
319 0.16
320 0.12
321 0.1
322 0.1
323 0.08
324 0.07
325 0.08
326 0.1
327 0.1
328 0.09
329 0.08
330 0.08
331 0.09
332 0.09
333 0.08
334 0.06
335 0.06
336 0.06
337 0.06
338 0.06
339 0.07
340 0.08
341 0.09
342 0.1
343 0.12
344 0.12
345 0.13
346 0.16
347 0.15
348 0.14
349 0.13
350 0.12
351 0.12
352 0.12
353 0.12
354 0.11
355 0.16
356 0.16
357 0.16
358 0.16
359 0.17
360 0.17
361 0.17
362 0.16
363 0.13
364 0.18
365 0.19
366 0.2
367 0.2
368 0.23
369 0.24
370 0.25
371 0.26
372 0.25
373 0.25
374 0.28
375 0.33
376 0.33
377 0.34
378 0.34
379 0.35
380 0.39
381 0.39
382 0.37
383 0.33
384 0.36
385 0.36
386 0.35
387 0.34
388 0.33
389 0.32
390 0.32
391 0.33
392 0.3
393 0.3
394 0.33
395 0.32
396 0.29
397 0.29
398 0.28
399 0.24
400 0.19
401 0.18
402 0.15
403 0.11
404 0.08
405 0.08
406 0.07
407 0.06
408 0.07
409 0.08
410 0.07
411 0.07
412 0.06
413 0.07
414 0.09
415 0.09
416 0.08
417 0.1
418 0.11
419 0.11
420 0.12
421 0.11
422 0.11
423 0.11
424 0.15
425 0.12
426 0.11
427 0.11
428 0.12
429 0.13
430 0.11
431 0.14
432 0.11
433 0.12
434 0.17
435 0.22
436 0.23
437 0.24
438 0.31
439 0.35
440 0.37
441 0.41
442 0.4
443 0.42
444 0.5
445 0.55
446 0.56
447 0.56
448 0.64
449 0.68
450 0.71
451 0.67
452 0.59
453 0.58
454 0.52
455 0.45
456 0.37
457 0.28
458 0.23
459 0.22
460 0.21
461 0.15
462 0.14
463 0.13
464 0.14
465 0.21
466 0.2
467 0.19
468 0.23
469 0.24
470 0.28
471 0.31
472 0.3
473 0.24
474 0.29
475 0.36
476 0.39
477 0.47
478 0.49
479 0.49
480 0.55
481 0.63
482 0.66
483 0.67
484 0.65
485 0.64
486 0.62
487 0.62
488 0.59
489 0.52
490 0.45
491 0.37
492 0.33
493 0.26
494 0.23
495 0.21
496 0.16
497 0.17
498 0.2
499 0.21
500 0.22
501 0.23
502 0.23
503 0.25
504 0.25
505 0.24
506 0.18
507 0.2
508 0.19
509 0.18
510 0.18
511 0.16
512 0.16
513 0.16
514 0.16
515 0.13
516 0.12
517 0.16
518 0.15
519 0.17
520 0.2
521 0.23
522 0.23
523 0.24
524 0.23
525 0.22
526 0.25
527 0.22
528 0.2
529 0.2
530 0.19
531 0.18
532 0.18
533 0.17
534 0.18
535 0.19
536 0.2
537 0.23
538 0.25
539 0.24
540 0.26
541 0.29
542 0.26
543 0.26
544 0.27
545 0.25
546 0.25
547 0.24
548 0.23
549 0.17
550 0.16
551 0.15
552 0.11
553 0.07
554 0.05
555 0.05
556 0.05
557 0.05
558 0.05
559 0.06
560 0.06
561 0.05
562 0.05
563 0.04
564 0.05
565 0.06
566 0.09
567 0.12
568 0.12
569 0.12
570 0.13
571 0.13
572 0.13
573 0.13
574 0.1
575 0.09
576 0.11
577 0.11
578 0.1
579 0.1
580 0.11
581 0.13
582 0.13
583 0.14
584 0.17
585 0.19
586 0.21
587 0.26
588 0.31
589 0.3
590 0.31
591 0.28
592 0.24
593 0.22
594 0.2
595 0.16
596 0.13
597 0.11
598 0.11
599 0.11
600 0.11
601 0.1
602 0.09
603 0.08
604 0.08
605 0.07
606 0.08
607 0.09
608 0.09
609 0.1
610 0.11
611 0.12
612 0.12
613 0.12
614 0.13
615 0.13
616 0.14
617 0.14
618 0.15
619 0.14
620 0.15
621 0.19
622 0.18
623 0.19
624 0.19
625 0.21
626 0.2
627 0.2
628 0.2
629 0.16
630 0.15
631 0.14
632 0.14
633 0.12
634 0.12
635 0.18
636 0.23
637 0.27
638 0.34
639 0.39
640 0.46
641 0.55
642 0.64
643 0.68
644 0.71
645 0.77
646 0.78
647 0.8
648 0.82
649 0.8
650 0.8
651 0.77
652 0.71
653 0.62
654 0.57
655 0.51
656 0.42
657 0.37
658 0.28
659 0.22
660 0.19
661 0.18
662 0.15
663 0.14
664 0.13
665 0.1
666 0.11
667 0.1
668 0.1
669 0.1
670 0.1
671 0.1
672 0.11
673 0.1
674 0.09
675 0.1
676 0.08
677 0.07
678 0.07
679 0.07
680 0.06
681 0.07
682 0.07
683 0.06
684 0.06
685 0.06
686 0.07
687 0.06
688 0.06
689 0.07
690 0.06
691 0.06
692 0.08
693 0.12
694 0.17
695 0.18
696 0.2
697 0.23
698 0.3
699 0.34
700 0.33
701 0.3
702 0.26
703 0.28
704 0.28
705 0.26
706 0.22
707 0.22
708 0.22
709 0.22
710 0.22
711 0.2
712 0.2
713 0.22
714 0.2
715 0.18
716 0.18
717 0.19
718 0.22
719 0.21
720 0.22
721 0.19
722 0.22
723 0.26
724 0.24
725 0.24
726 0.22
727 0.25
728 0.27
729 0.29
730 0.35
731 0.32
732 0.33
733 0.34
734 0.35
735 0.36
736 0.41
737 0.41
738 0.34
739 0.37
740 0.38
741 0.47
742 0.53
743 0.57
744 0.58
745 0.62
746 0.69
747 0.69
748 0.76
749 0.73
750 0.69
751 0.67
752 0.67
753 0.68
754 0.6
755 0.56
756 0.47
757 0.43
758 0.44
759 0.38
760 0.3
761 0.24
762 0.28
763 0.3
764 0.36
765 0.4
766 0.34
767 0.35
768 0.36
769 0.35
770 0.31
771 0.28
772 0.22
773 0.18
774 0.22
775 0.21
776 0.2
777 0.21
778 0.2
779 0.21
780 0.21
781 0.21
782 0.17
783 0.18
784 0.18
785 0.19
786 0.23
787 0.27
788 0.34
789 0.33
790 0.32
791 0.31
792 0.34
793 0.39
794 0.36
795 0.35
796 0.31
797 0.37
798 0.39
799 0.39
800 0.4
801 0.36
802 0.39
803 0.37
804 0.4
805 0.42
806 0.47
807 0.56
808 0.52
809 0.54
810 0.49
811 0.53
812 0.55
813 0.55
814 0.51
815 0.5
816 0.56
817 0.6
818 0.66
819 0.6
820 0.54
821 0.47
822 0.45
823 0.39
824 0.35
825 0.29
826 0.24
827 0.23
828 0.22
829 0.2
830 0.2
831 0.19
832 0.15
833 0.13
834 0.15
835 0.15
836 0.16
837 0.15
838 0.13
839 0.15
840 0.16
841 0.2
842 0.2
843 0.22
844 0.23
845 0.23
846 0.23
847 0.23
848 0.25
849 0.27
850 0.29
851 0.29
852 0.37
853 0.41
854 0.46
855 0.45
856 0.43
857 0.37
858 0.34
859 0.34
860 0.25
861 0.2
862 0.18
863 0.15
864 0.15
865 0.16
866 0.15
867 0.12
868 0.14
869 0.14
870 0.14
871 0.15
872 0.14
873 0.13
874 0.12
875 0.13
876 0.12
877 0.13
878 0.15
879 0.16
880 0.15
881 0.21
882 0.26
883 0.27
884 0.29
885 0.29
886 0.33
887 0.39
888 0.45
889 0.46
890 0.47
891 0.48
892 0.55
893 0.63
894 0.66
895 0.67
896 0.69
897 0.71
898 0.76
899 0.84
900 0.87
901 0.87
902 0.89
903 0.92
904 0.95
905 0.96
906 0.97
907 0.97
908 0.97
909 0.97
910 0.97
911 0.96
912 0.91
913 0.9
914 0.89
915 0.8
916 0.71
917 0.65
918 0.54
919 0.43
920 0.37
921 0.26
922 0.16
923 0.14
924 0.11
925 0.07
926 0.05
927 0.05
928 0.05
929 0.07
930 0.07
931 0.07
932 0.07
933 0.08
934 0.1
935 0.12
936 0.19
937 0.27
938 0.34
939 0.42
940 0.52
941 0.55
942 0.63
943 0.71
944 0.76
945 0.79
946 0.83
947 0.86
948 0.86
949 0.9
950 0.91
951 0.9
952 0.86
953 0.82
954 0.76