Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1E3NJL6

Protein Details
Accession A0A1E3NJL6    Localization Confidence High Confidence Score 23.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
648-668PESKNEKKAPKRFKEYRTILRBasic
899-933GKASAGKNSTPRKKNDKPKKPRKPTKKQLAAQAAAHydrophilic
946-972ATSASEPPKKKRAPAKKKNAANTPVTPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
229-277GKSLPGKKVPGKSVPGKSLPGKSLPGKSLPGKSLPGKSLPGKSLPGKSL
895-925KGKAGKASAGKNSTPRKKNDKPKKPRKPTKK
952-964PPKKKRAPAKKKN
Subcellular Location(s) nucl 25, cyto_nucl 14.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR021950  Spt20  
IPR046468  Spt20-like_SEP  
Gene Ontology GO:0000124  C:SAGA complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF12090  Spt20  
Amino Acid Sequences MSTGGEPNNLGFDQNGQTNGLGSFMDPVNQMGMAQSPNQPSPVDHMGQLNQLNMNPMSQMNSISQGNQMGQMSQLNQMNQINHLAPAGVQMNLNAIGQINNQHQLGQMGQRGHVGQMNQMNNASQMGHMGQASPQQRQQGSEVRGWNPAYVQSLLRKIQPGPGMTKQQRFQQLLRSGELTRTDVQILQRHQQMLRQAQAVRQKQLHQRALQQQQQQQQTSSYSGKSIPGKSLPGKKVPGKSVPGKSLPGKSLPGKSLPGKSLPGKSLPGKSLPGKSLPGKTVSGKTVPGKSLPGTGTPEFSPSLSHASLGGKSLPVNSTSQRTSGTETPMQISTGMSLPVNSPLAANLISASPLNNINSPVNPAVNLSVNQPVNSPVNLPLNQHINQPVNRPVNQPVNEPVNKPVNQSVNQYMSQMSNAASLVQQQAGIPQGNQVNGSVNPSQAHLEQLKQQEHQKKLLQQRQQQKYFNLTAEQYDKLNVQQKQLLKLQYLRRKAKTQRFYESDQELLKKYENSPPSLDFHIHEEHYRFGHNENLIPKNDPAIKDFLTYVAKKKIPDALMEIIKDGNIQLYDGNIILRIYDHRIVDDASLLPPKEPTPVPSSESKDLGAMVPNINPSVPAANDSLENSSNQSPDKINANASTTSTEIPESKNEKKAPKRFKEYRTILRLTQSALYEDFCLTTDTQMFGDSFVLTYESEILTAITRSVNLQPTNNPYLQGRSLWPTSEMVFPHYDEKEDRMIFTHRQDMRELVKSKLNHKKRALTYENYDYKPLHQDGSQSNSKYEKLMLIMGKSSPHSNISASKQSVEVPRFERLRFIENLRHQNLIKKENNLRGVSSIQSPPVGYTSFGSVMGNINNQKSFSFQGKNADNSTMADGEVKSEDNGGNSTSAANSKGKAGKASAGKNSTPRKKNDKPKKPRKPTKKQLAAQAAAQAATEGIPDGTSATSASEPPKKKRAPAKKKNAANTPVTPAN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.21
3 0.19
4 0.18
5 0.19
6 0.19
7 0.16
8 0.12
9 0.1
10 0.12
11 0.11
12 0.13
13 0.12
14 0.13
15 0.13
16 0.13
17 0.13
18 0.1
19 0.12
20 0.12
21 0.14
22 0.19
23 0.22
24 0.24
25 0.26
26 0.26
27 0.24
28 0.3
29 0.33
30 0.29
31 0.27
32 0.29
33 0.29
34 0.35
35 0.35
36 0.3
37 0.26
38 0.25
39 0.27
40 0.24
41 0.22
42 0.18
43 0.17
44 0.18
45 0.17
46 0.19
47 0.16
48 0.2
49 0.2
50 0.2
51 0.22
52 0.2
53 0.2
54 0.22
55 0.2
56 0.16
57 0.17
58 0.19
59 0.18
60 0.21
61 0.24
62 0.21
63 0.25
64 0.28
65 0.28
66 0.27
67 0.29
68 0.24
69 0.21
70 0.21
71 0.16
72 0.13
73 0.16
74 0.15
75 0.12
76 0.12
77 0.11
78 0.13
79 0.14
80 0.14
81 0.1
82 0.09
83 0.09
84 0.11
85 0.16
86 0.17
87 0.19
88 0.19
89 0.19
90 0.2
91 0.2
92 0.22
93 0.22
94 0.23
95 0.21
96 0.22
97 0.24
98 0.24
99 0.24
100 0.24
101 0.19
102 0.21
103 0.27
104 0.28
105 0.27
106 0.27
107 0.26
108 0.24
109 0.24
110 0.19
111 0.11
112 0.11
113 0.1
114 0.11
115 0.11
116 0.1
117 0.11
118 0.17
119 0.2
120 0.22
121 0.25
122 0.3
123 0.31
124 0.32
125 0.36
126 0.39
127 0.4
128 0.42
129 0.45
130 0.4
131 0.45
132 0.43
133 0.38
134 0.3
135 0.29
136 0.26
137 0.22
138 0.23
139 0.22
140 0.28
141 0.29
142 0.31
143 0.32
144 0.29
145 0.34
146 0.36
147 0.34
148 0.34
149 0.39
150 0.47
151 0.5
152 0.56
153 0.54
154 0.56
155 0.62
156 0.6
157 0.56
158 0.55
159 0.57
160 0.53
161 0.52
162 0.47
163 0.39
164 0.38
165 0.38
166 0.32
167 0.25
168 0.24
169 0.22
170 0.22
171 0.26
172 0.29
173 0.3
174 0.32
175 0.35
176 0.37
177 0.36
178 0.37
179 0.4
180 0.4
181 0.4
182 0.39
183 0.36
184 0.38
185 0.47
186 0.48
187 0.46
188 0.44
189 0.47
190 0.51
191 0.6
192 0.63
193 0.57
194 0.6
195 0.64
196 0.69
197 0.69
198 0.68
199 0.64
200 0.64
201 0.67
202 0.61
203 0.52
204 0.46
205 0.41
206 0.38
207 0.34
208 0.27
209 0.22
210 0.21
211 0.25
212 0.28
213 0.28
214 0.27
215 0.28
216 0.32
217 0.37
218 0.46
219 0.45
220 0.46
221 0.51
222 0.53
223 0.57
224 0.57
225 0.57
226 0.55
227 0.59
228 0.59
229 0.58
230 0.54
231 0.53
232 0.51
233 0.49
234 0.45
235 0.4
236 0.38
237 0.37
238 0.39
239 0.36
240 0.35
241 0.35
242 0.37
243 0.38
244 0.36
245 0.35
246 0.35
247 0.37
248 0.38
249 0.36
250 0.35
251 0.35
252 0.37
253 0.38
254 0.36
255 0.35
256 0.35
257 0.37
258 0.38
259 0.36
260 0.35
261 0.35
262 0.37
263 0.38
264 0.35
265 0.34
266 0.32
267 0.33
268 0.33
269 0.31
270 0.29
271 0.29
272 0.31
273 0.32
274 0.3
275 0.29
276 0.27
277 0.25
278 0.27
279 0.24
280 0.23
281 0.24
282 0.23
283 0.24
284 0.22
285 0.23
286 0.19
287 0.18
288 0.16
289 0.12
290 0.17
291 0.14
292 0.14
293 0.14
294 0.15
295 0.15
296 0.15
297 0.14
298 0.1
299 0.1
300 0.12
301 0.11
302 0.11
303 0.13
304 0.14
305 0.18
306 0.18
307 0.19
308 0.19
309 0.2
310 0.23
311 0.24
312 0.27
313 0.25
314 0.25
315 0.26
316 0.25
317 0.24
318 0.19
319 0.16
320 0.12
321 0.1
322 0.1
323 0.08
324 0.07
325 0.08
326 0.1
327 0.1
328 0.09
329 0.08
330 0.08
331 0.09
332 0.09
333 0.08
334 0.06
335 0.06
336 0.06
337 0.06
338 0.06
339 0.07
340 0.08
341 0.09
342 0.1
343 0.12
344 0.12
345 0.13
346 0.16
347 0.15
348 0.14
349 0.13
350 0.12
351 0.12
352 0.12
353 0.12
354 0.11
355 0.16
356 0.16
357 0.16
358 0.16
359 0.17
360 0.17
361 0.17
362 0.16
363 0.13
364 0.18
365 0.19
366 0.2
367 0.2
368 0.23
369 0.24
370 0.25
371 0.26
372 0.25
373 0.25
374 0.28
375 0.33
376 0.33
377 0.34
378 0.34
379 0.35
380 0.39
381 0.39
382 0.37
383 0.33
384 0.36
385 0.36
386 0.35
387 0.34
388 0.33
389 0.32
390 0.32
391 0.33
392 0.3
393 0.3
394 0.33
395 0.32
396 0.29
397 0.29
398 0.28
399 0.24
400 0.19
401 0.18
402 0.15
403 0.11
404 0.08
405 0.08
406 0.07
407 0.06
408 0.07
409 0.08
410 0.07
411 0.07
412 0.06
413 0.07
414 0.09
415 0.09
416 0.08
417 0.1
418 0.11
419 0.11
420 0.12
421 0.11
422 0.11
423 0.11
424 0.15
425 0.12
426 0.11
427 0.11
428 0.12
429 0.13
430 0.11
431 0.14
432 0.11
433 0.12
434 0.17
435 0.22
436 0.23
437 0.24
438 0.31
439 0.35
440 0.37
441 0.41
442 0.4
443 0.42
444 0.5
445 0.55
446 0.56
447 0.56
448 0.64
449 0.68
450 0.71
451 0.67
452 0.59
453 0.58
454 0.52
455 0.45
456 0.37
457 0.28
458 0.23
459 0.22
460 0.21
461 0.15
462 0.14
463 0.13
464 0.14
465 0.21
466 0.2
467 0.19
468 0.23
469 0.24
470 0.28
471 0.31
472 0.3
473 0.24
474 0.29
475 0.36
476 0.39
477 0.47
478 0.49
479 0.49
480 0.55
481 0.63
482 0.66
483 0.67
484 0.65
485 0.64
486 0.62
487 0.62
488 0.59
489 0.52
490 0.45
491 0.37
492 0.33
493 0.26
494 0.23
495 0.21
496 0.16
497 0.17
498 0.2
499 0.21
500 0.22
501 0.23
502 0.23
503 0.25
504 0.25
505 0.24
506 0.18
507 0.2
508 0.19
509 0.18
510 0.18
511 0.16
512 0.16
513 0.16
514 0.16
515 0.13
516 0.12
517 0.16
518 0.15
519 0.17
520 0.2
521 0.23
522 0.23
523 0.24
524 0.23
525 0.22
526 0.25
527 0.22
528 0.2
529 0.2
530 0.19
531 0.18
532 0.18
533 0.17
534 0.18
535 0.19
536 0.2
537 0.23
538 0.25
539 0.24
540 0.26
541 0.29
542 0.26
543 0.26
544 0.27
545 0.25
546 0.25
547 0.24
548 0.23
549 0.17
550 0.16
551 0.15
552 0.11
553 0.07
554 0.05
555 0.05
556 0.05
557 0.05
558 0.05
559 0.06
560 0.06
561 0.05
562 0.05
563 0.04
564 0.05
565 0.06
566 0.09
567 0.12
568 0.12
569 0.12
570 0.13
571 0.13
572 0.13
573 0.13
574 0.1
575 0.09
576 0.11
577 0.11
578 0.1
579 0.1
580 0.11
581 0.13
582 0.13
583 0.14
584 0.17
585 0.19
586 0.21
587 0.26
588 0.31
589 0.3
590 0.31
591 0.28
592 0.24
593 0.22
594 0.2
595 0.16
596 0.13
597 0.11
598 0.11
599 0.11
600 0.11
601 0.1
602 0.09
603 0.08
604 0.08
605 0.07
606 0.08
607 0.09
608 0.09
609 0.1
610 0.11
611 0.12
612 0.12
613 0.12
614 0.13
615 0.13
616 0.14
617 0.14
618 0.15
619 0.14
620 0.15
621 0.19
622 0.18
623 0.19
624 0.19
625 0.21
626 0.2
627 0.2
628 0.2
629 0.16
630 0.15
631 0.14
632 0.14
633 0.12
634 0.12
635 0.18
636 0.23
637 0.27
638 0.34
639 0.39
640 0.46
641 0.55
642 0.64
643 0.68
644 0.71
645 0.77
646 0.78
647 0.8
648 0.82
649 0.8
650 0.8
651 0.77
652 0.71
653 0.62
654 0.57
655 0.51
656 0.42
657 0.37
658 0.28
659 0.22
660 0.19
661 0.18
662 0.15
663 0.14
664 0.13
665 0.1
666 0.11
667 0.1
668 0.1
669 0.1
670 0.1
671 0.1
672 0.11
673 0.1
674 0.09
675 0.1
676 0.08
677 0.07
678 0.07
679 0.07
680 0.06
681 0.07
682 0.07
683 0.06
684 0.06
685 0.06
686 0.07
687 0.06
688 0.06
689 0.07
690 0.06
691 0.06
692 0.08
693 0.12
694 0.17
695 0.18
696 0.2
697 0.23
698 0.3
699 0.34
700 0.33
701 0.3
702 0.26
703 0.28
704 0.28
705 0.26
706 0.22
707 0.22
708 0.22
709 0.22
710 0.22
711 0.2
712 0.2
713 0.22
714 0.2
715 0.18
716 0.18
717 0.19
718 0.22
719 0.21
720 0.22
721 0.19
722 0.22
723 0.26
724 0.24
725 0.24
726 0.22
727 0.25
728 0.27
729 0.29
730 0.35
731 0.32
732 0.33
733 0.34
734 0.35
735 0.36
736 0.41
737 0.41
738 0.34
739 0.37
740 0.38
741 0.47
742 0.53
743 0.57
744 0.58
745 0.62
746 0.69
747 0.69
748 0.76
749 0.73
750 0.69
751 0.67
752 0.67
753 0.68
754 0.6
755 0.56
756 0.47
757 0.43
758 0.44
759 0.38
760 0.3
761 0.24
762 0.28
763 0.3
764 0.36
765 0.4
766 0.34
767 0.35
768 0.36
769 0.35
770 0.31
771 0.28
772 0.22
773 0.18
774 0.22
775 0.21
776 0.2
777 0.21
778 0.2
779 0.21
780 0.21
781 0.21
782 0.17
783 0.18
784 0.18
785 0.19
786 0.23
787 0.27
788 0.34
789 0.33
790 0.32
791 0.31
792 0.34
793 0.39
794 0.36
795 0.35
796 0.31
797 0.37
798 0.39
799 0.39
800 0.4
801 0.36
802 0.39
803 0.37
804 0.4
805 0.42
806 0.47
807 0.56
808 0.52
809 0.54
810 0.49
811 0.53
812 0.55
813 0.55
814 0.51
815 0.5
816 0.56
817 0.6
818 0.66
819 0.6
820 0.54
821 0.47
822 0.45
823 0.39
824 0.35
825 0.29
826 0.24
827 0.23
828 0.22
829 0.2
830 0.2
831 0.19
832 0.15
833 0.13
834 0.15
835 0.15
836 0.16
837 0.15
838 0.13
839 0.15
840 0.16
841 0.2
842 0.2
843 0.22
844 0.23
845 0.23
846 0.23
847 0.23
848 0.25
849 0.27
850 0.29
851 0.29
852 0.37
853 0.41
854 0.46
855 0.45
856 0.43
857 0.37
858 0.34
859 0.34
860 0.25
861 0.2
862 0.18
863 0.15
864 0.15
865 0.16
866 0.15
867 0.12
868 0.14
869 0.14
870 0.14
871 0.15
872 0.14
873 0.13
874 0.12
875 0.13
876 0.12
877 0.13
878 0.15
879 0.16
880 0.15
881 0.21
882 0.26
883 0.27
884 0.29
885 0.29
886 0.33
887 0.39
888 0.45
889 0.46
890 0.47
891 0.48
892 0.55
893 0.63
894 0.66
895 0.67
896 0.69
897 0.71
898 0.76
899 0.84
900 0.87
901 0.87
902 0.89
903 0.92
904 0.95
905 0.96
906 0.97
907 0.97
908 0.97
909 0.97
910 0.97
911 0.96
912 0.91
913 0.9
914 0.89
915 0.8
916 0.71
917 0.65
918 0.54
919 0.43
920 0.37
921 0.26
922 0.16
923 0.14
924 0.11
925 0.07
926 0.05
927 0.05
928 0.05
929 0.07
930 0.07
931 0.07
932 0.07
933 0.08
934 0.1
935 0.12
936 0.19
937 0.27
938 0.34
939 0.42
940 0.52
941 0.55
942 0.63
943 0.71
944 0.76
945 0.79
946 0.83
947 0.86
948 0.86
949 0.9
950 0.91
951 0.9
952 0.86
953 0.82
954 0.76