Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1E3NIV2

Protein Details
Accession A0A1E3NIV2    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
402-425TKAANKSHPPPTKQKPSNRSSSTKHydrophilic
437-462QDLFYSNHKTKRPRTHPNMSSKNTYIHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto_nucl 14.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR042326  Ctk3  
IPR024637  Ctk3_C  
IPR024638  Ctk3_N  
Gene Ontology GO:0070692  C:CTDK-1 complex  
GO:0032786  P:positive regulation of DNA-templated transcription, elongation  
Pfam View protein in Pfam  
PF12243  CTK3  
PF12350  CTK3_C  
Amino Acid Sequences MDSFELQMQLTGLLMGLNSSKQASFEICNFLIRNYVTQEDLYPALLDVLPKLDINKRLNFFQFIDDFLTLVTTEPKYKDNDIIFNYAFLIISDLHKILQYVLPETPSNVTDSSIAGAEAGVPKRSDIRTLANLPFCYSMLVHISKLFNLQVLAQFQKKYNSNLLTETDIDNVKRGLYFDEKSMYMENVEPTKSSHVDDYVNSSPKATDDSHQQQLEDNYIPEKINQGLIAAWDFIIKKRKQSEYEFLLIDYLDDPFHIKPMESTSKIPNSGANINNTSSPTIFNTSVKNTEDGATAKTPAKTPGKTPAKTPGNVSSQTPSNSNILSLTQSLILQRIEADRERQKRGKETLWEVERPSGTIKLAEFEYIYDTLQPYDEVGDKPIIDEMENLYELCTFREAGITKAANKSHPPPTKQKPSNRSSSTKAKSRGKTAYDSQDLFYSNHKTKRPRTHPNMSSKNTYIPNSNSNEYMDSRLYDGYYDYDSEWYYKNGRQSNSKRGGYGYERKR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.05
2 0.06
3 0.06
4 0.07
5 0.08
6 0.09
7 0.1
8 0.1
9 0.12
10 0.15
11 0.17
12 0.2
13 0.26
14 0.25
15 0.29
16 0.29
17 0.27
18 0.29
19 0.27
20 0.27
21 0.24
22 0.25
23 0.22
24 0.23
25 0.23
26 0.21
27 0.21
28 0.18
29 0.15
30 0.13
31 0.13
32 0.12
33 0.12
34 0.09
35 0.1
36 0.11
37 0.11
38 0.14
39 0.18
40 0.26
41 0.31
42 0.39
43 0.4
44 0.44
45 0.47
46 0.48
47 0.44
48 0.41
49 0.37
50 0.31
51 0.32
52 0.26
53 0.23
54 0.19
55 0.18
56 0.12
57 0.12
58 0.13
59 0.11
60 0.15
61 0.17
62 0.2
63 0.23
64 0.26
65 0.32
66 0.32
67 0.38
68 0.38
69 0.42
70 0.39
71 0.35
72 0.33
73 0.26
74 0.22
75 0.15
76 0.14
77 0.08
78 0.1
79 0.11
80 0.11
81 0.11
82 0.11
83 0.12
84 0.12
85 0.13
86 0.13
87 0.14
88 0.15
89 0.17
90 0.17
91 0.18
92 0.18
93 0.16
94 0.17
95 0.15
96 0.14
97 0.13
98 0.13
99 0.12
100 0.11
101 0.1
102 0.07
103 0.07
104 0.07
105 0.11
106 0.12
107 0.13
108 0.12
109 0.13
110 0.18
111 0.19
112 0.21
113 0.2
114 0.24
115 0.29
116 0.35
117 0.39
118 0.39
119 0.39
120 0.37
121 0.35
122 0.29
123 0.24
124 0.18
125 0.15
126 0.15
127 0.16
128 0.15
129 0.17
130 0.17
131 0.17
132 0.18
133 0.17
134 0.13
135 0.12
136 0.13
137 0.12
138 0.15
139 0.17
140 0.18
141 0.2
142 0.21
143 0.27
144 0.28
145 0.29
146 0.34
147 0.34
148 0.33
149 0.34
150 0.34
151 0.3
152 0.29
153 0.26
154 0.21
155 0.19
156 0.17
157 0.16
158 0.14
159 0.12
160 0.11
161 0.1
162 0.12
163 0.15
164 0.16
165 0.16
166 0.19
167 0.19
168 0.2
169 0.2
170 0.17
171 0.13
172 0.14
173 0.14
174 0.13
175 0.13
176 0.12
177 0.13
178 0.16
179 0.16
180 0.15
181 0.14
182 0.14
183 0.15
184 0.15
185 0.21
186 0.22
187 0.24
188 0.23
189 0.23
190 0.21
191 0.19
192 0.23
193 0.17
194 0.14
195 0.2
196 0.25
197 0.31
198 0.31
199 0.31
200 0.3
201 0.29
202 0.31
203 0.23
204 0.18
205 0.12
206 0.13
207 0.13
208 0.11
209 0.12
210 0.1
211 0.1
212 0.09
213 0.09
214 0.07
215 0.08
216 0.08
217 0.06
218 0.06
219 0.06
220 0.07
221 0.09
222 0.18
223 0.18
224 0.23
225 0.29
226 0.34
227 0.38
228 0.43
229 0.48
230 0.44
231 0.46
232 0.41
233 0.35
234 0.3
235 0.25
236 0.19
237 0.12
238 0.08
239 0.04
240 0.04
241 0.06
242 0.05
243 0.07
244 0.07
245 0.06
246 0.07
247 0.12
248 0.18
249 0.18
250 0.2
251 0.24
252 0.26
253 0.27
254 0.27
255 0.23
256 0.21
257 0.24
258 0.24
259 0.23
260 0.21
261 0.21
262 0.22
263 0.21
264 0.19
265 0.14
266 0.13
267 0.11
268 0.13
269 0.14
270 0.14
271 0.16
272 0.17
273 0.2
274 0.2
275 0.2
276 0.17
277 0.17
278 0.18
279 0.16
280 0.16
281 0.14
282 0.15
283 0.16
284 0.16
285 0.16
286 0.21
287 0.25
288 0.24
289 0.26
290 0.34
291 0.41
292 0.41
293 0.42
294 0.46
295 0.46
296 0.47
297 0.48
298 0.44
299 0.4
300 0.4
301 0.39
302 0.32
303 0.29
304 0.29
305 0.27
306 0.22
307 0.19
308 0.18
309 0.17
310 0.14
311 0.12
312 0.12
313 0.11
314 0.1
315 0.08
316 0.09
317 0.09
318 0.11
319 0.1
320 0.08
321 0.09
322 0.1
323 0.12
324 0.13
325 0.19
326 0.26
327 0.31
328 0.39
329 0.43
330 0.46
331 0.5
332 0.55
333 0.55
334 0.53
335 0.54
336 0.56
337 0.56
338 0.54
339 0.48
340 0.47
341 0.4
342 0.34
343 0.3
344 0.22
345 0.18
346 0.17
347 0.16
348 0.13
349 0.14
350 0.13
351 0.11
352 0.1
353 0.13
354 0.11
355 0.11
356 0.1
357 0.1
358 0.1
359 0.1
360 0.1
361 0.07
362 0.09
363 0.11
364 0.1
365 0.12
366 0.13
367 0.13
368 0.13
369 0.14
370 0.13
371 0.11
372 0.11
373 0.11
374 0.12
375 0.13
376 0.12
377 0.11
378 0.12
379 0.12
380 0.12
381 0.11
382 0.09
383 0.09
384 0.14
385 0.15
386 0.15
387 0.21
388 0.22
389 0.24
390 0.29
391 0.31
392 0.29
393 0.33
394 0.37
395 0.41
396 0.47
397 0.5
398 0.55
399 0.63
400 0.71
401 0.76
402 0.8
403 0.8
404 0.79
405 0.83
406 0.8
407 0.76
408 0.72
409 0.74
410 0.71
411 0.7
412 0.73
413 0.72
414 0.7
415 0.73
416 0.74
417 0.68
418 0.67
419 0.66
420 0.65
421 0.62
422 0.58
423 0.51
424 0.45
425 0.43
426 0.37
427 0.35
428 0.33
429 0.33
430 0.39
431 0.44
432 0.5
433 0.58
434 0.69
435 0.74
436 0.78
437 0.8
438 0.84
439 0.87
440 0.89
441 0.89
442 0.83
443 0.81
444 0.72
445 0.69
446 0.64
447 0.57
448 0.53
449 0.47
450 0.49
451 0.48
452 0.47
453 0.42
454 0.39
455 0.4
456 0.35
457 0.35
458 0.28
459 0.24
460 0.23
461 0.22
462 0.21
463 0.18
464 0.17
465 0.15
466 0.15
467 0.16
468 0.15
469 0.16
470 0.16
471 0.18
472 0.19
473 0.2
474 0.23
475 0.25
476 0.33
477 0.38
478 0.42
479 0.51
480 0.57
481 0.65
482 0.7
483 0.7
484 0.63
485 0.58
486 0.61
487 0.59