Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1E3NJK2

Protein Details
Accession A0A1E3NJK2    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
173-193NRNLSPTRGDRKRIKISLKKKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
180-193RGDRKRIKISLKKK
Subcellular Location(s) mito 16.5, mito_nucl 14, nucl 10.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013957  SNRNP27  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
Pfam View protein in Pfam  
PF08648  SNRNP27  
Amino Acid Sequences MARRIALNLGQRTALANGGRGSFGNRGRGQGKGVGRKTDTEDTNEAVGNIPTSSEETQGKKSQATSKIREEKITIVDVPADDLAKTDVDLESHQTAGQDASEEPSRGRKRAREPEGEEDEKVEVVDSDMMRLMGFESFDTTKNKHVKGVDCFGISFKQKTEYRQYMNREGGFNRNLSPTRGDRKRIKISLKKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.26
2 0.18
3 0.17
4 0.17
5 0.18
6 0.18
7 0.17
8 0.19
9 0.21
10 0.24
11 0.29
12 0.29
13 0.33
14 0.34
15 0.35
16 0.34
17 0.35
18 0.39
19 0.4
20 0.43
21 0.44
22 0.44
23 0.45
24 0.49
25 0.49
26 0.43
27 0.39
28 0.37
29 0.33
30 0.33
31 0.3
32 0.24
33 0.18
34 0.16
35 0.12
36 0.09
37 0.07
38 0.07
39 0.1
40 0.1
41 0.12
42 0.16
43 0.18
44 0.23
45 0.27
46 0.28
47 0.26
48 0.29
49 0.33
50 0.39
51 0.43
52 0.44
53 0.49
54 0.57
55 0.57
56 0.56
57 0.5
58 0.44
59 0.39
60 0.35
61 0.26
62 0.17
63 0.16
64 0.14
65 0.13
66 0.11
67 0.08
68 0.06
69 0.06
70 0.06
71 0.05
72 0.06
73 0.05
74 0.05
75 0.06
76 0.06
77 0.08
78 0.08
79 0.08
80 0.09
81 0.08
82 0.08
83 0.07
84 0.07
85 0.05
86 0.05
87 0.07
88 0.08
89 0.08
90 0.08
91 0.17
92 0.19
93 0.22
94 0.25
95 0.3
96 0.38
97 0.49
98 0.55
99 0.55
100 0.58
101 0.63
102 0.67
103 0.63
104 0.53
105 0.44
106 0.37
107 0.28
108 0.23
109 0.14
110 0.07
111 0.06
112 0.08
113 0.07
114 0.07
115 0.08
116 0.08
117 0.08
118 0.08
119 0.07
120 0.05
121 0.06
122 0.05
123 0.08
124 0.09
125 0.12
126 0.15
127 0.16
128 0.24
129 0.3
130 0.31
131 0.32
132 0.36
133 0.4
134 0.43
135 0.47
136 0.43
137 0.37
138 0.37
139 0.33
140 0.34
141 0.3
142 0.25
143 0.21
144 0.26
145 0.28
146 0.33
147 0.42
148 0.45
149 0.49
150 0.56
151 0.62
152 0.62
153 0.67
154 0.64
155 0.57
156 0.52
157 0.52
158 0.47
159 0.42
160 0.35
161 0.35
162 0.33
163 0.33
164 0.36
165 0.36
166 0.44
167 0.5
168 0.56
169 0.59
170 0.67
171 0.75
172 0.77
173 0.81