Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H2AVP4

Protein Details
Accession H2AVP4    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
80-111VEKLNRSHKNWNNSIKKHKKLAKQHYDGFNKNHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 13, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR024964  CTLH/CRA  
IPR006595  CTLH_C  
IPR045098  Fyv10_fam  
IPR037683  Rmd5_dRing  
IPR044063  ZF_RING_GID  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0061630  F:ubiquitin protein ligase activity  
GO:0045721  P:negative regulation of gluconeogenesis  
GO:0043161  P:proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process  
KEGG kaf:KAFR_0E02920  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF10607  CTLH  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50897  CTLH  
PS51867  ZF_RING_GID  
CDD cd16652  dRING_Rmd5p-like  
Amino Acid Sequences MSKLLETLDSEFNKLYSSDASEETPLKLYLKETHEFKVHLKKLKAHLNKHIEESELQIKGNGDVDKLNSNRMDKKHALIVEKLNRSHKNWNNSIKKHKKLAKQHYDGFNKNALVKLKKFDIDDVYVNKLPENSQKYINQAIGLHIARYNISMLPVQEKSDVLKYLQDVYGLDKRIAEHFIIMGQIVESLKSGKLDSCPEWCNMQKEKSASKSPTISILEYEIYVLKGLQMIKENSVLDVCKYLITAIPANTLNEKEIKNGKHVAELLTRLMLGEKIENIDELIKEKTDLCIKLFTDEYCLKNQLPFDSPLFLIVLSGLISFQFFIKYNQIRAYSHVGWTTQDELPFDVSLPEFLSRFHPIFICPVLKEETTRDNPPYSLACHHVISKKALDRLSKNGSLSFKCPYCPVHTSMAKTKKVKFIMV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.22
2 0.2
3 0.14
4 0.17
5 0.18
6 0.19
7 0.21
8 0.24
9 0.25
10 0.25
11 0.25
12 0.22
13 0.21
14 0.2
15 0.21
16 0.25
17 0.29
18 0.34
19 0.35
20 0.38
21 0.42
22 0.43
23 0.46
24 0.49
25 0.51
26 0.54
27 0.55
28 0.58
29 0.63
30 0.71
31 0.74
32 0.7
33 0.74
34 0.74
35 0.72
36 0.7
37 0.63
38 0.55
39 0.46
40 0.44
41 0.4
42 0.32
43 0.29
44 0.25
45 0.24
46 0.23
47 0.27
48 0.22
49 0.16
50 0.16
51 0.18
52 0.24
53 0.24
54 0.28
55 0.27
56 0.31
57 0.38
58 0.39
59 0.45
60 0.4
61 0.43
62 0.45
63 0.45
64 0.44
65 0.41
66 0.48
67 0.48
68 0.52
69 0.53
70 0.54
71 0.55
72 0.56
73 0.61
74 0.59
75 0.6
76 0.63
77 0.69
78 0.71
79 0.75
80 0.82
81 0.81
82 0.81
83 0.82
84 0.81
85 0.8
86 0.8
87 0.84
88 0.83
89 0.81
90 0.82
91 0.82
92 0.82
93 0.75
94 0.68
95 0.61
96 0.52
97 0.45
98 0.41
99 0.37
100 0.34
101 0.33
102 0.33
103 0.33
104 0.34
105 0.34
106 0.33
107 0.32
108 0.29
109 0.31
110 0.3
111 0.32
112 0.31
113 0.3
114 0.27
115 0.24
116 0.22
117 0.26
118 0.29
119 0.26
120 0.29
121 0.31
122 0.34
123 0.36
124 0.35
125 0.29
126 0.23
127 0.22
128 0.23
129 0.21
130 0.18
131 0.15
132 0.15
133 0.13
134 0.13
135 0.13
136 0.08
137 0.09
138 0.1
139 0.09
140 0.13
141 0.14
142 0.14
143 0.14
144 0.14
145 0.15
146 0.16
147 0.17
148 0.13
149 0.14
150 0.14
151 0.16
152 0.16
153 0.15
154 0.12
155 0.16
156 0.2
157 0.19
158 0.18
159 0.16
160 0.16
161 0.18
162 0.19
163 0.14
164 0.1
165 0.09
166 0.09
167 0.09
168 0.08
169 0.06
170 0.04
171 0.05
172 0.05
173 0.05
174 0.04
175 0.05
176 0.06
177 0.06
178 0.07
179 0.07
180 0.09
181 0.13
182 0.14
183 0.17
184 0.19
185 0.19
186 0.23
187 0.24
188 0.27
189 0.28
190 0.29
191 0.28
192 0.29
193 0.32
194 0.34
195 0.38
196 0.34
197 0.34
198 0.33
199 0.3
200 0.32
201 0.29
202 0.25
203 0.19
204 0.18
205 0.15
206 0.13
207 0.13
208 0.08
209 0.06
210 0.06
211 0.06
212 0.04
213 0.06
214 0.07
215 0.08
216 0.11
217 0.12
218 0.13
219 0.16
220 0.15
221 0.13
222 0.14
223 0.13
224 0.09
225 0.1
226 0.09
227 0.07
228 0.07
229 0.07
230 0.07
231 0.08
232 0.1
233 0.09
234 0.12
235 0.12
236 0.13
237 0.14
238 0.14
239 0.13
240 0.15
241 0.15
242 0.16
243 0.22
244 0.22
245 0.25
246 0.3
247 0.29
248 0.28
249 0.29
250 0.28
251 0.24
252 0.24
253 0.21
254 0.16
255 0.16
256 0.12
257 0.12
258 0.1
259 0.07
260 0.07
261 0.07
262 0.08
263 0.08
264 0.08
265 0.08
266 0.09
267 0.08
268 0.09
269 0.1
270 0.09
271 0.1
272 0.1
273 0.12
274 0.16
275 0.17
276 0.17
277 0.21
278 0.21
279 0.23
280 0.24
281 0.21
282 0.22
283 0.26
284 0.26
285 0.25
286 0.27
287 0.25
288 0.26
289 0.28
290 0.24
291 0.23
292 0.24
293 0.22
294 0.22
295 0.22
296 0.2
297 0.19
298 0.15
299 0.12
300 0.09
301 0.07
302 0.05
303 0.05
304 0.04
305 0.04
306 0.04
307 0.05
308 0.05
309 0.07
310 0.08
311 0.1
312 0.19
313 0.22
314 0.25
315 0.3
316 0.33
317 0.32
318 0.35
319 0.41
320 0.34
321 0.33
322 0.32
323 0.28
324 0.26
325 0.27
326 0.28
327 0.21
328 0.21
329 0.19
330 0.18
331 0.2
332 0.18
333 0.16
334 0.13
335 0.11
336 0.11
337 0.12
338 0.12
339 0.1
340 0.11
341 0.15
342 0.18
343 0.19
344 0.2
345 0.19
346 0.19
347 0.23
348 0.26
349 0.25
350 0.21
351 0.23
352 0.25
353 0.25
354 0.26
355 0.26
356 0.31
357 0.34
358 0.38
359 0.39
360 0.37
361 0.37
362 0.38
363 0.37
364 0.31
365 0.3
366 0.3
367 0.29
368 0.28
369 0.34
370 0.35
371 0.37
372 0.38
373 0.41
374 0.42
375 0.45
376 0.48
377 0.5
378 0.5
379 0.54
380 0.58
381 0.55
382 0.51
383 0.51
384 0.52
385 0.48
386 0.47
387 0.46
388 0.4
389 0.37
390 0.39
391 0.38
392 0.39
393 0.4
394 0.4
395 0.42
396 0.46
397 0.51
398 0.57
399 0.63
400 0.64
401 0.66
402 0.69
403 0.69