Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4QVV3

Protein Details
Accession C4QVV3    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
284-315ADPRLGKWKVKSYRKPKPKPKPLQVLQKQLYEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
287-305RLGKWKVKSYRKPKPKPKP
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 12.333, cyto 8, cyto_mito 5.333
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR016024  ARM-type_fold  
IPR010301  RRP1  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0030688  C:preribosome, small subunit precursor  
GO:0006364  P:rRNA processing  
KEGG ppa:PAS_chr1-1_0022  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF05997  Nop52  
Amino Acid Sequences MSTSAFIKQLATHDKPTRDDALEKLGSFLKHSKVLPELQYQKLWKGLFYAMWHCDKPIPQQHLALQLGELYYNIPETKFIPFFRAFWVVITREWKDLDKWRVDKFLMLIRKILNKSLAKLKSEDYDRDLLEKYIQVLSEYPLHINDIIVPRTITYHLCDIYTDELEKVMFSGLPGFEEEEDYEEEDEVSAPIEKKTRDTDNSDDEASDTDPETSDEEDEGENTENESEEEPIKLSAEEETALWKTKMEIIHETPIDKLLSPFVSLKKDTSNKPLKLKIQEAVLADPRLGKWKVKSYRKPKPKPKPLQVLQKQLYEQIKYKKGKAVTGEDDDELKDEDEDDDDEVISESEADNSDEEEDEEWNGFGTI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.51
2 0.53
3 0.56
4 0.54
5 0.49
6 0.47
7 0.41
8 0.42
9 0.4
10 0.37
11 0.34
12 0.32
13 0.29
14 0.3
15 0.32
16 0.28
17 0.3
18 0.31
19 0.32
20 0.33
21 0.38
22 0.39
23 0.44
24 0.46
25 0.45
26 0.5
27 0.49
28 0.47
29 0.47
30 0.43
31 0.34
32 0.3
33 0.28
34 0.25
35 0.27
36 0.31
37 0.29
38 0.34
39 0.33
40 0.31
41 0.33
42 0.32
43 0.38
44 0.41
45 0.43
46 0.41
47 0.44
48 0.46
49 0.5
50 0.49
51 0.39
52 0.3
53 0.25
54 0.22
55 0.18
56 0.15
57 0.07
58 0.07
59 0.08
60 0.08
61 0.07
62 0.08
63 0.1
64 0.15
65 0.18
66 0.18
67 0.23
68 0.24
69 0.25
70 0.28
71 0.31
72 0.26
73 0.24
74 0.28
75 0.23
76 0.24
77 0.29
78 0.26
79 0.24
80 0.25
81 0.25
82 0.26
83 0.33
84 0.37
85 0.41
86 0.44
87 0.44
88 0.47
89 0.46
90 0.43
91 0.36
92 0.36
93 0.34
94 0.3
95 0.3
96 0.28
97 0.35
98 0.34
99 0.34
100 0.35
101 0.3
102 0.32
103 0.39
104 0.4
105 0.35
106 0.36
107 0.35
108 0.34
109 0.36
110 0.35
111 0.3
112 0.3
113 0.28
114 0.28
115 0.27
116 0.22
117 0.19
118 0.18
119 0.15
120 0.13
121 0.13
122 0.11
123 0.11
124 0.12
125 0.14
126 0.14
127 0.12
128 0.11
129 0.12
130 0.12
131 0.11
132 0.13
133 0.13
134 0.13
135 0.13
136 0.13
137 0.12
138 0.13
139 0.14
140 0.12
141 0.1
142 0.12
143 0.12
144 0.12
145 0.12
146 0.12
147 0.13
148 0.13
149 0.12
150 0.09
151 0.09
152 0.08
153 0.08
154 0.07
155 0.05
156 0.04
157 0.04
158 0.05
159 0.05
160 0.06
161 0.06
162 0.06
163 0.06
164 0.07
165 0.07
166 0.07
167 0.07
168 0.07
169 0.07
170 0.07
171 0.07
172 0.06
173 0.06
174 0.04
175 0.04
176 0.05
177 0.05
178 0.07
179 0.1
180 0.1
181 0.12
182 0.16
183 0.21
184 0.23
185 0.28
186 0.31
187 0.34
188 0.36
189 0.34
190 0.3
191 0.25
192 0.22
193 0.17
194 0.14
195 0.09
196 0.07
197 0.07
198 0.07
199 0.08
200 0.08
201 0.08
202 0.07
203 0.08
204 0.07
205 0.07
206 0.08
207 0.08
208 0.07
209 0.07
210 0.07
211 0.07
212 0.07
213 0.08
214 0.08
215 0.07
216 0.08
217 0.08
218 0.08
219 0.08
220 0.08
221 0.07
222 0.07
223 0.07
224 0.07
225 0.06
226 0.09
227 0.1
228 0.11
229 0.11
230 0.11
231 0.11
232 0.14
233 0.16
234 0.17
235 0.21
236 0.23
237 0.28
238 0.29
239 0.29
240 0.25
241 0.25
242 0.23
243 0.18
244 0.15
245 0.12
246 0.12
247 0.13
248 0.16
249 0.17
250 0.21
251 0.22
252 0.23
253 0.29
254 0.34
255 0.36
256 0.43
257 0.49
258 0.51
259 0.57
260 0.63
261 0.62
262 0.63
263 0.63
264 0.56
265 0.49
266 0.47
267 0.41
268 0.38
269 0.35
270 0.29
271 0.25
272 0.23
273 0.21
274 0.24
275 0.24
276 0.23
277 0.25
278 0.35
279 0.45
280 0.54
281 0.64
282 0.68
283 0.78
284 0.85
285 0.91
286 0.92
287 0.93
288 0.94
289 0.95
290 0.94
291 0.94
292 0.92
293 0.92
294 0.9
295 0.89
296 0.82
297 0.76
298 0.66
299 0.62
300 0.58
301 0.51
302 0.49
303 0.48
304 0.53
305 0.52
306 0.55
307 0.55
308 0.53
309 0.54
310 0.54
311 0.54
312 0.51
313 0.53
314 0.51
315 0.45
316 0.43
317 0.38
318 0.33
319 0.25
320 0.19
321 0.13
322 0.11
323 0.11
324 0.11
325 0.12
326 0.12
327 0.11
328 0.1
329 0.1
330 0.1
331 0.1
332 0.08
333 0.08
334 0.07
335 0.08
336 0.09
337 0.09
338 0.09
339 0.1
340 0.11
341 0.12
342 0.12
343 0.12
344 0.11
345 0.12
346 0.12
347 0.11