Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A1E3NPN3

Protein Details
Accession A0A1E3NPN3    Localization Confidence High Confidence Score 16.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
211-232TNENLKKKSSVKSKKNSNSSNLHydrophilic
249-278NTVSNSNDKREKKKKKKSGRPSSAEKRAREBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
257-276KREKKKKKKSGRPSSAEKRA
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR038609  HDA1_su2/3_sf  
IPR021006  Hda2/3  
Gene Ontology GO:0070823  C:HDA1 complex  
GO:0016575  P:histone deacetylation  
Pfam View protein in Pfam  
PF11496  HDA2-3  
Amino Acid Sequences MSVKGDPSLFYLPLGQTVYQKCLIDILIQLHKPHILSYLQKETETRSLNSLTSLPNDTQTGKSQSSRPAAERQEEGTMSDESMFDAFIFNVKQITNHPSLLVDHYIPRNLLLLNSKENIISLSNKYYQVSEILDKLVQRDVRKTIIISVSNAKEMDLIESFLLGKRGLQYYRFSGSSLYYDNHGSFDFHKEEIESVTEKSSSPSSSETSNTNENLKKKSSVKSKKNSNSSNLYDSQDDSTPGLKSNNGNTVSNSNDKREKKKKKKSGRPSSAEKRAREQQAQVTAAIAAVTSSDQKSTDKDGTPSHKVRDNKEEYVPRLSKHNEEFCKMLIEKKSKKLNVYLILSSQLKYLLQFEDLKSDLILSLDSNFTDFEEVSNILHHQVPILKPVVLESLEHYEWELNNDEQAIFSDTSKRNKQRRSRSAALGATGNNNNGVDSETVSLSNINGNFKGKTSDEKARFNRLLALSVIAAWPEVEVESPFTIQSVSDKVIDWLVDPEKYTYPFNPAIETKIPHVLDDTLIDGVKATLSSPFELSTILGLHKLDKYTFFDEKLEKGKKIVEEDEGMTKVKQEIQHSVKRMKLSSNESNCTIPDNFTYRQYQSHLTNLITETLEAMLSWMNNIRRQLEFVHLDETERQYVIDRGNFDCGELYKKDRDLGVKIEARNKVKSRLIAECEKFELIASSDKDGQLGLKERYDLYSSKAIEKLPDTKKQDDEIQELKKKLSELQVTLDKCDAESLSIRQKYQETSSRAAELSAVTKRLQEEGKRLEDESKGLFKKIQVESIVEKQAYVNKRVKEMENDCLVWNGYLKALQVELEKRGSGVAATSRTSRASRNNTPH
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.22
3 0.25
4 0.27
5 0.31
6 0.32
7 0.32
8 0.28
9 0.28
10 0.27
11 0.22
12 0.23
13 0.24
14 0.27
15 0.29
16 0.3
17 0.29
18 0.31
19 0.29
20 0.26
21 0.24
22 0.21
23 0.26
24 0.32
25 0.41
26 0.4
27 0.41
28 0.42
29 0.43
30 0.47
31 0.45
32 0.39
33 0.34
34 0.34
35 0.33
36 0.35
37 0.32
38 0.26
39 0.25
40 0.27
41 0.24
42 0.24
43 0.26
44 0.26
45 0.27
46 0.3
47 0.33
48 0.33
49 0.36
50 0.38
51 0.44
52 0.49
53 0.5
54 0.48
55 0.51
56 0.53
57 0.54
58 0.52
59 0.47
60 0.44
61 0.4
62 0.37
63 0.31
64 0.26
65 0.22
66 0.19
67 0.16
68 0.12
69 0.12
70 0.11
71 0.08
72 0.08
73 0.07
74 0.09
75 0.1
76 0.09
77 0.11
78 0.11
79 0.13
80 0.16
81 0.23
82 0.24
83 0.24
84 0.25
85 0.24
86 0.25
87 0.28
88 0.27
89 0.22
90 0.23
91 0.25
92 0.27
93 0.25
94 0.24
95 0.22
96 0.19
97 0.2
98 0.22
99 0.22
100 0.25
101 0.26
102 0.26
103 0.24
104 0.24
105 0.22
106 0.19
107 0.19
108 0.18
109 0.22
110 0.25
111 0.27
112 0.27
113 0.27
114 0.25
115 0.24
116 0.24
117 0.22
118 0.19
119 0.2
120 0.2
121 0.2
122 0.21
123 0.24
124 0.24
125 0.24
126 0.28
127 0.29
128 0.31
129 0.33
130 0.32
131 0.32
132 0.34
133 0.33
134 0.31
135 0.34
136 0.33
137 0.33
138 0.32
139 0.27
140 0.22
141 0.2
142 0.2
143 0.13
144 0.13
145 0.1
146 0.11
147 0.11
148 0.11
149 0.12
150 0.09
151 0.1
152 0.12
153 0.17
154 0.18
155 0.21
156 0.23
157 0.27
158 0.31
159 0.3
160 0.27
161 0.24
162 0.24
163 0.24
164 0.22
165 0.19
166 0.16
167 0.18
168 0.18
169 0.18
170 0.17
171 0.16
172 0.15
173 0.19
174 0.2
175 0.18
176 0.18
177 0.17
178 0.18
179 0.17
180 0.18
181 0.14
182 0.13
183 0.14
184 0.14
185 0.14
186 0.15
187 0.16
188 0.14
189 0.14
190 0.16
191 0.16
192 0.18
193 0.19
194 0.2
195 0.22
196 0.25
197 0.25
198 0.28
199 0.32
200 0.34
201 0.37
202 0.37
203 0.4
204 0.4
205 0.48
206 0.52
207 0.59
208 0.65
209 0.7
210 0.78
211 0.81
212 0.86
213 0.83
214 0.79
215 0.76
216 0.7
217 0.66
218 0.58
219 0.51
220 0.42
221 0.37
222 0.33
223 0.26
224 0.23
225 0.18
226 0.17
227 0.15
228 0.15
229 0.15
230 0.15
231 0.17
232 0.2
233 0.26
234 0.27
235 0.27
236 0.27
237 0.29
238 0.3
239 0.35
240 0.33
241 0.3
242 0.36
243 0.41
244 0.5
245 0.58
246 0.66
247 0.7
248 0.79
249 0.85
250 0.88
251 0.94
252 0.95
253 0.95
254 0.94
255 0.91
256 0.9
257 0.89
258 0.88
259 0.84
260 0.75
261 0.7
262 0.68
263 0.66
264 0.59
265 0.53
266 0.49
267 0.48
268 0.47
269 0.4
270 0.32
271 0.26
272 0.22
273 0.18
274 0.12
275 0.05
276 0.04
277 0.04
278 0.05
279 0.06
280 0.06
281 0.07
282 0.08
283 0.11
284 0.15
285 0.2
286 0.2
287 0.22
288 0.28
289 0.33
290 0.4
291 0.42
292 0.4
293 0.42
294 0.44
295 0.46
296 0.5
297 0.51
298 0.46
299 0.5
300 0.53
301 0.49
302 0.54
303 0.51
304 0.41
305 0.41
306 0.4
307 0.38
308 0.38
309 0.44
310 0.38
311 0.38
312 0.39
313 0.33
314 0.35
315 0.3
316 0.29
317 0.27
318 0.34
319 0.37
320 0.44
321 0.52
322 0.5
323 0.52
324 0.53
325 0.53
326 0.5
327 0.48
328 0.41
329 0.33
330 0.34
331 0.32
332 0.27
333 0.21
334 0.15
335 0.11
336 0.11
337 0.12
338 0.09
339 0.1
340 0.12
341 0.12
342 0.15
343 0.15
344 0.15
345 0.13
346 0.12
347 0.1
348 0.08
349 0.08
350 0.05
351 0.05
352 0.06
353 0.05
354 0.06
355 0.06
356 0.06
357 0.06
358 0.06
359 0.05
360 0.06
361 0.07
362 0.07
363 0.07
364 0.07
365 0.08
366 0.08
367 0.08
368 0.07
369 0.1
370 0.1
371 0.12
372 0.13
373 0.12
374 0.11
375 0.12
376 0.13
377 0.1
378 0.1
379 0.09
380 0.12
381 0.12
382 0.12
383 0.12
384 0.11
385 0.11
386 0.13
387 0.13
388 0.08
389 0.08
390 0.09
391 0.09
392 0.07
393 0.08
394 0.09
395 0.07
396 0.08
397 0.15
398 0.18
399 0.24
400 0.31
401 0.4
402 0.45
403 0.53
404 0.63
405 0.66
406 0.73
407 0.77
408 0.75
409 0.7
410 0.69
411 0.61
412 0.53
413 0.43
414 0.34
415 0.28
416 0.23
417 0.18
418 0.12
419 0.11
420 0.1
421 0.08
422 0.09
423 0.06
424 0.06
425 0.07
426 0.07
427 0.07
428 0.07
429 0.07
430 0.06
431 0.08
432 0.08
433 0.08
434 0.09
435 0.11
436 0.11
437 0.11
438 0.14
439 0.12
440 0.15
441 0.19
442 0.27
443 0.31
444 0.39
445 0.42
446 0.47
447 0.47
448 0.44
449 0.44
450 0.36
451 0.33
452 0.24
453 0.22
454 0.14
455 0.13
456 0.13
457 0.07
458 0.06
459 0.04
460 0.04
461 0.03
462 0.03
463 0.03
464 0.04
465 0.05
466 0.05
467 0.06
468 0.06
469 0.06
470 0.06
471 0.05
472 0.07
473 0.07
474 0.08
475 0.09
476 0.09
477 0.1
478 0.1
479 0.1
480 0.1
481 0.1
482 0.1
483 0.1
484 0.1
485 0.12
486 0.13
487 0.15
488 0.16
489 0.14
490 0.18
491 0.21
492 0.2
493 0.21
494 0.21
495 0.23
496 0.24
497 0.25
498 0.21
499 0.24
500 0.24
501 0.21
502 0.21
503 0.18
504 0.15
505 0.15
506 0.14
507 0.08
508 0.08
509 0.08
510 0.07
511 0.06
512 0.06
513 0.05
514 0.04
515 0.06
516 0.07
517 0.08
518 0.09
519 0.09
520 0.09
521 0.1
522 0.09
523 0.08
524 0.08
525 0.07
526 0.08
527 0.07
528 0.09
529 0.1
530 0.11
531 0.11
532 0.13
533 0.17
534 0.21
535 0.23
536 0.23
537 0.25
538 0.25
539 0.28
540 0.35
541 0.34
542 0.29
543 0.29
544 0.31
545 0.31
546 0.33
547 0.31
548 0.25
549 0.23
550 0.24
551 0.26
552 0.24
553 0.22
554 0.18
555 0.17
556 0.15
557 0.16
558 0.18
559 0.18
560 0.26
561 0.32
562 0.38
563 0.42
564 0.46
565 0.46
566 0.46
567 0.44
568 0.4
569 0.39
570 0.41
571 0.46
572 0.47
573 0.47
574 0.46
575 0.45
576 0.41
577 0.39
578 0.31
579 0.23
580 0.19
581 0.22
582 0.21
583 0.23
584 0.28
585 0.25
586 0.27
587 0.29
588 0.3
589 0.28
590 0.31
591 0.3
592 0.26
593 0.27
594 0.25
595 0.24
596 0.2
597 0.17
598 0.13
599 0.1
600 0.1
601 0.07
602 0.07
603 0.06
604 0.05
605 0.06
606 0.1
607 0.12
608 0.16
609 0.18
610 0.2
611 0.2
612 0.22
613 0.23
614 0.26
615 0.27
616 0.25
617 0.26
618 0.24
619 0.24
620 0.25
621 0.27
622 0.21
623 0.18
624 0.17
625 0.15
626 0.18
627 0.2
628 0.2
629 0.2
630 0.2
631 0.24
632 0.24
633 0.23
634 0.22
635 0.19
636 0.2
637 0.2
638 0.23
639 0.23
640 0.24
641 0.26
642 0.27
643 0.3
644 0.29
645 0.31
646 0.35
647 0.36
648 0.38
649 0.43
650 0.47
651 0.48
652 0.52
653 0.52
654 0.51
655 0.5
656 0.52
657 0.49
658 0.5
659 0.52
660 0.54
661 0.53
662 0.48
663 0.46
664 0.41
665 0.36
666 0.28
667 0.24
668 0.16
669 0.19
670 0.18
671 0.19
672 0.21
673 0.21
674 0.21
675 0.2
676 0.19
677 0.17
678 0.22
679 0.21
680 0.2
681 0.22
682 0.22
683 0.24
684 0.26
685 0.22
686 0.21
687 0.26
688 0.26
689 0.29
690 0.31
691 0.29
692 0.3
693 0.33
694 0.38
695 0.37
696 0.45
697 0.47
698 0.5
699 0.53
700 0.54
701 0.57
702 0.52
703 0.52
704 0.51
705 0.54
706 0.55
707 0.53
708 0.5
709 0.45
710 0.42
711 0.4
712 0.4
713 0.37
714 0.33
715 0.38
716 0.45
717 0.43
718 0.44
719 0.41
720 0.32
721 0.26
722 0.26
723 0.19
724 0.14
725 0.16
726 0.19
727 0.27
728 0.3
729 0.31
730 0.32
731 0.35
732 0.36
733 0.41
734 0.45
735 0.41
736 0.42
737 0.45
738 0.45
739 0.42
740 0.38
741 0.31
742 0.24
743 0.23
744 0.22
745 0.21
746 0.19
747 0.22
748 0.23
749 0.26
750 0.31
751 0.31
752 0.37
753 0.43
754 0.48
755 0.48
756 0.48
757 0.48
758 0.43
759 0.41
760 0.37
761 0.38
762 0.34
763 0.33
764 0.34
765 0.33
766 0.4
767 0.4
768 0.41
769 0.34
770 0.37
771 0.41
772 0.45
773 0.48
774 0.39
775 0.36
776 0.32
777 0.38
778 0.38
779 0.4
780 0.4
781 0.37
782 0.44
783 0.49
784 0.51
785 0.54
786 0.54
787 0.54
788 0.54
789 0.52
790 0.47
791 0.44
792 0.4
793 0.3
794 0.27
795 0.2
796 0.15
797 0.15
798 0.14
799 0.14
800 0.13
801 0.14
802 0.18
803 0.21
804 0.24
805 0.26
806 0.25
807 0.24
808 0.24
809 0.22
810 0.16
811 0.16
812 0.18
813 0.18
814 0.21
815 0.23
816 0.25
817 0.29
818 0.31
819 0.34
820 0.38
821 0.44