Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1E3NI17

Protein Details
Accession A0A1E3NI17    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
491-510NVLIPRSKKHPNKRMPVPTIHydrophilic
980-1004DQILKFMTKRFVKNKKYNDSRDIKDHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 13.5, cyto_nucl 8.5, plas 4, cyto 2.5, mito 2, E.R. 2, golg 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR031120  HIR1-like  
IPR011494  HIRA-like_C  
IPR019015  HIRA_B_motif  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006325  P:chromatin organization  
GO:0006351  P:DNA-templated transcription  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF07569  Hira  
PF09453  HIRA_B  
PF00400  WD40  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50082  WD_REPEATS_2  
PS50294  WD_REPEATS_REGION  
Amino Acid Sequences MHVVKFPWVKHAEGPRSFEIYSVSVSPDGSRLATGGLDGKVKLWSIDTLQKYKEMDKMKDGNSSSSNIIDKSECRPLCSMSRHAGAITCIRFCPNGRFLASGSDDKLVLIWEKDEEKTRIMAMHRNEIANSGDSNFLFANGDDSGINDADLEHWTVRKRLVAHDNDVQDMAWAPDGSILVTVGLDRSIVVWNGMTFEKIKRFDIHQSHVKGVVFDPAGKYFATCSDDRTMRIFRYRKGVSVEGADMEFVVENIIRDPFAKSPLTTYFRRCSWSPDGLYIAAPNGTNEGVNANVVIKRGSWDSELSLIGHRLPCEVCSFSPRLYDVEFGNNNRNAGHSQSSSRSETVIITAGQDRTLALWSSSCATPLCVATEISAKSITDVAWNPDGLNVFLCGLDGVVLSLFFDERELGHVVPWEENNRALIRYGKDRDMFFPESVEQLKLEEFAEKRGIIGDSKPIKPDRLQSLMGGSSLGGNTELNTSNNDESKKVMNVLIPRSKKHPNKRMPVPTITPRSTVATNNSNTNNIDVSASSQAKMNLLSSKTQNITITKSGKKRVAPTLISVSSTNAATSAPSKSNAFLSGTTATATADANTTTSKNLMVEKRSKLSKIISLPYPPLPKHGLSTLTSSFRPNVANDETEQESLEKTIDYIAETDNNNSSSLDKRGKFSSSSKKSSSSNTLSKYTNGGRKPNPSVYGDSSGVWNKRRKVAYPDWIKDSLVSPITIYGDASMSSYNVLVERKQLAEPLVGEQVVEVRYENDHVYKYLDHNDDTEMESNWNEFDAVSHILAKTTNCESDSLEKWELFLNERITCIGESSLEGLSYWCFGTENGRLLLVSTTGRQLCGSIELGSNIVKLVCNESFIMCVCANGLIYSWKFFKCHSSLISGNSIVEGVSLAPVLNAHSTTTESKKKVDISAKITNIYMRSNGCPIIAINDEKRNCIYSFDPLLESWVEVLDSLYVDFLPASMLDPEMKLLGEIDQILKFMTKRFVKNKKYNDSRDIKDAKDINIANDSKTFKDLEVTKSTKDDTDTKDVKETQKVEADKIASMETSKGPALFIRSEAKEEATLQSIYEDWKSVNKCVAECINRKLEKC
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.6
2 0.54
3 0.56
4 0.53
5 0.47
6 0.4
7 0.31
8 0.28
9 0.23
10 0.21
11 0.18
12 0.18
13 0.18
14 0.17
15 0.16
16 0.14
17 0.13
18 0.11
19 0.11
20 0.11
21 0.11
22 0.13
23 0.14
24 0.15
25 0.15
26 0.16
27 0.17
28 0.17
29 0.17
30 0.15
31 0.15
32 0.18
33 0.27
34 0.32
35 0.36
36 0.37
37 0.41
38 0.42
39 0.43
40 0.45
41 0.45
42 0.43
43 0.47
44 0.53
45 0.51
46 0.56
47 0.55
48 0.53
49 0.47
50 0.46
51 0.38
52 0.35
53 0.34
54 0.26
55 0.27
56 0.24
57 0.24
58 0.26
59 0.35
60 0.31
61 0.33
62 0.34
63 0.36
64 0.42
65 0.46
66 0.46
67 0.42
68 0.45
69 0.43
70 0.41
71 0.38
72 0.33
73 0.34
74 0.31
75 0.27
76 0.24
77 0.25
78 0.27
79 0.28
80 0.33
81 0.31
82 0.33
83 0.33
84 0.35
85 0.33
86 0.38
87 0.4
88 0.34
89 0.31
90 0.27
91 0.25
92 0.23
93 0.23
94 0.17
95 0.15
96 0.12
97 0.11
98 0.13
99 0.16
100 0.19
101 0.25
102 0.26
103 0.26
104 0.26
105 0.27
106 0.28
107 0.28
108 0.33
109 0.3
110 0.37
111 0.39
112 0.38
113 0.37
114 0.35
115 0.34
116 0.29
117 0.26
118 0.18
119 0.18
120 0.16
121 0.18
122 0.16
123 0.14
124 0.13
125 0.12
126 0.13
127 0.1
128 0.11
129 0.09
130 0.1
131 0.12
132 0.11
133 0.11
134 0.08
135 0.08
136 0.08
137 0.1
138 0.11
139 0.1
140 0.13
141 0.15
142 0.17
143 0.19
144 0.22
145 0.23
146 0.29
147 0.38
148 0.41
149 0.45
150 0.5
151 0.5
152 0.47
153 0.45
154 0.36
155 0.27
156 0.22
157 0.16
158 0.11
159 0.09
160 0.08
161 0.09
162 0.1
163 0.09
164 0.09
165 0.08
166 0.06
167 0.06
168 0.06
169 0.05
170 0.05
171 0.05
172 0.04
173 0.05
174 0.07
175 0.08
176 0.08
177 0.08
178 0.08
179 0.11
180 0.11
181 0.11
182 0.11
183 0.15
184 0.22
185 0.24
186 0.27
187 0.28
188 0.32
189 0.4
190 0.46
191 0.49
192 0.5
193 0.51
194 0.51
195 0.52
196 0.48
197 0.39
198 0.32
199 0.3
200 0.23
201 0.21
202 0.21
203 0.18
204 0.19
205 0.17
206 0.17
207 0.12
208 0.15
209 0.18
210 0.16
211 0.19
212 0.25
213 0.27
214 0.29
215 0.33
216 0.32
217 0.32
218 0.41
219 0.41
220 0.37
221 0.45
222 0.45
223 0.45
224 0.47
225 0.45
226 0.38
227 0.37
228 0.35
229 0.26
230 0.24
231 0.2
232 0.14
233 0.12
234 0.1
235 0.06
236 0.06
237 0.05
238 0.05
239 0.06
240 0.07
241 0.06
242 0.07
243 0.1
244 0.11
245 0.15
246 0.16
247 0.15
248 0.19
249 0.26
250 0.31
251 0.32
252 0.36
253 0.37
254 0.38
255 0.42
256 0.39
257 0.39
258 0.41
259 0.45
260 0.4
261 0.38
262 0.38
263 0.34
264 0.34
265 0.27
266 0.21
267 0.14
268 0.12
269 0.1
270 0.09
271 0.08
272 0.08
273 0.08
274 0.08
275 0.07
276 0.07
277 0.07
278 0.07
279 0.08
280 0.09
281 0.09
282 0.08
283 0.1
284 0.11
285 0.12
286 0.13
287 0.13
288 0.13
289 0.15
290 0.16
291 0.15
292 0.15
293 0.14
294 0.15
295 0.15
296 0.14
297 0.13
298 0.13
299 0.13
300 0.15
301 0.16
302 0.15
303 0.18
304 0.2
305 0.19
306 0.21
307 0.21
308 0.2
309 0.19
310 0.2
311 0.16
312 0.22
313 0.24
314 0.24
315 0.3
316 0.3
317 0.29
318 0.27
319 0.28
320 0.21
321 0.21
322 0.23
323 0.18
324 0.2
325 0.24
326 0.28
327 0.29
328 0.28
329 0.25
330 0.22
331 0.21
332 0.19
333 0.16
334 0.12
335 0.11
336 0.13
337 0.13
338 0.12
339 0.11
340 0.1
341 0.09
342 0.11
343 0.09
344 0.07
345 0.07
346 0.08
347 0.1
348 0.1
349 0.11
350 0.09
351 0.1
352 0.11
353 0.11
354 0.12
355 0.1
356 0.1
357 0.1
358 0.14
359 0.13
360 0.13
361 0.13
362 0.11
363 0.11
364 0.12
365 0.11
366 0.11
367 0.12
368 0.14
369 0.14
370 0.15
371 0.14
372 0.15
373 0.15
374 0.12
375 0.11
376 0.08
377 0.07
378 0.07
379 0.07
380 0.05
381 0.04
382 0.04
383 0.04
384 0.03
385 0.03
386 0.03
387 0.03
388 0.03
389 0.03
390 0.03
391 0.03
392 0.04
393 0.04
394 0.07
395 0.08
396 0.08
397 0.09
398 0.11
399 0.11
400 0.12
401 0.14
402 0.13
403 0.13
404 0.13
405 0.15
406 0.14
407 0.13
408 0.13
409 0.16
410 0.16
411 0.23
412 0.25
413 0.28
414 0.3
415 0.31
416 0.32
417 0.35
418 0.35
419 0.28
420 0.26
421 0.23
422 0.22
423 0.22
424 0.19
425 0.13
426 0.1
427 0.1
428 0.1
429 0.09
430 0.11
431 0.1
432 0.12
433 0.14
434 0.13
435 0.13
436 0.13
437 0.14
438 0.11
439 0.12
440 0.18
441 0.21
442 0.22
443 0.25
444 0.25
445 0.27
446 0.28
447 0.33
448 0.31
449 0.31
450 0.3
451 0.27
452 0.28
453 0.26
454 0.24
455 0.18
456 0.12
457 0.08
458 0.07
459 0.07
460 0.05
461 0.04
462 0.05
463 0.07
464 0.08
465 0.07
466 0.09
467 0.11
468 0.12
469 0.15
470 0.15
471 0.14
472 0.15
473 0.16
474 0.16
475 0.15
476 0.15
477 0.15
478 0.18
479 0.24
480 0.29
481 0.29
482 0.3
483 0.34
484 0.42
485 0.48
486 0.55
487 0.59
488 0.61
489 0.68
490 0.77
491 0.81
492 0.76
493 0.72
494 0.66
495 0.64
496 0.61
497 0.53
498 0.45
499 0.37
500 0.34
501 0.31
502 0.28
503 0.24
504 0.23
505 0.23
506 0.26
507 0.25
508 0.25
509 0.23
510 0.23
511 0.19
512 0.13
513 0.12
514 0.08
515 0.09
516 0.12
517 0.12
518 0.11
519 0.12
520 0.12
521 0.12
522 0.13
523 0.12
524 0.11
525 0.12
526 0.13
527 0.13
528 0.16
529 0.17
530 0.18
531 0.19
532 0.17
533 0.19
534 0.22
535 0.26
536 0.28
537 0.32
538 0.35
539 0.37
540 0.39
541 0.4
542 0.42
543 0.43
544 0.39
545 0.37
546 0.38
547 0.34
548 0.33
549 0.28
550 0.22
551 0.17
552 0.16
553 0.13
554 0.07
555 0.07
556 0.06
557 0.07
558 0.09
559 0.09
560 0.1
561 0.11
562 0.11
563 0.12
564 0.13
565 0.13
566 0.1
567 0.12
568 0.12
569 0.11
570 0.11
571 0.1
572 0.09
573 0.08
574 0.08
575 0.06
576 0.05
577 0.05
578 0.05
579 0.06
580 0.06
581 0.06
582 0.07
583 0.07
584 0.07
585 0.12
586 0.15
587 0.19
588 0.25
589 0.27
590 0.31
591 0.33
592 0.33
593 0.31
594 0.3
595 0.31
596 0.29
597 0.3
598 0.28
599 0.28
600 0.29
601 0.31
602 0.34
603 0.28
604 0.27
605 0.26
606 0.24
607 0.24
608 0.24
609 0.22
610 0.19
611 0.23
612 0.22
613 0.22
614 0.22
615 0.22
616 0.2
617 0.19
618 0.19
619 0.15
620 0.17
621 0.17
622 0.17
623 0.17
624 0.19
625 0.19
626 0.18
627 0.18
628 0.13
629 0.11
630 0.11
631 0.1
632 0.07
633 0.05
634 0.06
635 0.06
636 0.06
637 0.06
638 0.07
639 0.1
640 0.1
641 0.12
642 0.12
643 0.13
644 0.13
645 0.12
646 0.13
647 0.12
648 0.17
649 0.23
650 0.23
651 0.24
652 0.26
653 0.28
654 0.3
655 0.35
656 0.41
657 0.42
658 0.47
659 0.47
660 0.48
661 0.48
662 0.49
663 0.49
664 0.45
665 0.43
666 0.41
667 0.43
668 0.41
669 0.4
670 0.39
671 0.37
672 0.37
673 0.35
674 0.38
675 0.38
676 0.44
677 0.48
678 0.48
679 0.46
680 0.42
681 0.42
682 0.39
683 0.39
684 0.34
685 0.28
686 0.26
687 0.27
688 0.28
689 0.3
690 0.32
691 0.3
692 0.37
693 0.39
694 0.4
695 0.44
696 0.49
697 0.53
698 0.58
699 0.58
700 0.56
701 0.55
702 0.52
703 0.44
704 0.36
705 0.3
706 0.2
707 0.17
708 0.12
709 0.12
710 0.13
711 0.12
712 0.11
713 0.08
714 0.07
715 0.07
716 0.07
717 0.06
718 0.05
719 0.06
720 0.06
721 0.05
722 0.07
723 0.08
724 0.08
725 0.1
726 0.12
727 0.14
728 0.14
729 0.15
730 0.15
731 0.15
732 0.16
733 0.15
734 0.14
735 0.12
736 0.12
737 0.1
738 0.11
739 0.1
740 0.1
741 0.08
742 0.07
743 0.08
744 0.1
745 0.11
746 0.11
747 0.11
748 0.12
749 0.14
750 0.14
751 0.16
752 0.22
753 0.23
754 0.22
755 0.22
756 0.23
757 0.22
758 0.23
759 0.21
760 0.15
761 0.14
762 0.13
763 0.13
764 0.11
765 0.1
766 0.08
767 0.06
768 0.06
769 0.08
770 0.09
771 0.09
772 0.11
773 0.1
774 0.11
775 0.12
776 0.12
777 0.13
778 0.13
779 0.15
780 0.14
781 0.15
782 0.17
783 0.22
784 0.24
785 0.27
786 0.26
787 0.24
788 0.24
789 0.26
790 0.25
791 0.23
792 0.24
793 0.22
794 0.21
795 0.21
796 0.21
797 0.2
798 0.19
799 0.16
800 0.12
801 0.09
802 0.09
803 0.1
804 0.1
805 0.08
806 0.08
807 0.08
808 0.08
809 0.08
810 0.08
811 0.06
812 0.06
813 0.06
814 0.11
815 0.14
816 0.17
817 0.16
818 0.17
819 0.16
820 0.17
821 0.17
822 0.14
823 0.11
824 0.09
825 0.14
826 0.14
827 0.15
828 0.14
829 0.14
830 0.13
831 0.15
832 0.15
833 0.12
834 0.12
835 0.12
836 0.13
837 0.12
838 0.12
839 0.09
840 0.09
841 0.08
842 0.08
843 0.12
844 0.11
845 0.13
846 0.13
847 0.13
848 0.14
849 0.14
850 0.17
851 0.12
852 0.12
853 0.11
854 0.11
855 0.1
856 0.09
857 0.09
858 0.1
859 0.11
860 0.14
861 0.17
862 0.17
863 0.18
864 0.19
865 0.26
866 0.25
867 0.29
868 0.29
869 0.32
870 0.33
871 0.36
872 0.39
873 0.32
874 0.29
875 0.24
876 0.21
877 0.15
878 0.12
879 0.09
880 0.05
881 0.04
882 0.05
883 0.04
884 0.04
885 0.05
886 0.06
887 0.07
888 0.07
889 0.07
890 0.08
891 0.11
892 0.16
893 0.23
894 0.3
895 0.31
896 0.33
897 0.37
898 0.39
899 0.44
900 0.48
901 0.48
902 0.48
903 0.54
904 0.54
905 0.51
906 0.49
907 0.44
908 0.38
909 0.32
910 0.29
911 0.23
912 0.23
913 0.24
914 0.24
915 0.21
916 0.2
917 0.18
918 0.19
919 0.19
920 0.21
921 0.23
922 0.31
923 0.31
924 0.33
925 0.34
926 0.33
927 0.3
928 0.3
929 0.27
930 0.26
931 0.29
932 0.29
933 0.29
934 0.25
935 0.27
936 0.24
937 0.22
938 0.15
939 0.12
940 0.09
941 0.08
942 0.08
943 0.06
944 0.06
945 0.06
946 0.06
947 0.05
948 0.06
949 0.05
950 0.05
951 0.05
952 0.05
953 0.06
954 0.07
955 0.08
956 0.09
957 0.09
958 0.1
959 0.1
960 0.1
961 0.08
962 0.08
963 0.08
964 0.09
965 0.1
966 0.11
967 0.11
968 0.11
969 0.12
970 0.13
971 0.13
972 0.15
973 0.23
974 0.28
975 0.36
976 0.47
977 0.57
978 0.66
979 0.75
980 0.82
981 0.85
982 0.88
983 0.88
984 0.87
985 0.85
986 0.79
987 0.79
988 0.74
989 0.64
990 0.62
991 0.58
992 0.5
993 0.5
994 0.46
995 0.39
996 0.42
997 0.41
998 0.34
999 0.36
1000 0.36
1001 0.29
1002 0.31
1003 0.29
1004 0.21
1005 0.27
1006 0.3
1007 0.31
1008 0.38
1009 0.4
1010 0.4
1011 0.42
1012 0.43
1013 0.39
1014 0.38
1015 0.39
1016 0.37
1017 0.44
1018 0.46
1019 0.45
1020 0.51
1021 0.54
1022 0.55
1023 0.56
1024 0.51
1025 0.47
1026 0.51
1027 0.5
1028 0.46
1029 0.46
1030 0.42
1031 0.35
1032 0.34
1033 0.29
1034 0.21
1035 0.21
1036 0.2
1037 0.16
1038 0.17
1039 0.17
1040 0.16
1041 0.16
1042 0.17
1043 0.21
1044 0.2
1045 0.22
1046 0.27
1047 0.27
1048 0.31
1049 0.31
1050 0.32
1051 0.29
1052 0.29
1053 0.28
1054 0.25
1055 0.23
1056 0.19
1057 0.19
1058 0.17
1059 0.18
1060 0.17
1061 0.16
1062 0.14
1063 0.21
1064 0.24
1065 0.26
1066 0.32
1067 0.32
1068 0.31
1069 0.36
1070 0.44
1071 0.46
1072 0.49
1073 0.53
1074 0.57