Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H2APF9

Protein Details
Accession H2APF9    Localization Confidence High Confidence Score 18
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
5-38ELELKEQLKKQKKEELERRRQASKQKRSSEPTGLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
13-30KKQKKEELERRRQASKQK
Subcellular Location(s) nucl 25
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR034393  TatSF1-like  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG kaf:KAFR_0A08250  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12285  RRM3_RBM39_like  
Amino Acid Sequences MDKEELELKEQLKKQKKEELERRRQASKQKRSSEPTGLYISNLSLESTTVDSLIDEFSTFGKIKKDHQNNYRCKLYLDENGRFKGDALIIYERAESVQLAIDLINDAELNGCKIKVERAEFNNDKRERIHDKDDSEPPLKRRVIEVSQEKIDTSSRKERTIVLSNILDIYEDIESDELHDLKQDILEGCESFGEVLNITVDSNRGEAHVVFKRQKDALQCCKKMNNRFFDGRKLIAFMLSEEDDVASSGAESTNGENSEGTQQEEDDVVEFT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.59
2 0.64
3 0.72
4 0.75
5 0.81
6 0.82
7 0.83
8 0.85
9 0.85
10 0.83
11 0.8
12 0.79
13 0.79
14 0.79
15 0.78
16 0.78
17 0.8
18 0.8
19 0.81
20 0.79
21 0.72
22 0.66
23 0.6
24 0.51
25 0.43
26 0.36
27 0.29
28 0.22
29 0.18
30 0.13
31 0.09
32 0.09
33 0.09
34 0.1
35 0.1
36 0.08
37 0.08
38 0.07
39 0.08
40 0.08
41 0.07
42 0.06
43 0.06
44 0.06
45 0.1
46 0.1
47 0.12
48 0.17
49 0.18
50 0.26
51 0.36
52 0.45
53 0.51
54 0.6
55 0.68
56 0.72
57 0.77
58 0.75
59 0.65
60 0.56
61 0.51
62 0.47
63 0.45
64 0.43
65 0.44
66 0.43
67 0.44
68 0.43
69 0.4
70 0.35
71 0.29
72 0.22
73 0.16
74 0.15
75 0.16
76 0.16
77 0.16
78 0.16
79 0.13
80 0.12
81 0.11
82 0.08
83 0.06
84 0.06
85 0.05
86 0.05
87 0.05
88 0.05
89 0.05
90 0.05
91 0.05
92 0.03
93 0.03
94 0.04
95 0.04
96 0.05
97 0.05
98 0.06
99 0.06
100 0.06
101 0.09
102 0.13
103 0.16
104 0.21
105 0.23
106 0.32
107 0.36
108 0.4
109 0.46
110 0.43
111 0.41
112 0.36
113 0.4
114 0.37
115 0.38
116 0.41
117 0.36
118 0.38
119 0.42
120 0.45
121 0.43
122 0.39
123 0.37
124 0.33
125 0.36
126 0.34
127 0.29
128 0.27
129 0.27
130 0.28
131 0.33
132 0.36
133 0.32
134 0.33
135 0.33
136 0.31
137 0.27
138 0.26
139 0.2
140 0.2
141 0.26
142 0.26
143 0.28
144 0.29
145 0.3
146 0.34
147 0.4
148 0.35
149 0.3
150 0.28
151 0.26
152 0.26
153 0.23
154 0.17
155 0.09
156 0.09
157 0.05
158 0.05
159 0.05
160 0.05
161 0.05
162 0.06
163 0.08
164 0.06
165 0.06
166 0.07
167 0.07
168 0.07
169 0.08
170 0.08
171 0.07
172 0.08
173 0.09
174 0.09
175 0.09
176 0.08
177 0.08
178 0.07
179 0.07
180 0.06
181 0.05
182 0.05
183 0.05
184 0.06
185 0.06
186 0.06
187 0.06
188 0.06
189 0.07
190 0.07
191 0.07
192 0.08
193 0.08
194 0.14
195 0.19
196 0.25
197 0.3
198 0.32
199 0.36
200 0.36
201 0.39
202 0.42
203 0.46
204 0.5
205 0.56
206 0.58
207 0.59
208 0.66
209 0.71
210 0.72
211 0.71
212 0.68
213 0.65
214 0.69
215 0.68
216 0.68
217 0.65
218 0.57
219 0.5
220 0.44
221 0.38
222 0.31
223 0.28
224 0.19
225 0.19
226 0.17
227 0.16
228 0.13
229 0.13
230 0.11
231 0.11
232 0.11
233 0.06
234 0.05
235 0.06
236 0.06
237 0.06
238 0.07
239 0.08
240 0.12
241 0.13
242 0.14
243 0.13
244 0.15
245 0.21
246 0.21
247 0.22
248 0.18
249 0.18
250 0.18
251 0.19
252 0.18