Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1E3NM80

Protein Details
Accession A0A1E3NM80    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
156-176IETQRVKRKEIKKKLDSIQDLHydrophilic
385-408SMERALQLKRQQKRHKQMEDDELHHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
108-119KPAAKAKPAGIR
Subcellular Location(s) nucl 21, mito_nucl 13.333, cyto_nucl 11.833, mito 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039128  TRIP4-like  
IPR009349  Znf_C2HC5  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF06221  zf-C2HC5  
Amino Acid Sequences MSSYSMSQIKRFAADSIKDIMPLDEESINEMVQYSIRNYKTREQISNHFLDLLGPTDATFQFVTKFGDMLFGSQQPLTKSEPKPTMPTKALPTKASTPAKPTLGSNGKPAAKAKPAGIRLVKNKIVANPSSKGRLSNNSRNGATTSDMFNMKPSSIETQRVKRKEIKKKLDSIQDLDDVLLELELMDSRENLDDIRVCNCNATRHPLFEMYPNCLNCGKIICAKEGLQPCSFCGKSLMSDEEKMELKDIFNREKEELEGKNEKPKETSSTGRGKKKNVIKITLNTPGQNNFKIQEQFYKQIEENRKQEREQEQITKEEEKEIAQNRKEMEYYKSVHKKDPELIKAEERLATLLSFQDNSAERTKIIDNAADFELPTARGNLWASSMERALQLKRQQKRHKQMEDDELHRSGRGNTVVDMTVRNGKVVFNDRTRESGVFENVSDDEEIQELQQQVNKEKMKQFKEEAQNVYDYDSFNDKLFKPVYSGKPLASRGNSAGDGNATKDIISELPPLGSVVQLGEVEQQEDRLFSMIGV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.33
2 0.34
3 0.35
4 0.33
5 0.31
6 0.31
7 0.27
8 0.21
9 0.2
10 0.19
11 0.15
12 0.15
13 0.17
14 0.17
15 0.17
16 0.14
17 0.13
18 0.11
19 0.11
20 0.13
21 0.13
22 0.2
23 0.24
24 0.29
25 0.34
26 0.42
27 0.5
28 0.56
29 0.6
30 0.58
31 0.63
32 0.66
33 0.65
34 0.57
35 0.48
36 0.4
37 0.33
38 0.28
39 0.22
40 0.15
41 0.11
42 0.1
43 0.13
44 0.13
45 0.15
46 0.14
47 0.12
48 0.13
49 0.15
50 0.18
51 0.15
52 0.15
53 0.13
54 0.17
55 0.17
56 0.17
57 0.19
58 0.17
59 0.18
60 0.19
61 0.21
62 0.18
63 0.21
64 0.24
65 0.3
66 0.32
67 0.39
68 0.45
69 0.46
70 0.52
71 0.55
72 0.57
73 0.52
74 0.54
75 0.54
76 0.56
77 0.57
78 0.51
79 0.51
80 0.48
81 0.54
82 0.55
83 0.49
84 0.46
85 0.47
86 0.48
87 0.44
88 0.39
89 0.39
90 0.41
91 0.4
92 0.39
93 0.41
94 0.4
95 0.41
96 0.43
97 0.38
98 0.36
99 0.37
100 0.36
101 0.37
102 0.37
103 0.42
104 0.45
105 0.47
106 0.48
107 0.54
108 0.52
109 0.48
110 0.48
111 0.45
112 0.45
113 0.42
114 0.4
115 0.37
116 0.36
117 0.38
118 0.36
119 0.35
120 0.33
121 0.4
122 0.44
123 0.5
124 0.55
125 0.55
126 0.55
127 0.53
128 0.5
129 0.42
130 0.36
131 0.27
132 0.22
133 0.19
134 0.2
135 0.18
136 0.19
137 0.19
138 0.16
139 0.15
140 0.14
141 0.18
142 0.2
143 0.27
144 0.31
145 0.39
146 0.49
147 0.51
148 0.55
149 0.58
150 0.65
151 0.68
152 0.73
153 0.75
154 0.73
155 0.79
156 0.8
157 0.81
158 0.74
159 0.67
160 0.59
161 0.5
162 0.42
163 0.33
164 0.26
165 0.17
166 0.13
167 0.09
168 0.05
169 0.03
170 0.03
171 0.04
172 0.04
173 0.04
174 0.04
175 0.05
176 0.06
177 0.06
178 0.06
179 0.07
180 0.09
181 0.1
182 0.13
183 0.13
184 0.13
185 0.16
186 0.17
187 0.21
188 0.2
189 0.27
190 0.25
191 0.26
192 0.28
193 0.27
194 0.26
195 0.28
196 0.28
197 0.25
198 0.29
199 0.27
200 0.27
201 0.26
202 0.25
203 0.19
204 0.19
205 0.17
206 0.17
207 0.18
208 0.17
209 0.18
210 0.19
211 0.24
212 0.27
213 0.29
214 0.25
215 0.24
216 0.24
217 0.29
218 0.28
219 0.22
220 0.2
221 0.17
222 0.16
223 0.19
224 0.21
225 0.17
226 0.18
227 0.18
228 0.18
229 0.18
230 0.17
231 0.16
232 0.12
233 0.11
234 0.14
235 0.17
236 0.19
237 0.2
238 0.22
239 0.22
240 0.22
241 0.23
242 0.23
243 0.21
244 0.22
245 0.26
246 0.25
247 0.31
248 0.32
249 0.31
250 0.28
251 0.28
252 0.28
253 0.26
254 0.29
255 0.28
256 0.36
257 0.43
258 0.5
259 0.53
260 0.51
261 0.54
262 0.58
263 0.6
264 0.55
265 0.54
266 0.49
267 0.49
268 0.51
269 0.5
270 0.44
271 0.37
272 0.33
273 0.32
274 0.31
275 0.28
276 0.24
277 0.18
278 0.21
279 0.22
280 0.22
281 0.24
282 0.25
283 0.29
284 0.29
285 0.31
286 0.28
287 0.34
288 0.41
289 0.41
290 0.44
291 0.46
292 0.48
293 0.46
294 0.52
295 0.5
296 0.48
297 0.46
298 0.46
299 0.41
300 0.41
301 0.43
302 0.39
303 0.34
304 0.3
305 0.25
306 0.19
307 0.22
308 0.26
309 0.31
310 0.29
311 0.32
312 0.31
313 0.32
314 0.32
315 0.29
316 0.26
317 0.24
318 0.25
319 0.32
320 0.39
321 0.4
322 0.44
323 0.45
324 0.45
325 0.47
326 0.52
327 0.47
328 0.44
329 0.44
330 0.42
331 0.41
332 0.38
333 0.33
334 0.24
335 0.2
336 0.16
337 0.13
338 0.11
339 0.09
340 0.09
341 0.08
342 0.08
343 0.11
344 0.12
345 0.15
346 0.17
347 0.17
348 0.16
349 0.18
350 0.19
351 0.19
352 0.19
353 0.18
354 0.15
355 0.18
356 0.19
357 0.16
358 0.15
359 0.12
360 0.12
361 0.11
362 0.11
363 0.09
364 0.08
365 0.1
366 0.11
367 0.11
368 0.12
369 0.13
370 0.13
371 0.14
372 0.14
373 0.13
374 0.14
375 0.16
376 0.16
377 0.21
378 0.28
379 0.35
380 0.42
381 0.52
382 0.61
383 0.7
384 0.79
385 0.83
386 0.84
387 0.83
388 0.82
389 0.82
390 0.78
391 0.71
392 0.64
393 0.55
394 0.47
395 0.39
396 0.34
397 0.24
398 0.23
399 0.22
400 0.19
401 0.18
402 0.2
403 0.2
404 0.2
405 0.2
406 0.17
407 0.21
408 0.2
409 0.2
410 0.18
411 0.17
412 0.22
413 0.28
414 0.32
415 0.31
416 0.35
417 0.36
418 0.39
419 0.42
420 0.37
421 0.33
422 0.31
423 0.29
424 0.26
425 0.24
426 0.23
427 0.2
428 0.21
429 0.18
430 0.14
431 0.11
432 0.1
433 0.1
434 0.08
435 0.12
436 0.11
437 0.12
438 0.15
439 0.17
440 0.2
441 0.28
442 0.31
443 0.34
444 0.41
445 0.49
446 0.51
447 0.56
448 0.58
449 0.59
450 0.66
451 0.67
452 0.64
453 0.57
454 0.54
455 0.48
456 0.45
457 0.37
458 0.28
459 0.23
460 0.23
461 0.21
462 0.2
463 0.25
464 0.22
465 0.27
466 0.27
467 0.25
468 0.26
469 0.34
470 0.4
471 0.43
472 0.45
473 0.42
474 0.47
475 0.5
476 0.53
477 0.47
478 0.44
479 0.39
480 0.41
481 0.39
482 0.32
483 0.3
484 0.25
485 0.23
486 0.22
487 0.21
488 0.16
489 0.15
490 0.14
491 0.15
492 0.13
493 0.14
494 0.15
495 0.14
496 0.14
497 0.15
498 0.15
499 0.14
500 0.13
501 0.1
502 0.08
503 0.09
504 0.09
505 0.09
506 0.13
507 0.13
508 0.15
509 0.15
510 0.16
511 0.15
512 0.15
513 0.15
514 0.12