Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H2AVX3

Protein Details
Accession H2AVX3    Localization Confidence High Confidence Score 16.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
187-217RGPNRKAALAKKKTQRPKKEKPAKKSLEDLDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
16-40RPKRATRGARAAAPRRATKQVNHRR
178-211RGNRPAAPVRGPNRKAALAKKKTQRPKKEKPAKK
Subcellular Location(s) nucl 25, cyto_nucl 14.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG kaf:KAFR_0E03720  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MSANLNKSLDEIIGTRPKRATRGARAAAPRRATKQVNHRRSQPVNRQRTSRGPANAVSRVARMLNSSASSLTKVNVEGLPRDIKQDAVREFFSSQVGGVQSVLLSYNERGQSTGMANITFRNSESAKVAVNKFNGAPIDGGRSKLRLNLIVDPTQSRQDLSQRIKPLPTRGQNQGPQRGNRPAAPVRGPNRKAALAKKKTQRPKKEKPAKKSLEDLDKEMADYFGDSSNAAAATGN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.28
2 0.3
3 0.34
4 0.37
5 0.4
6 0.47
7 0.5
8 0.51
9 0.6
10 0.61
11 0.64
12 0.7
13 0.74
14 0.72
15 0.69
16 0.64
17 0.59
18 0.62
19 0.58
20 0.56
21 0.6
22 0.63
23 0.67
24 0.67
25 0.7
26 0.72
27 0.77
28 0.8
29 0.8
30 0.79
31 0.8
32 0.79
33 0.76
34 0.72
35 0.72
36 0.68
37 0.65
38 0.59
39 0.52
40 0.52
41 0.53
42 0.5
43 0.44
44 0.38
45 0.31
46 0.28
47 0.25
48 0.2
49 0.16
50 0.14
51 0.14
52 0.13
53 0.14
54 0.13
55 0.13
56 0.14
57 0.13
58 0.12
59 0.11
60 0.11
61 0.12
62 0.12
63 0.13
64 0.12
65 0.15
66 0.18
67 0.17
68 0.19
69 0.17
70 0.18
71 0.19
72 0.24
73 0.23
74 0.23
75 0.24
76 0.23
77 0.23
78 0.22
79 0.2
80 0.14
81 0.11
82 0.1
83 0.09
84 0.08
85 0.07
86 0.06
87 0.05
88 0.05
89 0.06
90 0.05
91 0.05
92 0.05
93 0.09
94 0.11
95 0.11
96 0.11
97 0.11
98 0.12
99 0.12
100 0.14
101 0.1
102 0.09
103 0.09
104 0.1
105 0.1
106 0.09
107 0.08
108 0.09
109 0.09
110 0.1
111 0.11
112 0.11
113 0.12
114 0.16
115 0.17
116 0.18
117 0.18
118 0.18
119 0.17
120 0.18
121 0.16
122 0.13
123 0.12
124 0.09
125 0.14
126 0.14
127 0.16
128 0.15
129 0.16
130 0.16
131 0.18
132 0.19
133 0.17
134 0.19
135 0.23
136 0.26
137 0.27
138 0.28
139 0.27
140 0.27
141 0.26
142 0.24
143 0.18
144 0.16
145 0.2
146 0.28
147 0.32
148 0.36
149 0.38
150 0.4
151 0.44
152 0.45
153 0.47
154 0.48
155 0.49
156 0.48
157 0.5
158 0.56
159 0.59
160 0.63
161 0.65
162 0.62
163 0.59
164 0.6
165 0.61
166 0.56
167 0.51
168 0.51
169 0.45
170 0.45
171 0.45
172 0.47
173 0.48
174 0.55
175 0.55
176 0.53
177 0.53
178 0.52
179 0.53
180 0.55
181 0.58
182 0.56
183 0.63
184 0.67
185 0.73
186 0.79
187 0.84
188 0.86
189 0.85
190 0.88
191 0.91
192 0.92
193 0.92
194 0.91
195 0.92
196 0.89
197 0.84
198 0.81
199 0.78
200 0.77
201 0.7
202 0.65
203 0.58
204 0.5
205 0.45
206 0.37
207 0.29
208 0.19
209 0.16
210 0.14
211 0.11
212 0.11
213 0.1
214 0.1
215 0.11
216 0.11