Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H2B0D1

Protein Details
Accession H2B0D1    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
160-179TEERKRRAKEIARKEQERKNBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
163-174RKRRAKEIARKE
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 12, cyto 3.5, mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036168  AP2_Mu_C_sf  
IPR022775  AP_mu_sigma_su  
IPR027059  Coatomer_dsu  
IPR011012  Longin-like_dom_sf  
IPR028565  MHD  
Gene Ontology GO:0030126  C:COPI vesicle coat  
GO:0000139  C:Golgi membrane  
GO:0015031  P:protein transport  
GO:0006890  P:retrograde vesicle-mediated transport, Golgi to endoplasmic reticulum  
KEGG kaf:KAFR_0J00130  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00928  Adap_comp_sub  
PF01217  Clat_adaptor_s  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51072  MHD  
CDD cd09254  AP_delta-COPI_MHD  
cd14830  Delta_COP_N  
Amino Acid Sequences MVVLAASITTSNGKPLLSRQFKDLSRDRVLELLSNFQNLVSLKHSSNHTFVEDDHVRYVYKPFDDFYIILITNRQSNIVQDLSTLNLFSQTINAFLNNQFDQYEIYNKAFEILSSFDEIVSMGGYKEHLSLNQVNTYIAMESHEEKIQEIIERNKEIEATEERKRRAKEIARKEQERKNGMIYPSGNDFTAGANASNLNNAYNSYYSHASPAAQQSYLKQQQQQQHHHQQLPQSIPNSGPRAGMKLSGLGNNSNINAKRLNTSRVQTSSPSINNILEQDEKPIENNGILIQINETVNSEINRDGTVQSSELKGSLELRINDPELAHATIKLADSMNVKDRTFQFKTHPNIDKNSFLNNKIISLRDKSKSFPSNDHSLGVLRWRKIGSAGDKSLIPLEVSTWVTENSSNKFDVTVEFELNNDLEEKLDSIANLYFTIPVANGSISINEDSNDFSASIVNVDDEFGTTIKVESSLERGQSGLISFSVNADGEDSLFPINVSYKNYNIKENKSISGVAIEDIVNNEDSAFPYDSVANLTTEEYIIV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.15
2 0.22
3 0.32
4 0.38
5 0.4
6 0.43
7 0.5
8 0.53
9 0.6
10 0.61
11 0.58
12 0.57
13 0.57
14 0.53
15 0.48
16 0.46
17 0.42
18 0.36
19 0.35
20 0.29
21 0.28
22 0.26
23 0.22
24 0.25
25 0.2
26 0.21
27 0.17
28 0.2
29 0.2
30 0.24
31 0.29
32 0.3
33 0.33
34 0.33
35 0.32
36 0.29
37 0.28
38 0.33
39 0.32
40 0.3
41 0.29
42 0.27
43 0.26
44 0.26
45 0.29
46 0.24
47 0.23
48 0.22
49 0.21
50 0.22
51 0.26
52 0.25
53 0.23
54 0.24
55 0.21
56 0.2
57 0.22
58 0.2
59 0.21
60 0.21
61 0.21
62 0.16
63 0.17
64 0.22
65 0.2
66 0.19
67 0.16
68 0.17
69 0.17
70 0.17
71 0.15
72 0.1
73 0.1
74 0.11
75 0.09
76 0.12
77 0.1
78 0.11
79 0.12
80 0.13
81 0.13
82 0.15
83 0.2
84 0.17
85 0.18
86 0.16
87 0.15
88 0.17
89 0.16
90 0.2
91 0.18
92 0.19
93 0.19
94 0.18
95 0.2
96 0.18
97 0.16
98 0.13
99 0.12
100 0.12
101 0.14
102 0.14
103 0.12
104 0.12
105 0.12
106 0.1
107 0.08
108 0.07
109 0.05
110 0.05
111 0.06
112 0.06
113 0.08
114 0.09
115 0.09
116 0.14
117 0.18
118 0.2
119 0.23
120 0.22
121 0.21
122 0.2
123 0.21
124 0.16
125 0.11
126 0.1
127 0.09
128 0.11
129 0.13
130 0.14
131 0.14
132 0.14
133 0.15
134 0.15
135 0.16
136 0.18
137 0.22
138 0.25
139 0.26
140 0.27
141 0.26
142 0.25
143 0.22
144 0.23
145 0.23
146 0.23
147 0.3
148 0.36
149 0.38
150 0.45
151 0.46
152 0.45
153 0.48
154 0.53
155 0.55
156 0.6
157 0.68
158 0.71
159 0.77
160 0.81
161 0.78
162 0.76
163 0.7
164 0.61
165 0.55
166 0.5
167 0.44
168 0.42
169 0.37
170 0.3
171 0.29
172 0.28
173 0.23
174 0.18
175 0.17
176 0.12
177 0.13
178 0.11
179 0.08
180 0.07
181 0.08
182 0.08
183 0.09
184 0.09
185 0.07
186 0.07
187 0.08
188 0.09
189 0.09
190 0.09
191 0.11
192 0.12
193 0.12
194 0.13
195 0.13
196 0.12
197 0.14
198 0.18
199 0.17
200 0.16
201 0.16
202 0.16
203 0.25
204 0.31
205 0.3
206 0.29
207 0.34
208 0.4
209 0.5
210 0.56
211 0.56
212 0.6
213 0.65
214 0.63
215 0.6
216 0.57
217 0.53
218 0.49
219 0.43
220 0.34
221 0.28
222 0.27
223 0.29
224 0.28
225 0.23
226 0.2
227 0.17
228 0.19
229 0.19
230 0.18
231 0.14
232 0.14
233 0.14
234 0.14
235 0.15
236 0.13
237 0.14
238 0.14
239 0.14
240 0.15
241 0.14
242 0.14
243 0.14
244 0.14
245 0.18
246 0.19
247 0.22
248 0.21
249 0.23
250 0.25
251 0.26
252 0.27
253 0.24
254 0.24
255 0.25
256 0.22
257 0.23
258 0.2
259 0.17
260 0.17
261 0.16
262 0.15
263 0.13
264 0.12
265 0.13
266 0.13
267 0.12
268 0.12
269 0.12
270 0.11
271 0.09
272 0.09
273 0.07
274 0.07
275 0.07
276 0.07
277 0.06
278 0.08
279 0.08
280 0.08
281 0.08
282 0.07
283 0.08
284 0.08
285 0.09
286 0.08
287 0.08
288 0.09
289 0.09
290 0.09
291 0.09
292 0.09
293 0.09
294 0.1
295 0.1
296 0.1
297 0.09
298 0.09
299 0.08
300 0.08
301 0.11
302 0.13
303 0.14
304 0.16
305 0.17
306 0.18
307 0.18
308 0.16
309 0.14
310 0.13
311 0.13
312 0.11
313 0.1
314 0.09
315 0.1
316 0.1
317 0.11
318 0.09
319 0.09
320 0.11
321 0.13
322 0.2
323 0.22
324 0.22
325 0.25
326 0.28
327 0.34
328 0.34
329 0.35
330 0.33
331 0.38
332 0.44
333 0.49
334 0.53
335 0.48
336 0.52
337 0.53
338 0.52
339 0.45
340 0.48
341 0.42
342 0.36
343 0.36
344 0.31
345 0.3
346 0.27
347 0.28
348 0.23
349 0.26
350 0.3
351 0.31
352 0.32
353 0.33
354 0.39
355 0.44
356 0.44
357 0.45
358 0.44
359 0.46
360 0.46
361 0.44
362 0.37
363 0.31
364 0.28
365 0.3
366 0.29
367 0.23
368 0.24
369 0.24
370 0.23
371 0.25
372 0.3
373 0.29
374 0.31
375 0.32
376 0.31
377 0.3
378 0.31
379 0.29
380 0.24
381 0.17
382 0.1
383 0.09
384 0.11
385 0.11
386 0.11
387 0.11
388 0.11
389 0.12
390 0.15
391 0.17
392 0.17
393 0.19
394 0.19
395 0.18
396 0.18
397 0.18
398 0.17
399 0.2
400 0.19
401 0.18
402 0.17
403 0.17
404 0.18
405 0.18
406 0.16
407 0.11
408 0.09
409 0.08
410 0.08
411 0.08
412 0.08
413 0.09
414 0.08
415 0.09
416 0.1
417 0.1
418 0.1
419 0.1
420 0.09
421 0.09
422 0.1
423 0.08
424 0.08
425 0.08
426 0.07
427 0.08
428 0.08
429 0.08
430 0.1
431 0.11
432 0.1
433 0.1
434 0.1
435 0.11
436 0.11
437 0.11
438 0.1
439 0.09
440 0.09
441 0.09
442 0.1
443 0.08
444 0.08
445 0.07
446 0.08
447 0.07
448 0.07
449 0.08
450 0.07
451 0.08
452 0.07
453 0.08
454 0.07
455 0.08
456 0.08
457 0.09
458 0.15
459 0.18
460 0.19
461 0.19
462 0.19
463 0.18
464 0.19
465 0.18
466 0.13
467 0.1
468 0.1
469 0.1
470 0.11
471 0.12
472 0.11
473 0.1
474 0.1
475 0.1
476 0.1
477 0.1
478 0.1
479 0.09
480 0.09
481 0.09
482 0.09
483 0.11
484 0.13
485 0.19
486 0.21
487 0.26
488 0.35
489 0.38
490 0.46
491 0.5
492 0.54
493 0.57
494 0.58
495 0.56
496 0.49
497 0.48
498 0.39
499 0.36
500 0.3
501 0.21
502 0.19
503 0.16
504 0.13
505 0.14
506 0.15
507 0.12
508 0.11
509 0.11
510 0.1
511 0.12
512 0.15
513 0.16
514 0.15
515 0.16
516 0.17
517 0.17
518 0.19
519 0.19
520 0.15
521 0.14
522 0.14
523 0.13