Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H2AYU9

Protein Details
Accession H2AYU9    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
81-110GHERKYPEYKYRPVRKNKKRVSHNDHPLVNBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
76-100KKEKLGHERKYPEYKYRPVRKNKKR
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto_nucl 13.333, mito_nucl 12.999, mito 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
KEGG kaf:KAFR_0H00950  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00505  HMG_box  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50118  HMG_BOX_2  
CDD cd01389  HMG-box_ROX1-like  
Amino Acid Sequences MDNNSVRNSNNHQRAKIPRPRNAFILFRQHYHKILMDEWTATGVDIPHNSKISKILGNKWKTISPNEKLHWEELAKKEKLGHERKYPEYKYRPVRKNKKRVSHNDHPLVNMPPTPVFPSSNDDFFNNPFNFNRLMSPPQTFISNFNYPPLSMSAGQPMMRKDSQNNNNSNNNNNNNNNGKNSSKSNSSNNNNNPIMTRPVTMSSGYDSFSNSLQFAYLNGRQQNLIPIPLSMATPMKSNGSISNINSNFNNDEHFKPVQFLSTYHSFAQPTPQDYEQKLLFSSSIPGTNNNSQYIPKSSINQLDSNQMILPSISGNSSNNNNNSNSFNSDFPSDHSHHYSHSNFLFNSHPPPNSTTIYRDSFMSTNNNSVKSNSNINMGYSTTQQNFDNNDHSTLYKSGTN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.69
2 0.74
3 0.76
4 0.75
5 0.73
6 0.75
7 0.76
8 0.74
9 0.7
10 0.66
11 0.62
12 0.63
13 0.57
14 0.53
15 0.56
16 0.53
17 0.49
18 0.46
19 0.44
20 0.36
21 0.35
22 0.36
23 0.31
24 0.28
25 0.26
26 0.24
27 0.2
28 0.16
29 0.15
30 0.11
31 0.12
32 0.15
33 0.18
34 0.2
35 0.23
36 0.23
37 0.23
38 0.26
39 0.28
40 0.31
41 0.33
42 0.38
43 0.45
44 0.5
45 0.54
46 0.53
47 0.53
48 0.5
49 0.54
50 0.54
51 0.52
52 0.56
53 0.54
54 0.57
55 0.56
56 0.53
57 0.49
58 0.42
59 0.42
60 0.41
61 0.48
62 0.42
63 0.4
64 0.43
65 0.45
66 0.52
67 0.54
68 0.53
69 0.54
70 0.6
71 0.67
72 0.72
73 0.71
74 0.7
75 0.69
76 0.71
77 0.72
78 0.76
79 0.78
80 0.79
81 0.86
82 0.87
83 0.9
84 0.91
85 0.9
86 0.9
87 0.92
88 0.9
89 0.9
90 0.89
91 0.86
92 0.78
93 0.69
94 0.62
95 0.53
96 0.45
97 0.35
98 0.26
99 0.19
100 0.19
101 0.2
102 0.18
103 0.17
104 0.18
105 0.22
106 0.23
107 0.25
108 0.25
109 0.23
110 0.23
111 0.23
112 0.28
113 0.23
114 0.23
115 0.21
116 0.22
117 0.22
118 0.21
119 0.23
120 0.19
121 0.22
122 0.23
123 0.24
124 0.24
125 0.23
126 0.24
127 0.22
128 0.22
129 0.24
130 0.26
131 0.24
132 0.24
133 0.24
134 0.22
135 0.22
136 0.2
137 0.16
138 0.13
139 0.14
140 0.15
141 0.17
142 0.18
143 0.19
144 0.19
145 0.21
146 0.22
147 0.22
148 0.24
149 0.32
150 0.39
151 0.45
152 0.49
153 0.49
154 0.55
155 0.55
156 0.55
157 0.52
158 0.49
159 0.47
160 0.43
161 0.43
162 0.4
163 0.4
164 0.38
165 0.34
166 0.3
167 0.27
168 0.29
169 0.26
170 0.27
171 0.29
172 0.33
173 0.39
174 0.42
175 0.49
176 0.49
177 0.54
178 0.48
179 0.46
180 0.4
181 0.33
182 0.32
183 0.24
184 0.21
185 0.14
186 0.15
187 0.16
188 0.15
189 0.14
190 0.12
191 0.11
192 0.11
193 0.11
194 0.1
195 0.09
196 0.1
197 0.1
198 0.08
199 0.07
200 0.07
201 0.06
202 0.07
203 0.11
204 0.13
205 0.16
206 0.17
207 0.18
208 0.18
209 0.18
210 0.22
211 0.18
212 0.17
213 0.13
214 0.12
215 0.12
216 0.12
217 0.12
218 0.08
219 0.08
220 0.08
221 0.08
222 0.09
223 0.1
224 0.1
225 0.11
226 0.11
227 0.14
228 0.16
229 0.16
230 0.25
231 0.24
232 0.25
233 0.25
234 0.25
235 0.23
236 0.2
237 0.22
238 0.16
239 0.17
240 0.2
241 0.21
242 0.19
243 0.19
244 0.19
245 0.19
246 0.17
247 0.16
248 0.17
249 0.2
250 0.22
251 0.21
252 0.23
253 0.21
254 0.21
255 0.28
256 0.25
257 0.24
258 0.26
259 0.28
260 0.3
261 0.3
262 0.34
263 0.27
264 0.25
265 0.22
266 0.19
267 0.16
268 0.13
269 0.15
270 0.12
271 0.15
272 0.15
273 0.17
274 0.22
275 0.27
276 0.29
277 0.28
278 0.28
279 0.26
280 0.28
281 0.3
282 0.3
283 0.26
284 0.27
285 0.3
286 0.35
287 0.37
288 0.37
289 0.34
290 0.33
291 0.32
292 0.3
293 0.26
294 0.19
295 0.16
296 0.13
297 0.12
298 0.07
299 0.08
300 0.07
301 0.08
302 0.09
303 0.12
304 0.17
305 0.23
306 0.25
307 0.28
308 0.29
309 0.3
310 0.32
311 0.32
312 0.33
313 0.29
314 0.27
315 0.25
316 0.26
317 0.25
318 0.24
319 0.28
320 0.26
321 0.28
322 0.31
323 0.3
324 0.29
325 0.36
326 0.35
327 0.34
328 0.34
329 0.34
330 0.3
331 0.32
332 0.33
333 0.29
334 0.34
335 0.33
336 0.32
337 0.3
338 0.34
339 0.37
340 0.37
341 0.37
342 0.35
343 0.36
344 0.38
345 0.37
346 0.34
347 0.33
348 0.3
349 0.31
350 0.33
351 0.29
352 0.34
353 0.37
354 0.39
355 0.36
356 0.37
357 0.39
358 0.36
359 0.41
360 0.35
361 0.36
362 0.34
363 0.35
364 0.34
365 0.3
366 0.28
367 0.24
368 0.28
369 0.25
370 0.27
371 0.26
372 0.29
373 0.32
374 0.34
375 0.36
376 0.33
377 0.33
378 0.32
379 0.32
380 0.31
381 0.28