Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H2AXT7

Protein Details
Accession H2AXT7    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
127-146DANKKRRRDFDGQQTKRIRRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
130-134KKRRR
Subcellular Location(s) nucl 18, cyto 6, mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027141  LSm4/Sm_D1/D3  
IPR010920  LSM_dom_sf  
IPR047575  Sm  
IPR001163  Sm_dom_euk/arc  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0120114  C:Sm-like protein family complex  
GO:0006396  P:RNA processing  
KEGG kaf:KAFR_0G01530  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01423  LSM  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS52002  SM  
Amino Acid Sequences MKLVNFLKKLRNEQVTVELKNGTTIWGTLQTVSPQMNVTLTDVALTLPNNNHSNSPSALASMYLTGKGPSNEGATSGDKITTSLQYINVRGNTIRQIILPDSLNLDSLLIDETQLNRLRRQGKVVSDANKKRRRDFDGQQTKRIRRGV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.58
2 0.57
3 0.51
4 0.45
5 0.37
6 0.31
7 0.31
8 0.27
9 0.19
10 0.12
11 0.11
12 0.11
13 0.13
14 0.13
15 0.13
16 0.14
17 0.14
18 0.16
19 0.16
20 0.15
21 0.12
22 0.12
23 0.12
24 0.11
25 0.12
26 0.1
27 0.09
28 0.09
29 0.08
30 0.08
31 0.08
32 0.08
33 0.08
34 0.08
35 0.13
36 0.14
37 0.15
38 0.16
39 0.16
40 0.18
41 0.17
42 0.18
43 0.14
44 0.13
45 0.12
46 0.11
47 0.1
48 0.09
49 0.08
50 0.07
51 0.07
52 0.07
53 0.08
54 0.08
55 0.08
56 0.08
57 0.09
58 0.09
59 0.1
60 0.12
61 0.11
62 0.12
63 0.12
64 0.11
65 0.09
66 0.1
67 0.1
68 0.08
69 0.09
70 0.08
71 0.12
72 0.14
73 0.15
74 0.17
75 0.17
76 0.17
77 0.16
78 0.17
79 0.16
80 0.16
81 0.15
82 0.12
83 0.14
84 0.14
85 0.16
86 0.15
87 0.13
88 0.14
89 0.13
90 0.13
91 0.11
92 0.1
93 0.08
94 0.08
95 0.08
96 0.06
97 0.06
98 0.06
99 0.07
100 0.13
101 0.19
102 0.21
103 0.21
104 0.28
105 0.33
106 0.34
107 0.4
108 0.41
109 0.4
110 0.46
111 0.51
112 0.52
113 0.58
114 0.65
115 0.7
116 0.72
117 0.72
118 0.72
119 0.74
120 0.74
121 0.73
122 0.73
123 0.74
124 0.77
125 0.78
126 0.79
127 0.8
128 0.78