Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1E3NHW5

Protein Details
Accession A0A1E3NHW5    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
8-28GGGGGKDKKRQRCHALIEPGQBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
3-17KRKNGGGGGGKDKKR
Subcellular Location(s) nucl 16, cyto_nucl 14.5, cyto 11
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR040183  THUMPD1-like  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006400  P:tRNA modification  
CDD cd11717  THUMP_THUMPD1_like  
Amino Acid Sequences MGKRKNGGGGGGKDKKRQRCHALIEPGQYGVYASCARFKEVAAAKEMRLLLQDAIEKHYPKAEEEGGEGEDAKEDEKEDEKEDEKAVDIEDEIAKELAELKKNDDRSKQNRNNKDLVLREIPLGVESLTFFKLKQPVTPSSLVVAVCRDLYASGAKTGRFVQKLIPVDRSCNATKIEFDKLLAATVDAFVQEETARGGDARTALETYNVNLVKRNFDTISRDEFMETVKEKLDDTFGAGWCRLQYKGARTLLNIYCFKNNIGMSVVPNDAFEELAKFNVQQIFDK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.67
2 0.71
3 0.72
4 0.75
5 0.75
6 0.75
7 0.79
8 0.8
9 0.83
10 0.78
11 0.74
12 0.65
13 0.56
14 0.46
15 0.37
16 0.28
17 0.18
18 0.15
19 0.13
20 0.12
21 0.18
22 0.19
23 0.22
24 0.22
25 0.22
26 0.28
27 0.31
28 0.33
29 0.32
30 0.33
31 0.31
32 0.35
33 0.35
34 0.26
35 0.21
36 0.21
37 0.16
38 0.16
39 0.19
40 0.15
41 0.2
42 0.24
43 0.24
44 0.23
45 0.26
46 0.25
47 0.22
48 0.26
49 0.24
50 0.2
51 0.21
52 0.22
53 0.19
54 0.18
55 0.17
56 0.12
57 0.11
58 0.1
59 0.09
60 0.07
61 0.07
62 0.09
63 0.12
64 0.13
65 0.15
66 0.18
67 0.19
68 0.2
69 0.2
70 0.19
71 0.16
72 0.15
73 0.13
74 0.1
75 0.09
76 0.09
77 0.09
78 0.08
79 0.08
80 0.08
81 0.07
82 0.07
83 0.11
84 0.12
85 0.16
86 0.17
87 0.21
88 0.26
89 0.31
90 0.35
91 0.38
92 0.44
93 0.48
94 0.59
95 0.64
96 0.69
97 0.73
98 0.75
99 0.72
100 0.65
101 0.63
102 0.54
103 0.49
104 0.42
105 0.34
106 0.29
107 0.24
108 0.22
109 0.15
110 0.13
111 0.08
112 0.05
113 0.05
114 0.06
115 0.07
116 0.07
117 0.07
118 0.1
119 0.15
120 0.15
121 0.18
122 0.21
123 0.23
124 0.27
125 0.28
126 0.26
127 0.22
128 0.23
129 0.2
130 0.16
131 0.13
132 0.09
133 0.08
134 0.07
135 0.06
136 0.04
137 0.05
138 0.07
139 0.07
140 0.09
141 0.1
142 0.1
143 0.12
144 0.15
145 0.19
146 0.18
147 0.18
148 0.19
149 0.23
150 0.29
151 0.29
152 0.33
153 0.29
154 0.3
155 0.31
156 0.33
157 0.28
158 0.25
159 0.24
160 0.19
161 0.2
162 0.21
163 0.23
164 0.19
165 0.19
166 0.18
167 0.17
168 0.17
169 0.14
170 0.11
171 0.07
172 0.07
173 0.07
174 0.05
175 0.05
176 0.04
177 0.05
178 0.05
179 0.05
180 0.05
181 0.05
182 0.05
183 0.05
184 0.05
185 0.06
186 0.07
187 0.07
188 0.08
189 0.09
190 0.09
191 0.1
192 0.11
193 0.11
194 0.17
195 0.17
196 0.17
197 0.2
198 0.22
199 0.25
200 0.26
201 0.29
202 0.23
203 0.25
204 0.3
205 0.3
206 0.35
207 0.31
208 0.31
209 0.27
210 0.26
211 0.24
212 0.24
213 0.21
214 0.16
215 0.16
216 0.16
217 0.16
218 0.17
219 0.18
220 0.13
221 0.15
222 0.18
223 0.19
224 0.2
225 0.2
226 0.2
227 0.19
228 0.21
229 0.18
230 0.18
231 0.22
232 0.26
233 0.35
234 0.39
235 0.39
236 0.38
237 0.46
238 0.47
239 0.49
240 0.46
241 0.4
242 0.39
243 0.39
244 0.38
245 0.36
246 0.31
247 0.25
248 0.25
249 0.24
250 0.22
251 0.24
252 0.24
253 0.18
254 0.18
255 0.18
256 0.15
257 0.14
258 0.12
259 0.12
260 0.11
261 0.13
262 0.13
263 0.13
264 0.17
265 0.21